More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1707 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1707  TrkA-N domain protein  100 
 
 
224 aa  445  1.0000000000000001e-124  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102172  normal  0.0591298 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16160  K+ transport system, NAD-binding component  77.68 
 
 
249 aa  358  4e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.534565  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1918  TrkA-N domain protein  75.45 
 
 
224 aa  346  1e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388192  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1941  TrkA-N domain protein  75.11 
 
 
241 aa  337  5.9999999999999996e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0298197 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1406  TrkA-N domain protein  71.88 
 
 
225 aa  326  2.0000000000000001e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.699899  normal  0.545013 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1561  TrkA-N domain protein  67.74 
 
 
219 aa  291  4e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534326  normal  0.490374 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1712  TrkA-N domain protein  63.47 
 
 
219 aa  290  1e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.887824  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6760  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  61.93 
 
 
223 aa  278  6e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0522309 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1399  TrkA domain-containing protein  63.64 
 
 
233 aa  278  7e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2286  TrkA-N domain-containing protein  61.01 
 
 
219 aa  270  1e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.241613 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2904  TrkA domain-containing protein  60.83 
 
 
223 aa  270  1e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1641  TrkA-N domain protein  63.29 
 
 
233 aa  268  7e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  0.0943946 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1640  TrkA domain-containing protein  60.29 
 
 
253 aa  261  4.999999999999999e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0557692  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4528  TrkA-N domain-containing protein  57.53 
 
 
222 aa  261  6.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.468661  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1633  TrkA-N domain protein  56.7 
 
 
299 aa  258  7e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1322  TrkA-like  57.85 
 
 
231 aa  252  4.0000000000000004e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1485  TrkA domain-containing protein  57.4 
 
 
229 aa  251  5.000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0637531  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1450  TrkA domain-containing protein  56.95 
 
 
229 aa  248  7e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0807714  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5192  TrkA domain-containing protein  58.37 
 
 
259 aa  246  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0506525  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2196  TrkA-N  56.68 
 
 
222 aa  245  4e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2242  TrkA domain-containing protein  56.68 
 
 
222 aa  245  4e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.081798  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2185  TrkA domain-containing protein  56.68 
 
 
222 aa  245  4e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314676  normal  0.0103731 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1520  TrkA-N domain protein  57.82 
 
 
218 aa  244  9e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3757  TrkA-N domain protein  55.56 
 
 
217 aa  241  6e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000992935  normal  0.446525 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2256  TrkA-N domain protein  57.89 
 
 
218 aa  241  6e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13318  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1876  TrkA-N domain protein  56.11 
 
 
220 aa  240  1e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.416785  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3928  TrkA domain-containing protein  55.5 
 
 
221 aa  238  8e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0399436  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2472  TrkA domain-containing protein  55.05 
 
 
221 aa  237  1e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12707  trk system potassium uptake protein ceoC  53.66 
 
 
220 aa  225  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.44928  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0161  TrkA domain-containing protein  48.17 
 
 
231 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.825727 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13080  K+ transport system, NAD-binding component  53.62 
 
 
227 aa  205  5e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0024035  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0745  TrkA domain-containing protein  46.58 
 
 
231 aa  204  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26958  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1929  putative potassium uptake protein  47.53 
 
 
229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.123463  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1924  TrkA-N domain protein  45.54 
 
 
231 aa  174  8e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2875  TrkA-N domain protein  46.58 
 
 
226 aa  167  8e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220378  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3062  TrkA domain-containing protein  37.16 
 
 
227 aa  137  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.793731  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2661  TrkA domain-containing protein  36.7 
 
 
220 aa  134  8e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.202256  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  33.64 
 
 
221 aa  131  9e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  33.98 
 
 
221 aa  128  6e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  32.2 
 
 
221 aa  126  3e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  32.71 
 
 
218 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  36.27 
 
 
223 aa  125  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2407  TrkA domain-containing protein  33.96 
 
 
220 aa  123  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163912  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0254  TrkA-N domain protein  28.18 
 
 
221 aa  120  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.153232 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3071  TrkA domain-containing protein  32.58 
 
 
220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2082  TrkA-N domain protein  31.68 
 
 
218 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.124657  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0638  TrkA-N  31.19 
 
 
225 aa  111  8.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  35.35 
 
 
443 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0242  TrkA-N domain protein  28.83 
 
 
221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1348  hypothetical protein  32.88 
 
 
220 aa  101  9e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0533287  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1794  hypothetical protein  29.86 
 
