More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1918 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1918  TrkA-N domain protein  100 
 
 		 224 aa  444  1.0000000000000001e-124  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388192  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16160  K+ transport system, NAD-binding component  78.57 
 
 		 249 aa  353  2e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.534565  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1707  TrkA-N domain protein  75.45 
 
 		 224 aa  346  1e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102172  normal  0.0591298 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1406  TrkA-N domain protein  73.73 
 
 		 225 aa  323  2e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.699899  normal  0.545013 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1941  TrkA-N domain protein  68.12 
 
 		 241 aa  311  5.999999999999999e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0298197 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1561  TrkA-N domain protein  65.69 
 
 		 219 aa  282  3.0000000000000004e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534326  normal  0.490374 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1712  TrkA-N domain protein  60 
 
 		 219 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.887824  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6760  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  58.64 
 
 		 223 aa  268  4e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0522309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1641  TrkA-N domain protein  60.1 
 
 		 233 aa  256  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  0.0943946 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2286  TrkA-N domain-containing protein  57.27 
 
 		 219 aa  255  4e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.241613 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4528  TrkA-N domain-containing protein  56.82 
 
 		 222 aa  255  5e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.468661  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1485  TrkA domain-containing protein  58.02 
 
 		 229 aa  254  6e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0637531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2904  TrkA domain-containing protein  58.53 
 
 		 223 aa  254  9e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1450  TrkA domain-containing protein  58.02 
 
 		 229 aa  253  1.0000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0807714  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1640  TrkA domain-containing protein  59.8 
 
 		 253 aa  253  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0557692  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1399  TrkA domain-containing protein  57.99 
 
 		 233 aa  253  1.0000000000000001e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1633  TrkA-N domain protein  59.31 
 
 		 299 aa  251  8.000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2196  TrkA-N  57.6 
 
 		 222 aa  249  2e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2242  TrkA domain-containing protein  57.6 
 
 		 222 aa  249  2e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.081798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2185  TrkA domain-containing protein  57.6 
 
 		 222 aa  249  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314676  normal  0.0103731 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2256  TrkA-N domain protein  57.08 
 
 		 218 aa  241  9e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13318  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1322  TrkA-like  58.13 
 
 		 231 aa  240  2e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3928  TrkA domain-containing protein  57.42 
 
 		 221 aa  239  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0399436  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1876  TrkA-N domain protein  56.02 
 
 		 220 aa  238  4e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.416785  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2472  TrkA domain-containing protein  56.16 
 
 		 221 aa  237  1e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5192  TrkA domain-containing protein  55.2 
 
 		 259 aa  236  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0506525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1520  TrkA-N domain protein  55.66 
 
 		 218 aa  234  7e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3757  TrkA-N domain protein  53.7 
 
 		 217 aa  231  5e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000992935  normal  0.446525 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12707  trk system potassium uptake protein ceoC  52.53 
 
 		 220 aa  215  4e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.44928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0161  TrkA domain-containing protein  49.09 
 
 		 231 aa  212  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.825727 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13080  K+ transport system, NAD-binding component  51.67 
 
 		 227 aa  207  7e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0024035  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0745  TrkA domain-containing protein  47.73 
 
 		 231 aa  206  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1929  putative potassium uptake protein  47.53 
 
 		 229 aa  187  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.123463  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1924  TrkA-N domain protein  44.09 
 
 		 231 aa  180  2e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2875  TrkA-N domain protein  48.4 
 
 		 226 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3062  TrkA domain-containing protein  36.04 
 
 		 227 aa  132  5e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.793731  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2661  TrkA domain-containing protein  36.2 
 
 		 220 aa  132  5e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.202256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2407  TrkA domain-containing protein  31.67 
 
 		 220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  34.95 
 
 		 221 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3071  TrkA domain-containing protein  32.58 
 
 		 220 aa  129  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  34.15 
 
 		 221 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0254  TrkA-N domain protein  31.34 
 
 		 221 aa  128  6e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.153232 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  33.96 
 
 		 218 aa  128  9.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  34.47 
 
 		 221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  34.31 
 
 		 223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2082  TrkA-N domain protein  32.67 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.124657  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1728  TrkA domain-containing protein  30.77 
 
 		 218 aa  105  5e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000194267  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0638  TrkA-N  29.36 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  31.37 
 
 		 221 aa  101  9e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1348  hypothetical protein  33.04 
 
 		 220 aa  101  9e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0533287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  31.37 
 
