More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1261 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1261  TrkA domain-containing protein  100 
 
 		 219 aa  432  1e-120  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1728  TrkA domain-containing protein  45.32 
 
 		 218 aa  205  5e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000194267  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1655  TrkA domain-containing protein  43.54 
 
 		 218 aa  200  9.999999999999999e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000867889  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1686  TrkA domain-containing protein  41.36 
 
 		 219 aa  172  1.9999999999999998e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0415019  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0254  TrkA-N domain protein  34.72 
 
 		 221 aa  172  3.9999999999999995e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.153232 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11630  TrkA-C domain protein  42.29 
 
 		 207 aa  171  7.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  30.28 
 
 		 218 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2082  TrkA-N domain protein  34.6 
 
 		 218 aa  138  6e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.124657  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  30.28 
 
 		 221 aa  135  5e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  30.28 
 
 		 221 aa  134  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  30.14 
 
 		 221 aa  134  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0242  TrkA-N domain protein  31.67 
 
 		 221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1794  hypothetical protein  29.03 
 
 		 222 aa  125  6e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1348  hypothetical protein  32.5 
 
 		 220 aa  122  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0533287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  32.88 
 
 		 221 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  28.9 
 
 		 223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2911  potassium transporter peripheral membrane component  33.33 
 
 		 449 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000908908  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  32.88 
 
 		 221 aa  115  6e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0266  potassium transporter peripheral membrane component  31.37 
 
 		 445 aa  115  6e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  32.42 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2661  TrkA domain-containing protein  29.35 
 
 		 220 aa  112  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.202256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  32.42 
 
 		 221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2407  TrkA domain-containing protein  30.54 
 
 		 220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3126  potassium transporter peripheral membrane component  30.43 
 
 		 458 aa  107  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2907  potassium transporter peripheral membrane component  30.7 
 
 		 450 aa  107  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000237268  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3071  TrkA domain-containing protein  30.54 
 
 		 220 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1310  potassium transporter peripheral membrane component  28.7 
 
 		 444 aa  105  5e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  29.19 
 
 		 443 aa  105  7e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2196  TrkA-N  28.96 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2242  TrkA domain-containing protein  28.96 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.081798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2185  TrkA domain-containing protein  28.96 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314676  normal  0.0103731 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3757  TrkA-N domain protein  28.17 
 
 		 217 aa  102  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000992935  normal  0.446525 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1399  TrkA domain-containing protein  27.65 
 
 		 233 aa  102  5e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1924  TrkA-N domain protein  27.36 
 
 		 231 aa  102  6e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0542  TrkA-N domain protein  28.57 
 
 		 215 aa  101  8e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.840001  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3062  TrkA domain-containing protein  28.77 
 
 		 227 aa  101  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.793731  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12707  trk system potassium uptake protein ceoC  32.14 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.44928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1633  TrkA-N domain protein  28.96 
 
 		 299 aa  99.8  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2472  TrkA domain-containing protein  28.96 
 
 		 221 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1520  TrkA-N domain protein  26.27 
 
 		 218 aa  99.4  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2256  TrkA-N domain protein  29.27 
 
 		 218 aa  99.4  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13318  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3928  TrkA domain-containing protein  28.96 
 
 		 221 aa  99.4  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0399436  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2267  TrkA-N domain protein  28.37 
 
 		 459 aa  98.6  6e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.634076  hitchhiker  0.00765776 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1876  TrkA-N domain protein  27.06 
 
 		 220 aa  97.4  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.416785  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1615  potassium transporter peripheral membrane component  29.3 
 
 		 458 aa  96.7  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6760  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  25.23 
 
 		 223 aa  96.7  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0522309 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3335  sodium/hydrogen exchanger  30 
 
 		 620 aa  97.4  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1712  TrkA-N domain protein  26.36 
 
 		 219 aa  97.1  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.887824  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2085  TrkA-N domain protein  26.73 
 
 		 444 aa  96.3  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3424  potassium transporter peripheral membrane component  26.51 
 
 		 448 aa  95.9  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2904  TrkA domain-containing protein  28.16 
 
 		 223 aa  95.9  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2286  TrkA-N domain-containing protein  25.69 
 
 		 219 aa  94.7  8e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.241613 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0638  TrkA-N  26.91 
 
 		 225 aa  94.7  8e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1093  potassium transporter peripheral membrane component  28.17 
 
 		 458 aa  94.7  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.915935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2406  TrkA domain-containing protein  22.86 
 
