More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0112 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0112  TrkA-N domain protein  100 
 
 		 617 aa  1189    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  53.71 
 
 		 617 aa  603  1.0000000000000001e-171  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  54.55 
 
 		 626 aa  564  1.0000000000000001e-159  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  52.49 
 
 		 630 aa  550  1e-155  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  52.67 
 
 		 628 aa  545  1e-154  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1363  sodium/hydrogen exchanger  37.13 
 
 		 610 aa  394  1e-108  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00040523  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3265  hypothetical protein  33 
 
 		 612 aa  363  4e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.769883  normal  0.438481 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3335  sodium/hydrogen exchanger  33.12 
 
 		 620 aa  280  4e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3229  sodium/hydrogen exchanger  35.76 
 
 		 652 aa  242  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2891  sodium/hydrogen exchanger  35.76 
 
 		 652 aa  242  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04922  Na+/K+/H+ antiporter  31.67 
 
 		 597 aa  235  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000727  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  32.2 
 
 		 599 aa  233  7.000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1446  sodium/hydrogen exchanger  34.47 
 
 		 641 aa  233  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0220  hypothetical protein  33.73 
 
 		 598 aa  229  8e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4262  sodium/hydrogen exchanger  34.44 
 
 		 741 aa  228  3e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387435  normal  0.153793 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4152  sodium/hydrogen exchanger  33.47 
 
 		 608 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.561792 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1072  sodium/hydrogen exchanger  33.47 
 
 		 601 aa  224  4e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.558941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0888  sodium/hydrogen exchanger  32.74 
 
 		 628 aa  219  7.999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.043911 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0859  sodium/hydrogen exchanger  30 
 
 		 640 aa  218  2.9999999999999998e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4254  sodium/hydrogen exchanger  33.4 
 
 		 601 aa  216  8e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1467  sodium/hydrogen exchanger  33.4 
 
 		 601 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.236845 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3909  Na+/H+ antiporter  32.76 
 
 		 607 aa  212  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1982  sodium/hydrogen exchanger  30.75 
 
 		 619 aa  212  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1024  Sodium/hydrogen exchanger  30.08 
 
 		 602 aa  209  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30796  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2292  sodium/hydrogen exchanger  32.55 
 
 		 637 aa  209  2e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.042334  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0511  sodium/hydrogen exchanger  30.91 
 
 		 622 aa  207  4e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2318  sodium/hydrogen exchanger  34.62 
 
 		 599 aa  206  7e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0395796  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4478  sodium/hydrogen exchanger  33.19 
 
 		 602 aa  200  6e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16030  putative sodium/hydrogen antiporter  33.4 
 
 		 611 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00461  Na+/H+ antiporter  31.7 
 
 		 569 aa  198  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1380  putative sodium/hydrogen antiporter  33.4 
 
 		 611 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00463957  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0956  sodium/hydrogen exchanger  29.34 
 
 		 639 aa  197  4.0000000000000005e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2740  Sodium/hydrogen exchanger  27.51 
 
 		 629 aa  197  6e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1871  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.6 
 
 		 666 aa  197  6e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2605  sodium/hydrogen exchanger  30.77 
 
 		 637 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00858761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2400  sodium/hydrogen exchanger  32.87 
 
 		 625 aa  196  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000130765  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0521  Sodium/hydrogen exchanger  28.91 
 
 		 604 aa  195  2e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0127  sodium/hydrogen exchanger  29.61 
 
 		 760 aa  193  7e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.302904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1998  sodium/hydrogen exchanger  31.92 
 
 		 616 aa  193  7e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000112153 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0850  sodium/hydrogen exchanger  29.93 
 
 		 617 aa  193  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03225  Na(+):H(+) antiporter, CPA1 family protein  29.61 
 
 		 625 aa  192  2e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0477  sodium/hydrogen exchanger  31.27 
 
 		 616 aa  192  2e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0802705  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0707  sodium/hydrogen exchanger  29.4 
 
 		 651 aa  191  2.9999999999999997e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1211  Sodium/hydrogen exchanger  27.34 
 
 		 611 aa  190  5.999999999999999e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4286  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.44 
 
 		 596 aa  189  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0381852  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2147  sodium/hydrogen exchanger  31.86 
 
 		 670 aa  189  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251145  normal  0.368531 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2224  sodium/hydrogen exchanger  31.86 
 
 		 673 aa  189  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00760493  normal  0.0969988 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4275  Na+/H+ exchanger (Na+/H+ antiporter)  29.03 
 
 		 596 aa  188  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4654  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.03 
 
 		 596 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4667  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.23 
 
 		 596 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4781  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.03 
 
