More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1399 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1399  TrkA domain-containing protein  100 
 
 		 233 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6760  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  80.56 
 
 		 223 aa  347  7e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0522309 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2286  TrkA-N domain-containing protein  81.02 
 
 		 219 aa  345  4e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.241613 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1712  TrkA-N domain protein  80.56 
 
 		 219 aa  341  5e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.887824  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1641  TrkA-N domain protein  74.51 
 
 		 233 aa  302  3.0000000000000004e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  0.0943946 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5192  TrkA domain-containing protein  72.22 
 
 		 259 aa  297  8e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0506525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3757  TrkA-N domain protein  69.91 
 
 		 217 aa  291  5e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000992935  normal  0.446525 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2904  TrkA domain-containing protein  66.67 
 
 		 223 aa  290  1e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2196  TrkA-N  69.23 
 
 		 222 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2242  TrkA domain-containing protein  69.23 
 
 		 222 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.081798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2185  TrkA domain-containing protein  69.23 
 
 		 222 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314676  normal  0.0103731 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1450  TrkA domain-containing protein  67.28 
 
 		 229 aa  285  2.9999999999999996e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0807714  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1561  TrkA-N domain protein  66.2 
 
 		 219 aa  285  2.9999999999999996e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534326  normal  0.490374 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1322  TrkA-like  68.52 
 
 		 231 aa  285  4e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2256  TrkA-N domain protein  69.01 
 
 		 218 aa  284  9e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13318  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3928  TrkA domain-containing protein  67.87 
 
 		 221 aa  283  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0399436  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1520  TrkA-N domain protein  66.67 
 
 		 218 aa  283  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1485  TrkA domain-containing protein  66.82 
 
 		 229 aa  281  4.0000000000000003e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0637531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2472  TrkA domain-containing protein  68.66 
 
 		 221 aa  280  2e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1707  TrkA-N domain protein  63.64 
 
 		 224 aa  278  7e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102172  normal  0.0591298 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4528  TrkA-N domain-containing protein  65.44 
 
 		 222 aa  275  5e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.468661  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1876  TrkA-N domain protein  65.74 
 
 		 220 aa  275  6e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.416785  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16160  K+ transport system, NAD-binding component  60.91 
 
 		 249 aa  274  9e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.534565  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1406  TrkA-N domain protein  60 
 
 		 225 aa  272  3e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.699899  normal  0.545013 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1941  TrkA-N domain protein  58.8 
 
 		 241 aa  265  5e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0298197 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12707  trk system potassium uptake protein ceoC  64.88 
 
 		 220 aa  260  1e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.44928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1918  TrkA-N domain protein  57.99 
 
 		 224 aa  253  2.0000000000000002e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388192  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1640  TrkA domain-containing protein  57.41 
 
 		 253 aa  246  3e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0557692  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1633  TrkA-N domain protein  56.48 
 
 		 299 aa  245  4e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0161  TrkA domain-containing protein  56.25 
 
 		 231 aa  239  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.825727 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0745  TrkA domain-containing protein  53.12 
 
 		 231 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1929  putative potassium uptake protein  53.45 
 
 		 229 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.123463  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13080  K+ transport system, NAD-binding component  50.22 
 
 		 227 aa  201  6e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0024035  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2875  TrkA-N domain protein  52.19 
 
 		 226 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1924  TrkA-N domain protein  47.71 
 
 		 231 aa  195  5.000000000000001e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2661  TrkA domain-containing protein  37.16 
 
 		 220 aa  143  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.202256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  35.48 
 
 		 218 aa  142  7e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3071  TrkA domain-containing protein  35.35 
 
 		 220 aa  137  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3062  TrkA domain-containing protein  34.68 
 
 		 227 aa  135  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.793731  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2407  TrkA domain-containing protein  34.42 
 
 		 220 aa  133  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  33.03 
 
 		 221 aa  132  5e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  32.57 
 
 		 221 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  32.11 
 
 		 221 aa  128  6e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0638  TrkA-N  33.48 
 
 		 225 aa  126  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1348  hypothetical protein  34.07 
 
 		 220 aa  116  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0533287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  35.71 
 
 		 223 aa  116  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2082  TrkA-N domain protein  30.28 
 
 		 218 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.124657  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0542  TrkA-N domain protein  32.69 
 
 		 215 aa  108  9.000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.840001  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1794  hypothetical protein  29.36 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0254  TrkA-N domain protein  27.85 
 
