More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1634 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_1634  TrkA-N domain protein  100 
 
 		 224 aa  451  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000521907 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1641  TrkA domain-containing protein  86.49 
 
 		 223 aa  403  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0270311  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1562  TrkA-N domain protein  63.59 
 
 		 221 aa  278  7e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.308966  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2285  TrkA-N domain-containing protein  60.36 
 
 		 221 aa  275  3e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.311674 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1642  TrkA-N domain protein  62.67 
 
 		 219 aa  271  6e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.623208  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6759  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  59.73 
 
 		 221 aa  268  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0519804 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16170  K+ transport system, NAD-binding component  58.18 
 
 		 221 aa  264  8.999999999999999e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.11506 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1708  TrkA-N domain protein  60.75 
 
 		 216 aa  261  4.999999999999999e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0311888  normal  0.0547174 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1917  TrkA-N domain protein  59.53 
 
 		 217 aa  259  2e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.678679  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1942  TrkA-N domain protein  62.5 
 
 		 216 aa  258  3e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0161521 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1713  TrkA-N domain protein  60.81 
 
 		 222 aa  256  1e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1323  TrkA-like  58.9 
 
 		 264 aa  252  3e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2903  TrkA domain-containing protein  56.36 
 
 		 220 aa  250  1e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1405  TrkA-N domain protein  56.02 
 
 		 218 aa  241  7.999999999999999e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.364271  normal  0.729476 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1398  TrkA domain-containing protein  55.81 
 
 		 224 aa  239  2e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.870164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1486  TrkA domain-containing protein  55.14 
 
 		 221 aa  232  3e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.370955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4527  TrkA-N domain-containing protein  54.63 
 
 		 221 aa  231  9e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.621759 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13070  K+ transport system, NAD-binding component  53.95 
 
 		 233 aa  229  2e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00265603  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1877  TrkA-N domain protein  52.53 
 
 		 222 aa  229  3e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.608746  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1451  TrkA domain-containing protein  54.21 
 
 		 221 aa  229  3e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0437642  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3756  TrkA-N domain protein  53.39 
 
 		 236 aa  227  1e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000258956  normal  0.472401 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1928  putative potassium transporter  57.14 
 
 		 224 aa  223  3e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.292607  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5191  TrkA domain-containing protein  55.3 
 
 		 243 aa  221  7e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0357985  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2874  TrkA-N domain protein  57.14 
 
 		 242 aa  220  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.493191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2197  TrkA-N  57.22 
 
 		 217 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2243  TrkA domain-containing protein  57.22 
 
 		 217 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2186  TrkA domain-containing protein  57.22 
 
 		 217 aa  218  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0106506 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12706  trk system potassium uptake protein ceoB  55.1 
 
 		 227 aa  217  1e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1521  TrkA-N domain protein  52.51 
 
 		 220 aa  215  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.709024  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2473  TrkA domain-containing protein  53.27 
 
 		 223 aa  215  4e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.214066  normal  0.684987 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3927  TrkA domain-containing protein  55.61 
 
 		 234 aa  215  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0233751  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2257  TrkA-N domain protein  51.39 
 
 		 220 aa  214  9e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222998  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3072  TrkA domain-containing protein  43.94 
 
 		 214 aa  172  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2406  TrkA domain-containing protein  42.51 
 
 		 214 aa  167  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.716891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1923  TrkA-N domain protein  48.22 
 
 		 220 aa  161  6e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3063  TrkA domain-containing protein  36.57 
 
 		 214 aa  142  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0807  TrkA-N domain protein  46.21 
 
 		 137 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2660  TrkA domain-containing protein  36.28 
 
 		 214 aa  134  9e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0646767  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0243  TrkA-N domain protein  43.26 
 
 		 206 aa  129  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00280  K+ transport system, NAD-binding component  30.18 
 
 		 219 aa  124  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0250  TrkA-N domain protein  33.01 
 
 		 219 aa  123  2e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0637  TrkA-N  33.65 
 
 		 219 aa  119  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0432302 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01270  K+ transport system, NAD-binding component  33.97 
 
 		 219 aa  119  3e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0026  TrkA domain-containing protein  46.46 
 
 		 134 aa  118  7e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_26  cation transport protein, Trk system  46.46 
 
 		 134 aa  117  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0437885  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0027  potassium uptake protein, putative  45.67 
 
 		 134 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.248151  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2083  TrkA-N domain protein  31.07 
 
