More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0542 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0542  TrkA-N domain protein  100 
 
 
215 aa  430  1e-120  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.840001  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  35.94 
 
 
221 aa  154  8e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  35.94 
 
 
221 aa  153  2e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  34.56 
 
 
221 aa  149  3e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0242  TrkA-N domain protein  36.24 
 
 
221 aa  148  5e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  37.27 
 
 
443 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  33.33 
 
 
218 aa  146  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2082  TrkA-N domain protein  31.82 
 
 
218 aa  143  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.124657  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0254  TrkA-N domain protein  34.86 
 
 
221 aa  143  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.153232 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3757  TrkA-N domain protein  36.7 
 
 
217 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000992935  normal  0.446525 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1728  TrkA domain-containing protein  33.18 
 
 
218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000194267  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00290  K+ transport system, NAD-binding component  36.16 
 
 
226 aa  131  7.999999999999999e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1348  hypothetical protein  33.03 
 
 
220 aa  129  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0533287  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1655  TrkA domain-containing protein  32.26 
 
 
218 aa  128  6e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000867889  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1924  TrkA-N domain protein  33.79 
 
 
231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  31.6 
 
 
223 aa  124  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0251  TrkA-N domain protein  36 
 
 
225 aa  124  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2661  TrkA domain-containing protein  30.32 
 
 
220 aa  123  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.202256  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1520  TrkA-N domain protein  33.64 
 
 
218 aa  121  8e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2407  TrkA domain-containing protein  35.48 
 
 
220 aa  121  8e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163912  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1794  hypothetical protein  29.82 
 
 
222 aa  121  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1876  TrkA-N domain protein  32.26 
 
 
220 aa  120  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.416785  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3062  TrkA domain-containing protein  31.31 
 
 
227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.793731  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1399  TrkA domain-containing protein  31.86 
 
 
233 aa  118  7.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1712  TrkA-N domain protein  30.73 
 
 
219 aa  115  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.887824  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  33.95 
 
 
221 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1322  TrkA-like  33.33 
 
 
231 aa  115  5e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01280  K+ transport system, NAD-binding component  35.35 
 
 
225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2085  TrkA-N domain protein  29.73 
 
 
444 aa  113  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  33.49 
 
 
221 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0266  potassium transporter peripheral membrane component  37.31 
 
 
445 aa  112  3e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3071  TrkA domain-containing protein  34.1 
 
 
220 aa  112  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1485  TrkA domain-containing protein  31.96 
 
 
229 aa  112  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0637531  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2286  TrkA-N domain-containing protein  30.59 
 
 
219 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.241613 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1261  TrkA domain-containing protein  29.17 
 
 
219 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0914  potassium transporter peripheral membrane component  31.9 
 
 
450 aa  112  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  33.02 
 
 
221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5192  TrkA domain-containing protein  33.02 
 
 
259 aa  111  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0506525  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  33.49 
 
 
221 aa  111  8.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1450  TrkA domain-containing protein  31.51 
 
 
229 aa  111  9e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0807714  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6760  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  29.82 
 
 
223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0522309 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0161  TrkA domain-containing protein  32.62 
 
 
231 aa  108  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.825727 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1213  TrkA-N domain protein  27.27 
 
 
228 aa  108  6e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0014  TrkA domain-containing protein  33.64 
 
 
457 aa  108  8.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0240987 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1918  TrkA-N domain protein  30.91 
 
 
224 aa  108  8.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388192  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00140  potassium transporter peripheral membrane component  34.11 
 
 
457 aa  107  9.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35944  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0505  TrkA domain-containing protein  35.24 
 
 
229 aa  107  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3713  potassium transporter peripheral membrane component  32.39 
 
 
458 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.461523 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3606  potassium transporter peripheral membrane component  32.39 
 
 
458 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.454415 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3605  potassium transporter peripheral membrane component  32.39 
 
 
458 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.267887  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4514  potassium transporter peripheral membrane component  32.39 
 
 
458 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00906883  hitchhiker  0.00000865676 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3776  potassium transporter peripheral membrane component  32.39 
 
 
458 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3678  potassium transporter peripheral membrane component  32.39 
 
 
458 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0052  potassium transporter peripheral membrane component  32.09 
 
 
457 aa  106  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2904  TrkA domain-containing protein  29.95 
 
