More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0633 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0633  TrkA-N domain protein  100 
 
 
248 aa  494  1e-139  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2258  TrkA-N domain protein  82.27 
 
 
236 aa  367  1e-101  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1276  TrkA-N domain protein  62.05 
 
 
228 aa  286  2e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.283168  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1602  TrkA-N domain protein  65.94 
 
 
228 aa  280  2e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.316093  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1539  TrkA-N domain protein  50.68 
 
 
222 aa  222  3e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.465203  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1173  TrkA-N domain protein  50.7 
 
 
221 aa  211  1e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2420  TrkA-N domain protein  50.46 
 
 
220 aa  209  2e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1184  TrkA-N domain protein  47.93 
 
 
218 aa  205  5e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1520  TrkA-N domain protein  31.34 
 
 
218 aa  89.7  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  30.77 
 
 
443 aa  87.8  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1754  hypothetical protein  29.49 
 
 
227 aa  84.7  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169137  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0542  TrkA-N domain protein  29.56 
 
 
215 aa  84.7  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.840001  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  27.4 
 
 
221 aa  84.3  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0914  potassium transporter peripheral membrane component  30.04 
 
 
450 aa  84  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  28.83 
 
 
221 aa  83.6  0.000000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1485  TrkA domain-containing protein  30.32 
 
 
229 aa  82.8  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0637531  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  28.38 
 
 
221 aa  82  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3757  TrkA-N domain protein  28.57 
 
 
217 aa  82.4  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000992935  normal  0.446525 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  28.38 
 
 
221 aa  82.4  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0018  potassium transporter peripheral membrane component  32.46 
 
 
477 aa  80.9  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.265003  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4528  TrkA-N domain-containing protein  28.83 
 
 
222 aa  80.5  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.468661  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  27.48 
 
 
221 aa  79.7  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1450  TrkA domain-containing protein  29.86 
 
 
229 aa  79.7  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0807714  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2286  TrkA-N domain-containing protein  29.22 
 
 
219 aa  79  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.241613 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1794  hypothetical protein  28.19 
 
 
222 aa  77.8  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1348  hypothetical protein  29.96 
 
 
220 aa  77.4  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0533287  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1322  TrkA-like  28.32 
 
 
231 aa  76.6  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1924  TrkA-N domain protein  28.02 
 
 
231 aa  74.7  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1876  TrkA-N domain protein  29.03 
 
 
220 aa  74.7  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.416785  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0251  TrkA-N domain protein  28.14 
 
 
225 aa  73.9  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0254  TrkA-N domain protein  27.6 
 
 
221 aa  74.3  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.153232 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  25.57 
 
 
221 aa  73.9  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3126  potassium transporter peripheral membrane component  28.18 
 
 
458 aa  73.2  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1970  potassium transporter peripheral membrane component  30.43 
 
 
453 aa  73.6  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.616677  normal  0.0915611 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00290  K+ transport system, NAD-binding component  28 
 
 
226 aa  73.2  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2030  potassium transporter peripheral membrane component  27.6 
 
 
465 aa  72.8  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0693486  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2196  TrkA-N  26.61 
 
 
222 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2242  TrkA domain-containing protein  26.61 
 
 
222 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.081798  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2185  TrkA domain-containing protein  26.61 
 
 
222 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314676  normal  0.0103731 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1712  TrkA-N domain protein  28.11 
 
 
219 aa  72.4  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.887824  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  24.66 
 
 
221 aa  72  0.000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5192  TrkA domain-containing protein  28.19 
 
 
259 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0506525  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6760  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  28.57 
 
 
223 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0522309 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0112  TrkA-N domain protein  34.23 
 
 
617 aa  71.2  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1877  potassium transporter peripheral membrane component  30.8 
 
 
445 aa  71.6  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.113601 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1633  TrkA-N domain protein  25.66 
 
 
299 aa  70.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00019  potassium transporter peripheral membrane component  33.54 
 
 
459 aa  70.5  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3473  TrkA-N domain protein  30.17 
 
 
442 aa  69.7  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.249749  normal  0.0183508 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0547  K+ transport systems NAD-binding subunit  26.91 
 
 
219 aa  69.7  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2904  TrkA domain-containing protein  25.35 
 
 
223 aa  69.7  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0052  potassium transporter peripheral membrane component  29.92 
 
 
457 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0014  TrkA domain-containing protein  28.82 
 
 
457 aa  69.3  0.00000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0240987 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1406  TrkA-N domain protein  28.89 
 
