More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1877 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1877  TrkA-N domain protein  100 
 
 		 222 aa  444  1.0000000000000001e-124  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.608746  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1642  TrkA-N domain protein  61.93 
 
 		 219 aa  274  8e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.623208  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2285  TrkA-N domain-containing protein  60.37 
 
 		 221 aa  262  3e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.311674 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4527  TrkA-N domain-containing protein  60.38 
 
 		 221 aa  259  3e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.621759 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6759  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  58.18 
 
 		 221 aa  258  7e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0519804 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1323  TrkA-like  57.99 
 
 		 264 aa  252  3e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2473  TrkA domain-containing protein  61.19 
 
 		 223 aa  252  3e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.214066  normal  0.684987 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1451  TrkA domain-containing protein  60.38 
 
 		 221 aa  251  8.000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0437642  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1521  TrkA-N domain protein  56.36 
 
 		 220 aa  250  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.709024  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12706  trk system potassium uptake protein ceoB  61.69 
 
 		 227 aa  249  2e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3756  TrkA-N domain protein  57.41 
 
 		 236 aa  249  2e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000258956  normal  0.472401 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1486  TrkA domain-containing protein  59.91 
 
 		 221 aa  248  5e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.370955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3927  TrkA domain-containing protein  59.2 
 
 		 234 aa  247  1e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0233751  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1398  TrkA domain-containing protein  54.93 
 
 		 224 aa  241  3.9999999999999997e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.870164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2197  TrkA-N  59.18 
 
 		 217 aa  239  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2243  TrkA domain-containing protein  59.18 
 
 		 217 aa  239  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1562  TrkA-N domain protein  58.13 
 
 		 221 aa  239  2.9999999999999997e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.308966  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2186  TrkA domain-containing protein  59.18 
 
 		 217 aa  239  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0106506 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2903  TrkA domain-containing protein  53.92 
 
 		 220 aa  238  6.999999999999999e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16170  K+ transport system, NAD-binding component  55.61 
 
 		 221 aa  237  1e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.11506 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1405  TrkA-N domain protein  56.25 
 
 		 218 aa  232  3e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.364271  normal  0.729476 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2257  TrkA-N domain protein  56.22 
 
 		 220 aa  231  1e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222998  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1634  TrkA-N domain protein  52.53 
 
 		 224 aa  229  3e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000521907 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1942  TrkA-N domain protein  57.49 
 
 		 216 aa  229  3e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0161521 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1708  TrkA-N domain protein  56.72 
 
 		 216 aa  227  9e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0311888  normal  0.0547174 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1713  TrkA-N domain protein  56.16 
 
 		 222 aa  227  1e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1917  TrkA-N domain protein  56.7 
 
 		 217 aa  225  4e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.678679  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5191  TrkA domain-containing protein  57.6 
 
 		 243 aa  225  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0357985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1641  TrkA domain-containing protein  54.31 
 
 		 223 aa  224  1e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0270311  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1928  putative potassium transporter  53.33 
 
 		 224 aa  216  2e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.292607  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2874  TrkA-N domain protein  52.68 
 
 		 242 aa  208  6e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.493191  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13070  K+ transport system, NAD-binding component  48.22 
 
 		 233 aa  186  2e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00265603  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3072  TrkA domain-containing protein  44 
 
 		 214 aa  169  5e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1923  TrkA-N domain protein  47.03 
 
 		 220 aa  167  1e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2406  TrkA domain-containing protein  40.65 
 
 		 214 aa  166  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.716891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3063  TrkA domain-containing protein  40.09 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2660  TrkA domain-containing protein  40.55 
 
 		 214 aa  149  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0646767  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0243  TrkA-N domain protein  33.83 
 
 		 206 aa  134  8e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2083  TrkA-N domain protein  35.58 
 
 		 210 aa  131  6.999999999999999e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00280  K+ transport system, NAD-binding component  31.96 
 
 		 219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0807  TrkA-N domain protein  44.36 
 
 		 137 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0637  TrkA-N  31.84 
 
 		 219 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0432302 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0250  TrkA-N domain protein  30.59 
 
