More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1923 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1923  TrkA-N domain protein  100 
 
 		 220 aa  427  1e-119  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1942  TrkA-N domain protein  53.59 
 
 		 216 aa  192  3e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0161521 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4527  TrkA-N domain-containing protein  48.24 
 
 		 221 aa  190  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.621759 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2285  TrkA-N domain-containing protein  49.76 
 
 		 221 aa  190  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.311674 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1642  TrkA-N domain protein  49.76 
 
 		 219 aa  190  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.623208  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1323  TrkA-like  51.92 
 
 		 264 aa  188  4e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6759  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  51.74 
 
 		 221 aa  188  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0519804 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1398  TrkA domain-containing protein  49.04 
 
 		 224 aa  188  5.999999999999999e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.870164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1562  TrkA-N domain protein  51.71 
 
 		 221 aa  187  8e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.308966  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2874  TrkA-N domain protein  51.71 
 
 		 242 aa  187  8e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.493191  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1708  TrkA-N domain protein  51.58 
 
 		 216 aa  187  9e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0311888  normal  0.0547174 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3756  TrkA-N domain protein  49.28 
 
 		 236 aa  187  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000258956  normal  0.472401 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2406  TrkA domain-containing protein  48.57 
 
 		 214 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.716891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1486  TrkA domain-containing protein  49.75 
 
 		 221 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.370955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1877  TrkA-N domain protein  47.03 
 
 		 222 aa  181  7e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.608746  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2903  TrkA domain-containing protein  50.26 
 
 		 220 aa  181  9.000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3072  TrkA domain-containing protein  49 
 
 		 214 aa  180  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1641  TrkA domain-containing protein  48.73 
 
 		 223 aa  181  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0270311  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1451  TrkA domain-containing protein  50.75 
 
 		 221 aa  180  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0437642  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1713  TrkA-N domain protein  49.28 
 
 		 222 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1634  TrkA-N domain protein  48.22 
 
 		 224 aa  177  8e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000521907 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16170  K+ transport system, NAD-binding component  45.64 
 
 		 221 aa  177  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.11506 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1917  TrkA-N domain protein  48.95 
 
 		 217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.678679  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3927  TrkA domain-containing protein  50.5 
 
 		 234 aa  172  5e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0233751  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1405  TrkA-N domain protein  46.5 
 
 		 218 aa  171  5.999999999999999e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.364271  normal  0.729476 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2257  TrkA-N domain protein  48.51 
 
 		 220 aa  171  5.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222998  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2473  TrkA domain-containing protein  48.56 
 
 		 223 aa  171  6.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.214066  normal  0.684987 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2197  TrkA-N  50 
 
 		 217 aa  170  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2243  TrkA domain-containing protein  50 
 
 		 217 aa  170  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2186  TrkA domain-containing protein  50.25 
 
 		 217 aa  170  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0106506 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5191  TrkA domain-containing protein  51.71 
 
 		 243 aa  169  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0357985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1928  putative potassium transporter  49.52 
 
 		 224 aa  168  5e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.292607  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1521  TrkA-N domain protein  49.26 
 
 		 220 aa  168  7e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.709024  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12706  trk system potassium uptake protein ceoB  48.26 
 
 		 227 aa  167  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2660  TrkA domain-containing protein  42.99 
 
 		 214 aa  148  7e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0646767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3063  TrkA domain-containing protein  41.15 
 
 		 214 aa  148  7e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13070  K+ transport system, NAD-binding component  45.13 
 
 		 233 aa  145  5e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00265603  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0807  TrkA-N domain protein  55 
 
 		 137 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01270  K+ transport system, NAD-binding component  35.62 
 
 		 219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0243  TrkA-N domain protein  34.98 
 
 		 206 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0250  TrkA-N domain protein  32.87 
 
 		 219 aa  125  7e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0637  TrkA-N  33.49 
 
 		 219 aa  124  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0432302 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00280  K+ transport system, NAD-binding component  32.41 
 
 		 219 aa  124  1e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0027  potassium uptake protein, putative  42.65 
 
 		 134 aa  112  5e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.248151  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0026  TrkA domain-containing protein  41.91 
 
