More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1941 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1941  TrkA-N domain protein  100 
 
 		 241 aa  476  1e-133  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0298197 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1707  TrkA-N domain protein  75.11 
 
 		 224 aa  337  7e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102172  normal  0.0591298 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16160  K+ transport system, NAD-binding component  68.05 
 
 		 249 aa  335  2.9999999999999997e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.534565  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1918  TrkA-N domain protein  68.12 
 
 		 224 aa  311  6.999999999999999e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388192  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1561  TrkA-N domain protein  70.94 
 
 		 219 aa  294  1e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534326  normal  0.490374 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1406  TrkA-N domain protein  68.47 
 
 		 225 aa  291  8e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.699899  normal  0.545013 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1712  TrkA-N domain protein  63.77 
 
 		 219 aa  274  9e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.887824  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6760  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  63.29 
 
 		 223 aa  268  8e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0522309 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4528  TrkA-N domain-containing protein  62.8 
 
 		 222 aa  267  1e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.468661  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2286  TrkA-N domain-containing protein  62.8 
 
 		 219 aa  266  2e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.241613 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1399  TrkA domain-containing protein  58.8 
 
 		 233 aa  265  5.999999999999999e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1641  TrkA-N domain protein  63.55 
 
 		 233 aa  263  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  0.0943946 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1633  TrkA-N domain protein  56.43 
 
 		 299 aa  262  4e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1640  TrkA domain-containing protein  57.85 
 
 		 253 aa  261  8.999999999999999e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0557692  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2904  TrkA domain-containing protein  60.49 
 
 		 223 aa  257  1e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1485  TrkA domain-containing protein  58.94 
 
 		 229 aa  249  3e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0637531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1450  TrkA domain-containing protein  58.94 
 
 		 229 aa  248  5e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0807714  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1322  TrkA-like  55.36 
 
 		 231 aa  246  2e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5192  TrkA domain-containing protein  59.07 
 
 		 259 aa  246  3e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0506525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1520  TrkA-N domain protein  56.02 
 
 		 218 aa  244  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3757  TrkA-N domain protein  56.94 
 
 		 217 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000992935  normal  0.446525 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2256  TrkA-N domain protein  56.88 
 
 		 218 aa  238  5e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13318  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2196  TrkA-N  57.97 
 
 		 222 aa  237  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2242  TrkA domain-containing protein  57.97 
 
 		 222 aa  237  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.081798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2185  TrkA domain-containing protein  57.97 
 
 		 222 aa  237  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314676  normal  0.0103731 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1876  TrkA-N domain protein  57.14 
 
 		 220 aa  236  2e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.416785  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3928  TrkA domain-containing protein  57.49 
 
 		 221 aa  236  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0399436  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2472  TrkA domain-containing protein  58.13 
 
 		 221 aa  235  4e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12707  trk system potassium uptake protein ceoC  55.38 
 
 		 220 aa  224  1e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.44928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0161  TrkA domain-containing protein  47.89 
 
 		 231 aa  207  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.825727 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13080  K+ transport system, NAD-binding component  48.94 
 
 		 227 aa  204  8e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0024035  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0745  TrkA domain-containing protein  47.89 
 
 		 231 aa  203  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1929  putative potassium uptake protein  52.36 
 
 		 229 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.123463  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1924  TrkA-N domain protein  48.39 
 
 		 231 aa  195  6e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2875  TrkA-N domain protein  50.71 
 
 		 226 aa  177  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  35.45 
 
 		 218 aa  134  9e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3062  TrkA domain-containing protein  37.14 
 
 		 227 aa  132  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.793731  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2661  TrkA domain-containing protein  37.32 
 
 		 220 aa  130  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.202256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  33.33 
 
 		 221 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  33.33 
 
 		 221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2407  TrkA domain-containing protein  35.44 
 
 		 220 aa  129  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163912  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  32.68 
 
 		 221 aa  128  8.000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3071  TrkA domain-containing protein  35.44 
 
 		 220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2082  TrkA-N domain protein  33.85 
 
 		 218 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.124657  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0638  TrkA-N  30.73 
 
 		 225 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0242  TrkA-N domain protein  29.67 
 
 		 221 aa  111  9e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0254  TrkA-N domain protein  28.92 
 
 		 221 aa  111  9e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.153232 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  33.33 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1794  hypothetical protein  32.2 
 
 		 222 aa  106  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1348  hypothetical protein  33.33 
 
 		 220 aa  102  7e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0533287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  27.67 
 
