More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2875 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2875  TrkA-N domain protein  100 
 
 		 226 aa  427  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1929  putative potassium uptake protein  60.44 
 
 		 229 aa  249  3e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.123463  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1712  TrkA-N domain protein  54.67 
 
 		 219 aa  204  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.887824  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2286  TrkA-N domain-containing protein  53.6 
 
 		 219 aa  203  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.241613 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1399  TrkA domain-containing protein  52.19 
 
 		 233 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6760  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  52.68 
 
 		 223 aa  196  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0522309 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1561  TrkA-N domain protein  51.12 
 
 		 219 aa  194  6e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534326  normal  0.490374 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2904  TrkA domain-containing protein  48.86 
 
 		 223 aa  195  6e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4528  TrkA-N domain-containing protein  52.38 
 
 		 222 aa  192  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.468661  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1520  TrkA-N domain protein  51.58 
 
 		 218 aa  188  5.999999999999999e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2256  TrkA-N domain protein  51.63 
 
 		 218 aa  187  8e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13318  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1485  TrkA domain-containing protein  49.78 
 
 		 229 aa  187  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0637531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3757  TrkA-N domain protein  52.27 
 
 		 217 aa  186  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000992935  normal  0.446525 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1450  TrkA domain-containing protein  49.78 
 
 		 229 aa  186  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0807714  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1876  TrkA-N domain protein  48.23 
 
 		 220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.416785  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2196  TrkA-N  49.1 
 
 		 222 aa  180  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2242  TrkA domain-containing protein  49.1 
 
 		 222 aa  180  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.081798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2185  TrkA domain-containing protein  49.1 
 
 		 222 aa  180  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314676  normal  0.0103731 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1641  TrkA-N domain protein  50.71 
 
 		 233 aa  180  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  0.0943946 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1406  TrkA-N domain protein  46.19 
 
 		 225 aa  177  9e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.699899  normal  0.545013 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1322  TrkA-like  49.32 
 
 		 231 aa  177  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1941  TrkA-N domain protein  50.71 
 
 		 241 aa  177  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0298197 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16160  K+ transport system, NAD-binding component  46.85 
 
 		 249 aa  174  8e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.534565  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1918  TrkA-N domain protein  48.4 
 
 		 224 aa  174  9.999999999999999e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388192  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5192  TrkA domain-containing protein  50 
 
 		 259 aa  172  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0506525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2472  TrkA domain-containing protein  48.2 
 
 		 221 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3928  TrkA domain-containing protein  45.95 
 
 		 221 aa  171  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0399436  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1707  TrkA-N domain protein  46.58 
 
 		 224 aa  167  8e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102172  normal  0.0591298 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0161  TrkA domain-containing protein  45.54 
 
 		 231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.825727 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0745  TrkA domain-containing protein  43.36 
 
 		 231 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1640  TrkA domain-containing protein  60.16 
 
 		 253 aa  159  4e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0557692  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12707  trk system potassium uptake protein ceoC  45.37 
 
 		 220 aa  158  7e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.44928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1633  TrkA-N domain protein  58.59 
 
 		 299 aa  156  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1924  TrkA-N domain protein  45.09 
 
 		 231 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13080  K+ transport system, NAD-binding component  42.86 
 
 		 227 aa  132  3e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0024035  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3062  TrkA domain-containing protein  36.12 
 
 		 227 aa  101  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.793731  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2661  TrkA domain-containing protein  35.56 
 
 		 220 aa  97.1  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.202256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  35.05 
 
 		 218 aa  96.7  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1348  hypothetical protein  36.73 
 
 		 220 aa  95.5  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0533287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  34.43 
 
 		 223 aa  91.3  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  30.95 
 
 		 221 aa  89.4  4e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2407  TrkA domain-containing protein  32.42 
 
 		 220 aa  88.6  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2082  TrkA-N domain protein  29.9 
 
 		 218 aa  87.4  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.124657  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  28.89 
 
 		 221 aa  86.3  3e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1794  hypothetical protein  29.78 
 
 		 222 aa  85.9  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  28.89 
 
 		 221 aa  85.1  7e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3071  TrkA domain-containing protein  32.23 
 
 		 220 aa  84.3  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1877  potassium transporter peripheral membrane component  32.11 
 
 		 445 aa  83.6  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.113601 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  28 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0638  TrkA-N  29.15 
 
 		 225 aa  80.5  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  29.15 
 
 		 630 aa  80.1  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00290  K+ transport system, NAD-binding component  34.2 
 
