More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0739 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  61.39 
 
 
626 aa  677    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  100 
 
 
630 aa  1221    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  67.09 
 
 
628 aa  758    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  53.06 
 
 
617 aa  597  1e-169  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0112  TrkA-N domain protein  52.49 
 
 
617 aa  558  1e-157  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1363  sodium/hydrogen exchanger  36.5 
 
 
610 aa  415  1e-114  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00040523  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3265  hypothetical protein  33.98 
 
 
612 aa  385  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.769883  normal  0.438481 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3335  sodium/hydrogen exchanger  32.54 
 
 
620 aa  300  5e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1446  sodium/hydrogen exchanger  32.21 
 
 
641 aa  224  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3229  sodium/hydrogen exchanger  31.58 
 
 
652 aa  222  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2891  sodium/hydrogen exchanger  31.58 
 
 
652 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0220  hypothetical protein  31.5 
 
 
598 aa  219  1e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1072  sodium/hydrogen exchanger  33.26 
 
 
601 aa  219  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.558941  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4152  sodium/hydrogen exchanger  30.63 
 
 
608 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.561792 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2292  sodium/hydrogen exchanger  31.88 
 
 
637 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.042334  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1467  sodium/hydrogen exchanger  33.26 
 
 
601 aa  211  4e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.236845 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4254  sodium/hydrogen exchanger  33.26 
 
 
601 aa  210  6e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16030  putative sodium/hydrogen antiporter  33.4 
 
 
611 aa  210  7e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04922  Na+/K+/H+ antiporter  29.07 
 
 
597 aa  209  1e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000727  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  29.37 
 
 
599 aa  207  3e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1380  putative sodium/hydrogen antiporter  33.19 
 
 
611 aa  207  5e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00463957  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3909  Na+/H+ antiporter  33.55 
 
 
607 aa  206  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2869  sodium/hydrogen exchanger  32.32 
 
 
623 aa  206  1e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.824474  normal  0.920346 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0888  sodium/hydrogen exchanger  29.3 
 
 
628 aa  205  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.043911 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4286  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.63 
 
 
596 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0381852  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1982  sodium/hydrogen exchanger  33.11 
 
 
619 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0859  sodium/hydrogen exchanger  31.03 
 
 
640 aa  201  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0511  sodium/hydrogen exchanger  32.33 
 
 
622 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4667  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.43 
 
 
596 aa  201  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4275  Na+/H+ exchanger (Na+/H+ antiporter)  30.24 
 
 
596 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4781  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.24 
 
 
596 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4654  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.24 
 
 
596 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4369  sodium/hydrogen exchanger  30.04 
 
 
596 aa  199  9e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4436  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.24 
 
 
596 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00005477  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1211  Sodium/hydrogen exchanger  27.73 
 
 
611 aa  199  2.0000000000000003e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4262  sodium/hydrogen exchanger  33.87 
 
 
741 aa  198  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387435  normal  0.153793 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2400  sodium/hydrogen exchanger  34.83 
 
 
625 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000130765  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0707  sodium/hydrogen exchanger  31.44 
 
 
651 aa  196  7e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2740  Sodium/hydrogen exchanger  30.26 
 
 
629 aa  196  8.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1024  Sodium/hydrogen exchanger  32.42 
 
 
602 aa  196  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30796  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2605  sodium/hydrogen exchanger  31.61 
 
 
637 aa  195  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00858761  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2318  sodium/hydrogen exchanger  33.26 
 
 
599 aa  192  1e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0395796  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0127  sodium/hydrogen exchanger  30.2 
 
 
760 aa  189  2e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.302904  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0521  Sodium/hydrogen exchanger  29.08 
 
 
604 aa  189  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1871  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.6 
 
 
666 aa  188  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03225  Na(+):H(+) antiporter, CPA1 family protein  28.52 
 
 
625 aa  188  3e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00461  Na+/H+ antiporter  30.56 
 
 
569 aa  188  3e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0956  sodium/hydrogen exchanger  29.68 
 
 
639 aa  187  4e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1998  sodium/hydrogen exchanger  31.48 
 
 
616 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000112153 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0868  Na(+):H(+) antiporter  28.96 
 
 
606 aa  185  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1861  sodium/hydrogen exchanger  34.79 
 
 
719 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.182882  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4478  sodium/hydrogen exchanger  32.25 
 
 
602 aa  181  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0156  sodium/hydrogen exchanger  29.98 
 
