More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1405 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1405  TrkA-N domain protein  100 
 
 		 218 aa  449  1e-125  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.364271  normal  0.729476 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16170  K+ transport system, NAD-binding component  71.16 
 
 		 221 aa  328  3e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.11506 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1917  TrkA-N domain protein  72.64 
 
 		 217 aa  327  7e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.678679  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1708  TrkA-N domain protein  68.4 
 
 		 216 aa  303  1.0000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0311888  normal  0.0547174 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1942  TrkA-N domain protein  63.21 
 
 		 216 aa  284  8e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0161521 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2285  TrkA-N domain-containing protein  56.48 
 
 		 221 aa  263  1e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.311674 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1642  TrkA-N domain protein  58.02 
 
 		 219 aa  255  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.623208  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6759  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  55.14 
 
 		 221 aa  250  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0519804 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1398  TrkA domain-containing protein  55.35 
 
 		 224 aa  249  2e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.870164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1641  TrkA domain-containing protein  56.48 
 
 		 223 aa  246  2e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0270311  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1562  TrkA-N domain protein  60.2 
 
 		 221 aa  246  2e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.308966  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1323  TrkA-like  56.67 
 
 		 264 aa  244  9e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1634  TrkA-N domain protein  56.02 
 
 		 224 aa  241  7e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000521907 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2903  TrkA domain-containing protein  57.89 
 
 		 220 aa  240  9e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1451  TrkA domain-containing protein  58.67 
 
 		 221 aa  238  4e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0437642  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1486  TrkA domain-containing protein  58.16 
 
 		 221 aa  235  4e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.370955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4527  TrkA-N domain-containing protein  57.14 
 
 		 221 aa  233  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.621759 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1521  TrkA-N domain protein  51.87 
 
 		 220 aa  232  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.709024  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1877  TrkA-N domain protein  56.25 
 
 		 222 aa  232  3e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.608746  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3756  TrkA-N domain protein  52.94 
 
 		 236 aa  228  6e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000258956  normal  0.472401 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1713  TrkA-N domain protein  53.05 
 
 		 222 aa  228  7e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2197  TrkA-N  48.85 
 
 		 217 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2257  TrkA-N domain protein  54.17 
 
 		 220 aa  223  2e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222998  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2243  TrkA domain-containing protein  48.85 
 
 		 217 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2186  TrkA domain-containing protein  48.85 
 
 		 217 aa  222  3e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0106506 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2473  TrkA domain-containing protein  48.37 
 
 		 223 aa  220  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.214066  normal  0.684987 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3927  TrkA domain-containing protein  48.37 
 
 		 234 aa  216  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0233751  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12706  trk system potassium uptake protein ceoB  48.37 
 
 		 227 aa  216  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5191  TrkA domain-containing protein  52.34 
 
 		 243 aa  210  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0357985  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2874  TrkA-N domain protein  52.76 
 
 		 242 aa  201  8e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.493191  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13070  K+ transport system, NAD-binding component  51.53 
 
 		 233 aa  200  9.999999999999999e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00265603  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1928  putative potassium transporter  49.53 
 
 		 224 aa  197  7.999999999999999e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.292607  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2406  TrkA domain-containing protein  44.02 
 
 		 214 aa  162  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.716891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3072  TrkA domain-containing protein  43.72 
 
 		 214 aa  162  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1923  TrkA-N domain protein  46.5 
 
 		 220 aa  155  6e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2660  TrkA domain-containing protein  39.5 
 
 		 214 aa  138  7e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0646767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3063  TrkA domain-containing protein  37 
 
 		 214 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2083  TrkA-N domain protein  34.36 
 
 		 210 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0807  TrkA-N domain protein  48.65 
 
 		 137 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0243  TrkA-N domain protein  43.65 
 
 		 206 aa  119  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0250  TrkA-N domain protein  40.94 
 
 		 219 aa  114  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00280  K+ transport system, NAD-binding component  30.77 
 
 		 219 aa  112  6e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1347  TrkA-N  42.4 
 
 		 134 aa  110  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0274494  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0027  potassium uptake protein, putative  45.54 
 
 		 134 aa  106  3e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.248151  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0026  TrkA domain-containing protein  44.64 
 
 		 134 aa  105  6e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_26  cation transport protein, Trk system  44.64 
 
