291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1708 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1708  TrkA-N domain protein  100 
 
 
216 aa  436  1e-121  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0311888  normal  0.0547174 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16170  K+ transport system, NAD-binding component  74.07 
 
 
221 aa  336  1.9999999999999998e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.11506 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1917  TrkA-N domain protein  71.7 
 
 
217 aa  318  3e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.678679  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1405  TrkA-N domain protein  68.4 
 
 
218 aa  303  1.0000000000000001e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.364271  normal  0.729476 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1942  TrkA-N domain protein  68.4 
 
 
216 aa  298  6e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0161521 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1562  TrkA-N domain protein  62.96 
 
 
221 aa  270  1e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.308966  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1642  TrkA-N domain protein  62.74 
 
 
219 aa  266  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.623208  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6759  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  60.38 
 
 
221 aa  265  4e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0519804 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1641  TrkA domain-containing protein  60.56 
 
 
223 aa  264  7e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0270311  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2285  TrkA-N domain-containing protein  58.69 
 
 
221 aa  263  2e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.311674 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1634  TrkA-N domain protein  60.75 
 
 
224 aa  261  4.999999999999999e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000521907 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1398  TrkA domain-containing protein  63.08 
 
 
224 aa  256  3e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.870164  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2903  TrkA domain-containing protein  58.02 
 
 
220 aa  250  1e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1323  TrkA-like  58.96 
 
 
264 aa  248  4e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1486  TrkA domain-containing protein  58.29 
 
 
221 aa  244  9.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.370955  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4527  TrkA-N domain-containing protein  60.2 
 
 
221 aa  239  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.621759 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1451  TrkA domain-containing protein  57.82 
 
 
221 aa  238  4e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0437642  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1713  TrkA-N domain protein  60.51 
 
 
222 aa  235  5.0000000000000005e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3756  TrkA-N domain protein  56.48 
 
 
236 aa  229  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000258956  normal  0.472401 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1877  TrkA-N domain protein  56.72 
 
 
222 aa  227  9e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.608746  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5191  TrkA domain-containing protein  58.49 
 
 
243 aa  225  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0357985  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3927  TrkA domain-containing protein  50.46 
 
 
234 aa  216  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0233751  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2874  TrkA-N domain protein  56.28 
 
 
242 aa  215  5e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.493191  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1521  TrkA-N domain protein  54.12 
 
 
220 aa  214  5.9999999999999996e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.709024  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2257  TrkA-N domain protein  52.08 
 
 
220 aa  214  9.999999999999999e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222998  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2473  TrkA domain-containing protein  50.46 
 
 
223 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.214066  normal  0.684987 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1928  putative potassium transporter  54.72 
 
 
224 aa  211  4.9999999999999996e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.292607  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13070  K+ transport system, NAD-binding component  53.59 
 
 
233 aa  211  7.999999999999999e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00265603  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2197  TrkA-N  51.85 
 
 
217 aa  211  9e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2243  TrkA domain-containing protein  51.85 
 
 
217 aa  211  9e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20721  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2186  TrkA domain-containing protein  51.85 
 
 
217 aa  210  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0106506 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12706  trk system potassium uptake protein ceoB  52.06 
 
 
227 aa  205  3e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1923  TrkA-N domain protein  51.58 
 
 
220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2406  TrkA domain-containing protein  44.83 
 
 
214 aa  165  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.716891  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3072  TrkA domain-containing protein  43.3 
 
 
214 aa  164  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3063  TrkA domain-containing protein  41.24 
 
 
214 aa  149  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2660  TrkA domain-containing protein  39.69 
 
 
214 aa  139  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0646767  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0807  TrkA-N domain protein  49.55 
 
 
137 aa  123  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0243  TrkA-N domain protein  31.77 
 
 
206 aa  115  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2083  TrkA-N domain protein  29.02 
 
 
210 aa  109  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0027  potassium uptake protein, putative  43.2 
 
 
134 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.248151  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00280  K+ transport system, NAD-binding component  31.79 
 
 
219 aa  109  4.0000000000000004e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0250  TrkA-N domain protein  40.94 
 
 
219 aa  108  7.000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_26  cation transport protein, Trk system  42.4 
 
 
134 aa  107  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0437885  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0026  TrkA domain-containing protein  42.4 
 
 
134 aa  107  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0637  TrkA-N  30.93 
 
 
219 aa  107  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0432302 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01270  K+ transport system, NAD-binding component  36.8 
 