 		 221 aa  97.1  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  27.94 
 
 		 221 aa  97.4  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  27.94 
 
 		 221 aa  97.4  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  28.92 
 
 		 221 aa  96.7  3e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  30.59 
 
 		 443 aa  95.5  7e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2849  potassium transporter peripheral membrane component  27.91 
 
 		 457 aa  95.1  9e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.336578  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0187  potassium transporter peripheral membrane component  26.64 
 
 		 465 aa  93.2  3e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0017  potassium transporter peripheral membrane component  29.91 
 
 		 457 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.290257  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0072  potassium transporter peripheral membrane component  28.3 
 
 		 458 aa  90.1  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0052  potassium transporter peripheral membrane component  28.5 
 
 		 457 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  31.67 
 
 		 626 aa  89.7  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00170  potassium transporter peripheral membrane component  29.44 
 
 		 457 aa  89  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1728  TrkA domain-containing protein  28.37 
 
 		 218 aa  89  7e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000194267  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0065  potassium transporter peripheral membrane component  29.65 
 
 		 457 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948816  unclonable  0.000000448887 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00290  K+ transport system, NAD-binding component  39.42 
 
 		 226 aa  87.8  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0081  potassium transporter peripheral membrane component  29.65 
 
 		 457 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  hitchhiker  0.0000000000177319 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0081  potassium transporter peripheral membrane component  29.65 
 
 		 457 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685696  normal  0.107342 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0084  potassium transporter peripheral membrane component  29.65 
 
 		 457 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.409393  hitchhiker  0.00000000549949 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11630  TrkA-C domain protein  28.09 
 
 		 207 aa  87.8  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2479  TrkA-N domain protein  34.27 
 
 		 445 aa  87.4  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0014  potassium transporter peripheral membrane component  30.04 
 
 		 458 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00830339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00394  potassium transporter peripheral membrane component  27.83 
 
 		 458 aa  85.5  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1681  potassium transporter peripheral membrane component  31.56 
 
 		 458 aa  85.5  7e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2476  potassium transporter peripheral membrane component  27.36 
 
 		 458 aa  85.1  9e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  37.31 
 
 		 630 aa  85.1  9e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01280  K+ transport system, NAD-binding component  32.98 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002054  Trk system potassium uptake protein TrkA  27.83 
 
 		 458 aa  84.7  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0542  TrkA-N domain protein  27.51 
 
 		 215 aa  84.7  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.840001  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2085  TrkA-N domain protein  33.33 
 
 		 444 aa  84  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4126  potassium transporter peripheral membrane component  29.82 
 
 		 458 aa  84  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.215607  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1655  TrkA domain-containing protein  27.88 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000867889  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3218  potassium transporter peripheral membrane component  28.37 
 
 		 454 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.715113  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0914  potassium transporter peripheral membrane component  27.59 
 
 		 450 aa  83.2  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0251  TrkA-N domain protein  31.34 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1261  TrkA domain-containing protein  26.21 
 
 		 219 aa  82  0.000000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0180  Trk system potassium uptake protein TrkA  27.96 
 
 		 457 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0266  potassium transporter peripheral membrane component  29.85 
 
 		 445 aa  81.3  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0018  potassium transporter peripheral membrane component  27.49 
 
 		 477 aa  81.6  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.265003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0201  potassium transporter peripheral membrane component  27.49 
 
 		 457 aa  81.3  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0211158  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1590  potassium transporter peripheral membrane component  23.77 
 
 		 449 aa  80.9  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00906485  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00140  potassium transporter peripheral membrane component  27.1 
 
 		 457 aa  80.1  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35944  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0312  potassium transporter peripheral membrane component  26.01 
 
 		 449 aa  79.7  0.00000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0720169  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3424  potassium transporter peripheral membrane component  25.23 
 
 		 448 aa  79.7  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0016  potassium transporter peripheral membrane component  27.57 
 
 		 457 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2872  potassium transporter peripheral membrane component  27.91 
 
 		 457 aa  79  0.00000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2258  TrkA-N domain protein  30.24 
 
 		 236 aa  79  0.00000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4514  potassium transporter peripheral membrane component  25.46 
 
 		 458 aa  77.8  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00906883  hitchhiker  0.00000865676 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0029  potassium transporter peripheral membrane component  25.56 
 
 		 469 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0028  potassium transporter peripheral membrane component  25.56 
 
 		 469 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.736909  normal  0.0141363 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2907  potassium transporter peripheral membrane component  29.25 
 
 		 450 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000237268  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>