More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5192 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5192  TrkA domain-containing protein  100 
 
 		 259 aa  502  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0506525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1322  TrkA-like  82.14 
 
 		 231 aa  360  1e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2286  TrkA-N domain-containing protein  73.15 
 
 		 219 aa  305  4.0000000000000004e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.241613 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6760  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  72.48 
 
 		 223 aa  302  4.0000000000000003e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0522309 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1712  TrkA-N domain protein  70.18 
 
 		 219 aa  300  1e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.887824  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1399  TrkA domain-containing protein  72.22 
 
 		 233 aa  297  9e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1641  TrkA-N domain protein  68.97 
 
 		 233 aa  279  3e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  0.0943946 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2904  TrkA domain-containing protein  63.43 
 
 		 223 aa  270  2e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1450  TrkA domain-containing protein  62.88 
 
 		 229 aa  265  4e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0807714  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1485  TrkA domain-containing protein  65.57 
 
 		 229 aa  265  7e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0637531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3757  TrkA-N domain protein  64.39 
 
 		 217 aa  261  6.999999999999999e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000992935  normal  0.446525 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4528  TrkA-N domain-containing protein  65.09 
 
 		 222 aa  261  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.468661  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1520  TrkA-N domain protein  61.4 
 
 		 218 aa  255  6e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16160  K+ transport system, NAD-binding component  57.14 
 
 		 249 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.534565  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1876  TrkA-N domain protein  60.45 
 
 		 220 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.416785  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2196  TrkA-N  62.5 
 
 		 222 aa  252  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2242  TrkA domain-containing protein  62.5 
 
 		 222 aa  252  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.081798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2185  TrkA domain-containing protein  62.5 
 
 		 222 aa  252  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314676  normal  0.0103731 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1561  TrkA-N domain protein  61.29 
 
 		 219 aa  250  1e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534326  normal  0.490374 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1707  TrkA-N domain protein  58.37 
 
 		 224 aa  246  2e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102172  normal  0.0591298 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1941  TrkA-N domain protein  59.07 
 
 		 241 aa  246  3e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0298197 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2256  TrkA-N domain protein  62.26 
 
 		 218 aa  244  6.999999999999999e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13318  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2472  TrkA domain-containing protein  61.11 
 
 		 221 aa  242  5e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3928  TrkA domain-containing protein  60.65 
 
 		 221 aa  238  5e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0399436  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1640  TrkA domain-containing protein  57.87 
 
 		 253 aa  236  3e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0557692  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1918  TrkA-N domain protein  55.2 
 
 		 224 aa  236  3e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388192  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1633  TrkA-N domain protein  56.94 
 
 		 299 aa  236  4e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1406  TrkA-N domain protein  53.21 
 
 		 225 aa  235  7e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.699899  normal  0.545013 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12707  trk system potassium uptake protein ceoC  59.02 
 
 		 220 aa  231  9e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.44928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0161  TrkA domain-containing protein  50 
 
 		 231 aa  212  5.999999999999999e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.825727 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0745  TrkA domain-containing protein  47.77 
 
 		 231 aa  207  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1924  TrkA-N domain protein  51.15 
 
 		 231 aa  202  5e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1929  putative potassium uptake protein  53.33 
 
 		 229 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.123463  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13080  K+ transport system, NAD-binding component  49.76 
 
 		 227 aa  182  4.0000000000000006e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0024035  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2875  TrkA-N domain protein  50 
 
 		 226 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3062  TrkA domain-containing protein  42.29 
 
 		 227 aa  160  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.793731  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2661  TrkA domain-containing protein  41.82 
 
 		 220 aa  157  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.202256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0638  TrkA-N  39.42 
 
 		 225 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  34.42 
 
 		 218 aa  142  6e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2407  TrkA domain-containing protein  35.61 
 
 		 220 aa  139  4.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3071  TrkA domain-containing protein  35.92 
 
 		 220 aa  133  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  36.89 
 
 		 223 aa  122  7e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  32.71 
 
 		 221 aa  121  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1348  hypothetical protein  34.7 
 
 		 220 aa  121  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0533287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  32.39 
 
 		 221 aa  121  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2082  TrkA-N domain protein  31.34 
 
 		 218 aa  120  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.124657  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  31.92 
 
 		 221 aa  118  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0242  TrkA-N domain protein  29.11 
 
 		 221 aa  107  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1794  hypothetical protein  30.58 
 
