More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0807 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0807  TrkA-N domain protein  100 
 
 
137 aa  276  1e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0027  potassium uptake protein, putative  56.92 
 
 
134 aa  158  2e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.248151  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0026  TrkA domain-containing protein  56.15 
 
 
134 aa  157  5e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_26  cation transport protein, Trk system  56.15 
 
 
134 aa  157  5e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0437885  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3072  TrkA domain-containing protein  52.59 
 
 
214 aa  149  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0243  TrkA-N domain protein  56.35 
 
 
206 aa  149  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2406  TrkA domain-containing protein  54.76 
 
 
214 aa  147  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.716891  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1634  TrkA-N domain protein  46.21 
 
 
224 aa  139  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000521907 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1641  TrkA domain-containing protein  45.45 
 
 
223 aa  135  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0270311  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1486  TrkA domain-containing protein  49.62 
 
 
221 aa  135  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.370955  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2257  TrkA-N domain protein  52.85 
 
 
220 aa  134  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222998  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1323  TrkA-like  47.37 
 
 
264 aa  133  9e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2903  TrkA domain-containing protein  52.59 
 
 
220 aa  132  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1451  TrkA domain-containing protein  54.24 
 
 
221 aa  133  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0437642  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1562  TrkA-N domain protein  45.99 
 
 
221 aa  131  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.308966  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3063  TrkA domain-containing protein  48.74 
 
 
214 aa  130  5e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1877  TrkA-N domain protein  44.36 
 
 
222 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.608746  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2285  TrkA-N domain-containing protein  46.62 
 
 
221 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.311674 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2660  TrkA domain-containing protein  51.26 
 
 
214 aa  129  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0646767  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12706  trk system potassium uptake protein ceoB  49.59 
 
 
227 aa  128  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1642  TrkA-N domain protein  51.72 
 
 
219 aa  127  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.623208  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3756  TrkA-N domain protein  47.83 
 
 
236 aa  125  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000258956  normal  0.472401 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0250  TrkA-N domain protein  42.22 
 
 
219 aa  126  1.0000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2083  TrkA-N domain protein  46.03 
 
 
210 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16170  K+ transport system, NAD-binding component  46.61 
 
 
221 aa  124  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.11506 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6759  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  45.11 
 
 
221 aa  124  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0519804 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4527  TrkA-N domain-containing protein  49.15 
 
 
221 aa  124  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.621759 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1708  TrkA-N domain protein  49.55 
 
 
216 aa  123  7e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0311888  normal  0.0547174 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01270  K+ transport system, NAD-binding component  44.96 
 
 
219 aa  122  1e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00280  K+ transport system, NAD-binding component  45.38 
 
 
219 aa  122  1e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1942  TrkA-N domain protein  45.8 
 
 
216 aa  121  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0161521 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2473  TrkA domain-containing protein  47.97 
 
 
223 aa  121  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.214066  normal  0.684987 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1398  TrkA domain-containing protein  43.18 
 
 
224 aa  120  5e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.870164  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1521  TrkA-N domain protein  50 
 
 
220 aa  120  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.709024  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1928  putative potassium transporter  50 
 
 
224 aa  120  8e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.292607  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0253  TrkA-N domain protein  44.27 
 
 
138 aa  120  8e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1405  TrkA-N domain protein  48.65 
 
 
218 aa  120  8e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.364271  normal  0.729476 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3927  TrkA domain-containing protein  47.15 
 
 
234 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0233751  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1347  TrkA-N  42.31 
 
 
134 aa  118  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0274494  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1917  TrkA-N domain protein  47.75 
 
 
217 aa  117  4.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.678679  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1923  TrkA-N domain protein  55 
 
 
220 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1713  TrkA-N domain protein  46.62 
 
 
222 aa  117  6e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2874  TrkA-N domain protein  43.51 
 
 
242 aa  117  7.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.493191  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2197  TrkA-N  49.15 
 
 
217 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2243  TrkA domain-containing protein  49.15 
 
 
217 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20721  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2186  TrkA domain-containing protein  49.15 
 
 
217 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0106506 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0637  TrkA-N  42.98 
 
 
219 aa  113  8.999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0432302 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13070  K+ transport system, NAD-binding component  40.3 
 
 
233 aa  108  4.0000000000000004e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00265603  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5191  TrkA domain-containing protein  49.14 
 
 
243 aa  107  7.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0357985  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2911  TrkA-N domain protein  40.74 
 
 
142 aa  103  8e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0359474  normal  0.209528 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1262  TrkA domain-containing protein  36.29 
 
 
141 aa  95.5  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  38.21 
 
 
218 aa  90.1  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0251  TrkA-N domain protein  35.34 
 
