More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1276 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1276  TrkA-N domain protein  100 
 
 		 228 aa  453  1e-127  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.283168  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1602  TrkA-N domain protein  67.11 
 
 		 228 aa  298  4e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.316093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2258  TrkA-N domain protein  64.86 
 
 		 236 aa  297  1e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0633  TrkA-N domain protein  63.01 
 
 		 248 aa  283  1.0000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1184  TrkA-N domain protein  52.53 
 
 		 218 aa  224  9e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1539  TrkA-N domain protein  49.32 
 
 		 222 aa  219  3.9999999999999997e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.465203  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1173  TrkA-N domain protein  50.94 
 
 		 221 aa  203  1e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2420  TrkA-N domain protein  50 
 
 		 220 aa  202  4e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1794  hypothetical protein  29.6 
 
 		 222 aa  85.5  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  31.25 
 
 		 443 aa  83.2  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3757  TrkA-N domain protein  31.02 
 
 		 217 aa  83.2  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000992935  normal  0.446525 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1485  TrkA domain-containing protein  31.53 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0637531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1450  TrkA domain-containing protein  31.08 
 
 		 229 aa  81.3  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0807714  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2904  TrkA domain-containing protein  30.28 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2286  TrkA-N domain-containing protein  31.36 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.241613 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1876  TrkA-N domain protein  31.19 
 
 		 220 aa  78.6  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.416785  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4528  TrkA-N domain-containing protein  29.6 
 
 		 222 aa  78.2  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.468661  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2196  TrkA-N  30.97 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2242  TrkA domain-containing protein  30.97 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.081798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2185  TrkA domain-containing protein  30.97 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314676  normal  0.0103731 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6760  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  29.6 
 
 		 223 aa  74.7  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0522309 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16160  K+ transport system, NAD-binding component  27.4 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.534565  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1399  TrkA domain-containing protein  30.34 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1918  TrkA-N domain protein  28.96 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388192  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1640  TrkA domain-containing protein  27.63 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0557692  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1633  TrkA-N domain protein  27.35 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0251  TrkA-N domain protein  29.2 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0914  potassium transporter peripheral membrane component  26.91 
 
 		 450 aa  72.8  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  26.11 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2472  TrkA domain-containing protein  30.18 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  26.79 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5192  TrkA domain-containing protein  29.27 
 
 		 259 aa  72.4  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0506525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1520  TrkA-N domain protein  30.91 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1712  TrkA-N domain protein  30.58 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.887824  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  24.2 
 
 		 221 aa  72  0.000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1561  TrkA-N domain protein  30.58 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534326  normal  0.490374 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1322  TrkA-like  31.86 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  26.13 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  26.13 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  24.78 
 
 		 221 aa  68.6  0.00000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1970  potassium transporter peripheral membrane component  30.63 
 
 		 453 aa  68.6  0.00000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.616677  normal  0.0915611 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0547  K+ transport systems NAD-binding subunit  24.32 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2256  TrkA-N domain protein  30.45 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13318  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  28.44 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1590  potassium transporter peripheral membrane component  24.27 
 
 		 449 aa  66.6  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00906485  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1406  TrkA-N domain protein  28.3 
 
 		 225 aa  67  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.699899  normal  0.545013 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1754  hypothetical protein  25.73 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169137  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1707  TrkA-N domain protein  29.06 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102172  normal  0.0591298 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13080  K+ transport system, NAD-binding component  31.16 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0024035  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0312  potassium transporter peripheral membrane component  24.29 
 
 		 449 aa  66.2  0.0000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0720169  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2079  TrkA-N domain protein  28.3 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3928  TrkA domain-containing protein  28.76 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0399436  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01280  K+ transport system, NAD-binding component  29.63 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2030  potassium transporter peripheral membrane component  27.52 
 
 		 465 aa  64.7  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0693486  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3218  potassium transporter peripheral membrane component  28.02 
 
 		 454 aa  64.3  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.715113  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3473  TrkA-N domain protein  29.68 
 
 		 442 aa  65.1  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.249749  normal  0.0183508 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1941  TrkA-N domain protein  28.78 
 
 		 241 aa  63.9  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0298197 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01407  hypothetical protein  25.48 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  24.77 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12243  putative potassium uptake protein  27.84 
 
 		 449 aa  62.8  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0254  TrkA-N domain protein  23.48 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.153232 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_29  cation transport protein, Trk system  26.98 
 
 		 454 aa  62.8  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0243  TrkA-N domain protein  34.81 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00290  K+ transport system, NAD-binding component  26.34 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004055  potassium uptake protein integral membrane component KtrA  25 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.248543  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0161  TrkA domain-containing protein  28.16 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.825727 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1640  K+ transport systems NAD-binding component, TrkA-N  26.09 
 
 		 221 aa  61.6  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1877  TrkA-N domain protein  28.7 
 
 		 222 aa  62  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.608746  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1641  TrkA-N domain protein  29.83 
 
 		 233 aa  62  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  0.0943946 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0065  potassium transporter peripheral membrane component  25.97 
 
 		 457 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948816  unclonable  0.000000448887 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0081  potassium transporter peripheral membrane component  25.97 
 
 		 457 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  hitchhiker  0.0000000000177319 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0084  potassium transporter peripheral membrane component  25.97 
 
 		 457 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.409393  hitchhiker  0.00000000549949 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2407  TrkA domain-containing protein  27.98 
 
 		 220 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3437  potassium transporter peripheral membrane component  31.28 
 
 		 452 aa  61.2  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0081  potassium transporter peripheral membrane component  25.97 
 
 		 457 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685696  normal  0.107342 
 
 
-
 
NC_002936  DET0030  potassium transporter peripheral membrane component  27.44 
 
 		 454 aa  60.5  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1093  potassium transporter peripheral membrane component  27.23 
 
 		 458 aa  60.5  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.915935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0014  potassium transporter peripheral membrane component  26.27 
 
 		 458 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00830339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0807  TrkA-N domain protein  38.18 
 
 		 137 aa  60.5  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0339  TrkA-N domain protein  29.09 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00738023  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2083  TrkA-N domain protein  31.08 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3071  TrkA domain-containing protein  27.52 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0416  TrkA domain-containing protein  26.29 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000130553  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1929  putative potassium uptake protein  31.6 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.123463  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0085  K+ transport systems, NAD-binding component  26.34 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.73294e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1348  hypothetical protein  26.42 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0533287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12707  trk system potassium uptake protein ceoC  29.69 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.44928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0029  potassium transporter peripheral membrane component  26.85 
 
 		 454 aa  59.7  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0436  potassium transporter peripheral membrane component  29.87 
 
 		 458 aa  59.7  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4032  TrkA-N  33.33 
 
 		 565 aa  59.7  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.341469 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2267  TrkA-N domain protein  28.19 
 
 		 459 aa  59.7  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.634076  hitchhiker  0.00765776 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1041  TrkA domain-containing protein  29.3 
 
 		 452 aa  59.7  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3126  potassium transporter peripheral membrane component  25.68 
 
 		 458 aa  59.7  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2479  TrkA-N domain protein  28.57 
 
 		 445 aa  59.7  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13070  K+ transport system, NAD-binding component  38.53 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00265603  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1826  TrkA-N domain protein  24.39 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1353  TrkA-N domain protein  30.62 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6759  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  31.19 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0519804 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3072  TrkA domain-containing protein  33.64 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3792  potassium transporter peripheral membrane component  27.47 
 
 		 458 aa  58.5  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>