More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_12243 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_12243  putative potassium uptake protein  100 
 
 
449 aa  902    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0734  TrkA-N domain protein  34.67 
 
 
450 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0914  potassium transporter peripheral membrane component  34.89 
 
 
450 aa  277  3e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2218  potassium transporter peripheral membrane component  37.67 
 
 
446 aa  268  2e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000230921 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3218  potassium transporter peripheral membrane component  33.18 
 
 
454 aa  268  2e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.715113  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2911  potassium transporter peripheral membrane component  32.67 
 
 
449 aa  248  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000908908  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  32 
 
 
443 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4082  potassium transporter peripheral membrane component  34.99 
 
 
467 aa  242  7.999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1310  potassium transporter peripheral membrane component  32.96 
 
 
444 aa  242  1e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0266  potassium transporter peripheral membrane component  33.41 
 
 
445 aa  239  5e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0020  potassium transporter peripheral membrane component  34 
 
 
457 aa  240  5e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2030  potassium transporter peripheral membrane component  29.56 
 
 
465 aa  236  8e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0693486  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2907  potassium transporter peripheral membrane component  31.19 
 
 
450 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000237268  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1970  potassium transporter peripheral membrane component  31.54 
 
 
453 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.616677  normal  0.0915611 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0014  potassium transporter peripheral membrane component  31.94 
 
 
458 aa  234  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00830339  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0038  potassium transporter peripheral membrane component  34.93 
 
 
458 aa  234  3e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3126  potassium transporter peripheral membrane component  30.02 
 
 
458 aa  234  3e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0081  potassium transporter peripheral membrane component  32.23 
 
 
457 aa  233  6e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  hitchhiker  0.0000000000177319 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0084  potassium transporter peripheral membrane component  32.45 
 
 
457 aa  233  6e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.409393  hitchhiker  0.00000000549949 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0052  potassium transporter peripheral membrane component  31.79 
 
 
457 aa  231  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0065  potassium transporter peripheral membrane component  32.01 
 
 
457 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948816  unclonable  0.000000448887 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0081  potassium transporter peripheral membrane component  32.01 
 
 
457 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685696  normal  0.107342 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1569  potassium transporter peripheral membrane component  31.28 
 
 
458 aa  231  3e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0202479  normal  0.0449671 
 
 
-
 
NC_002936  DET0030  potassium transporter peripheral membrane component  30.15 
 
 
454 aa  230  5e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3792  potassium transporter peripheral membrane component  31.94 
 
 
458 aa  229  7e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5096  TrkA-N domain protein  29.11 
 
 
448 aa  229  7e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0436  potassium transporter peripheral membrane component  32.16 
 
 
458 aa  229  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0108  potassium transporter peripheral membrane component  30.72 
 
 
462 aa  228  1e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.386766  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3971  potassium transporter peripheral membrane component  31.72 
 
 
458 aa  227  4e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0755481  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_29  cation transport protein, Trk system  29.72 
 
 
454 aa  227  4e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00170  potassium transporter peripheral membrane component  31.35 
 
 
457 aa  225  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0029  potassium transporter peripheral membrane component  30.15 
 
 
454 aa  224  3e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0353  potassium transporter peripheral membrane component  31.5 
 
 
458 aa  224  3e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2455  potassium transporter peripheral membrane component  30.07 
 
 
452 aa  224  4e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.341783  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0088  potassium transporter peripheral membrane component  29.81 
 
 
462 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0201  potassium transporter peripheral membrane component  31.79 
 
 
457 aa  223  6e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0211158  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0180  Trk system potassium uptake protein TrkA  31.13 
 
 
457 aa  223  7e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4514  potassium transporter peripheral membrane component  31.5 
 
 
458 aa  223  8e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00906883  hitchhiker  0.00000865676 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3885  potassium transporter peripheral membrane component  31.5 
 
 
458 aa  222  9e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0054195  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0017  potassium transporter peripheral membrane component  31.13 
 
 
457 aa  222  9e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.290257  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0313  potassium transporter peripheral membrane component  31.5 
 
 
458 aa  222  9e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.888467  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0612  potassium transporter peripheral membrane component  31.5 
 
 
458 aa  222  9e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0369792  normal  0.0559785 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4396  potassium transporter peripheral membrane component  28.04 
 
 
458 aa  221  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0641614  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0016  potassium transporter peripheral membrane component  30.91 
 
 
457 aa  220  5e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00140  potassium transporter peripheral membrane component  32.68 
 
 
457 aa  218  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35944  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0187  potassium transporter peripheral membrane component  31.77 
 
 
465 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5999  potassium transporter peripheral membrane component  31.73 
 
 
485 aa  216  5e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0135992 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2872  potassium transporter peripheral membrane component  32.67 
 
 
457 aa  216  7e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2079  TrkA-N domain protein  32.16 
 
 
458 aa  216  7e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3424  potassium transporter peripheral membrane component  30.7 
 
