More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0161 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0161  TrkA domain-containing protein  100 
 
 
231 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.825727 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0745  TrkA domain-containing protein  86.15 
 
 
231 aa  402  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26958  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1520  TrkA-N domain protein  59.73 
 
 
218 aa  253  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1450  TrkA domain-containing protein  53.68 
 
 
229 aa  244  8e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0807714  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3757  TrkA-N domain protein  56.56 
 
 
217 aa  244  9.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000992935  normal  0.446525 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4528  TrkA-N domain-containing protein  52.4 
 
 
222 aa  243  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.468661  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1485  TrkA domain-containing protein  53.25 
 
 
229 aa  241  5e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0637531  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1399  TrkA domain-containing protein  56.25 
 
 
233 aa  239  2e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1876  TrkA-N domain protein  52.44 
 
 
220 aa  239  4e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.416785  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1712  TrkA-N domain protein  53.1 
 
 
219 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.887824  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6760  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  51.95 
 
 
223 aa  229  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0522309 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2256  TrkA-N domain protein  52 
 
 
218 aa  228  6e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13318  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2286  TrkA-N domain-containing protein  53.1 
 
 
219 aa  228  8e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.241613 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2904  TrkA domain-containing protein  51.1 
 
 
223 aa  227  1e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1641  TrkA-N domain protein  55.92 
 
 
233 aa  225  5.0000000000000005e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  0.0943946 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2196  TrkA-N  51.09 
 
 
222 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2242  TrkA domain-containing protein  51.09 
 
 
222 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.081798  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2185  TrkA domain-containing protein  51.09 
 
 
222 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314676  normal  0.0103731 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3928  TrkA domain-containing protein  50.66 
 
 
221 aa  221  8e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0399436  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1561  TrkA-N domain protein  50 
 
 
219 aa  221  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534326  normal  0.490374 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2472  TrkA domain-containing protein  52.23 
 
 
221 aa  218  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16160  K+ transport system, NAD-binding component  50.24 
 
 
249 aa  216  2e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.534565  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1707  TrkA-N domain protein  48.17 
 
 
224 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102172  normal  0.0591298 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1918  TrkA-N domain protein  49.09 
 
 
224 aa  212  2.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388192  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5192  TrkA domain-containing protein  50 
 
 
259 aa  212  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0506525  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1941  TrkA-N domain protein  47.89 
 
 
241 aa  207  1e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0298197 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12707  trk system potassium uptake protein ceoC  50 
 
 
220 aa  204  9e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.44928  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1406  TrkA-N domain protein  46.92 
 
 
225 aa  203  2e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.699899  normal  0.545013 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1322  TrkA-like  45.78 
 
 
231 aa  198  6e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1640  TrkA domain-containing protein  40.69 
 
 
253 aa  194  8.000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0557692  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1633  TrkA-N domain protein  40.89 
 
 
299 aa  190  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1929  putative potassium uptake protein  42.49 
 
 
229 aa  171  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.123463  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2875  TrkA-N domain protein  45.54 
 
 
226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220378  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13080  K+ transport system, NAD-binding component  40.27 
 
 
227 aa  155  7e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0024035  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1924  TrkA-N domain protein  38.33 
 
 
231 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2407  TrkA domain-containing protein  32.08 
 
 
220 aa  115  7.999999999999999e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163912  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3071  TrkA domain-containing protein  32.55 
 
 
220 aa  112  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  31.84 
 
 
218 aa  106  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  29.13 
 
 
221 aa  102  4e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2082  TrkA-N domain protein  29.52 
 
 
218 aa  102  6e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.124657  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  32.13 
 
 
223 aa  101  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  29.2 
 
 
221 aa  100  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2661  TrkA domain-containing protein  30.26 
 
 
220 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.202256  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  28.26 
 
 
221 aa  99.4  4e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0542  TrkA-N domain protein  32.56 
 
 
215 aa  99.4  4e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.840001  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1348  hypothetical protein  32.38 
 
 
220 aa  95.5  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0533287  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3062  TrkA domain-containing protein  30.81 
 
 
227 aa  94.4  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.793731  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0638  TrkA-N  27.31 
 
 
225 aa  92.4  5e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0254  TrkA-N domain protein  25.44 
 
 
221 aa  87.8  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.153232 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  27.16 
 
 
221 aa  83.2  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  27.16 
 
 
221 aa  82.4  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1794  hypothetical protein  28.05 
 
