287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0890 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0890  TrkA-C domain protein  100 
 
 
446 aa  893    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000220881  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2907  potassium transporter peripheral membrane component  30.24 
 
 
450 aa  208  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000237268  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0734  TrkA-N domain protein  29.95 
 
 
450 aa  204  2e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1186  potassium transporter peripheral membrane component  28.73 
 
 
445 aa  202  9.999999999999999e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.596494  decreased coverage  0.00000028569 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0266  potassium transporter peripheral membrane component  27.66 
 
 
445 aa  201  3e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0914  potassium transporter peripheral membrane component  28.82 
 
 
450 aa  201  3e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2085  TrkA-N domain protein  27.31 
 
 
444 aa  197  4.0000000000000005e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3126  potassium transporter peripheral membrane component  29.35 
 
 
458 aa  195  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2911  potassium transporter peripheral membrane component  26.93 
 
 
449 aa  195  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000908908  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0699  TrkA-N domain protein  27.48 
 
 
444 aa  193  5e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  26.07 
 
 
443 aa  191  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3885  potassium transporter peripheral membrane component  27.87 
 
 
458 aa  187  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0054195  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0612  potassium transporter peripheral membrane component  27.87 
 
 
458 aa  187  4e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0369792  normal  0.0559785 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0313  potassium transporter peripheral membrane component  27.87 
 
 
458 aa  187  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.888467  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1877  potassium transporter peripheral membrane component  27.49 
 
 
445 aa  186  7e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.113601 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1970  potassium transporter peripheral membrane component  28.79 
 
 
453 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.616677  normal  0.0915611 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4396  potassium transporter peripheral membrane component  27.52 
 
 
458 aa  184  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0641614  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0040  potassium transporter peripheral membrane component  27.71 
 
 
467 aa  181  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4514  potassium transporter peripheral membrane component  26.97 
 
 
458 aa  180  4.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00906883  hitchhiker  0.00000865676 
 
 
-
 
NC_004310  BR1114  potassium transporter peripheral membrane component  28.09 
 
 
458 aa  178  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1072  potassium transporter peripheral membrane component  27.64 
 
 
458 aa  178  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3776  potassium transporter peripheral membrane component  27.42 
 
 
458 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3713  potassium transporter peripheral membrane component  27.42 
 
 
458 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.461523 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1093  potassium transporter peripheral membrane component  27.33 
 
 
458 aa  177  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.915935  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3606  potassium transporter peripheral membrane component  27.42 
 
 
458 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.454415 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3678  potassium transporter peripheral membrane component  27.42 
 
 
458 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3605  potassium transporter peripheral membrane component  27.42 
 
 
458 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.267887  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03140  potassium transporter peripheral membrane component  27.42 
 
 
458 aa  176  9e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.946548  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0424  TrkA-N domain protein  27.42 
 
 
458 aa  176  9e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4612  potassium transporter peripheral membrane component  27.42 
 
 
458 aa  176  9e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00524775  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3772  potassium transporter peripheral membrane component  27.42 
 
 
458 aa  176  9e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.241443  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3674  potassium transporter peripheral membrane component  27.42 
 
 
458 aa  176  9e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3585  potassium transporter peripheral membrane component  27.42 
 
 
458 aa  176  9e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.931761  normal  0.13042 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0424  potassium transporter peripheral membrane component  27.42 
 
 
458 aa  176  9e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000421391 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3483  potassium transporter peripheral membrane component  27.42 
 
 
458 aa  176  9e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0624843  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03091  hypothetical protein  27.42 
 
 
458 aa  176  9e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00140  potassium transporter peripheral membrane component  27.96 
 
 
457 aa  175  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35944  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1615  potassium transporter peripheral membrane component  28.76 
 
 
458 aa  176  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0436  potassium transporter peripheral membrane component  27.33 
 
 
458 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4082  potassium transporter peripheral membrane component  25.27 
 
 
467 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3721  potassium transporter peripheral membrane component  26.97 
 
 
458 aa  175  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.455601  hitchhiker  0.00773793 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0052  potassium transporter peripheral membrane component  25.95 
 
 
457 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2209  potassium transporter peripheral membrane component  27.64 
 
 
458 aa  173  6.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3792  potassium transporter peripheral membrane component  27.05 
 
 
458 aa  172  7.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1041  TrkA domain-containing protein  24.29 
 
 
452 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0353  potassium transporter peripheral membrane component  26.42 
 
 
458 aa  171  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3971  potassium transporter peripheral membrane component  27.05 
 
 
458 aa  171  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0755481  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2455  potassium transporter peripheral membrane component  25.71 
 
 
452 aa  171  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.341783  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00394  potassium transporter peripheral membrane component  26.39 
 
 
458 aa  171  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002054  Trk system potassium uptake protein TrkA  26.39 
 
 
458 aa  171  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0180  Trk system potassium uptake protein TrkA  26.07 
 