 
219 aa  97.8  1e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1347  TrkA-N  39.2 
 
 
134 aa  97.4  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0274494  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  31.19 
 
 
630 aa  90.9  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  32.18 
 
 
626 aa  90.9  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0253  TrkA-N domain protein  36.28 
 
 
138 aa  90.9  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  29.02 
 
 
218 aa  85.9  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  30.2 
 
 
628 aa  80.1  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1656  TrkA domain-containing protein  39.29 
 
 
143 aa  80.1  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153236  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1729  TrkA domain-containing protein  38.39 
 
 
143 aa  79.3  0.00000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000411585  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1262  TrkA domain-containing protein  30.36 
 
 
141 aa  79.3  0.00000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00019  potassium transporter peripheral membrane component  28.24 
 
 
459 aa  76.3  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2911  TrkA-N domain protein  32.03 
 
 
142 aa  75.1  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0359474  normal  0.209528 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3183  potassium transporter peripheral membrane component  25.37 
 
 
465 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00657284  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  29.95 
 
 
443 aa  69.7  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0016  potassium transporter peripheral membrane component  29.49 
 
 
457 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0112  TrkA-N domain protein  30.7 
 
 
617 aa  69.3  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  22.97 
 
 
221 aa  69.3  0.00000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00290  K+ transport system, NAD-binding component  30.67 
 
 
226 aa  68.2  0.00000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0072  potassium transporter peripheral membrane component  26.32 
 
 
458 aa  68.6  0.00000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3721  potassium transporter peripheral membrane component  29.88 
 
 
458 aa  67.8  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.455601  hitchhiker  0.00773793 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3713  potassium transporter peripheral membrane component  27.36 
 
 
458 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.461523 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3678  potassium transporter peripheral membrane component  27.36 
 
 
458 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3605  potassium transporter peripheral membrane component  27.36 
 
 
458 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.267887  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1685  TrkA domain-containing protein  26.19 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.124287  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  27.2 
 
 
221 aa  67  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3606  potassium transporter peripheral membrane component  27.36 
 
 
458 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.454415 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0266  potassium transporter peripheral membrane component  26.02 
 
 
445 aa  67  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  27.2 
 
 
221 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3776  potassium transporter peripheral membrane component  27.36 
 
 
458 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03140  potassium transporter peripheral membrane component  27.36 
 
 
458 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.946548  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0424  TrkA-N domain protein  27.36 
 
 
458 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0424  potassium transporter peripheral membrane component  27.36 
 
 
458 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000421391 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0180  Trk system potassium uptake protein TrkA  29.03 
 
 
457 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3772  potassium transporter peripheral membrane component  27.36 
 
 
458 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.241443  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3483  potassium transporter peripheral membrane component  27.36 
 
 
458 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0624843  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0242  TrkA-N domain protein  21.4 
 
 
221 aa  66.6  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3585  potassium transporter peripheral membrane component  27.36 
 
 
458 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.931761  normal  0.13042 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4612  potassium transporter peripheral membrane component  27.36 
 
 
458 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00524775  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03091  hypothetical protein  27.36 
 
 
458 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3674  potassium transporter peripheral membrane component  27.36 
 
 
458 aa  66.6  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0353  potassium transporter peripheral membrane component  25.47 
 
 
458 aa  65.9  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0201  potassium transporter peripheral membrane component  27.36 
 
 
457 aa  65.9  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0211158  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3218  potassium transporter peripheral membrane component  27.05 
 
 
454 aa  65.5  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.715113  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  31.3 
 
 
617 aa  65.5  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2476  potassium transporter peripheral membrane component  26.32 
 
 
458 aa  65.5  0.0000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0020  potassium transporter peripheral membrane component  26.48 
 
 
459 aa  64.7  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.688304  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3335  sodium/hydrogen exchanger  28.36 
 
 
620 aa  64.7  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  26.4 
 
 
221 aa  64.3  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0436  potassium transporter peripheral membrane component  26.83 
 
 
458 aa  64.7  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0014  potassium transporter peripheral membrane component  27.98 
 
 
458 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00830339  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2841  potassium transporter peripheral membrane component  30.84 
 
 
458 aa  63.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.340173  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3792  potassium transporter peripheral membrane component  26.83 
 
 
458 aa  63.9  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1453  potassium transporter peripheral membrane component  30.84 
 
 
458 aa  63.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.687964  normal  0.06884 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1491  potassium transporter peripheral membrane component  30.84 
 
 
458 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.404255 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>