More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1713 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1713  TrkA-N domain protein  100 
 
 
222 aa  444  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6759  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  73.85 
 
 
221 aa  338  4e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0519804 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2285  TrkA-N domain-containing protein  74.19 
 
 
221 aa  330  1e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.311674 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1642  TrkA-N domain protein  67.74 
 
 
219 aa  307  9e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.623208  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1634  TrkA-N domain protein  60.81 
 
 
224 aa  280  1e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000521907 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1398  TrkA domain-containing protein  61.82 
 
 
224 aa  278  6e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.870164  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1323  TrkA-like  67.84 
 
 
264 aa  273  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2903  TrkA domain-containing protein  61.01 
 
 
220 aa  272  3e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1562  TrkA-N domain protein  60.45 
 
 
221 aa  270  2e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.308966  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1641  TrkA domain-containing protein  60.37 
 
 
223 aa  269  2e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0270311  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1942  TrkA-N domain protein  62.74 
 
 
216 aa  269  2.9999999999999997e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0161521 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1917  TrkA-N domain protein  60.38 
 
 
217 aa  267  8e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.678679  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16170  K+ transport system, NAD-binding component  56.42 
 
 
221 aa  265  5.999999999999999e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.11506 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4527  TrkA-N domain-containing protein  58.9 
 
 
221 aa  258  5.0000000000000005e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.621759 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1708  TrkA-N domain protein  60.51 
 
 
216 aa  255  4e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0311888  normal  0.0547174 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1486  TrkA domain-containing protein  58.45 
 
 
221 aa  254  9e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.370955  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1928  putative potassium transporter  61.32 
 
 
224 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.292607  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1451  TrkA domain-containing protein  58.9 
 
 
221 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0437642  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1521  TrkA-N domain protein  58.72 
 
 
220 aa  247  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.709024  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1877  TrkA-N domain protein  56.16 
 
 
222 aa  244  4.9999999999999997e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.608746  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1405  TrkA-N domain protein  53.05 
 
 
218 aa  244  4.9999999999999997e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.364271  normal  0.729476 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2257  TrkA-N domain protein  58.74 
 
 
220 aa  243  1.9999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222998  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2874  TrkA-N domain protein  60.49 
 
 
242 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.493191  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5191  TrkA domain-containing protein  63.82 
 
 
243 aa  241  6e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0357985  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3756  TrkA-N domain protein  55.3 
 
 
236 aa  240  1e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000258956  normal  0.472401 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2473  TrkA domain-containing protein  56.36 
 
 
223 aa  234  8e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.214066  normal  0.684987 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2197  TrkA-N  62.24 
 
 
217 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2243  TrkA domain-containing protein  62.24 
 
 
217 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20721  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2186  TrkA domain-containing protein  61.73 
 
 
217 aa  232  3e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0106506 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12706  trk system potassium uptake protein ceoB  55.2 
 
 
227 aa  230  1e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3927  TrkA domain-containing protein  57.64 
 
 
234 aa  229  4e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0233751  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13070  K+ transport system, NAD-binding component  48.2 
 
 
233 aa  198  5e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00265603  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1923  TrkA-N domain protein  49.76 
 
 
220 aa  177  9e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3072  TrkA domain-containing protein  46.23 
 
 
214 aa  176  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2406  TrkA domain-containing protein  44.72 
 
 
214 aa  171  7.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.716891  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3063  TrkA domain-containing protein  38.97 
 
 
214 aa  150  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2660  TrkA domain-containing protein  38.97 
 
 
214 aa  145  5e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0646767  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0807  TrkA-N domain protein  46.62 
 
 
137 aa  131  7.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00280  K+ transport system, NAD-binding component  33.49 
 
 
219 aa  126  2.0000000000000002e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0243  TrkA-N domain protein  44.27 
 
 
206 aa  126  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2083  TrkA-N domain protein  32.55 
 
 
210 aa  123  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0027  potassium uptake protein, putative  46.15 
 
 
134 aa  121  9e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.248151  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0250  TrkA-N domain protein  32.56 
 
 
219 aa  121  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0026  TrkA domain-containing protein  45.38 
 
 
134 aa  119  3e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0637  TrkA-N  33.18 
 
 
219 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0432302 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_26  cation transport protein, Trk system  45.38 
 
 
134 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0437885  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01270  K+ transport system, NAD-binding component  30.7 
 
 
219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1347  TrkA-N  40 
 
 
134 aa  109  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0274494  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  35.59 
 
 
626 aa  103  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0253  TrkA-N domain protein  37.61 
 