 		 214 aa  94.7  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.716891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1640  TrkA domain-containing protein  27.6 
 
 		 253 aa  94.7  9e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0557692  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1450  TrkA domain-containing protein  26.76 
 
 		 229 aa  94.4  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0807714  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3072  TrkA domain-containing protein  23.08 
 
 		 214 aa  94.4  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1114  potassium transporter peripheral membrane component  27.49 
 
 		 458 aa  94  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1877  potassium transporter peripheral membrane component  26.96 
 
 		 445 aa  94  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.113601 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1072  potassium transporter peripheral membrane component  27.49 
 
 		 458 aa  93.6  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1485  TrkA domain-containing protein  26.76 
 
 		 229 aa  93.6  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0637531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0914  potassium transporter peripheral membrane component  29.13 
 
 		 450 aa  92.8  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16160  K+ transport system, NAD-binding component  27.8 
 
 		 249 aa  92.8  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.534565  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2209  potassium transporter peripheral membrane component  27.49 
 
 		 458 aa  92.4  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0819  potassium transporter peripheral membrane component  26.51 
 
 		 437 aa  92.8  4e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1209  potassium transporter peripheral membrane component  27.57 
 
 		 448 aa  92.4  5e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.356485  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0637  TrkA-N  27.23 
 
 		 219 aa  92  7e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0432302 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1920  TrkA domain-containing protein  27.06 
 
 		 224 aa  91.7  7e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  26.24 
 
 		 628 aa  90.9  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1561  TrkA-N domain protein  25.81 
 
 		 219 aa  91.3  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534326  normal  0.490374 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2030  potassium transporter peripheral membrane component  28.5 
 
 		 465 aa  90.9  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0693486  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1322  TrkA-like  27.19 
 
 		 231 aa  91.3  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0734  TrkA-N domain protein  27.31 
 
 		 450 aa  90.5  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0052  potassium transporter peripheral membrane component  28.02 
 
 		 457 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2479  TrkA-N domain protein  27.45 
 
 		 445 aa  90.1  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1186  potassium transporter peripheral membrane component  23.9 
 
 		 445 aa  90.5  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.596494  decreased coverage  0.00000028569 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0699  TrkA-N domain protein  24.75 
 
 		 444 aa  90.5  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4396  potassium transporter peripheral membrane component  28.37 
 
 		 458 aa  89.7  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0641614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4528  TrkA-N domain-containing protein  26.48 
 
 		 222 aa  89.7  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.468661  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0040  potassium transporter peripheral membrane component  27.09 
 
 		 467 aa  89.7  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1707  TrkA-N domain protein  27.32 
 
 		 224 aa  89.4  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102172  normal  0.0591298 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0201  potassium transporter peripheral membrane component  29.44 
 
 		 457 aa  89.4  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0211158  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1406  TrkA-N domain protein  26.09 
 
 		 225 aa  89  5e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.699899  normal  0.545013 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0014  potassium transporter peripheral membrane component  30.19 
 
 		 458 aa  89  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00830339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  28.16 
 
 		 630 aa  87.4  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2455  potassium transporter peripheral membrane component  29.36 
 
 		 452 aa  87.8  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.341783  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3218  potassium transporter peripheral membrane component  26.22 
 
 		 454 aa  87.8  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.715113  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1641  TrkA-N domain protein  26.09 
 
 		 233 aa  87.8  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  0.0943946 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5192  TrkA domain-containing protein  26.61 
 
 		 259 aa  87  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0506525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1918  TrkA-N domain protein  26.34 
 
 		 224 aa  87  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388192  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3430  potassium transporter peripheral membrane component  26.05 
 
 		 448 aa  87  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0375932  normal  0.146617 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00170  potassium transporter peripheral membrane component  25.84 
 
 		 457 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12243  putative potassium uptake protein  26.98 
 
 		 449 aa  87  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0769  TrkA-N domain protein  28.43 
 
 		 445 aa  85.9  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.601936 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01280  K+ transport system, NAD-binding component  25.12 
 
 		 225 aa  85.9  5e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00290  K+ transport system, NAD-binding component  24.53 
 
 		 226 aa  85.5  5e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3265  hypothetical protein  31.4 
 
 		 612 aa  85.1  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.769883  normal  0.438481 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0180  Trk system potassium uptake protein TrkA  26.11 
 
 		 457 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0312  potassium transporter peripheral membrane component  26.58 
 
 		 449 aa  84.3  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0720169  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>