More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1262 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1262  TrkA domain-containing protein  100 
 
 		 141 aa  284  4e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1729  TrkA domain-containing protein  45.26 
 
 		 143 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000411585  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1656  TrkA domain-containing protein  45.26 
 
 		 143 aa  118  3e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153236  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1685  TrkA domain-containing protein  42.96 
 
 		 153 aa  111  3e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.124287  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0243  TrkA-N domain protein  38.17 
 
 		 206 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2083  TrkA-N domain protein  35.38 
 
 		 210 aa  107  7.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0253  TrkA-N domain protein  39.84 
 
 		 138 aa  106  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3072  TrkA domain-containing protein  34.59 
 
 		 214 aa  103  6e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2406  TrkA domain-containing protein  33.83 
 
 		 214 aa  100  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.716891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1486  TrkA domain-containing protein  32.48 
 
 		 221 aa  99  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.370955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0807  TrkA-N domain protein  36.29 
 
 		 137 aa  95.5  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12706  trk system potassium uptake protein ceoB  33.33 
 
 		 227 aa  94  7e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1451  TrkA domain-containing protein  31.62 
 
 		 221 aa  94  7e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0437642  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2903  TrkA domain-containing protein  31.62 
 
 		 220 aa  93.2  9e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2257  TrkA-N domain protein  32.48 
 
 		 220 aa  92.8  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222998  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3927  TrkA domain-containing protein  31.4 
 
 		 234 aa  92  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0233751  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2473  TrkA domain-containing protein  30.77 
 
 		 223 aa  90.5  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.214066  normal  0.684987 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2285  TrkA-N domain-containing protein  29.91 
 
 		 221 aa  88.6  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.311674 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1642  TrkA-N domain protein  29.06 
 
 		 219 aa  89  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.623208  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1398  TrkA domain-containing protein  29.06 
 
 		 224 aa  89.4  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.870164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3063  TrkA domain-containing protein  27.69 
 
 		 214 aa  88.2  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0250  TrkA-N domain protein  35.83 
 
 		 219 aa  87.8  4e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1877  TrkA-N domain protein  27.78 
 
 		 222 aa  87.4  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.608746  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1323  TrkA-like  29.06 
 
 		 264 aa  87  8e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1521  TrkA-N domain protein  29.91 
 
 		 220 aa  86.3  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.709024  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2197  TrkA-N  30.36 
 
 		 217 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1919  TrkA domain-containing protein  38.4 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1634  TrkA-N domain protein  27.86 
 
 		 224 aa  85.9  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000521907 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1641  TrkA domain-containing protein  27.14 
 
 		 223 aa  85.5  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0270311  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2243  TrkA domain-containing protein  30.36 
 
 		 217 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2186  TrkA domain-containing protein  30.36 
 
 		 217 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0106506 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13070  K+ transport system, NAD-binding component  28.45 
 
 		 233 aa  85.1  3e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00265603  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_26  cation transport protein, Trk system  30.3 
 
 		 134 aa  85.1  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0437885  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6759  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  29.06 
 
 		 221 aa  85.1  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0519804 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0026  TrkA domain-containing protein  30.71 
 
 		 134 aa  84.7  4e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2874  TrkA-N domain protein  26.09 
 
 		 242 aa  84.3  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.493191  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0027  potassium uptake protein, putative  29.55 
 
 		 134 aa  84  6e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.248151  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16170  K+ transport system, NAD-binding component  29.06 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.11506 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1405  TrkA-N domain protein  30.36 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.364271  normal  0.729476 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1562  TrkA-N domain protein  29.06 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.308966  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1928  putative potassium transporter  27.35 
 
 		 224 aa  82  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.292607  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1929  putative potassium uptake protein  34.38 
 
 		 229 aa  80.9  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.123463  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4527  TrkA-N domain-containing protein  28.21 
 
 		 221 aa  80.9  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.621759 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1489  hypothetical protein  34.78 
 
 		 218 aa  80.9  0.000000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00984888  normal  0.0109156 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5191  TrkA domain-containing protein  28.36 
 
 		 243 aa  80.5  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0357985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01270  K+ transport system, NAD-binding component  32.5 
 
