264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0242 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0242  TrkA domain-containing protein  100 
 
 		 668 aa  1300    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0022  TrkA-N domain-containing protein  41.73 
 
 		 553 aa  344  2.9999999999999997e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.377987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2117  TrkA-N domain protein  37.2 
 
 		 569 aa  251  4e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2794  TrkA-N domain protein  27.74 
 
 		 568 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3306  TrkA-N domain protein  27.74 
 
 		 568 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.484589 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2939  TrkA-N  27.35 
 
 		 749 aa  128  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4032  TrkA-N  26.21 
 
 		 565 aa  125  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.341469 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2853  TrkA-N  25.87 
 
 		 561 aa  123  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3336  TrkA domain-containing protein  35.19 
 
 		 359 aa  105  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.819763  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3105  TrkA-N  21.66 
 
 		 683 aa  104  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.716552 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0931  TrkA domain-containing protein  31.61 
 
 		 605 aa  99  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.18233  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4226  TrkA-N domain protein  23.15 
 
 		 682 aa  98.2  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4290  TrkA domain-containing protein  30.65 
 
 		 606 aa  97.1  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.286091  decreased coverage  0.00534263 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4414  TrkA-N domain protein  22.53 
 
 		 676 aa  91.3  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4477  TrkA-N domain protein  22.8 
 
 		 676 aa  90.1  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.124156 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  31.79 
 
 		 324 aa  85.1  0.000000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  25.23 
 
 		 352 aa  79  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2769  TrkA-N domain protein  33.49 
 
 		 565 aa  77.8  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  28.3 
 
 		 332 aa  75.5  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  31.25 
 
 		 350 aa  73.2  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  24.92 
 
 		 330 aa  71.6  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  27.05 
 
 		 325 aa  71.2  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  27.55 
 
 		 350 aa  71.2  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  24.25 
 
 		 330 aa  70.9  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  25.25 
 
 		 330 aa  70.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  23.92 
 
 		 334 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  24.25 
 
 		 334 aa  70.5  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  26.36 
 
 		 332 aa  70.5  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  27.47 
 
 		 352 aa  69.3  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0210  TrkA-N domain protein  26.42 
 
 		 460 aa  69.7  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  23.59 
 
 		 337 aa  68.9  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  24.67 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  23.83 
 
 		 351 aa  67  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  24.42 
 
 		 330 aa  67  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  23.83 
 
 		 351 aa  67  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1634  TrkA domain-containing protein  26.5 
 
 		 339 aa  66.2  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.853014  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  23.83 
 
 		 351 aa  66.6  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  24.26 
 
 		 335 aa  66.2  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  23.08 
 
 		 351 aa  65.5  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2212  TrkA domain-containing protein  30.05 
 
 		 347 aa  65.1  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217414  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  28.36 
 
 		 333 aa  64.7  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  25.69 
 
 		 332 aa  64.3  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  26.29 
 
 		 346 aa  63.5  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1539  TrkA-N domain protein  28.23 
 
 		 222 aa  63.9  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.465203  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  23.27 
 
 		 335 aa  63.9  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  23.88 
 
 		 341 aa  62.8  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  22.77 
 
 		 335 aa  62.4  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  27.43 
 
 		 362 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  26.67 
 
 		 338 aa  61.6  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  26.29 
 
 		 355 aa  61.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  25.17 
 
 		 355 aa  61.6  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2323  TrkA domain-containing protein  28.77 
 
 		 549 aa  60.5  0.00000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.551813 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  25.38 
 
 		 341 aa  60.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1323  TrkA-N domain protein  26.34 
 
 		 346 aa  60.1  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0403  VIC family potassium channel protein  25.77 
 
 		 346 aa  59.3  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.133961  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2566  TrkA-N  27.27 
 
 		 366 aa  59.3  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  25.53 
 
 		 354 aa  59.7  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0633  TrkA-N domain protein  28.85 
 
 		 248 aa  58.5  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  26.51 
 
 		 218 aa  58.9  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  25.22 
 
 		 357 aa  58.9  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3710  TrkA-N  29.03 
 
 		 364 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360814  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4658  TrkA domain-containing protein  29.03 
 
 		 364 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.677832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1744  TrkA-N domain protein  25.25 
 
 		 368 aa  58.9  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  27.17 
 
 		 371 aa  58.9  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1162  TrkA-like protein  28.57 
 
 		 386 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.30388 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  26.11 
 
 		 347 aa  58.5  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  25 
 
 		 346 aa  57.8  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4030  TrkA domain-containing protein  30.1 
 
 		 364 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.702941  normal  0.742816 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5641  TrkA domain-containing protein  28.57 
 
 		 364 aa  56.6  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.289182 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  24.63 
 
 		 335 aa  57  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10941  hypothetical protein  25.26 
 
 		 346 aa  56.6  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275534 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1186  potassium transporter peripheral membrane component  26.32 
 
 		 445 aa  57  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.596494  decreased coverage  0.00000028569 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13070  K+ transport system, NAD-binding component  35.42 
 
 		 233 aa  56.2  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00265603  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  26.04 
 
 		 352 aa  55.5  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  27.08 
 
 		 531 aa  55.8  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3513  potassium efflux system protein  30.28 
 
 		 602 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0869039  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0396  TrkA domain-containing protein  30.72 
 
 		 457 aa  55.1  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  25.91 
 
 		 359 aa  54.7  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1276  TrkA-N domain protein  27.4 
 
 		 228 aa  54.7  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.283168  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  24.91 
 
 		 337 aa  54.7  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  33.94 
 
 		 670 aa  54.7  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000025266  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  26.59 
 
 		 345 aa  54.7  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1457  K+ efflux antiporter, putative (KEA1)  25.35 
 
 		 583 aa  54.3  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0250  TrkA-N domain protein  30.73 
 
 		 219 aa  54.3  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3169  TrkA-N:Sodium/hydrogen exchanger  32.82 
 
 		 567 aa  53.9  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0402  sodium/hydrogen exchanger  33.66 
 
 		 562 aa  53.9  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  26.47 
 
 		 350 aa  53.9  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  33.67 
 
 		 668 aa  53.9  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1539  sodium/hydrogen exchanger  36.36 
 
 		 662 aa  53.5  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0064  TrkA-N domain protein  24.89 
 
 		 337 aa  53.9  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  23.05 
 
 		 350 aa  52.8  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1633  TrkA-N domain protein  28.41 
 
 		 299 aa  53.1  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4504  TrkA domain-containing protein  28.42 
 
 		 364 aa  52.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4046  TrkA domain-containing protein  28.42 
 
 		 364 aa  53.1  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.809582 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1196  TrkA-N domain protein  29.17 
 
 		 569 aa  52.8  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  23.05 
 
 		 350 aa  52.4  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2358  TrkA domain-containing protein  23.93 
 
 		 564 aa  52.4  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1132  hypothetical protein  33.62 
 
 		 564 aa  51.6  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3503  TrkA domain-containing protein  35.35 
 
 		 261 aa  51.6  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  22.97 
 
 		 346 aa  52  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>