More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1655 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_1655  TrkA domain-containing protein  100 
 
 
218 aa  432  1e-120  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000867889  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1728  TrkA domain-containing protein  94.95 
 
 
218 aa  413  9.999999999999999e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000194267  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1261  TrkA domain-containing protein  43.54 
 
 
219 aa  200  9.999999999999999e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0254  TrkA-N domain protein  38.81 
 
 
221 aa  177  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.153232 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1686  TrkA domain-containing protein  40.09 
 
 
219 aa  166  2.9999999999999998e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0415019  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11630  TrkA-C domain protein  41.48 
 
 
207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0242  TrkA-N domain protein  37.74 
 
 
221 aa  142  3e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  32.86 
 
 
218 aa  137  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2082  TrkA-N domain protein  29.36 
 
 
218 aa  136  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.124657  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1794  hypothetical protein  30.32 
 
 
222 aa  124  9e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  30.92 
 
 
221 aa  123  2e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  31.28 
 
 
221 aa  122  4e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  29.03 
 
 
221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0542  TrkA-N domain protein  31.86 
 
 
215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.840001  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1348  hypothetical protein  32.57 
 
 
220 aa  117  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0533287  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1924  TrkA-N domain protein  31.96 
 
 
231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  30.05 
 
 
223 aa  104  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1520  TrkA-N domain protein  28.85 
 
 
218 aa  102  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2407  TrkA domain-containing protein  31.96 
 
 
220 aa  99.4  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163912  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2661  TrkA domain-containing protein  29.55 
 
 
220 aa  99.4  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.202256  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1918  TrkA-N domain protein  29.86 
 
 
224 aa  98.6  6e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388192  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2030  potassium transporter peripheral membrane component  29.3 
 
 
465 aa  98.6  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0693486  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2256  TrkA-N domain protein  29.49 
 
 
218 aa  97.8  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13318  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2196  TrkA-N  30.28 
 
 
222 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3126  potassium transporter peripheral membrane component  29.17 
 
 
458 aa  97.4  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2242  TrkA domain-containing protein  30.28 
 
 
222 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.081798  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3063  TrkA domain-containing protein  29.35 
 
 
214 aa  97.4  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2185  TrkA domain-containing protein  30.28 
 
 
222 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314676  normal  0.0103731 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3335  sodium/hydrogen exchanger  28.37 
 
 
620 aa  96.7  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0914  potassium transporter peripheral membrane component  30.41 
 
 
450 aa  96.3  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3757  TrkA-N domain protein  29.03 
 
 
217 aa  95.9  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000992935  normal  0.446525 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16160  K+ transport system, NAD-binding component  27.62 
 
 
249 aa  95.9  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.534565  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2911  potassium transporter peripheral membrane component  31.46 
 
 
449 aa  95.1  8e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000908908  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1876  TrkA-N domain protein  26.73 
 
 
220 aa  94.7  9e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.416785  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3071  TrkA domain-containing protein  32.06 
 
 
220 aa  94.4  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1640  TrkA domain-containing protein  29.86 
 
 
253 aa  94.7  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0557692  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1633  TrkA-N domain protein  29.38 
 
 
299 aa  92.8  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2660  TrkA domain-containing protein  30.88 
 
 
214 aa  92.8  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0646767  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01280  K+ transport system, NAD-binding component  30.94 
 
 
225 aa  92  5e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1093  potassium transporter peripheral membrane component  28.7 
 
 
458 aa  92  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.915935  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1681  potassium transporter peripheral membrane component  31.34 
 
 
458 aa  92  6e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  26.92 
 
 
221 aa  91.3  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2907  potassium transporter peripheral membrane component  32.04 
 
 
450 aa  90.1  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000237268  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  27.4 
 
 
221 aa  89.4  4e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2455  potassium transporter peripheral membrane component  29.44 
 
 
452 aa  89.4  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.341783  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0638  TrkA-N  28.51 
 
 
225 aa  89.4  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6760  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  28.44 
 
 
223 aa  89.4  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0522309 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2286  TrkA-N domain-containing protein  27.73 
 
 
219 aa  89.4  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.241613 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1485  TrkA domain-containing protein  27.4 
 
 
229 aa  89.4  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0637531  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1450  TrkA domain-containing protein  27.4 
 
 
229 aa  89  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0807714  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3062  TrkA domain-containing protein  28.64 
 
 
227 aa  88.6  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.793731  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  27.14 
 
