More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2903 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2903  TrkA domain-containing protein  100 
 
 
220 aa  449  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6759  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  60.73 
 
 
221 aa  272  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0519804 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2285  TrkA-N domain-containing protein  59.36 
 
 
221 aa  265  4e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.311674 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1642  TrkA-N domain protein  58.53 
 
 
219 aa  259  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.623208  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1562  TrkA-N domain protein  56.88 
 
 
221 aa  255  4e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.308966  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1486  TrkA domain-containing protein  59.8 
 
 
221 aa  254  8e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.370955  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1713  TrkA-N domain protein  61.01 
 
 
222 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1451  TrkA domain-containing protein  60.78 
 
 
221 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0437642  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1323  TrkA-like  56.42 
 
 
264 aa  250  1e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1634  TrkA-N domain protein  56.36 
 
 
224 aa  250  1e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000521907 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1708  TrkA-N domain protein  58.02 
 
 
216 aa  250  2e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0311888  normal  0.0547174 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16170  K+ transport system, NAD-binding component  56.22 
 
 
221 aa  248  3e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.11506 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1641  TrkA domain-containing protein  57.27 
 
 
223 aa  249  3e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0270311  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1398  TrkA domain-containing protein  57.21 
 
 
224 aa  248  4e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.870164  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1942  TrkA-N domain protein  58.14 
 
 
216 aa  248  5e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0161521 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1917  TrkA-N domain protein  56.54 
 
 
217 aa  247  9e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.678679  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1521  TrkA-N domain protein  55.25 
 
 
220 aa  243  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.709024  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1405  TrkA-N domain protein  57.89 
 
 
218 aa  240  1e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.364271  normal  0.729476 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4527  TrkA-N domain-containing protein  59.69 
 
 
221 aa  240  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.621759 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1877  TrkA-N domain protein  53.92 
 
 
222 aa  238  6.999999999999999e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.608746  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2257  TrkA-N domain protein  54.55 
 
 
220 aa  229  3e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222998  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3756  TrkA-N domain protein  55.72 
 
 
236 aa  228  4e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000258956  normal  0.472401 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2874  TrkA-N domain protein  56.37 
 
 
242 aa  226  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.493191  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1928  putative potassium transporter  58.62 
 
 
224 aa  224  8e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.292607  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5191  TrkA domain-containing protein  53.67 
 
 
243 aa  221  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0357985  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12706  trk system potassium uptake protein ceoB  53.27 
 
 
227 aa  219  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2473  TrkA domain-containing protein  50.23 
 
 
223 aa  213  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.214066  normal  0.684987 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2197  TrkA-N  50.47 
 
 
217 aa  212  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2243  TrkA domain-containing protein  50.47 
 
 
217 aa  212  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20721  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2186  TrkA domain-containing protein  50 
 
 
217 aa  211  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0106506 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3927  TrkA domain-containing protein  52.76 
 
 
234 aa  209  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0233751  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13070  K+ transport system, NAD-binding component  51.13 
 
 
233 aa  204  8e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00265603  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1923  TrkA-N domain protein  50.26 
 
 
220 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2406  TrkA domain-containing protein  40.3 
 
 
214 aa  156  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.716891  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3072  TrkA domain-containing protein  39.8 
 
 
214 aa  155  6e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3063  TrkA domain-containing protein  39.8 
 
 
214 aa  154  7e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2660  TrkA domain-containing protein  40.8 
 
 
214 aa  152  5e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0646767  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0243  TrkA-N domain protein  35.12 
 
 
206 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0807  TrkA-N domain protein  52.59 
 
 
137 aa  132  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00280  K+ transport system, NAD-binding component  32.21 
 
 
219 aa  128  8.000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2083  TrkA-N domain protein  34.48 
 
 
210 aa  125  6e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0250  TrkA-N domain protein  34.93 
 
 
219 aa  124  8.000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0637  TrkA-N  30.54 
 
 
219 aa  118  6e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0432302 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_26  cation transport protein, Trk system  47.86 
 
 
134 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0437885  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0026  TrkA domain-containing protein  47.86 
 
 
134 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01270  K+ transport system, NAD-binding component  40.31 
 
 
219 aa  116  3e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0027  potassium uptake protein, putative  47.01 
 
 
134 aa  115  5e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.248151  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1347  TrkA-N  44.12 
 
 
134 aa  108  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0274494  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0253  TrkA-N domain protein  38.46 
 