 
222 aa  82  0.000000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  27.59 
 
 
221 aa  81.3  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  27.68 
 
 
221 aa  81.3  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1184  TrkA-N domain protein  30.13 
 
 
218 aa  80.9  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  29.82 
 
 
443 aa  79  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1728  TrkA domain-containing protein  24.14 
 
 
218 aa  78.2  0.00000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000194267  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1261  TrkA domain-containing protein  26.27 
 
 
219 aa  77.8  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  31.31 
 
 
626 aa  76.3  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2479  TrkA-N domain protein  31.02 
 
 
445 aa  75.5  0.0000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0242  TrkA-N domain protein  24.02 
 
 
221 aa  75.5  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0769  TrkA-N domain protein  27.88 
 
 
445 aa  73.2  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.601936 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1655  TrkA domain-containing protein  25.45 
 
 
218 aa  73.6  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000867889  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0201  potassium transporter peripheral membrane component  29.15 
 
 
457 aa  73.2  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0211158  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01280  K+ transport system, NAD-binding component  29.79 
 
 
225 aa  72.8  0.000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2849  potassium transporter peripheral membrane component  26.91 
 
 
457 aa  71.6  0.000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.336578  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  30.33 
 
 
628 aa  71.6  0.000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1363  sodium/hydrogen exchanger  27.84 
 
 
610 aa  71.2  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00040523  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  26.78 
 
 
630 aa  70.1  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12706  trk system potassium uptake protein ceoB  30.28 
 
 
227 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2406  TrkA domain-containing protein  29.06 
 
 
214 aa  69.7  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.716891  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11630  TrkA-C domain protein  27.38 
 
 
207 aa  69.7  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1686  TrkA domain-containing protein  22.64 
 
 
219 aa  67.8  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0415019  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1539  TrkA-N domain protein  29.15 
 
 
222 aa  67.8  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.465203  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1262  TrkA domain-containing protein  31.39 
 
 
141 aa  67.8  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0088  potassium transporter peripheral membrane component  27.03 
 
 
462 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0266  potassium transporter peripheral membrane component  28.84 
 
 
445 aa  66.6  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00290  K+ transport system, NAD-binding component  31.31 
 
 
226 aa  66.6  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3072  TrkA domain-containing protein  30.23 
 
 
214 aa  66.2  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2267  TrkA-N domain protein  26.76 
 
 
459 aa  66.2  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.634076  hitchhiker  0.00765776 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2872  potassium transporter peripheral membrane component  26.17 
 
 
457 aa  65.5  0.0000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3424  potassium transporter peripheral membrane component  28.18 
 
 
448 aa  65.5  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0020  potassium transporter peripheral membrane component  30.77 
 
 
457 aa  65.5  0.0000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1445  potassium transporter peripheral membrane component  31.6 
 
 
457 aa  65.1  0.0000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000607771 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0180  Trk system potassium uptake protein TrkA  25.47 
 
 
457 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3971  potassium transporter peripheral membrane component  27.31 
 
 
458 aa  64.7  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0755481  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2911  potassium transporter peripheral membrane component  28.7 
 
 
449 aa  64.7  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000908908  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0014  potassium transporter peripheral membrane component  26.42 
 
 
458 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00830339  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2258  TrkA-N domain protein  26.75 
 
 
236 aa  63.5  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0251  TrkA-N domain protein  33.06 
 
 
225 aa  63.2  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0436  potassium transporter peripheral membrane component  26.83 
 
 
458 aa  63.5  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00394  potassium transporter peripheral membrane component  28.46 
 
 
458 aa  63.2  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2622  potassium transporter peripheral membrane component  26.76 
 
 
458 aa  62.8  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.637696 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1276  TrkA-N domain protein  28.16 
 
 
228 aa  62.8  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.283168  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0072  potassium transporter peripheral membrane component  27.69 
 
 
458 aa  62.8  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2476  potassium transporter peripheral membrane component  28.05 
 
 
458 aa  62.4  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00140  potassium transporter peripheral membrane component  26.42 
 
 
457 aa  62  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35944  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0914  potassium transporter peripheral membrane component  25.12 
 
 
450 aa  62  0.000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0052  potassium transporter peripheral membrane component  25.71 
 
 
457 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4396  potassium transporter peripheral membrane component  29.41 
 
 
458 aa  61.2  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0641614  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>