 
448 aa  216  8e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2242  potassium transporter peripheral membrane component  30.55 
 
 
458 aa  215  1.9999999999999998e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0521644  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2267  TrkA-N domain protein  31.35 
 
 
459 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.634076  hitchhiker  0.00765776 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03140  potassium transporter peripheral membrane component  30.62 
 
 
458 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.946548  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0424  TrkA-N domain protein  30.62 
 
 
458 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4612  potassium transporter peripheral membrane component  30.62 
 
 
458 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00524775  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3483  potassium transporter peripheral membrane component  30.62 
 
 
458 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0624843  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3020  potassium transporter peripheral membrane component  31.13 
 
 
457 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0424  potassium transporter peripheral membrane component  30.62 
 
 
458 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000421391 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3674  potassium transporter peripheral membrane component  30.62 
 
 
458 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03091  hypothetical protein  30.62 
 
 
458 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3585  potassium transporter peripheral membrane component  30.62 
 
 
458 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.931761  normal  0.13042 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3772  potassium transporter peripheral membrane component  30.62 
 
 
458 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.241443  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3776  potassium transporter peripheral membrane component  30.4 
 
 
458 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3678  potassium transporter peripheral membrane component  30.4 
 
 
458 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3713  potassium transporter peripheral membrane component  30.4 
 
 
458 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.461523 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3606  potassium transporter peripheral membrane component  30.4 
 
 
458 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.454415 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0028  potassium transporter peripheral membrane component  32.47 
 
 
469 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3605  potassium transporter peripheral membrane component  30.4 
 
 
458 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.267887  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4126  potassium transporter peripheral membrane component  31.5 
 
 
458 aa  213  5.999999999999999e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.215607  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2209  potassium transporter peripheral membrane component  29.54 
 
 
458 aa  213  5.999999999999999e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0040  potassium transporter peripheral membrane component  30.82 
 
 
467 aa  213  7e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0035  potassium transporter peripheral membrane component  32.04 
 
 
469 aa  212  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.154438 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0028  potassium transporter peripheral membrane component  32.69 
 
 
469 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.736909  normal  0.0141363 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0028  potassium transporter peripheral membrane component  32.69 
 
 
469 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000283519 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0029  potassium transporter peripheral membrane component  32.69 
 
 
469 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.313972  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0024  potassium transporter peripheral membrane component  32.69 
 
 
469 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002054  Trk system potassium uptake protein TrkA  31.06 
 
 
458 aa  211  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3739  potassium transporter peripheral membrane component  32.69 
 
 
469 aa  210  3e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00764602 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1491  potassium transporter peripheral membrane component  29.07 
 
 
458 aa  211  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.404255 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0032  potassium transporter peripheral membrane component  31.83 
 
 
469 aa  210  4e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0670474 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2849  potassium transporter peripheral membrane component  29.8 
 
 
457 aa  209  6e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.336578  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0021  potassium transporter peripheral membrane component  32.62 
 
 
469 aa  209  7e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0021  potassium transporter peripheral membrane component  32.47 
 
 
469 aa  209  7e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2622  potassium transporter peripheral membrane component  30.62 
 
 
458 aa  209  8e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.637696 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0029  potassium transporter peripheral membrane component  32.04 
 
 
469 aa  208  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0021  potassium transporter peripheral membrane component  32.26 
 
 
469 aa  208  1e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881079  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0026  potassium transporter peripheral membrane component  32.26 
 
 
469 aa  208  1e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.570638  hitchhiker  0.00237688 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0024  potassium transporter peripheral membrane component  32.26 
 
 
469 aa  208  1e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.738729  normal  0.0894147 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3721  potassium transporter peripheral membrane component  30.18 
 
 
458 aa  208  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.455601  hitchhiker  0.00773793 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0032  potassium transporter peripheral membrane component  32.26 
 
 
469 aa  208  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.21174  hitchhiker  0.00000689203 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00394  potassium transporter peripheral membrane component  30.84 
 
 
458 aa  207  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2841  potassium transporter peripheral membrane component  28.63 
 
 
458 aa  208  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.340173  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0040  potassium transporter peripheral membrane component  32.04 
 
 
469 aa  208  2e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.165147 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0081  potassium transporter peripheral membrane component  31.07 
 
 
458 aa  208  2e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1453  potassium transporter peripheral membrane component  28.63 
 
 
458 aa  208  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.687964  normal  0.06884 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1681  potassium transporter peripheral membrane component  28.7 
 
 
458 aa  206  6e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1114  potassium transporter peripheral membrane component  28.23 
 
 
458 aa  205  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1072  potassium transporter peripheral membrane component  28.01 
 
 
458 aa  204  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1615  potassium transporter peripheral membrane component  29.1 
 
 
458 aa  204  3e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3261  potassium transporter peripheral membrane component  30.54 
 
 
484 aa  203  5e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.386779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>