 		 134 aa  104  8e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0437885  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01270  K+ transport system, NAD-binding component  38.4 
 
 		 219 aa  102  3e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0637  TrkA-N  30.96 
 
 		 219 aa  97.1  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0432302 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0253  TrkA-N domain protein  34.51 
 
 		 138 aa  89.4  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1685  TrkA domain-containing protein  30.16 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.124287  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2911  TrkA-N domain protein  33.59 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0359474  normal  0.209528 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1262  TrkA domain-containing protein  30.36 
 
 		 141 aa  82  0.000000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  30.71 
 
 		 218 aa  78.2  0.00000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1656  TrkA domain-containing protein  34.71 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153236  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  30.3 
 
 		 626 aa  75.1  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1729  TrkA domain-containing protein  33.88 
 
 		 143 aa  74.7  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000411585  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  24.77 
 
 		 221 aa  72  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  24.31 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  22.58 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3183  potassium transporter peripheral membrane component  23.66 
 
 		 465 aa  70.1  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00657284  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  32.28 
 
 		 630 aa  69.3  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  24.3 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  29.92 
 
 		 628 aa  67.4  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  23.83 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2242  potassium transporter peripheral membrane component  28.64 
 
 		 458 aa  64.3  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0521644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1358  potassium transporter peripheral membrane component  28.64 
 
 		 458 aa  64.3  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  23.83 
 
 		 221 aa  64.7  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0242  TrkA-N domain protein  30.43 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1041  TrkA domain-containing protein  30.38 
 
 		 452 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00019  potassium transporter peripheral membrane component  35.58 
 
 		 459 aa  63.5  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1348  hypothetical protein  26.49 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0533287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0914  potassium transporter peripheral membrane component  24.07 
 
 		 450 aa  63.2  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  29.13 
 
 		 617 aa  62.8  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  27.87 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0020  potassium transporter peripheral membrane component  33.65 
 
 		 459 aa  62  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.688304  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2841  potassium transporter peripheral membrane component  27.73 
 
 		 458 aa  60.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.340173  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0040  potassium transporter peripheral membrane component  30.91 
 
 		 469 aa  60.5  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.165147 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1453  potassium transporter peripheral membrane component  27.73 
 
 		 458 aa  60.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.687964  normal  0.06884 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04100  K+ transport system, NAD-binding component  31.25 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.453544  normal  0.632996 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1491  potassium transporter peripheral membrane component  28.18 
 
 		 458 aa  59.7  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.404255 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1067  hypothetical protein  34.21 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521072 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00290  K+ transport system, NAD-binding component  25.12 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0072  potassium transporter peripheral membrane component  29.63 
 
 		 458 aa  58.9  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1928  TrkA domain-containing protein  24.12 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0353  potassium transporter peripheral membrane component  34.29 
 
 		 458 aa  58.5  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3721  potassium transporter peripheral membrane component  35.11 
 
 		 458 aa  58.5  0.00000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.455601  hitchhiker  0.00773793 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1363  sodium/hydrogen exchanger  30.83 
 
 		 610 aa  58.5  0.00000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00040523  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3605  potassium transporter peripheral membrane component  25.56 
 
 		 458 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.267887  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0436  potassium transporter peripheral membrane component  32.98 
 
 		 458 aa  57.8  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0267  TrkA-N domain protein  22.61 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3265  hypothetical protein  29.17 
 
 		 612 aa  57.8  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.769883  normal  0.438481 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3713  potassium transporter peripheral membrane component  25.56 
 
 		 458 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.461523 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3678  potassium transporter peripheral membrane component  25.56 
 
 		 458 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3776  potassium transporter peripheral membrane component  25.56 
 
 		 458 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3606  potassium transporter peripheral membrane component  25.56 
 
 		 458 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.454415 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16160  K+ transport system, NAD-binding component  29.81 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.534565  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0769  TrkA-N domain protein  32.77 
 
 		 445 aa  58.2  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.601936 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3772  potassium transporter peripheral membrane component  35.11 
 
 		 458 aa  57  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.241443  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0424  potassium transporter peripheral membrane component  35.11 
 
 		 458 aa  57  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000421391 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2082  TrkA-N domain protein  23.14 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.124657  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>