 
457 aa  170  4e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2841  potassium transporter peripheral membrane component  27.29 
 
 
458 aa  170  5e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.340173  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1453  potassium transporter peripheral membrane component  27.29 
 
 
458 aa  170  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.687964  normal  0.06884 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0016  potassium transporter peripheral membrane component  25.88 
 
 
457 aa  170  6e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1569  potassium transporter peripheral membrane component  28.23 
 
 
458 aa  170  6e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0202479  normal  0.0449671 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3673  TrkA-N domain protein  26.9 
 
 
444 aa  169  1e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728396  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0020  potassium transporter peripheral membrane component  26.23 
 
 
457 aa  168  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0017  potassium transporter peripheral membrane component  26.62 
 
 
457 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.290257  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1310  potassium transporter peripheral membrane component  25.96 
 
 
444 aa  168  2e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1681  potassium transporter peripheral membrane component  27.58 
 
 
458 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0084  potassium transporter peripheral membrane component  26.4 
 
 
457 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.409393  hitchhiker  0.00000000549949 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1491  potassium transporter peripheral membrane component  27.23 
 
 
458 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.404255 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0065  potassium transporter peripheral membrane component  26.17 
 
 
457 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948816  unclonable  0.000000448887 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1469  TrkA-N domain protein  26.8 
 
 
454 aa  167  5e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0081  potassium transporter peripheral membrane component  26.17 
 
 
457 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  hitchhiker  0.0000000000177319 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3424  potassium transporter peripheral membrane component  26.52 
 
 
448 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3430  potassium transporter peripheral membrane component  26.36 
 
 
448 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0375932  normal  0.146617 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0014  potassium transporter peripheral membrane component  25.89 
 
 
458 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00830339  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0081  potassium transporter peripheral membrane component  26.17 
 
 
457 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685696  normal  0.107342 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1445  potassium transporter peripheral membrane component  24.77 
 
 
457 aa  166  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000607771 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00170  potassium transporter peripheral membrane component  26.4 
 
 
457 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0544  potassium transporter peripheral membrane component  27.91 
 
 
458 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.027133  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2030  potassium transporter peripheral membrane component  23.95 
 
 
465 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0693486  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2267  TrkA-N domain protein  25.27 
 
 
459 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.634076  hitchhiker  0.00765776 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2479  TrkA-N domain protein  25.11 
 
 
445 aa  163  5.0000000000000005e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2476  potassium transporter peripheral membrane component  26.21 
 
 
458 aa  163  5.0000000000000005e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0072  potassium transporter peripheral membrane component  25.72 
 
 
458 aa  163  6e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0030  potassium transporter peripheral membrane component  24.68 
 
 
454 aa  162  9e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0187  potassium transporter peripheral membrane component  25.97 
 
 
465 aa  160  3e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_29  cation transport protein, Trk system  24.46 
 
 
454 aa  160  4e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0769  TrkA-N domain protein  25.68 
 
 
445 aa  160  6e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.601936 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3020  potassium transporter peripheral membrane component  25.56 
 
 
457 aa  159  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0026  potassium transporter peripheral membrane component  25.71 
 
 
469 aa  159  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.570638  hitchhiker  0.00237688 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0024  potassium transporter peripheral membrane component  25.71 
 
 
469 aa  159  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.738729  normal  0.0894147 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0032  potassium transporter peripheral membrane component  25.71 
 
 
469 aa  159  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.21174  hitchhiker  0.00000689203 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5096  TrkA-N domain protein  23.13 
 
 
448 aa  159  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0029  potassium transporter peripheral membrane component  25.93 
 
 
469 aa  158  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0021  potassium transporter peripheral membrane component  25.93 
 
 
469 aa  158  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0081  potassium transporter peripheral membrane component  26.21 
 
 
458 aa  157  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0028  potassium transporter peripheral membrane component  25.6 
 
 
469 aa  157  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0032  potassium transporter peripheral membrane component  25.05 
 
 
469 aa  155  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0670474 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2242  potassium transporter peripheral membrane component  27.19 
 
 
458 aa  155  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0521644  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0035  potassium transporter peripheral membrane component  24.62 
 
 
469 aa  154  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.154438 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1590  potassium transporter peripheral membrane component  25.61 
 
 
449 aa  153  5.9999999999999996e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00906485  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12243  putative potassium uptake protein  27.48 
 
 
449 aa  153  7e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0021  potassium transporter peripheral membrane component  25.05 
 
 
469 aa  152  8e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881079  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0017  potassium transporter peripheral membrane component  26.07 
 
 
458 aa  152  8.999999999999999e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0028  potassium transporter peripheral membrane component  24.62 
 
 
469 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000283519 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2872  potassium transporter peripheral membrane component  25.28 
 
 
457 aa  152  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0029  potassium transporter peripheral membrane component  24.62 
 
 
469 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.313972  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>