More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2079 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2079  TrkA-N domain protein  100 
 
 		 225 aa  447  1e-125  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1216  TrkA-N domain protein  75.11 
 
 		 229 aa  340  1e-92  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1213  TrkA-N domain protein  73.78 
 
 		 228 aa  340  1e-92  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1489  hypothetical protein  39.42 
 
 		 218 aa  149  5e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00984888  normal  0.0109156 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0505  TrkA domain-containing protein  40.8 
 
 		 229 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1944  TrkA domain-containing protein  38.94 
 
 		 222 aa  131  7.999999999999999e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.772638 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  31.39 
 
 		 221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  31.67 
 
 		 221 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  31.22 
 
 		 221 aa  116  3e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  30.49 
 
 		 221 aa  113  3e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  28.89 
 
 		 221 aa  106  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  31.48 
 
 		 221 aa  105  7e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  29.52 
 
 		 221 aa  101  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1348  hypothetical protein  32.65 
 
 		 220 aa  96.3  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0533287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  29.77 
 
 		 443 aa  96.7  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4120  TrkA-N domain protein  34.85 
 
 		 132 aa  95.9  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1794  hypothetical protein  26.87 
 
 		 222 aa  95.1  7e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0914  potassium transporter peripheral membrane component  30.2 
 
 		 450 aa  93.2  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  33.17 
 
 		 223 aa  92.8  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002054  Trk system potassium uptake protein TrkA  29.05 
 
 		 458 aa  91.3  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0072  potassium transporter peripheral membrane component  29.38 
 
 		 458 aa  90.5  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2083  TrkA-N domain protein  32.48 
 
 		 210 aa  90.1  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2476  potassium transporter peripheral membrane component  28.91 
 
 		 458 aa  90.5  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3739  potassium transporter peripheral membrane component  28.38 
 
 		 469 aa  90.1  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00764602 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00394  potassium transporter peripheral membrane component  28.57 
 
 		 458 aa  88.6  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0038  potassium transporter peripheral membrane component  29.36 
 
 		 458 aa  88.2  8e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1186  potassium transporter peripheral membrane component  32.44 
 
 		 445 aa  88.2  9e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.596494  decreased coverage  0.00000028569 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2479  TrkA-N domain protein  34.12 
 
 		 445 aa  87.8  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0032  potassium transporter peripheral membrane component  27.48 
 
 		 469 aa  87.8  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0670474 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0035  potassium transporter peripheral membrane component  27.93 
 
 		 469 aa  86.7  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.154438 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1569  potassium transporter peripheral membrane component  29.36 
 
 		 458 aa  86.3  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0202479  normal  0.0449671 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2085  TrkA-N domain protein  31.67 
 
 		 444 aa  85.9  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4514  potassium transporter peripheral membrane component  26.67 
 
 		 458 aa  86.3  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00906883  hitchhiker  0.00000865676 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1363  sodium/hydrogen exchanger  29.67 
 
 		 610 aa  85.5  5e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00040523  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0028  potassium transporter peripheral membrane component  26.58 
 
 		 469 aa  85.5  6e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0542  TrkA-N domain protein  28.08 
 
 		 215 aa  85.5  6e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.840001  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0905  TrkA-N domain protein  26.42 
 
 		 225 aa  85.5  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0254  TrkA-N domain protein  27.01 
 
 		 221 aa  85.1  8e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.153232 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0243  TrkA-N domain protein  28.02 
 
 		 206 aa  84.7  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0040  potassium transporter peripheral membrane component  26.99 
 
 		 469 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.165147 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  27.66 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0029  potassium transporter peripheral membrane component  26.58 
 
 		 469 aa  84  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3126  potassium transporter peripheral membrane component  28.38 
 
 		 458 aa  83.6  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0187  potassium transporter peripheral membrane component  30.7 
 
 		 465 aa  83.6  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0021  potassium transporter peripheral membrane component  26.58 
 
 		 469 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1265  hypothetical protein  25.74 
 
 		 237 aa  82.8  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2911  potassium transporter peripheral membrane component  28.96 
 
 		 449 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000908908  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0028  potassium transporter peripheral membrane component  27.03 
 
 		 469 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.736909  normal  0.0141363 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0024  potassium transporter peripheral membrane component  27.03 
 
 		 469 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2907  potassium transporter peripheral membrane component  30 
 
 		 450 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000237268  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0028  potassium transporter peripheral membrane component  27.03 
 
 		 469 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000283519 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0029  potassium transporter peripheral membrane component  27.03 
 