 
225 aa  69.3  0.00000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.699899  normal  0.545013 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_29  cation transport protein, Trk system  27.15 
 
 
454 aa  68.6  0.00000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  27.31 
 
 
223 aa  68.6  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11690  TrkA-N domain protein  26.36 
 
 
215 aa  68.6  0.00000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00343321  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2257  TrkA-N domain protein  30.73 
 
 
220 aa  68.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222998  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1561  TrkA-N domain protein  27.19 
 
 
219 aa  68.2  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534326  normal  0.490374 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3424  potassium transporter peripheral membrane component  29.46 
 
 
448 aa  67.8  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0085  K+ transport systems, NAD-binding component  27.14 
 
 
218 aa  68.2  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.73294e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0029  potassium transporter peripheral membrane component  26.7 
 
 
454 aa  68.2  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0243  TrkA-N domain protein  29.9 
 
 
206 aa  68.2  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0020  potassium transporter peripheral membrane component  32.28 
 
 
459 aa  67.8  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.688304  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0312  potassium transporter peripheral membrane component  24.76 
 
 
449 aa  67.8  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0720169  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1634  TrkA-N domain protein  33.47 
 
 
224 aa  68.2  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000521907 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0064  TrkA-N domain protein  29.96 
 
 
337 aa  68.2  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0734  TrkA-N domain protein  33.19 
 
 
450 aa  67.4  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3928  TrkA domain-containing protein  26.48 
 
 
221 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0399436  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  27.83 
 
 
218 aa  67.8  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0038  potassium transporter peripheral membrane component  35.16 
 
 
458 aa  67.4  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1707  TrkA-N domain protein  26.67 
 
 
224 aa  67.8  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102172  normal  0.0591298 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16160  K+ transport system, NAD-binding component  26.89 
 
 
249 aa  67.8  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.534565  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1918  TrkA-N domain protein  27.8 
 
 
224 aa  67.4  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388192  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00140  potassium transporter peripheral membrane component  30.2 
 
 
457 aa  67  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35944  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1399  TrkA domain-containing protein  26.18 
 
 
233 aa  67  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4514  potassium transporter peripheral membrane component  35.16 
 
 
458 aa  66.6  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00906883  hitchhiker  0.00000865676 
 
 
-
 
NC_002936  DET0030  potassium transporter peripheral membrane component  27.15 
 
 
454 aa  66.6  0.0000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0313  potassium transporter peripheral membrane component  28.29 
 
 
458 aa  66.2  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.888467  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12707  trk system potassium uptake protein ceoC  26.73 
 
 
220 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.44928  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0416  TrkA domain-containing protein  26.64 
 
 
217 aa  65.9  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000130553  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3885  potassium transporter peripheral membrane component  28.29 
 
 
458 aa  66.2  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0054195  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4126  potassium transporter peripheral membrane component  31.46 
 
 
458 aa  66.2  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.215607  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0022  TrkA-N domain-containing protein  30.1 
 
 
553 aa  65.9  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.377987  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0612  potassium transporter peripheral membrane component  28.29 
 
 
458 aa  66.2  0.0000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0369792  normal  0.0559785 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0017  potassium transporter peripheral membrane component  32.81 
 
 
458 aa  65.9  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00394  potassium transporter peripheral membrane component  34.38 
 
 
458 aa  65.5  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3218  potassium transporter peripheral membrane component  27.93 
 
 
454 aa  65.9  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.715113  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2406  TrkA domain-containing protein  28.71 
 
 
214 aa  65.5  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.716891  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1213  TrkA-N domain protein  25.71 
 
 
228 aa  65.5  0.0000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0819  potassium transporter peripheral membrane component  27.8 
 
 
437 aa  65.5  0.0000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0242  TrkA-N domain protein  24.78 
 
 
221 aa  65.5  0.0000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0016  potassium transporter peripheral membrane component  29.72 
 
 
457 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0014  potassium transporter peripheral membrane component  28.95 
 
 
458 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00830339  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1491  potassium transporter peripheral membrane component  30.84 
 
 
458 aa  65.5  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.404255 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0180  Trk system potassium uptake protein TrkA  29.72 
 
 
457 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1941  TrkA-N domain protein  27.32 
 
 
241 aa  65.1  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0298197 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002054  Trk system potassium uptake protein TrkA  34.38 
 
 
458 aa  65.1  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1590  potassium transporter peripheral membrane component  24.27 
 
 
449 aa  65.1  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00906485  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2472  TrkA domain-containing protein  26.03 
 
 
221 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3062  TrkA domain-containing protein  30.87 
 
 
227 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.793731  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>