219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_04100 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_04100  K+ transport system, NAD-binding component  100 
 
 		 152 aa  309  1e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.453544  normal  0.632996 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12706  trk system potassium uptake protein ceoB  37.93 
 
 		 227 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1398  TrkA domain-containing protein  35.96 
 
 		 224 aa  87.4  6e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.870164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3927  TrkA domain-containing protein  37.93 
 
 		 234 aa  87  9e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0233751  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2473  TrkA domain-containing protein  37.93 
 
 		 223 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.214066  normal  0.684987 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1521  TrkA-N domain protein  36.84 
 
 		 220 aa  85.5  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.709024  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1877  TrkA-N domain protein  36.72 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.608746  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1451  TrkA domain-containing protein  36.84 
 
 		 221 aa  80.5  0.000000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0437642  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2197  TrkA-N  35.71 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2083  TrkA-N domain protein  33.61 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2243  TrkA domain-containing protein  35.71 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2186  TrkA domain-containing protein  35.71 
 
 		 217 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0106506 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0243  TrkA-N domain protein  34.78 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2257  TrkA-N domain protein  36.21 
 
 		 220 aa  79  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222998  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2285  TrkA-N domain-containing protein  35.09 
 
 		 221 aa  78.6  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.311674 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0807  TrkA-N domain protein  30.33 
 
 		 137 aa  75.5  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2903  TrkA domain-containing protein  34.21 
 
 		 220 aa  75.5  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1486  TrkA domain-containing protein  34.21 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.370955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1262  TrkA domain-containing protein  31.71 
 
 		 141 aa  75.5  0.0000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1323  TrkA-like  33.33 
 
 		 264 aa  74.7  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1642  TrkA-N domain protein  35.09 
 
 		 219 aa  73.6  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.623208  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4527  TrkA-N domain-containing protein  34.21 
 
 		 221 aa  72  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.621759 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6759  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  33.33 
 
 		 221 aa  70.9  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0519804 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1347  TrkA-N  30.77 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0274494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5191  TrkA domain-containing protein  35.96 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0357985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2406  TrkA domain-containing protein  34.21 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.716891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1562  TrkA-N domain protein  33.33 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.308966  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1685  TrkA domain-containing protein  29.57 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.124287  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3072  TrkA domain-containing protein  33.33 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1656  TrkA domain-containing protein  27.78 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153236  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1729  TrkA domain-containing protein  27.78 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000411585  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1641  TrkA domain-containing protein  32.46 
 
 		 223 aa  67.4  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0270311  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16170  K+ transport system, NAD-binding component  32.46 
 
 		 221 aa  67  0.00000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.11506 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3756  TrkA-N domain protein  32.46 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000258956  normal  0.472401 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1634  TrkA-N domain protein  32.46 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000521907 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1405  TrkA-N domain protein  31.25 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.364271  normal  0.729476 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0250  TrkA-N domain protein  30.89 
 
 		 219 aa  64.7  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0253  TrkA-N domain protein  28.93 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_26  cation transport protein, Trk system  28 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0437885  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0026  TrkA domain-containing protein  28 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1942  TrkA-N domain protein  33.93 
 
 		 216 aa  64.3  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0161521 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3063  TrkA domain-containing protein  30.94 
 
 		 214 aa  64.7  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_002936  DET0027  potassium uptake protein, putative  28 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.248151  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1708  TrkA-N domain protein  30.36 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0311888  normal  0.0547174 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2874  TrkA-N domain protein  30.7 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.493191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2660  TrkA domain-containing protein  30.94 
 
 		 214 aa  62  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0646767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1917  TrkA-N domain protein  29.46 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.678679  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1928  putative potassium transporter  31.58 
 
 		 224 aa  60.8  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.292607  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0637  TrkA-N  27.59 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0432302 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1919  TrkA domain-containing protein  28.8 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1923  TrkA-N domain protein  36.84 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00290  K+ transport system, NAD-binding component  32 
 
 		 226 aa  58.2  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  33.62 
 
 		 626 aa  57.8  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00280  K+ transport system, NAD-binding component  26.83 
 
 		 219 aa  57  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1713  TrkA-N domain protein  33.33 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2079  TrkA-N domain protein  34.88 
 