 		 596 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4369  sodium/hydrogen exchanger  28.83 
 
 		 596 aa  188  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2324  sodium/hydrogen exchanger  31.64 
 
 		 670 aa  188  3e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.339898  normal  0.580137 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2537  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.61 
 
 		 669 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4436  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.83 
 
 		 596 aa  184  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00005477  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0868  Na(+):H(+) antiporter  32.81 
 
 		 606 aa  183  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2308  sodium/hydrogen exchanger  33.08 
 
 		 660 aa  182  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5185  sodium/hydrogen exchanger  32.45 
 
 		 660 aa  182  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2017  sodium/hydrogen exchanger  33.08 
 
 		 660 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000155921  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2321  sodium/hydrogen exchanger  33.08 
 
 		 660 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.545125  hitchhiker  0.000203679 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2065  sodium/hydrogen exchanger  33.08 
 
 		 660 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000562767  hitchhiker  0.000963897 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0146  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  32.1 
 
 		 763 aa  181  4e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000269507 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0156  sodium/hydrogen exchanger  31.4 
 
 		 764 aa  180  5.999999999999999e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1861  sodium/hydrogen exchanger  31.49 
 
 		 719 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.182882  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2109  sodium/hydrogen exchanger  33.87 
 
 		 643 aa  178  3e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1732  sodium/hydrogen exchanger  31.16 
 
 		 702 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0042  sodium/hydrogen exchanger  29.81 
 
 		 607 aa  166  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126585  normal  0.101979 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2869  sodium/hydrogen exchanger  29.94 
 
 		 623 aa  159  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.824474  normal  0.920346 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2394  Na+/H+ antiporter  36.2 
 
 		 593 aa  159  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00954713  hitchhiker  0.00302602 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2077  Na+/H+ antiporter, putative  25.17 
 
 		 595 aa  158  4e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05361  CPA1 family Na+/H+ antiporter  31.19 
 
 		 399 aa  157  7e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06781  putative Na+/H+ antiporter, CPA1 family  34.38 
 
 		 421 aa  156  9e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0472  CPA1 family Na+/H+ antiporter  30.47 
 
 		 399 aa  151  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0494569  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0759  sodium/hydrogen exchanger  33.02 
 
 		 584 aa  150  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135673  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4282  sodium/hydrogen exchanger  31.26 
 
 		 609 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19170  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  27.01 
 
 		 640 aa  145  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.490991  normal  0.0684118 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0424  sodium/hydrogen exchanger  30.33 
 
 		 852 aa  143  9e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04971  CPA1 family Na+/H+ antiporter  30.84 
 
 		 401 aa  139  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04731  CPA1 family Na+/H+ antiporter  31.74 
 
 		 402 aa  139  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.281963  normal  0.831051 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05271  CPA1 family Na+/H+ antiporter  30.84 
 
 		 401 aa  139  1e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0377759  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1720  CPA1 family Na+/H+ antiporter  31.82 
 
 		 414 aa  131  4.0000000000000003e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05281  CPA1 family Na+/H+ antiporter  31.73 
 
 		 414 aa  130  9.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0626531  normal  0.0646135 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1805  CPA1 family Na+/H+ antiporter  31.73 
 
 		 414 aa  129  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.781588  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0640  CPA1 family Na+/H+ antiporter  31.07 
 
 		 421 aa  110  7.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3821  sodium/hydrogen exchanger  31.97 
 
 		 407 aa  110  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0242  TrkA-N domain protein  33.03 
 
 		 221 aa  99.8  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  32.86 
 
 		 223 aa  97.8  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2276  potassium/proton antiporter  23.82 
 
 		 581 aa  97.8  5e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0543146  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  31.19 
 
 		 221 aa  94.7  5e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4297  TrkA domain-containing protein  25.82 
 
 		 636 aa  93.6  9e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2255  sodium/hydrogen exchanger  27.7 
 
 		 573 aa  93.2  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272655  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  31.19 
 
 		 221 aa  93.6  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  29.81 
 
 		 221 aa  91.7  4e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0362  TrkA-C domain protein  26.52 
 
 		 637 aa  91.7  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0161079 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0657  potassium/proton antiporter  24.69 
 
 		 597 aa  91.7  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0833853 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002210  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  22.77 
 
 		 581 aa  89.7  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.90325  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00290  K+ transport system, NAD-binding component  32.05 
 
 		 226 aa  88.2  4e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1794  hypothetical protein  32.18 
 
 		 222 aa  88.2  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0921  sodium/hydrogen exchanger  25.13 
 
 		 574 aa  87.8  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0538395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  26.32 
 
 		 596 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>