 		 222 aa  102  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0542  TrkA-N domain protein  34.17 
 
 		 215 aa  101  9e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.840001  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11630  TrkA-C domain protein  30.05 
 
 		 207 aa  98.2  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  31.51 
 
 		 626 aa  96.7  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0254  TrkA-N domain protein  26.15 
 
 		 221 aa  95.9  6e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.153232 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0914  potassium transporter peripheral membrane component  30.22 
 
 		 450 aa  94.7  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  31.7 
 
 		 630 aa  92.8  5e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  32.7 
 
 		 443 aa  92.4  7e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2267  TrkA-N domain protein  30.81 
 
 		 459 aa  91.3  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.634076  hitchhiker  0.00765776 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01280  K+ transport system, NAD-binding component  32.74 
 
 		 225 aa  90.1  3e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0251  TrkA-N domain protein  30.8 
 
 		 225 aa  89.4  5e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2907  potassium transporter peripheral membrane component  32.04 
 
 		 450 aa  89  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000237268  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  29.71 
 
 		 628 aa  89  7e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00290  K+ transport system, NAD-binding component  31.28 
 
 		 226 aa  89  7e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0020  potassium transporter peripheral membrane component  31.75 
 
 		 457 aa  88.2  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1261  TrkA domain-containing protein  26.61 
 
 		 219 aa  87  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2911  potassium transporter peripheral membrane component  33.94 
 
 		 449 aa  87.4  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000908908  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0112  TrkA-N domain protein  32.27 
 
 		 617 aa  86.3  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0065  potassium transporter peripheral membrane component  29.63 
 
 		 457 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948816  unclonable  0.000000448887 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1877  potassium transporter peripheral membrane component  35.19 
 
 		 445 aa  86.3  5e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.113601 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00170  potassium transporter peripheral membrane component  30.56 
 
 		 457 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0081  potassium transporter peripheral membrane component  29.63 
 
 		 457 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  hitchhiker  0.0000000000177319 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2849  potassium transporter peripheral membrane component  24.78 
 
 		 457 aa  85.5  8e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.336578  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  27.01 
 
 		 221 aa  85.1  9e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  27.01 
 
 		 221 aa  84.7  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0081  potassium transporter peripheral membrane component  29.17 
 
 		 457 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685696  normal  0.107342 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1728  TrkA domain-containing protein  30.59 
 
 		 218 aa  84.3  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000194267  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00140  potassium transporter peripheral membrane component  29.25 
 
 		 457 aa  84.3  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35944  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0052  potassium transporter peripheral membrane component  29.81 
 
 		 457 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0017  potassium transporter peripheral membrane component  30.09 
 
 		 457 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.290257  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1655  TrkA domain-containing protein  29.82 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000867889  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  27.01 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0084  potassium transporter peripheral membrane component  29.17 
 
 		 457 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.409393  hitchhiker  0.00000000549949 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3126  potassium transporter peripheral membrane component  29.03 
 
 		 458 aa  82.4  0.000000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1944  TrkA domain-containing protein  32.54 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.772638 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  26.54 
 
 		 221 aa  82  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1216  TrkA-N domain protein  30.4 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1877  TrkA-N domain protein  29.61 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.608746  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2622  potassium transporter peripheral membrane component  28.64 
 
 		 458 aa  80.9  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637696 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2258  TrkA-N domain protein  30.88 
 
 		 236 aa  81.3  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12706  trk system potassium uptake protein ceoB  30.19 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0014  potassium transporter peripheral membrane component  28.37 
 
 		 458 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00830339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1681  potassium transporter peripheral membrane component  30.09 
 
 		 458 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3020  potassium transporter peripheral membrane component  28.64 
 
 		 457 aa  79.3  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0266  potassium transporter peripheral membrane component  30.33 
 
 		 445 aa  79.3  0.00000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0180  Trk system potassium uptake protein TrkA  30.1 
 
 		 457 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1213  TrkA-N domain protein  30.26 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3424  potassium transporter peripheral membrane component  29.38 
 
 		 448 aa  78.6  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2479  TrkA-N domain protein  29.39 
 
 		 445 aa  78.6  0.00000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3437  potassium transporter peripheral membrane component  29.55 
 
 		 452 aa  78.6  0.00000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0201  potassium transporter peripheral membrane component  29.13 
 
 		 457 aa  78.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0211158  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0187  potassium transporter peripheral membrane component  27.67 
 
 		 465 aa  78.2  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>