 
764 aa  181  4e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0146  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  29.76 
 
 
763 aa  180  5.999999999999999e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000269507 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5185  sodium/hydrogen exchanger  32.19 
 
 
660 aa  179  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2147  sodium/hydrogen exchanger  31.05 
 
 
670 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251145  normal  0.368531 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2224  sodium/hydrogen exchanger  31.05 
 
 
673 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00760493  normal  0.0969988 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2324  sodium/hydrogen exchanger  31.09 
 
 
670 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.339898  normal  0.580137 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2537  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.56 
 
 
669 aa  172  1e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0850  sodium/hydrogen exchanger  32.63 
 
 
617 aa  171  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2394  Na+/H+ antiporter  35.65 
 
 
593 aa  169  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00954713  hitchhiker  0.00302602 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2109  sodium/hydrogen exchanger  31.29 
 
 
643 aa  167  5e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235083  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0424  sodium/hydrogen exchanger  30.21 
 
 
852 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1732  sodium/hydrogen exchanger  31.12 
 
 
702 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0477  sodium/hydrogen exchanger  29.27 
 
 
616 aa  164  6e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0802705  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2308  sodium/hydrogen exchanger  30.69 
 
 
660 aa  157  6e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2065  sodium/hydrogen exchanger  30.45 
 
 
660 aa  157  8e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000562767  hitchhiker  0.000963897 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2017  sodium/hydrogen exchanger  30.45 
 
 
660 aa  157  8e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000155921  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2321  sodium/hydrogen exchanger  30.37 
 
 
660 aa  156  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.545125  hitchhiker  0.000203679 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0042  sodium/hydrogen exchanger  30.69 
 
 
607 aa  146  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126585  normal  0.101979 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05361  CPA1 family Na+/H+ antiporter  27.8 
 
 
399 aa  143  9e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2077  Na+/H+ antiporter, putative  28.63 
 
 
595 aa  143  9.999999999999999e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19170  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  29.76 
 
 
640 aa  138  3.0000000000000003e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.490991  normal  0.0684118 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06781  putative Na+/H+ antiporter, CPA1 family  29.1 
 
 
421 aa  135  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0472  CPA1 family Na+/H+ antiporter  28.36 
 
 
399 aa  134  6e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0494569  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0759  sodium/hydrogen exchanger  33.4 
 
 
584 aa  131  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135673  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04971  CPA1 family Na+/H+ antiporter  28.29 
 
 
401 aa  129  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05271  CPA1 family Na+/H+ antiporter  27.73 
 
 
401 aa  126  1e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0377759  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  38.97 
 
 
218 aa  125  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04731  CPA1 family Na+/H+ antiporter  27.56 
 
 
402 aa  125  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.281963  normal  0.831051 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1720  CPA1 family Na+/H+ antiporter  29.46 
 
 
414 aa  124  6e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4282  sodium/hydrogen exchanger  30.08 
 
 
609 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3821  sodium/hydrogen exchanger  33.58 
 
 
407 aa  121  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0583  sodium/hydrogen exchanger  30.46 
 
 
572 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0657  potassium/proton antiporter  27.91 
 
 
597 aa  110  9.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0833853 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  32.67 
 
 
221 aa  109  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0921  sodium/hydrogen exchanger  32.17 
 
 
574 aa  109  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0538395  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  34.3 
 
 
223 aa  109  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0160  potassium/proton antiporter  30.47 
 
 
498 aa  107  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.719209 
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  31.68 
 
 
221 aa  107  8e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  31.68 
 
 
221 aa  106  1e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05281  CPA1 family Na+/H+ antiporter  26.29 
 
 
414 aa  106  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0626531  normal  0.0646135 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1805  CPA1 family Na+/H+ antiporter  26.29 
 
 
414 aa  106  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.781588  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1590  potassium/proton antiporter  24.21 
 
 
498 aa  105  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.609323  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3728  sodium/hydrogen exchanger  25.38 
 
 
496 aa  104  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0572  sodium/hydrogen exchanger  30.94 
 
 
575 aa  103  9e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45090  potassium/proton antiporter  29.68 
 
 
582 aa  103  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00181989  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0640  CPA1 family Na+/H+ antiporter  28.98 
 
 
421 aa  103  1e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2255  sodium/hydrogen exchanger  28.93 
 
 
573 aa  103  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272655  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0502  potassium/proton antiporter  28.95 
 
 
580 aa  102  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>