 		 221 aa  101  9e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  30.88 
 
 		 221 aa  100  3e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1655  TrkA domain-containing protein  29.86 
 
 		 218 aa  98.6  6e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000867889  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  30.39 
 
 		 221 aa  97.4  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0542  TrkA-N domain protein  31.19 
 
 		 215 aa  97.1  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.840001  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  30.88 
 
 		 443 aa  94.7  9e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0242  TrkA-N domain protein  27.18 
 
 		 221 aa  94  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0914  potassium transporter peripheral membrane component  28.57 
 
 		 450 aa  93.6  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0187  potassium transporter peripheral membrane component  28.64 
 
 		 465 aa  92.4  4e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1794  hypothetical protein  26.13 
 
 		 222 aa  91.3  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  30.77 
 
 		 626 aa  89.4  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11630  TrkA-C domain protein  29.21 
 
 		 207 aa  89.4  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2849  potassium transporter peripheral membrane component  26.34 
 
 		 457 aa  88.6  8e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.336578  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00290  K+ transport system, NAD-binding component  30.85 
 
 		 226 aa  88.2  9e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2907  potassium transporter peripheral membrane component  32.41 
 
 		 450 aa  87.8  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000237268  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0312  potassium transporter peripheral membrane component  26.79 
 
 		 449 aa  88.2  1e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0720169  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1261  TrkA domain-containing protein  26.34 
 
 		 219 aa  87  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0072  potassium transporter peripheral membrane component  27.11 
 
 		 458 aa  87  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0251  TrkA-N domain protein  30.66 
 
 		 225 aa  87.4  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01280  K+ transport system, NAD-binding component  30.67 
 
 		 225 aa  85.9  5e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00394  potassium transporter peripheral membrane component  26.67 
 
 		 458 aa  82.4  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1590  potassium transporter peripheral membrane component  24.44 
 
 		 449 aa  82  0.000000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00906485  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2476  potassium transporter peripheral membrane component  26.22 
 
 		 458 aa  81.6  0.000000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1686  TrkA domain-containing protein  25.35 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0415019  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002054  Trk system potassium uptake protein TrkA  26.22 
 
 		 458 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4126  potassium transporter peripheral membrane component  28.57 
 
 		 458 aa  80.5  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.215607  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2258  TrkA-N domain protein  29.41 
 
 		 236 aa  80.9  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  28.51 
 
 		 630 aa  80.1  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1216  TrkA-N domain protein  30.14 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1877  potassium transporter peripheral membrane component  32.88 
 
 		 445 aa  79  0.00000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.113601 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4514  potassium transporter peripheral membrane component  24.89 
 
 		 458 aa  78.6  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00906883  hitchhiker  0.00000865676 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0201  potassium transporter peripheral membrane component  28.64 
 
 		 457 aa  77.8  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0211158  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0020  potassium transporter peripheral membrane component  26.34 
 
 		 457 aa  77.8  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0014  potassium transporter peripheral membrane component  27.43 
 
 		 458 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00830339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1262  TrkA domain-containing protein  35.51 
 
 		 141 aa  77.8  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0436  potassium transporter peripheral membrane component  24.89 
 
 		 458 aa  77.8  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00170  potassium transporter peripheral membrane component  25.89 
 
 		 457 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2479  TrkA-N domain protein  30.81 
 
 		 445 aa  77.8  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0266  potassium transporter peripheral membrane component  27.09 
 
 		 445 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2267  TrkA-N domain protein  27.54 
 
 		 459 aa  77  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.634076  hitchhiker  0.00765776 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1970  potassium transporter peripheral membrane component  26.43 
 
 		 453 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.616677  normal  0.0915611 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0028  potassium transporter peripheral membrane component  23.31 
 
 		 469 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000283519 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0029  potassium transporter peripheral membrane component  23.73 
 
 		 469 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0028  potassium transporter peripheral membrane component  23.31 
 
 		 469 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.736909  normal  0.0141363 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2242  potassium transporter peripheral membrane component  28.11 
 
 		 458 aa  76.6  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0521644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0024  potassium transporter peripheral membrane component  23.31 
 
 		 469 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0029  potassium transporter peripheral membrane component  23.31 
 
 		 469 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.313972  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0026  potassium transporter peripheral membrane component  23.31 
 
 		 469 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.570638  hitchhiker  0.00237688 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0017  potassium transporter peripheral membrane component  25.45 
 
 		 457 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.290257  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3218  potassium transporter peripheral membrane component  25.54 
 
 		 454 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.715113  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>