 
138 aa  100  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1262  TrkA domain-containing protein  31.62 
 
 
141 aa  93.2  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  31.34 
 
 
628 aa  86.3  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1656  TrkA domain-containing protein  33.58 
 
 
143 aa  85.9  4e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153236  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3183  potassium transporter peripheral membrane component  23.35 
 
 
465 aa  85.9  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00657284  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2082  TrkA-N domain protein  29.25 
 
 
218 aa  85.5  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.124657  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1729  TrkA domain-containing protein  32.85 
 
 
143 aa  85.1  8e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000411585  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2911  TrkA-N domain protein  33.83 
 
 
142 aa  84.3  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0359474  normal  0.209528 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1348  hypothetical protein  27.49 
 
 
220 aa  82.8  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0533287  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  25.25 
 
 
218 aa  82.8  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00290  K+ transport system, NAD-binding component  28.5 
 
 
226 aa  82.4  0.000000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  29.81 
 
 
626 aa  82.4  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  27.9 
 
 
630 aa  82  0.000000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0312  potassium transporter peripheral membrane component  25.68 
 
 
449 aa  79.3  0.00000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0720169  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4070  potassium transporter peripheral membrane component  42.16 
 
 
471 aa  79  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000101925 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0242  TrkA-N domain protein  24.06 
 
 
221 aa  78.6  0.00000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0251  TrkA-N domain protein  25.84 
 
 
225 aa  77.8  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1041  TrkA domain-containing protein  33.92 
 
 
452 aa  77  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00019  potassium transporter peripheral membrane component  29.95 
 
 
459 aa  76.3  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0266  potassium transporter peripheral membrane component  29.91 
 
 
445 aa  75.1  0.0000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  29.01 
 
 
221 aa  75.1  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  28.24 
 
 
221 aa  75.1  0.0000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0020  potassium transporter peripheral membrane component  28.18 
 
 
457 aa  75.1  0.0000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1261  TrkA domain-containing protein  22.28 
 
 
219 aa  74.7  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  29.01 
 
 
221 aa  74.7  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  28.02 
 
 
223 aa  74.3  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0180  Trk system potassium uptake protein TrkA  28.96 
 
 
457 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  25.37 
 
 
221 aa  72.4  0.000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  28.24 
 
 
221 aa  72.4  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0029  potassium transporter peripheral membrane component  29.51 
 
 
469 aa  72  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0542  TrkA-N domain protein  24.49 
 
 
215 aa  72.4  0.000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.840001  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0021  potassium transporter peripheral membrane component  29.75 
 
 
469 aa  72  0.000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0020  potassium transporter peripheral membrane component  27.96 
 
 
459 aa  71.6  0.000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.688304  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03140  potassium transporter peripheral membrane component  27.54 
 
 
458 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.946548  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0424  TrkA-N domain protein  27.54 
 
 
458 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1400  TrkA-N domain-containing protein  29.7 
 
 
227 aa  71.2  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1655  TrkA domain-containing protein  30.25 
 
 
218 aa  71.2  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000867889  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0016  potassium transporter peripheral membrane component  28.91 
 
 
457 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4396  potassium transporter peripheral membrane component  27 
 
 
458 aa  70.9  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0641614  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1728  TrkA domain-containing protein  25.11 
 
 
218 aa  71.2  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000194267  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3713  potassium transporter peripheral membrane component  27.54 
 
 
458 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.461523 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3776  potassium transporter peripheral membrane component  27.54 
 
 
458 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3674  potassium transporter peripheral membrane component  27.54 
 
 
458 aa  71.2  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3261  potassium transporter peripheral membrane component  34.95 
 
 
484 aa  70.9  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.386779  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3678  potassium transporter peripheral membrane component  27.54 
 
 
458 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3483  potassium transporter peripheral membrane component  27.54 
 
 
458 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0624843  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3772  potassium transporter peripheral membrane component  27.54 
 
 
458 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.241443  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3606  potassium transporter peripheral membrane component  27.54 
 
 
458 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.454415 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3912  potassium transporter peripheral membrane component  34.95 
 
 
484 aa  70.9  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  30.97 
 
 
221 aa  70.9  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0424  potassium transporter peripheral membrane component  27.54 
 
 
458 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000421391 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3605  potassium transporter peripheral membrane component  27.54 
 
 
458 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.267887  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>