 		 219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_26  cation transport protein, Trk system  43.9 
 
 		 134 aa  112  3e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0437885  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0026  TrkA domain-containing protein  43.9 
 
 		 134 aa  113  3e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0027  potassium uptake protein, putative  43.9 
 
 		 134 aa  112  6e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.248151  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01270  K+ transport system, NAD-binding component  32.37 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1347  TrkA-N  40 
 
 		 134 aa  104  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0274494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0253  TrkA-N domain protein  34.19 
 
 		 138 aa  96.3  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2911  TrkA-N domain protein  36.03 
 
 		 142 aa  92.8  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0359474  normal  0.209528 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0242  TrkA-N domain protein  25.84 
 
 		 221 aa  91.3  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  30.45 
 
 		 626 aa  88.6  7e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  25.12 
 
 		 218 aa  88.2  9e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1262  TrkA domain-containing protein  27.78 
 
 		 141 aa  87.4  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1067  hypothetical protein  28.51 
 
 		 225 aa  86.3  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521072 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0542  TrkA-N domain protein  25.64 
 
 		 215 aa  85.9  5e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.840001  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0254  TrkA-N domain protein  23.15 
 
 		 221 aa  85.5  7e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.153232 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2082  TrkA-N domain protein  23.41 
 
 		 218 aa  84.3  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.124657  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1322  TrkA-like  27.88 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1399  TrkA-N domain protein  26.51 
 
 		 455 aa  83.2  0.000000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000200171  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1656  TrkA domain-containing protein  33.59 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153236  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  32.59 
 
 		 617 aa  83.2  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1729  TrkA domain-containing protein  36.21 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000411585  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1685  TrkA domain-containing protein  29.01 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.124287  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4814  TrkA-N domain protein  25.91 
 
 		 226 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5192  TrkA domain-containing protein  29.61 
 
 		 259 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0506525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00290  K+ transport system, NAD-binding component  28.9 
 
 		 226 aa  80.1  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  28.04 
 
 		 628 aa  79.7  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0638  TrkA-N  27.23 
 
 		 225 aa  78.6  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3757  TrkA-N domain protein  29.3 
 
 		 217 aa  78.2  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000992935  normal  0.446525 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1400  TrkA-N domain-containing protein  25.44 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2407  TrkA domain-containing protein  29.61 
 
 		 220 aa  77.8  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  30.49 
 
 		 443 aa  77  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2286  TrkA-N domain-containing protein  28.37 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.241613 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04100  K+ transport system, NAD-binding component  36.72 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.453544  normal  0.632996 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3071  TrkA domain-containing protein  30.1 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1261  TrkA domain-containing protein  21.08 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  23.96 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  24.76 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0251  TrkA-N domain protein  30.32 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1348  hypothetical protein  26.7 
 
 		 220 aa  73.2  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0533287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1041  TrkA domain-containing protein  35.63 
 
 		 452 aa  73.2  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  23.58 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  24.39 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1265  hypothetical protein  26.61 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16160  K+ transport system, NAD-binding component  26.43 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.534565  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1655  TrkA domain-containing protein  27.27 
 
 		 218 aa  72  0.000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000867889  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00140  potassium transporter peripheral membrane component  27.75 
 
 		 457 aa  71.6  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35944  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01280  K+ transport system, NAD-binding component  28.64 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0905  TrkA-N domain protein  24.89 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3183  potassium transporter peripheral membrane component  23.27 
 
 		 465 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00657284  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  23.11 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0180  Trk system potassium uptake protein TrkA  28.71 
 
 		 457 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0014  potassium transporter peripheral membrane component  26.67 
 
 		 458 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00830339  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0065  potassium transporter peripheral membrane component  27.27 
 
 		 457 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948816  unclonable  0.000000448887 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0081  potassium transporter peripheral membrane component  27.27 
 
 		 457 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685696  normal  0.107342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6760  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  28.11 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0522309 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0112  TrkA-N domain protein  28.83 
 
 		 617 aa  68.9  0.00000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0081  potassium transporter peripheral membrane component  27.27 
 
 		 457 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  hitchhiker  0.0000000000177319 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  20.37 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>