 
225 aa  88.6  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1729  TrkA domain-containing protein  37.98 
 
 
143 aa  88.2  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000411585  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1656  TrkA domain-containing protein  38.28 
 
 
143 aa  87.8  5e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153236  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4514  potassium transporter peripheral membrane component  43.14 
 
 
458 aa  87.4  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00906883  hitchhiker  0.00000865676 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01280  K+ transport system, NAD-binding component  36.92 
 
 
225 aa  87.4  6e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00290  K+ transport system, NAD-binding component  36.15 
 
 
226 aa  87.4  7e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0313  potassium transporter peripheral membrane component  43.43 
 
 
458 aa  87  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.888467  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0612  potassium transporter peripheral membrane component  43.43 
 
 
458 aa  87  8e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0369792  normal  0.0559785 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3885  potassium transporter peripheral membrane component  43.43 
 
 
458 aa  87  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0054195  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  37.1 
 
 
221 aa  86.3  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0020  potassium transporter peripheral membrane component  40.74 
 
 
459 aa  86.3  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.688304  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  40.34 
 
 
626 aa  86.7  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0187  potassium transporter peripheral membrane component  36.92 
 
 
465 aa  85.5  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0353  potassium transporter peripheral membrane component  41.41 
 
 
458 aa  85.1  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0436  potassium transporter peripheral membrane component  41.41 
 
 
458 aa  85.1  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  36.29 
 
 
221 aa  85.1  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00019  potassium transporter peripheral membrane component  40.74 
 
 
459 aa  85.1  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3792  potassium transporter peripheral membrane component  42.42 
 
 
458 aa  84.3  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3971  potassium transporter peripheral membrane component  42.42 
 
 
458 aa  84.3  5e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0755481  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0017  potassium transporter peripheral membrane component  36.89 
 
 
457 aa  84  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.290257  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3776  potassium transporter peripheral membrane component  41.18 
 
 
458 aa  84  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00170  potassium transporter peripheral membrane component  40.2 
 
 
457 aa  84  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3678  potassium transporter peripheral membrane component  41.18 
 
 
458 aa  84  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3713  potassium transporter peripheral membrane component  41.18 
 
 
458 aa  84  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.461523 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3606  potassium transporter peripheral membrane component  41.18 
 
 
458 aa  84  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.454415 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3721  potassium transporter peripheral membrane component  40.2 
 
 
458 aa  84  7e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.455601  hitchhiker  0.00773793 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3605  potassium transporter peripheral membrane component  41.18 
 
 
458 aa  84  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.267887  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03140  potassium transporter peripheral membrane component  41.18 
 
 
458 aa  83.6  8e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.946548  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0424  TrkA-N domain protein  41.18 
 
 
458 aa  83.6  8e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  35.48 
 
 
221 aa  83.6  8e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3483  potassium transporter peripheral membrane component  41.18 
 
 
458 aa  83.6  8e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0624843  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03091  hypothetical protein  41.18 
 
 
458 aa  83.6  8e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3772  potassium transporter peripheral membrane component  41.18 
 
 
458 aa  83.6  8e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.241443  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3585  potassium transporter peripheral membrane component  41.18 
 
 
458 aa  83.6  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.931761  normal  0.13042 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4612  potassium transporter peripheral membrane component  41.18 
 
 
458 aa  83.6  8e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00524775  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3674  potassium transporter peripheral membrane component  41.18 
 
 
458 aa  83.6  8e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0424  potassium transporter peripheral membrane component  41.18 
 
 
458 aa  83.6  8e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000421391 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0065  potassium transporter peripheral membrane component  41.41 
 
 
457 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948816  unclonable  0.000000448887 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0081  potassium transporter peripheral membrane component  41.41 
 
 
457 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  hitchhiker  0.0000000000177319 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0014  TrkA domain-containing protein  38.98 
 
 
457 aa  83.2  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0240987 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0052  potassium transporter peripheral membrane component  38.71 
 
 
457 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00140  potassium transporter peripheral membrane component  42.42 
 
 
457 aa  83.2  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35944  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0021  potassium transporter peripheral membrane component  39.13 
 
 
469 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881079  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0026  potassium transporter peripheral membrane component  38.26 
 
 
469 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.570638  hitchhiker  0.00237688 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0024  potassium transporter peripheral membrane component  38.26 
 
 
469 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.738729  normal  0.0894147 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2476  potassium transporter peripheral membrane component  41.18 
 
 
458 aa  82.8  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0040  potassium transporter peripheral membrane component  39.13 
 
 
469 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.165147 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0081  potassium transporter peripheral membrane component  41.41 
 
 
457 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685696  normal  0.107342 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>