 
223 aa  105  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2911  potassium transporter peripheral membrane component  31.73 
 
 
449 aa  105  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000908908  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0014  potassium transporter peripheral membrane component  31.94 
 
 
458 aa  105  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00830339  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00170  potassium transporter peripheral membrane component  32.09 
 
 
457 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03140  potassium transporter peripheral membrane component  32.08 
 
 
458 aa  105  6e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.946548  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0424  TrkA-N domain protein  32.08 
 
 
458 aa  105  6e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3674  potassium transporter peripheral membrane component  32.08 
 
 
458 aa  105  6e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3585  potassium transporter peripheral membrane component  32.08 
 
 
458 aa  105  6e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.931761  normal  0.13042 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0424  potassium transporter peripheral membrane component  32.08 
 
 
458 aa  105  6e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000421391 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4612  potassium transporter peripheral membrane component  32.08 
 
 
458 aa  105  6e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00524775  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16160  K+ transport system, NAD-binding component  30.09 
 
 
249 aa  105  6e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.534565  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3483  potassium transporter peripheral membrane component  32.08 
 
 
458 aa  105  6e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0624843  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3772  potassium transporter peripheral membrane component  32.08 
 
 
458 aa  105  6e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.241443  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03091  hypothetical protein  32.08 
 
 
458 aa  105  6e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  33.33 
 
 
626 aa  105  7e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2196  TrkA-N  29.91 
 
 
222 aa  104  8e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2242  TrkA domain-containing protein  29.91 
 
 
222 aa  104  8e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.081798  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2185  TrkA domain-containing protein  29.91 
 
 
222 aa  104  8e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314676  normal  0.0103731 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1877  potassium transporter peripheral membrane component  29.13 
 
 
445 aa  104  9e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.113601 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0065  potassium transporter peripheral membrane component  32.14 
 
 
457 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948816  unclonable  0.000000448887 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0084  potassium transporter peripheral membrane component  32.14 
 
 
457 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.409393  hitchhiker  0.00000000549949 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0017  potassium transporter peripheral membrane component  31.63 
 
 
457 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.290257  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0081  potassium transporter peripheral membrane component  32.14 
 
 
457 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685696  normal  0.107342 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0081  potassium transporter peripheral membrane component  32.14 
 
 
457 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  hitchhiker  0.0000000000177319 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0745  TrkA domain-containing protein  31.22 
 
 
231 aa  104  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26958  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3928  TrkA domain-containing protein  30.22 
 
 
221 aa  104  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0399436  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0313  potassium transporter peripheral membrane component  32.39 
 
 
458 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.888467  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0612  potassium transporter peripheral membrane component  32.39 
 
 
458 aa  103  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0369792  normal  0.0559785 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3885  potassium transporter peripheral membrane component  32.39 
 
 
458 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0054195  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0072  potassium transporter peripheral membrane component  33.49 
 
 
458 aa  103  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1489  hypothetical protein  29.25 
 
 
218 aa  103  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00984888  normal  0.0109156 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0638  TrkA-N  27.98 
 
 
225 aa  102  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2476  potassium transporter peripheral membrane component  32.55 
 
 
458 aa  102  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1216  TrkA-N domain protein  28.18 
 
 
229 aa  103  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11630  TrkA-C domain protein  26.55 
 
 
207 aa  102  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2256  TrkA-N domain protein  30.23 
 
 
218 aa  102  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13318  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2472  TrkA domain-containing protein  29.78 
 
 
221 aa  102  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  32.72 
 
 
628 aa  102  5e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  33.94 
 
 
630 aa  102  6e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00394  potassium transporter peripheral membrane component  32.08 
 
 
458 aa  102  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1640  TrkA domain-containing protein  32.57 
 
 
253 aa  101  7e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0557692  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2267  TrkA-N domain protein  32.11 
 
 
459 aa  101  8e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.634076  hitchhiker  0.00765776 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2907  potassium transporter peripheral membrane component  31.98 
 
 
450 aa  101  9e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000237268  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4528  TrkA-N domain-containing protein  30 
 
 
222 aa  101  9e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.468661  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0637  TrkA-N  31.67 
 
 
219 aa  101  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0432302 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2079  TrkA-N domain protein  29.03 
 
 
225 aa  100  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>