 
221 aa  88.6  7e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  27.65 
 
 
443 aa  88.2  8e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1970  potassium transporter peripheral membrane component  27.91 
 
 
453 aa  87.8  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.616677  normal  0.0915611 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3424  potassium transporter peripheral membrane component  29.95 
 
 
448 aa  87  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1399  TrkA-N domain protein  29.65 
 
 
455 aa  86.7  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000200171  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1712  TrkA-N domain protein  27.15 
 
 
219 aa  86.7  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.887824  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  26.67 
 
 
221 aa  87  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1944  TrkA domain-containing protein  30.1 
 
 
222 aa  86.3  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.772638 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4396  potassium transporter peripheral membrane component  29.03 
 
 
458 aa  85.9  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0641614  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1469  TrkA-N domain protein  30.48 
 
 
454 aa  85.1  7e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1310  potassium transporter peripheral membrane component  29.11 
 
 
444 aa  84.3  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1941  TrkA-N domain protein  27.88 
 
 
241 aa  83.6  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0298197 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00290  K+ transport system, NAD-binding component  31.48 
 
 
226 aa  83.6  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1406  TrkA-N domain protein  27.94 
 
 
225 aa  83.6  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.699899  normal  0.545013 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3928  TrkA domain-containing protein  27.98 
 
 
221 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0399436  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1322  TrkA-like  30.33 
 
 
231 aa  83.2  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2472  TrkA domain-containing protein  27.52 
 
 
221 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0251  TrkA-N domain protein  29.86 
 
 
225 aa  83.2  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5192  TrkA domain-containing protein  29.82 
 
 
259 aa  82.8  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0506525  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4528  TrkA-N domain-containing protein  26.58 
 
 
222 aa  82.4  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.468661  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0266  potassium transporter peripheral membrane component  30.05 
 
 
445 aa  82.4  0.000000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1877  potassium transporter peripheral membrane component  28.43 
 
 
445 aa  82  0.000000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.113601 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2267  TrkA-N domain protein  26.96 
 
 
459 aa  82  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.634076  hitchhiker  0.00765776 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1072  potassium transporter peripheral membrane component  26.39 
 
 
458 aa  82  0.000000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  29.91 
 
 
628 aa  82  0.000000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  29.72 
 
 
626 aa  81.6  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1114  potassium transporter peripheral membrane component  26.39 
 
 
458 aa  82  0.000000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3218  potassium transporter peripheral membrane component  28.31 
 
 
454 aa  81.6  0.000000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.715113  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0547  K+ transport systems NAD-binding subunit  26.24 
 
 
219 aa  81.6  0.000000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1920  TrkA domain-containing protein  27.98 
 
 
224 aa  81.6  0.000000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3430  potassium transporter peripheral membrane component  28.11 
 
 
448 aa  80.9  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0375932  normal  0.146617 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2079  TrkA-N domain protein  30.11 
 
 
225 aa  80.9  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2904  TrkA domain-containing protein  25.35 
 
 
223 aa  80.9  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0745  TrkA domain-containing protein  24.14 
 
 
231 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26958  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2209  potassium transporter peripheral membrane component  25.93 
 
 
458 aa  80.1  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0312  potassium transporter peripheral membrane component  26.79 
 
 
449 aa  80.1  0.00000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0720169  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1216  TrkA-N domain protein  26.98 
 
 
229 aa  79.3  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4126  potassium transporter peripheral membrane component  25.35 
 
 
458 aa  79.3  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.215607  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1489  hypothetical protein  27.4 
 
 
218 aa  79.3  0.00000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00984888  normal  0.0109156 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5999  potassium transporter peripheral membrane component  27.6 
 
 
485 aa  79  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0135992 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12243  putative potassium uptake protein  27.31 
 
 
449 aa  79  0.00000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  29.58 
 
 
630 aa  79  0.00000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1399  TrkA domain-containing protein  26.15 
 
 
233 aa  79  0.00000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0890  TrkA-C domain protein  28.57 
 
 
446 aa  79  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000220881  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1707  TrkA-N domain protein  25.91 
 
 
224 aa  79  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102172  normal  0.0591298 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12707  trk system potassium uptake protein ceoC  28.99 
 
 
220 aa  78.2  0.00000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.44928  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00170  potassium transporter peripheral membrane component  27.59 
 
 
457 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2406  TrkA domain-containing protein  25 
 
 
214 aa  77.8  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.716891  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2242  potassium transporter peripheral membrane component  27.52 
 
 
458 aa  77.8  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0521644  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>