 		 210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1347  TrkA-N  41.73 
 
 		 134 aa  107  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0274494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0253  TrkA-N domain protein  35.9 
 
 		 138 aa  106  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  33.33 
 
 		 626 aa  89.7  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  26.73 
 
 		 218 aa  88.2  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1656  TrkA domain-containing protein  38.79 
 
 		 143 aa  86.7  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153236  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1729  TrkA domain-containing protein  35.38 
 
 		 143 aa  86.3  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000411585  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1262  TrkA domain-containing protein  27.86 
 
 		 141 aa  85.9  5e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  30.05 
 
 		 628 aa  84.3  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3062  TrkA domain-containing protein  32.88 
 
 		 227 aa  84  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.793731  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2911  TrkA-N domain protein  32.65 
 
 		 142 aa  83.2  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0359474  normal  0.209528 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2079  TrkA-N domain protein  29.33 
 
 		 458 aa  80.1  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00019  potassium transporter peripheral membrane component  28 
 
 		 459 aa  78.6  0.00000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  29.27 
 
 		 630 aa  76.6  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  28.02 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  31.78 
 
 		 617 aa  75.1  0.0000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00290  K+ transport system, NAD-binding component  33.07 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0020  potassium transporter peripheral membrane component  28.37 
 
 		 457 aa  73.2  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0251  TrkA-N domain protein  28.66 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0180  Trk system potassium uptake protein TrkA  28.85 
 
 		 457 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0020  potassium transporter peripheral membrane component  26.22 
 
 		 459 aa  72.8  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.688304  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  26.15 
 
 		 221 aa  71.6  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0016  potassium transporter peripheral membrane component  29.33 
 
 		 457 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  26.15 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0072  potassium transporter peripheral membrane component  25.78 
 
 		 458 aa  71.2  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1348  hypothetical protein  33.91 
 
 		 220 aa  70.9  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0533287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00140  potassium transporter peripheral membrane component  27.88 
 
 		 457 aa  71.2  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35944  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  26.15 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1685  TrkA domain-containing protein  25.55 
 
 		 153 aa  70.9  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.124287  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0254  TrkA-N domain protein  21.86 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.153232 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4082  potassium transporter peripheral membrane component  27.71 
 
 		 467 aa  70.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0542  TrkA-N domain protein  25.27 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.840001  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3713  potassium transporter peripheral membrane component  26.09 
 
 		 458 aa  70.1  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.461523 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2661  TrkA domain-containing protein  29.22 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.202256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0014  TrkA domain-containing protein  26.92 
 
 		 457 aa  70.1  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0240987 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3776  potassium transporter peripheral membrane component  26.09 
 
 		 458 aa  70.1  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4514  potassium transporter peripheral membrane component  34 
 
 		 458 aa  69.7  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00906883  hitchhiker  0.00000865676 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3605  potassium transporter peripheral membrane component  26.09 
 
 		 458 aa  70.1  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.267887  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3606  potassium transporter peripheral membrane component  26.09 
 
 		 458 aa  70.1  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.454415 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3678  potassium transporter peripheral membrane component  26.09 
 
 		 458 aa  70.1  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1454  TrkA-N domain protein  26.67 
 
 		 443 aa  69.7  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03140  potassium transporter peripheral membrane component  26.09 
 
 		 458 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.946548  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0424  TrkA-N domain protein  26.09 
 
 		 458 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0424  potassium transporter peripheral membrane component  26.09 
 
 		 458 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000421391 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3483  potassium transporter peripheral membrane component  26.09 
 
 		 458 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0624843  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2622  potassium transporter peripheral membrane component  29.22 
 
 		 458 aa  69.7  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637696 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4612  potassium transporter peripheral membrane component  26.09 
 
 		 458 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00524775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3585  potassium transporter peripheral membrane component  26.09 
 
 		 458 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.931761  normal  0.13042 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3772  potassium transporter peripheral membrane component  26.09 
 
 		 458 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.241443  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3674  potassium transporter peripheral membrane component  26.09 
 
 		 458 aa  69.3  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03091  hypothetical protein  26.09 
 
 		 458 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0112  TrkA-N domain protein  32.67 
 
 		 617 aa  68.9  0.00000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3183  potassium transporter peripheral membrane component  23.68 
 
 		 465 aa  68.9  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00657284  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0081  potassium transporter peripheral membrane component  28.37 
 
 		 457 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685696  normal  0.107342 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>