 		 134 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_26  cation transport protein, Trk system  41.91 
 
 		 134 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0437885  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2083  TrkA-N domain protein  28.96 
 
 		 210 aa  105  6e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0253  TrkA-N domain protein  41.03 
 
 		 138 aa  102  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1347  TrkA-N  38.46 
 
 		 134 aa  95.5  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0274494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  31.51 
 
 		 630 aa  87.4  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  33.18 
 
 		 626 aa  86.3  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  29.65 
 
 		 628 aa  86.3  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3062  TrkA domain-containing protein  32.23 
 
 		 227 aa  84  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.793731  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  28.89 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1262  TrkA domain-containing protein  30 
 
 		 141 aa  83.2  0.000000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1656  TrkA domain-containing protein  37.82 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153236  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1729  TrkA domain-containing protein  36.97 
 
 		 143 aa  80.9  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000411585  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2911  TrkA-N domain protein  34.88 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0359474  normal  0.209528 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  28.25 
 
 		 221 aa  79.3  0.00000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1685  TrkA domain-containing protein  34.17 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.124287  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  27.78 
 
 		 221 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  27.31 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  27.8 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3218  potassium transporter peripheral membrane component  37.72 
 
 		 454 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.715113  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  27.31 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3126  potassium transporter peripheral membrane component  41.38 
 
 		 458 aa  75.9  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  31.21 
 
 		 617 aa  75.5  0.0000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0242  TrkA-N domain protein  27.62 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  26.85 
 
 		 221 aa  74.7  0.0000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  26.39 
 
 		 221 aa  74.7  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0020  potassium transporter peripheral membrane component  36.7 
 
 		 459 aa  73.9  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.688304  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0251  TrkA-N domain protein  27.15 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1261  TrkA domain-containing protein  22.9 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1406  TrkA-N domain protein  26.7 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.699899  normal  0.545013 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01280  K+ transport system, NAD-binding component  29.95 
 
 		 225 aa  71.2  0.00000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00019  potassium transporter peripheral membrane component  34.23 
 
 		 459 aa  71.2  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13080  K+ transport system, NAD-binding component  30.1 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0024035  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2476  potassium transporter peripheral membrane component  36.89 
 
 		 458 aa  69.7  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00394  potassium transporter peripheral membrane component  37.25 
 
 		 458 aa  69.3  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1399  TrkA-N domain protein  35.92 
 
 		 455 aa  69.3  0.00000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000200171  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002054  Trk system potassium uptake protein TrkA  37.25 
 
 		 458 aa  68.9  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3071  TrkA domain-containing protein  29.95 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3335  sodium/hydrogen exchanger  26.6 
 
 		 620 aa  68.6  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0016  potassium transporter peripheral membrane component  26.39 
 
 		 457 aa  68.2  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0072  potassium transporter peripheral membrane component  35.14 
 
 		 458 aa  68.2  0.00000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00290  K+ transport system, NAD-binding component  31.67 
 
 		 226 aa  67.4  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3721  potassium transporter peripheral membrane component  37.25 
 
 		 458 aa  67.8  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.455601  hitchhiker  0.00773793 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1681  potassium transporter peripheral membrane component  38.38 
 
 		 458 aa  67.8  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3757  TrkA-N domain protein  26.29 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000992935  normal  0.446525 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2472  TrkA domain-containing protein  28.04 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1348  hypothetical protein  33.33 
 
 		 220 aa  67  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0533287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12707  trk system potassium uptake protein ceoC  27.05 
 
 		 220 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.44928  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2286  TrkA-N domain-containing protein  24.77 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.241613 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0180  Trk system potassium uptake protein TrkA  36.28 
 
 		 457 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2661  TrkA domain-containing protein  39.25 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.202256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3585  potassium transporter peripheral membrane component  37.25 
 
 		 458 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.931761  normal  0.13042 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3678  potassium transporter peripheral membrane component  37.25 
 
 		 458 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16160  K+ transport system, NAD-binding component  25.56 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.534565  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3776  potassium transporter peripheral membrane component  37.25 
 
 		 458 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0424  potassium transporter peripheral membrane component  37.25 
 
 		 458 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000421391 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>