 		 219 aa  80.1  0.000000000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2660  TrkA domain-containing protein  28.57 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0646767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3756  TrkA-N domain protein  26.45 
 
 		 236 aa  79.7  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000258956  normal  0.472401 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2911  TrkA-N domain protein  32.54 
 
 		 142 aa  79  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0359474  normal  0.209528 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1708  TrkA-N domain protein  30.36 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0311888  normal  0.0547174 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1918  TrkA-N domain protein  35.51 
 
 		 224 aa  77.8  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388192  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1261  TrkA domain-containing protein  33.08 
 
 		 219 aa  77.4  0.00000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1917  TrkA-N domain protein  29.46 
 
 		 217 aa  77.8  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.678679  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1347  TrkA-N  27.73 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0274494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0637  TrkA-N  26.92 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0432302 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00280  K+ transport system, NAD-binding component  29.01 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  34.68 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1794  hypothetical protein  30.23 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1942  TrkA-N domain protein  29.46 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0161521 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16160  K+ transport system, NAD-binding component  33.33 
 
 		 249 aa  74.7  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.534565  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2875  TrkA-N domain protein  33.33 
 
 		 226 aa  74.7  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1713  TrkA-N domain protein  27.07 
 
 		 222 aa  74.3  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1633  TrkA-N domain protein  32.64 
 
 		 299 aa  73.9  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  32.82 
 
 		 218 aa  74.3  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2907  potassium transporter peripheral membrane component  34.09 
 
 		 450 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000237268  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1348  hypothetical protein  36.59 
 
 		 220 aa  73.9  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0533287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1640  TrkA domain-containing protein  31.94 
 
 		 253 aa  73.9  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0557692  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  31.71 
 
 		 628 aa  73.9  0.0000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1923  TrkA-N domain protein  30 
 
 		 220 aa  73.6  0.0000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1876  TrkA-N domain protein  30.66 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.416785  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3757  TrkA-N domain protein  30.66 
 
 		 217 aa  72  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000992935  normal  0.446525 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2904  TrkA domain-containing protein  31.88 
 
 		 223 aa  72  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  31.97 
 
 		 221 aa  70.5  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  31.97 
 
 		 221 aa  70.5  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1520  TrkA-N domain protein  29.2 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1641  TrkA-N domain protein  30.22 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  0.0943946 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  31.15 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  29.82 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2407  TrkA domain-containing protein  32.14 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04100  K+ transport system, NAD-binding component  31.71 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.453544  normal  0.632996 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  29.82 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00290  K+ transport system, NAD-binding component  31.45 
 
 		 226 aa  68.9  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0251  TrkA-N domain protein  33.06 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1712  TrkA-N domain protein  29.71 
 
 		 219 aa  68.2  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.887824  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1399  TrkA domain-containing protein  31.16 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  29.82 
 
 		 221 aa  67.8  0.00000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2661  TrkA domain-containing protein  29.36 
 
 		 220 aa  68.2  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.202256  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1707  TrkA-N domain protein  27.74 
 
 		 224 aa  68.2  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102172  normal  0.0591298 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  31.15 
 
 		 221 aa  67.8  0.00000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1561  TrkA-N domain protein  31.88 
 
 		 219 aa  67.8  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534326  normal  0.490374 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0161  TrkA domain-containing protein  31.39 
 
 		 231 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.825727 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2286  TrkA-N domain-containing protein  30.66 
 
 		 219 aa  67.4  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.241613 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2196  TrkA-N  30.66 
 
 		 222 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2242  TrkA domain-containing protein  30.66 
 
 		 222 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.081798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2185  TrkA domain-containing protein  30.66 
 
 		 222 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314676  normal  0.0103731 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4528  TrkA-N domain-containing protein  30.22 
 
 		 222 aa  67  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.468661  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01280  K+ transport system, NAD-binding component  33.06 
 
 		 225 aa  67  0.00000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1941  TrkA-N domain protein  29.2 
 
 		 241 aa  66.2  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0298197 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  29.75 
 
 		 630 aa  66.6  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1406  TrkA-N domain protein  28.47 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.699899  normal  0.545013 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>