More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1539 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1539  TrkA-N domain protein  100 
 
 		 222 aa  443  1.0000000000000001e-124  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.465203  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1184  TrkA-N domain protein  72.56 
 
 		 218 aa  323  2e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2420  TrkA-N domain protein  61.4 
 
 		 220 aa  255  3e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1173  TrkA-N domain protein  58.14 
 
 		 221 aa  249  3e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2258  TrkA-N domain protein  53.67 
 
 		 236 aa  239  2.9999999999999997e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0633  TrkA-N domain protein  50.92 
 
 		 248 aa  221  7e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1276  TrkA-N domain protein  49.32 
 
 		 228 aa  219  3.9999999999999997e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.283168  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1602  TrkA-N domain protein  51.83 
 
 		 228 aa  205  5e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.316093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  32.11 
 
 		 443 aa  84  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  28.07 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1918  TrkA-N domain protein  28.64 
 
 		 224 aa  75.1  0.0000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388192  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  29 
 
 		 221 aa  75.1  0.0000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  27.36 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3757  TrkA-N domain protein  30.1 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000992935  normal  0.446525 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  26.32 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1485  TrkA domain-containing protein  30.05 
 
 		 229 aa  72  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0637531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1754  hypothetical protein  29.03 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  28.57 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0914  potassium transporter peripheral membrane component  26.7 
 
 		 450 aa  70.5  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0085  K+ transport systems, NAD-binding component  25.33 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.73294e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2030  potassium transporter peripheral membrane component  28.26 
 
 		 465 aa  69.7  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0693486  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1794  hypothetical protein  25.35 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4528  TrkA-N domain-containing protein  28.24 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.468661  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1520  TrkA-N domain protein  28.9 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0017  potassium transporter peripheral membrane component  28.02 
 
 		 458 aa  68.6  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0542  TrkA-N domain protein  26.63 
 
 		 215 aa  68.2  0.00000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.840001  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0161  TrkA domain-containing protein  29.15 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.825727 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1633  TrkA-N domain protein  28.82 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  28.57 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16160  K+ transport system, NAD-binding component  27.67 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.534565  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  27.71 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2286  TrkA-N domain-containing protein  27.67 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.241613 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0187  potassium transporter peripheral membrane component  27.71 
 
 		 465 aa  65.5  0.0000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1322  TrkA-like  26.91 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1406  TrkA-N domain protein  26.75 
 
 		 225 aa  64.7  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.699899  normal  0.545013 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1876  TrkA-N domain protein  29.7 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.416785  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  26.36 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1970  potassium transporter peripheral membrane component  31.05 
 
 		 453 aa  64.7  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.616677  normal  0.0915611 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12706  trk system potassium uptake protein ceoB  30.14 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1707  TrkA-N domain protein  27.94 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102172  normal  0.0591298 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0242  TrkA domain-containing protein  28.23 
 
 		 668 aa  63.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0807  TrkA-N domain protein  37.72 
 
 		 137 aa  63.5  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1399  TrkA domain-containing protein  25.69 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13070  K+ transport system, NAD-binding component  29.87 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00265603  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0201  potassium transporter peripheral membrane component  29.76 
 
 		 457 aa  63.5  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0211158  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1640  TrkA domain-containing protein  25.34 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0557692  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0819  potassium transporter peripheral membrane component  26.61 
 
 		 437 aa  62.8  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5192  TrkA domain-containing protein  25.79 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0506525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2185  TrkA domain-containing protein  28.5 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314676  normal  0.0103731 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2285  TrkA-N domain-containing protein  29 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.311674 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2196  TrkA-N  28.5 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2242  TrkA domain-containing protein  28.5 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.081798  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12243  putative potassium uptake protein  25.43 
 
 		 449 aa  62.4  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6760  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  25.73 
 
 		 223 aa  62  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0522309 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2904  TrkA domain-containing protein  25.62 
 
 		 223 aa  62  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0745  TrkA domain-containing protein  27.93 
 
 		 231 aa  62  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  27.98 
 
 		 223 aa  62  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1469  TrkA-N domain protein  28.84 
 
 		 454 aa  61.6  0.000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2907  potassium transporter peripheral membrane component  29.44 
 
 		 450 aa  61.2  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000237268  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0018  potassium transporter peripheral membrane component  29.2 
 
 		 477 aa  60.8  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.265003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0243  TrkA-N domain protein  32.35 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2472  TrkA domain-containing protein  30.43 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1941  TrkA-N domain protein  27.43 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0298197 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1041  TrkA domain-containing protein  32.28 
 
 		 452 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2407  TrkA domain-containing protein  30.24 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0112  TrkA-N domain protein  42.86 
 
 		 617 aa  60.5  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1826  TrkA-N domain protein  29.17 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1561  TrkA-N domain protein  27.98 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534326  normal  0.490374 
 
 
-
 
NC_002936  DET0027  potassium uptake protein, putative  39.45 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.248151  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2566  TrkA-N  26.87 
 
 		 366 aa  60.1  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2083  TrkA-N domain protein  33.04 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3928  TrkA domain-containing protein  28.81 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0399436  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2680  TrkA domain-containing protein  26 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000338081  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0769  TrkA-N domain protein  24.67 
 
 		 445 aa  58.9  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.601936 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1976  sodium/hydrogen exchanger  34.13 
 
 		 666 aa  59.3  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0132674  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1399  TrkA-N domain protein  25.76 
 
 		 455 aa  58.9  0.00000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000200171  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3072  TrkA domain-containing protein  33.64 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_29  cation transport protein, Trk system  26.42 
 
 		 454 aa  58.9  0.00000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_26  cation transport protein, Trk system  39.45 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0437885  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0026  TrkA domain-containing protein  39.45 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2406  TrkA domain-containing protein  33.64 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.716891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3063  TrkA domain-containing protein  27.32 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11690  TrkA-N domain protein  31.4 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00343321  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0065  potassium transporter peripheral membrane component  28.07 
 
 		 457 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948816  unclonable  0.000000448887 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0081  potassium transporter peripheral membrane component  28.07 
 
 		 457 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  hitchhiker  0.0000000000177319 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0612  potassium transporter peripheral membrane component  27.88 
 
 		 458 aa  58.2  0.00000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0369792  normal  0.0559785 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0313  potassium transporter peripheral membrane component  27.88 
 
 		 458 aa  58.2  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.888467  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0081  potassium transporter peripheral membrane component  28.07 
 
 		 457 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685696  normal  0.107342 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3885  potassium transporter peripheral membrane component  27.88 
 
 		 458 aa  58.2  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0054195  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0254  TrkA-N domain protein  23.32 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.153232 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0084  potassium transporter peripheral membrane component  28.07 
 
 		 457 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.409393  hitchhiker  0.00000000549949 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3020  potassium transporter peripheral membrane component  28 
 
 		 457 aa  57.8  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0890  TrkA-C domain protein  21.95 
 
 		 446 aa  58.2  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000220881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0379  VIC family potassium channel protein  27.04 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2314  VIC family potassium channel protein  25.7 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.537657  normal  0.229836 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3071  TrkA domain-containing protein  29.76 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2197  TrkA-N  30.73 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2622  potassium transporter peripheral membrane component  27.88 
 
 		 458 aa  57.8  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637696 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3792  potassium transporter peripheral membrane component  27.43 
 
 		 458 aa  57.8  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2243  TrkA domain-containing protein  30.73 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20721  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>