 		 226 aa  78.2  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  34.11 
 
 		 221 aa  77.4  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1209  potassium transporter peripheral membrane component  33.18 
 
 		 448 aa  77  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.356485  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  28.91 
 
 		 221 aa  77.4  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  34.11 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1186  potassium transporter peripheral membrane component  29.49 
 
 		 445 aa  75.5  0.0000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.596494  decreased coverage  0.00000028569 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0251  TrkA-N domain protein  31.51 
 
 		 225 aa  74.7  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1262  TrkA domain-containing protein  33.33 
 
 		 141 aa  74.7  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4514  potassium transporter peripheral membrane component  28.33 
 
 		 458 aa  74.7  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00906883  hitchhiker  0.00000865676 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2849  potassium transporter peripheral membrane component  25.86 
 
 		 457 aa  74.3  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.336578  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0819  potassium transporter peripheral membrane component  29.49 
 
 		 437 aa  73.6  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0436  potassium transporter peripheral membrane component  27.9 
 
 		 458 aa  73.2  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  30.99 
 
 		 617 aa  72.8  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0914  potassium transporter peripheral membrane component  25.22 
 
 		 450 aa  72.8  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0769  TrkA-N domain protein  31.28 
 
 		 445 aa  70.9  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.601936 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3971  potassium transporter peripheral membrane component  29.18 
 
 		 458 aa  71.2  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0755481  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1213  TrkA-N domain protein  33.16 
 
 		 228 aa  71.2  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  28.89 
 
 		 626 aa  70.9  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0353  potassium transporter peripheral membrane component  27.04 
 
 		 458 aa  70.9  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5096  TrkA-N domain protein  29.3 
 
 		 448 aa  70.5  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4396  potassium transporter peripheral membrane component  28.44 
 
 		 458 aa  70.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0641614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1310  potassium transporter peripheral membrane component  29.86 
 
 		 444 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  30.56 
 
 		 443 aa  70.5  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3792  potassium transporter peripheral membrane component  29.18 
 
 		 458 aa  70.9  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0242  TrkA-N domain protein  27.88 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3424  potassium transporter peripheral membrane component  30.32 
 
 		 448 aa  69.7  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0072  potassium transporter peripheral membrane component  28.45 
 
 		 458 aa  70.1  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2267  TrkA-N domain protein  27.9 
 
 		 459 aa  70.1  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.634076  hitchhiker  0.00765776 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1216  TrkA-N domain protein  30.57 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0021  potassium transporter peripheral membrane component  27.76 
 
 		 469 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00170  potassium transporter peripheral membrane component  28.14 
 
 		 457 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4082  potassium transporter peripheral membrane component  27.23 
 
 		 467 aa  69.3  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0313  potassium transporter peripheral membrane component  27.04 
 
 		 458 aa  69.3  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.888467  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0612  potassium transporter peripheral membrane component  27.04 
 
 		 458 aa  69.3  0.00000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0369792  normal  0.0559785 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01280  K+ transport system, NAD-binding component  35.08 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3885  potassium transporter peripheral membrane component  27.04 
 
 		 458 aa  69.3  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0054195  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0699  TrkA-N domain protein  29.86 
 
 		 444 aa  68.9  0.00000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3606  potassium transporter peripheral membrane component  27.04 
 
 		 458 aa  68.6  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.454415 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3605  potassium transporter peripheral membrane component  27.04 
 
 		 458 aa  68.6  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.267887  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3713  potassium transporter peripheral membrane component  27.04 
 
 		 458 aa  68.6  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.461523 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3678  potassium transporter peripheral membrane component  27.04 
 
 		 458 aa  68.6  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3776  potassium transporter peripheral membrane component  27.04 
 
 		 458 aa  68.6  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12706  trk system potassium uptake protein ceoB  29.81 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0035  potassium transporter peripheral membrane component  26.02 
 
 		 469 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.154438 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0038  potassium transporter peripheral membrane component  27.47 
 
 		 458 aa  68.6  0.00000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1261  TrkA domain-containing protein  28.79 
 
 		 219 aa  68.2  0.00000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0040  potassium transporter peripheral membrane component  27.64 
 
 		 469 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.165147 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0017  potassium transporter peripheral membrane component  27.71 
 
 		 457 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.290257  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00394  potassium transporter peripheral membrane component  27.97 
 
 		 458 aa  68.2  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>