 		 458 aa  55.1  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13070  K+ transport system, NAD-binding component  26.61 
 
 		 233 aa  54.7  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00265603  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2030  potassium transporter peripheral membrane component  27.72 
 
 		 465 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0693486  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  35 
 
 		 443 aa  54.3  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2911  TrkA-N domain protein  26.4 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0359474  normal  0.209528 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01270  K+ transport system, NAD-binding component  28.46 
 
 		 219 aa  53.9  0.0000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0017  potassium transporter peripheral membrane component  26.15 
 
 		 458 aa  52.8  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0014  TrkA domain-containing protein  25.93 
 
 		 457 aa  53.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0240987 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1877  potassium transporter peripheral membrane component  28.21 
 
 		 445 aa  52.8  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.113601 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0180  Trk system potassium uptake protein TrkA  29.13 
 
 		 457 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0016  potassium transporter peripheral membrane component  29.13 
 
 		 457 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1970  potassium transporter peripheral membrane component  29 
 
 		 453 aa  52.8  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.616677  normal  0.0915611 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1445  potassium transporter peripheral membrane component  30.69 
 
 		 457 aa  52.8  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000607771 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2907  potassium transporter peripheral membrane component  26.83 
 
 		 450 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000237268  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  34.19 
 
 		 628 aa  52.4  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2267  TrkA-N domain protein  27.45 
 
 		 459 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.634076  hitchhiker  0.00765776 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0612  potassium transporter peripheral membrane component  27 
 
 		 458 aa  52  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0369792  normal  0.0559785 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0313  potassium transporter peripheral membrane component  27 
 
 		 458 aa  52  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.888467  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3885  potassium transporter peripheral membrane component  27 
 
 		 458 aa  52  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0054195  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0021  potassium transporter peripheral membrane component  26.47 
 
 		 469 aa  51.6  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0139  TrkA-N domain protein  31.15 
 
 		 218 aa  51.6  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3971  potassium transporter peripheral membrane component  27.55 
 
 		 458 aa  51.2  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0755481  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0021  potassium transporter peripheral membrane component  26.47 
 
 		 469 aa  51.2  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3792  potassium transporter peripheral membrane component  27.55 
 
 		 458 aa  51.2  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00140  potassium transporter peripheral membrane component  26.72 
 
 		 457 aa  50.8  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35944  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3335  sodium/hydrogen exchanger  29.03 
 
 		 620 aa  50.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4514  potassium transporter peripheral membrane component  27.55 
 
 		 458 aa  50.8  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00906883  hitchhiker  0.00000865676 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2849  potassium transporter peripheral membrane component  26.53 
 
 		 457 aa  50.4  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.336578  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2911  potassium transporter peripheral membrane component  26.52 
 
 		 449 aa  50.4  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000908908  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  25.51 
 
 		 223 aa  50.4  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0353  potassium transporter peripheral membrane component  26.53 
 
 		 458 aa  50.4  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00019  potassium transporter peripheral membrane component  24.24 
 
 		 459 aa  49.7  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0020  potassium transporter peripheral membrane component  25.76 
 
 		 459 aa  50.1  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.688304  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3739  potassium transporter peripheral membrane component  25.74 
 
 		 469 aa  50.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00764602 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3721  potassium transporter peripheral membrane component  27 
 
 		 458 aa  49.7  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.455601  hitchhiker  0.00773793 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0021  potassium transporter peripheral membrane component  25.74 
 
 		 469 aa  50.1  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881079  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0424  TrkA-N domain protein  28 
 
 		 458 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0424  potassium transporter peripheral membrane component  28 
 
 		 458 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000421391 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3678  potassium transporter peripheral membrane component  28 
 
 		 458 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4612  potassium transporter peripheral membrane component  28 
 
 		 458 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00524775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0081  potassium transporter peripheral membrane component  24.51 
 
 		 458 aa  49.7  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4082  potassium transporter peripheral membrane component  25.98 
 
 		 467 aa  49.7  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03091  hypothetical protein  28 
 
 		 458 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3483  potassium transporter peripheral membrane component  28 
 
 		 458 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0624843  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3772  potassium transporter peripheral membrane component  28 
 
 		 458 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.241443  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>