More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1729 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1729  TrkA domain-containing protein  100 
 
 		 143 aa  291  3e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000411585  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1656  TrkA domain-containing protein  97.9 
 
 		 143 aa  265  2e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153236  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1262  TrkA domain-containing protein  45.26 
 
 		 141 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3072  TrkA domain-containing protein  42.86 
 
 		 214 aa  129  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2406  TrkA domain-containing protein  42.11 
 
 		 214 aa  125  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.716891  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0243  TrkA-N domain protein  41.35 
 
 		 206 aa  121  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0253  TrkA-N domain protein  44.12 
 
 		 138 aa  117  4.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1486  TrkA domain-containing protein  41.38 
 
 		 221 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.370955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1323  TrkA-like  41.38 
 
 		 264 aa  108  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4527  TrkA-N domain-containing protein  34.33 
 
 		 221 aa  104  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.621759 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2285  TrkA-N domain-containing protein  37.93 
 
 		 221 aa  103  7e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.311674 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1685  TrkA domain-containing protein  37.69 
 
 		 153 aa  103  8e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.124287  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1451  TrkA domain-containing protein  38.79 
 
 		 221 aa  103  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0437642  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1641  TrkA domain-containing protein  36.15 
 
 		 223 aa  102  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0270311  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1562  TrkA-N domain protein  38.46 
 
 		 221 aa  102  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.308966  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0637  TrkA-N  37.5 
 
 		 219 aa  101  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0432302 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0807  TrkA-N domain protein  37.98 
 
 		 137 aa  101  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1634  TrkA-N domain protein  35.38 
 
 		 224 aa  100  5e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000521907 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1642  TrkA-N domain protein  39.66 
 
 		 219 aa  99.8  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.623208  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6759  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  37.93 
 
 		 221 aa  99.4  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0519804 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3063  TrkA domain-containing protein  35.16 
 
 		 214 aa  99.8  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1928  putative potassium transporter  32.84 
 
 		 224 aa  99  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.292607  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3756  TrkA-N domain protein  35.04 
 
 		 236 aa  99.4  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000258956  normal  0.472401 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2257  TrkA-N domain protein  35.77 
 
 		 220 aa  98.2  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222998  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2911  TrkA-N domain protein  36.84 
 
 		 142 aa  98.2  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0359474  normal  0.209528 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16170  K+ transport system, NAD-binding component  37.93 
 
 		 221 aa  98.2  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.11506 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1398  TrkA domain-containing protein  38.79 
 
 		 224 aa  98.6  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.870164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5191  TrkA domain-containing protein  37.5 
 
 		 243 aa  98.2  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0357985  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2874  TrkA-N domain protein  37.07 
 
 		 242 aa  97.8  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.493191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2083  TrkA-N domain protein  36.75 
 
 		 210 aa  97.4  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1917  TrkA-N domain protein  40.18 
 
 		 217 aa  97.1  8e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.678679  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_26  cation transport protein, Trk system  33.33 
 
 		 134 aa  95.9  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0437885  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2660  TrkA domain-containing protein  35.94 
 
 		 214 aa  95.5  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0646767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1877  TrkA-N domain protein  33.6 
 
 		 222 aa  95.5  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.608746  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1708  TrkA-N domain protein  38.39 
 
 		 216 aa  95.5  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0311888  normal  0.0547174 
 
 
-
 
NC_002936  DET0027  potassium uptake protein, putative  32.58 
 
 		 134 aa  95.1  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.248151  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1919  TrkA domain-containing protein  43.33 
 
 		 144 aa  95.1  3e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2903  TrkA domain-containing protein  32.85 
 
 		 220 aa  95.1  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1347  TrkA-N  33.33 
 
 		 134 aa  94.4  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0274494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3927  TrkA domain-containing protein  35.54 
 
 		 234 aa  94  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0233751  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0250  TrkA-N domain protein  38.71 
 
 		 219 aa  94  7e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12706  trk system potassium uptake protein ceoB  35.65 
 
 		 227 aa  94  7e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0026  TrkA domain-containing protein  32.81 
 
 		 134 aa  93.6  9e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1521  TrkA-N domain protein  37.93 
 
 		 220 aa  91.7  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.709024  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2473  TrkA domain-containing protein  34.78 
 