 
222 aa  100  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0187  potassium transporter peripheral membrane component  30.24 
 
 
465 aa  99.4  4e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2849  potassium transporter peripheral membrane component  27.96 
 
 
457 aa  98.2  9e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.336578  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0017  potassium transporter peripheral membrane component  30.37 
 
 
457 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.290257  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0072  potassium transporter peripheral membrane component  30.13 
 
 
458 aa  96.3  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1590  potassium transporter peripheral membrane component  25.23 
 
 
449 aa  95.1  7e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00906485  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00170  potassium transporter peripheral membrane component  29.91 
 
 
457 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  28.95 
 
 
630 aa  92.4  5e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0052  potassium transporter peripheral membrane component  28.97 
 
 
457 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00290  K+ transport system, NAD-binding component  31.38 
 
 
226 aa  92.4  5e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0312  potassium transporter peripheral membrane component  26.17 
 
 
449 aa  91.7  9e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0720169  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0065  potassium transporter peripheral membrane component  30.23 
 
 
457 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948816  unclonable  0.000000448887 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11630  TrkA-C domain protein  28.09 
 
 
207 aa  91.3  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0081  potassium transporter peripheral membrane component  30.23 
 
 
457 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685696  normal  0.107342 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0014  potassium transporter peripheral membrane component  30.09 
 
 
458 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00830339  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0081  potassium transporter peripheral membrane component  30.23 
 
 
457 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  hitchhiker  0.0000000000177319 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0084  potassium transporter peripheral membrane component  30.23 
 
 
457 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.409393  hitchhiker  0.00000000549949 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2476  potassium transporter peripheral membrane component  29.26 
 
 
458 aa  90.5  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  30.13 
 
 
626 aa  89.7  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1261  TrkA domain-containing protein  27.32 
 
 
219 aa  89.4  4e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00394  potassium transporter peripheral membrane component  29.26 
 
 
458 aa  89.4  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  27.83 
 
 
221 aa  89  5e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  27.88 
 
 
221 aa  89.4  5e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  27.88 
 
 
221 aa  88.6  6e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002054  Trk system potassium uptake protein TrkA  29.26 
 
 
458 aa  88.6  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0180  Trk system potassium uptake protein TrkA  28.04 
 
 
457 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2907  potassium transporter peripheral membrane component  32.5 
 
 
450 aa  86.7  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000237268  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0040  potassium transporter peripheral membrane component  25.56 
 
 
469 aa  87  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.165147 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0024  potassium transporter peripheral membrane component  26.01 
 
 
469 aa  86.7  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0028  potassium transporter peripheral membrane component  26.01 
 
 
469 aa  86.7  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.736909  normal  0.0141363 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00140  potassium transporter peripheral membrane component  28.9 
 
 
457 aa  86.3  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35944  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0028  potassium transporter peripheral membrane component  26.01 
 
 
469 aa  86.7  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000283519 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0029  potassium transporter peripheral membrane component  26.01 
 
 
469 aa  86.7  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.313972  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0029  potassium transporter peripheral membrane component  25.56 
 
 
469 aa  85.5  5e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_29  cation transport protein, Trk system  28.8 
 
 
454 aa  85.5  6e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2872  potassium transporter peripheral membrane component  28.04 
 
 
457 aa  84.7  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0769  TrkA-N domain protein  29.3 
 
 
445 aa  84.3  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.601936 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0026  potassium transporter peripheral membrane component  25.11 
 
 
469 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.570638  hitchhiker  0.00237688 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0024  potassium transporter peripheral membrane component  25.11 
 
 
469 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.738729  normal  0.0894147 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0021  potassium transporter peripheral membrane component  25.56 
 
 
469 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0032  potassium transporter peripheral membrane component  25.11 
 
 
469 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.21174  hitchhiker  0.00000689203 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0032  potassium transporter peripheral membrane component  25.11 
 
 
469 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0670474 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4514  potassium transporter peripheral membrane component  27.95 
 
 
458 aa  84  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00906883  hitchhiker  0.00000865676 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  27.45 
 
 
221 aa  84  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0021  potassium transporter peripheral membrane component  25.11 
 
 
469 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881079  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1681  potassium transporter peripheral membrane component  29.91 
 
 
458 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0251  TrkA-N domain protein  28.86 
 
 
225 aa  83.2  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1728  TrkA domain-containing protein  26.36 
 
 
218 aa  83.6  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000194267  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0016  potassium transporter peripheral membrane component  27.1 
 
 
457 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0021  potassium transporter peripheral membrane component  25.11 
 
 
469 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>