 
138 aa  98.2  8e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  33.8 
 
 
628 aa  97.1  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00290  K+ transport system, NAD-binding component  31.36 
 
 
226 aa  93.2  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3792  potassium transporter peripheral membrane component  30.34 
 
 
458 aa  92.4  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3713  potassium transporter peripheral membrane component  31.62 
 
 
458 aa  92.4  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.461523 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3606  potassium transporter peripheral membrane component  31.62 
 
 
458 aa  92.4  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.454415 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3776  potassium transporter peripheral membrane component  31.62 
 
 
458 aa  92.4  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3678  potassium transporter peripheral membrane component  31.62 
 
 
458 aa  92.4  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3605  potassium transporter peripheral membrane component  31.62 
 
 
458 aa  92.4  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.267887  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3971  potassium transporter peripheral membrane component  30.34 
 
 
458 aa  92  6e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0755481  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03140  potassium transporter peripheral membrane component  31.62 
 
 
458 aa  91.7  8e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.946548  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0424  TrkA-N domain protein  31.62 
 
 
458 aa  91.7  8e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3585  potassium transporter peripheral membrane component  31.62 
 
 
458 aa  91.7  8e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.931761  normal  0.13042 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0424  potassium transporter peripheral membrane component  31.62 
 
 
458 aa  91.7  8e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000421391 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03091  hypothetical protein  31.62 
 
 
458 aa  91.7  8e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1656  TrkA domain-containing protein  40.52 
 
 
143 aa  91.7  8e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153236  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3772  potassium transporter peripheral membrane component  31.62 
 
 
458 aa  91.7  8e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.241443  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3483  potassium transporter peripheral membrane component  31.62 
 
 
458 aa  91.7  8e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0624843  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3674  potassium transporter peripheral membrane component  31.62 
 
 
458 aa  91.7  8e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0436  potassium transporter peripheral membrane component  29.06 
 
 
458 aa  91.7  8e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4612  potassium transporter peripheral membrane component  31.62 
 
 
458 aa  91.7  8e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00524775  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0353  potassium transporter peripheral membrane component  29.49 
 
 
458 aa  90.9  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  26.15 
 
 
218 aa  91.3  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2911  TrkA-N domain protein  36.84 
 
 
142 aa  91.3  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0359474  normal  0.209528 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1729  TrkA domain-containing protein  39.66 
 
 
143 aa  90.9  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000411585  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4514  potassium transporter peripheral membrane component  29.91 
 
 
458 aa  90.1  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00906883  hitchhiker  0.00000865676 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  28.5 
 
 
221 aa  89  5e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3721  potassium transporter peripheral membrane component  31.62 
 
 
458 aa  89  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.455601  hitchhiker  0.00773793 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  28.5 
 
 
221 aa  87.4  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3885  potassium transporter peripheral membrane component  29.49 
 
 
458 aa  87  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0054195  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1262  TrkA domain-containing protein  27.07 
 
 
141 aa  87  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0612  potassium transporter peripheral membrane component  29.49 
 
 
458 aa  87  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0369792  normal  0.0559785 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0313  potassium transporter peripheral membrane component  29.49 
 
 
458 aa  87  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.888467  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  29.44 
 
 
221 aa  86.7  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00019  potassium transporter peripheral membrane component  29.66 
 
 
459 aa  87  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0072  potassium transporter peripheral membrane component  30.08 
 
 
458 aa  86.3  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0081  potassium transporter peripheral membrane component  27.78 
 
 
458 aa  86.3  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0020  potassium transporter peripheral membrane component  28.63 
 
 
459 aa  86.3  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.688304  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1348  hypothetical protein  28.37 
 
 
220 aa  85.9  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0533287  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0242  TrkA-N domain protein  27.05 
 
 
221 aa  84.3  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0017  potassium transporter peripheral membrane component  29.66 
 
 
458 aa  84  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2082  TrkA-N domain protein  26.29 
 
 
218 aa  83.6  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.124657  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  26.64 
 
 
221 aa  83.6  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  29.38 
 
 
630 aa  83.6  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0251  TrkA-N domain protein  27.98 
 
 
225 aa  82.8  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002054  Trk system potassium uptake protein TrkA  29.13 
 
 
458 aa  82.4  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00394  potassium transporter peripheral membrane component  29.13 
 
 
458 aa  82.4  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2476  potassium transporter peripheral membrane component  29.24 
 
 
458 aa  82  0.000000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0312  potassium transporter peripheral membrane component  25.23 
 
 
449 aa  80.9  0.00000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0720169  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  28.76 
 
 
617 aa  81.3  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0914  potassium transporter peripheral membrane component  27.4 
 
 
450 aa  80.5  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>