 		 221 aa  102  5e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.153232 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1261  TrkA domain-containing protein  27.65 
 
 		 219 aa  102  6e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  28.38 
 
 		 221 aa  99.8  4e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  28.38 
 
 		 221 aa  99.4  5e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  28.38 
 
 		 221 aa  97.4  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  29.07 
 
 		 221 aa  96.7  3e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  30.91 
 
 		 443 aa  95.9  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11630  TrkA-C domain protein  30.91 
 
 		 207 aa  93.6  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00290  K+ transport system, NAD-binding component  29.39 
 
 		 226 aa  92.4  6e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0242  TrkA-N domain protein  24.2 
 
 		 221 aa  92  8e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2479  TrkA-N domain protein  31.46 
 
 		 445 aa  90.1  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0251  TrkA-N domain protein  30.8 
 
 		 225 aa  90.1  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2907  potassium transporter peripheral membrane component  31.58 
 
 		 450 aa  88.6  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000237268  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0187  potassium transporter peripheral membrane component  29.28 
 
 		 465 aa  87.4  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0637  TrkA-N  29.15 
 
 		 219 aa  86.7  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0432302 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  30.36 
 
 		 626 aa  85.1  8e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2085  TrkA-N domain protein  29.38 
 
 		 444 aa  84.3  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  30.19 
 
 		 630 aa  84.3  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1454  TrkA-N domain protein  28.99 
 
 		 443 aa  83.2  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0699  TrkA-N domain protein  29.58 
 
 		 444 aa  82  0.000000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3424  potassium transporter peripheral membrane component  31.43 
 
 		 448 aa  81.6  0.000000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2849  potassium transporter peripheral membrane component  24.36 
 
 		 457 aa  81.3  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.336578  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2406  TrkA domain-containing protein  30.29 
 
 		 214 aa  81.3  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.716891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1728  TrkA domain-containing protein  25.69 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000194267  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  33.18 
 
 		 617 aa  81.3  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3072  TrkA domain-containing protein  30.77 
 
 		 214 aa  81.3  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00170  potassium transporter peripheral membrane component  27.68 
 
 		 457 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2911  potassium transporter peripheral membrane component  30.18 
 
 		 449 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000908908  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0914  potassium transporter peripheral membrane component  26.72 
 
 		 450 aa  79.7  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3126  potassium transporter peripheral membrane component  28.25 
 
 		 458 aa  79.3  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01280  K+ transport system, NAD-binding component  30.04 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  32.35 
 
 		 628 aa  79.3  0.00000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0052  potassium transporter peripheral membrane component  26.61 
 
 		 457 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1655  TrkA domain-containing protein  26.15 
 
 		 218 aa  79  0.00000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000867889  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1489  hypothetical protein  30.95 
 
 		 218 aa  79.3  0.00000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00984888  normal  0.0109156 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3063  TrkA domain-containing protein  27.88 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2660  TrkA domain-containing protein  29.52 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0646767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0017  potassium transporter peripheral membrane component  27.23 
 
 		 457 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.290257  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0020  potassium transporter peripheral membrane component  28.18 
 
 		 457 aa  77.4  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1877  potassium transporter peripheral membrane component  28.44 
 
 		 445 aa  77  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.113601 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2267  TrkA-N domain protein  28.25 
 
 		 459 aa  76.6  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.634076  hitchhiker  0.00765776 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1186  potassium transporter peripheral membrane component  30.73 
 
 		 445 aa  76.3  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.596494  decreased coverage  0.00000028569 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2258  TrkA-N domain protein  28.44 
 
 		 236 aa  76.3  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0014  potassium transporter peripheral membrane component  27.35 
 
 		 458 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00830339  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0769  TrkA-N domain protein  27.65 
 
 		 445 aa  75.9  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.601936 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0266  potassium transporter peripheral membrane component  30.09 
 
 		 445 aa  75.5  0.0000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2622  potassium transporter peripheral membrane component  29.36 
 
 		 458 aa  75.1  0.0000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637696 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3261  potassium transporter peripheral membrane component  26.75 
 
 		 484 aa  75.1  0.0000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.386779  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3912  potassium transporter peripheral membrane component  26.75 
 
 		 484 aa  75.1  0.0000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0035  potassium transporter peripheral membrane component  28.16 
 
 		 469 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.154438 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0243  TrkA-N domain protein  25.94 
 
 		 206 aa  74.7  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>