 		 223 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.214066  normal  0.684987 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2186  TrkA domain-containing protein  37.5 
 
 		 217 aa  90.5  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0106506 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2197  TrkA-N  37.5 
 
 		 217 aa  90.5  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2243  TrkA domain-containing protein  37.5 
 
 		 217 aa  90.5  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1713  TrkA-N domain protein  39.66 
 
 		 222 aa  90.1  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1405  TrkA-N domain protein  33.88 
 
 		 218 aa  89.4  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.364271  normal  0.729476 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1923  TrkA-N domain protein  36.97 
 
 		 220 aa  87.8  5e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01270  K+ transport system, NAD-binding component  36.29 
 
 		 219 aa  87  7e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1942  TrkA-N domain protein  35.71 
 
 		 216 aa  86.7  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0161521 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13070  K+ transport system, NAD-binding component  33.62 
 
 		 233 aa  86.3  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00265603  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00280  K+ transport system, NAD-binding component  35.48 
 
 		 219 aa  85.1  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  34.21 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  34.21 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  34.21 
 
 		 221 aa  81.6  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1213  TrkA-N domain protein  33.04 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  32.77 
 
 		 628 aa  80.1  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  33.61 
 
 		 630 aa  78.6  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  36.44 
 
 		 626 aa  77.4  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  33.33 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1216  TrkA-N domain protein  30.43 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0251  TrkA-N domain protein  33.33 
 
 		 225 aa  75.1  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  33.59 
 
 		 221 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3062  TrkA domain-containing protein  35.78 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.793731  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2079  TrkA-N domain protein  28.7 
 
 		 225 aa  73.2  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  31.54 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1489  hypothetical protein  32.74 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00984888  normal  0.0109156 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00290  K+ transport system, NAD-binding component  31.01 
 
 		 226 aa  71.6  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2661  TrkA domain-containing protein  34.26 
 
 		 220 aa  71.6  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.202256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1794  hypothetical protein  31.01 
 
 		 222 aa  71.2  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  30.77 
 
 		 221 aa  70.9  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  27.56 
 
 		 223 aa  70.9  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  30.77 
 
 		 221 aa  70.9  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0436  potassium transporter peripheral membrane component  32.59 
 
 		 458 aa  70.5  0.000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2875  TrkA-N domain protein  32.61 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1261  TrkA domain-containing protein  27.07 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0353  potassium transporter peripheral membrane component  32.59 
 
 		 458 aa  70.1  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0072  potassium transporter peripheral membrane component  32.85 
 
 		 458 aa  69.3  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1348  hypothetical protein  31.97 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0533287  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2849  potassium transporter peripheral membrane component  32.35 
 
 		 457 aa  68.2  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.336578  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04100  K+ transport system, NAD-binding component  27.78 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.453544  normal  0.632996 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01280  K+ transport system, NAD-binding component  30.47 
 
 		 225 aa  67.4  0.00000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1941  TrkA-N domain protein  34.26 
 
 		 241 aa  67.4  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0298197 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1041  TrkA domain-containing protein  34.29 
 
 		 452 aa  67  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2082  TrkA-N domain protein  31.53 
 
 		 218 aa  67  0.00000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.124657  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4514  potassium transporter peripheral membrane component  31.85 
 
 		 458 aa  66.6  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00906883  hitchhiker  0.00000865676 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3757  TrkA-N domain protein  33.33 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000992935  normal  0.446525 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0112  TrkA-N domain protein  35.09 
 
 		 617 aa  66.2  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1399  TrkA domain-containing protein  32.11 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2476  potassium transporter peripheral membrane component  31.11 
 
 		 458 aa  66.2  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1929  putative potassium uptake protein  35.78 
 
 		 229 aa  65.1  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.123463  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03091  hypothetical protein  29.63 
 
 		 458 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3218  potassium transporter peripheral membrane component  32.59 
 
 		 454 aa  65.1  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.715113  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4612  potassium transporter peripheral membrane component  29.63 
 
 		 458 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00524775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3772  potassium transporter peripheral membrane component  29.63 
 
 		 458 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.241443  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0424  potassium transporter peripheral membrane component  29.63 
 
 		 458 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000421391 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3585  potassium transporter peripheral membrane component  29.63 
 
 		 458 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.931761  normal  0.13042 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>