 		 469 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.313972  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1454  TrkA-N domain protein  30.73 
 
 		 443 aa  82  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0242  TrkA-N domain protein  29.09 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00170  potassium transporter peripheral membrane component  27.14 
 
 		 457 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  29.72 
 
 		 371 aa  82  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0612  potassium transporter peripheral membrane component  26.19 
 
 		 458 aa  82  0.000000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0369792  normal  0.0559785 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0313  potassium transporter peripheral membrane component  26.19 
 
 		 458 aa  82  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.888467  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2082  TrkA-N domain protein  26.58 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.124657  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0017  potassium transporter peripheral membrane component  27.14 
 
 		 457 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.290257  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3885  potassium transporter peripheral membrane component  26.19 
 
 		 458 aa  82  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0054195  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00290  K+ transport system, NAD-binding component  35.25 
 
 		 226 aa  81.6  0.000000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0026  potassium transporter peripheral membrane component  26.99 
 
 		 469 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.570638  hitchhiker  0.00237688 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0024  potassium transporter peripheral membrane component  26.99 
 
 		 469 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.738729  normal  0.0894147 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0032  potassium transporter peripheral membrane component  26.99 
 
 		 469 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.21174  hitchhiker  0.00000689203 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1400  TrkA-N domain-containing protein  24.41 
 
 		 227 aa  81.3  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1728  TrkA domain-containing protein  31.15 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000194267  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1655  TrkA domain-containing protein  30.11 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000867889  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0266  potassium transporter peripheral membrane component  27.51 
 
 		 445 aa  80.5  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0065  potassium transporter peripheral membrane component  27.14 
 
 		 457 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948816  unclonable  0.000000448887 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0081  potassium transporter peripheral membrane component  27.14 
 
 		 457 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685696  normal  0.107342 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4396  potassium transporter peripheral membrane component  31.43 
 
 		 458 aa  80.9  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0641614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0084  potassium transporter peripheral membrane component  27.14 
 
 		 457 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.409393  hitchhiker  0.00000000549949 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0312  potassium transporter peripheral membrane component  26.07 
 
 		 449 aa  80.9  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0720169  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0081  potassium transporter peripheral membrane component  27.14 
 
 		 457 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  hitchhiker  0.0000000000177319 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2455  potassium transporter peripheral membrane component  27.23 
 
 		 452 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.341783  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3335  sodium/hydrogen exchanger  30.62 
 
 		 620 aa  79.7  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12243  putative potassium uptake protein  24.14 
 
 		 449 aa  79.3  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0637  TrkA-N  26.54 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0432302 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00019  potassium transporter peripheral membrane component  28.91 
 
 		 459 aa  79.3  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0699  TrkA-N domain protein  30.81 
 
 		 444 aa  79.3  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0021  potassium transporter peripheral membrane component  26.55 
 
 		 469 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881079  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3673  TrkA-N domain protein  32.69 
 
 		 444 aa  79  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728396  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0014  potassium transporter peripheral membrane component  26.07 
 
 		 458 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00830339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1877  potassium transporter peripheral membrane component  30.33 
 
 		 445 aa  78.2  0.00000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.113601 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1590  potassium transporter peripheral membrane component  25.47 
 
 		 449 aa  78.2  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00906485  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3183  potassium transporter peripheral membrane component  23.94 
 
 		 465 aa  77.4  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00657284  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0353  potassium transporter peripheral membrane component  25.59 
 
 		 458 aa  77  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0251  TrkA-N domain protein  35.11 
 
 		 225 aa  77  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3430  potassium transporter peripheral membrane component  27.6 
 
 		 448 aa  77  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0375932  normal  0.146617 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1067  hypothetical protein  24.41 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521072 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3971  potassium transporter peripheral membrane component  25.24 
 
 		 458 aa  77  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0755481  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2242  potassium transporter peripheral membrane component  28.05 
 
 		 458 aa  77  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0521644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1615  potassium transporter peripheral membrane component  28.38 
 
 		 458 aa  77.4  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0021  potassium transporter peripheral membrane component  24.77 
 
 		 469 aa  77  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1685  TrkA domain-containing protein  32.06 
 
 		 153 aa  77  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.124287  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2841  potassium transporter peripheral membrane component  27.52 
 
 		 458 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.340173  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1041  TrkA domain-containing protein  27.2 
 
 		 452 aa  76.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1322  TrkA-like  29.91 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1453  potassium transporter peripheral membrane component  27.52 
 
 		 458 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.687964  normal  0.06884 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>