More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1928 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1928  putative potassium transporter  100 
 
 		 224 aa  438  9.999999999999999e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.292607  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2874  TrkA-N domain protein  69.76 
 
 		 242 aa  272  3e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.493191  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2285  TrkA-N domain-containing protein  64.68 
 
 		 221 aa  262  4e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.311674 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6759  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  59.63 
 
 		 221 aa  250  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0519804 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1642  TrkA-N domain protein  62.2 
 
 		 219 aa  245  4.9999999999999997e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.623208  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1713  TrkA-N domain protein  61.32 
 
 		 222 aa  244  9e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2903  TrkA domain-containing protein  58.62 
 
 		 220 aa  224  9e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1323  TrkA-like  57.33 
 
 		 264 aa  224  1e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1634  TrkA-N domain protein  57.14 
 
 		 224 aa  223  3e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000521907 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1562  TrkA-N domain protein  57.84 
 
 		 221 aa  222  4e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.308966  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1641  TrkA domain-containing protein  56.16 
 
 		 223 aa  221  9e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0270311  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1917  TrkA-N domain protein  55.19 
 
 		 217 aa  218  7e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.678679  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1877  TrkA-N domain protein  53.33 
 
 		 222 aa  216  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.608746  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4527  TrkA-N domain-containing protein  51.56 
 
 		 221 aa  214  5.9999999999999996e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.621759 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1451  TrkA domain-containing protein  64.13 
 
 		 221 aa  214  9e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0437642  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1486  TrkA domain-containing protein  63.04 
 
 		 221 aa  214  9e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.370955  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1708  TrkA-N domain protein  54.72 
 
 		 216 aa  211  4.9999999999999996e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0311888  normal  0.0547174 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16170  K+ transport system, NAD-binding component  50.69 
 
 		 221 aa  211  7e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.11506 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1398  TrkA domain-containing protein  51.63 
 
 		 224 aa  207  1e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.870164  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1942  TrkA-N domain protein  56.1 
 
 		 216 aa  206  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0161521 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1521  TrkA-N domain protein  54.29 
 
 		 220 aa  199  3.9999999999999996e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.709024  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1405  TrkA-N domain protein  49.53 
 
 		 218 aa  197  9e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.364271  normal  0.729476 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3756  TrkA-N domain protein  52.97 
 
 		 236 aa  195  4.0000000000000005e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000258956  normal  0.472401 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5191  TrkA domain-containing protein  55.66 
 
 		 243 aa  193  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0357985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12706  trk system potassium uptake protein ceoB  50.72 
 
 		 227 aa  190  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2257  TrkA-N domain protein  52.68 
 
 		 220 aa  189  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222998  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2473  TrkA domain-containing protein  51.21 
 
 		 223 aa  188  5.999999999999999e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.214066  normal  0.684987 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3927  TrkA domain-containing protein  50.72 
 
 		 234 aa  188  5.999999999999999e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0233751  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2197  TrkA-N  52 
 
 		 217 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2243  TrkA domain-containing protein  52 
 
 		 217 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2186  TrkA domain-containing protein  52 
 
 		 217 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0106506 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13070  K+ transport system, NAD-binding component  50 
 
 		 233 aa  178  4.999999999999999e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00265603  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1923  TrkA-N domain protein  49.52 
 
 		 220 aa  155  6e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3072  TrkA domain-containing protein  40.89 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2406  TrkA domain-containing protein  39.9 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.716891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2660  TrkA domain-containing protein  39.35 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0646767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3063  TrkA domain-containing protein  40.1 
 
 		 214 aa  135  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0807  TrkA-N domain protein  50 
 
 		 137 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00280  K+ transport system, NAD-binding component  36.95 
 
 		 219 aa  115  6e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0243  TrkA-N domain protein  41.98 
 
 		 206 aa  114  8.999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_26  cation transport protein, Trk system  44.44 
 
 		 134 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0437885  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0027  potassium uptake protein, putative  43.7 
 
 		 134 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.248151  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0250  TrkA-N domain protein  40.15 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0026  TrkA domain-containing protein  45.24 
 
 		 134 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2083  TrkA-N domain protein  28.84 
 
 		 210 aa  108  8.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1347  TrkA-N  40 
 
 		 134 aa  102  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0274494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0637  TrkA-N  30.8 
 
 		 219 aa  100  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0432302 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01270  K+ transport system, NAD-binding component  37.12 
 
 		 219 aa  98.6  6e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0253  TrkA-N domain protein  35.04 
 
 		 138 aa  95.1  7e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  27.86 
 
 		 218 aa  89  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2911  TrkA-N domain protein  35.82 
 
 		 142 aa  86.7  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0359474  normal  0.209528 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1656  TrkA domain-containing protein  37.93 
 
 		 143 aa  85.1  7e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153236  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1729  TrkA domain-containing protein  32.84 
 
 		 143 aa  84.7  9e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000411585  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2082  TrkA-N domain protein  32.28 
 
 		 218 aa  84  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.124657  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  31.42 
 
 		 626 aa  83.2  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1262  TrkA domain-containing protein  27.35 
 
 		 141 aa  82  0.000000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1348  hypothetical protein  28.22 
 
 		 220 aa  80.9  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0533287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1399  TrkA-N domain protein  25.79 
 
 		 455 aa  78.6  0.00000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000200171  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1489  hypothetical protein  25.35 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00984888  normal  0.0109156 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0242  TrkA-N domain protein  25.34 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0638  TrkA-N  27.94 
 
 		 225 aa  74.7  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  32.31 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  32.31 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1685  TrkA domain-containing protein  26.28 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.124287  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  29.38 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0251  TrkA-N domain protein  26.99 
 
 		 225 aa  73.2  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00290  K+ transport system, NAD-binding component  26.79 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00019  potassium transporter peripheral membrane component  35.59 
 
 		 459 aa  72.8  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  32.31 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1041  TrkA domain-containing protein  36.81 
 
 		 452 aa  72.4  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0072  potassium transporter peripheral membrane component  31.72 
 
 		 458 aa  71.6  0.000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  33.07 
 
 		 628 aa  71.2  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1686  TrkA domain-containing protein  23.87 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0415019  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1615  potassium transporter peripheral membrane component  27.51 
 
 		 458 aa  70.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0544  potassium transporter peripheral membrane component  27.63 
 
 		 458 aa  70.1  0.00000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.027133  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4396  potassium transporter peripheral membrane component  28.14 
 
 		 458 aa  69.7  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0641614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  28.76 
 
 		 617 aa  69.7  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3062  TrkA domain-containing protein  31.6 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.793731  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3265  hypothetical protein  28.71 
 
 		 612 aa  68.9  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.769883  normal  0.438481 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  29.63 
 
 		 221 aa  68.6  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  29.63 
 
 		 221 aa  68.2  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  29.63 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  32.8 
 
 		 630 aa  67.8  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4070  potassium transporter peripheral membrane component  27.19 
 
 		 471 aa  67.8  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000101925 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0020  potassium transporter peripheral membrane component  31.48 
 
 		 459 aa  67  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.688304  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0914  potassium transporter peripheral membrane component  23.01 
 
 		 450 aa  67.4  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1655  TrkA domain-containing protein  27.19 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000867889  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3792  potassium transporter peripheral membrane component  31.13 
 
 		 458 aa  66.2  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  29.63 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1400  TrkA-N domain-containing protein  38.68 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1728  TrkA domain-containing protein  26.58 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000194267  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1265  hypothetical protein  39.39 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1681  potassium transporter peripheral membrane component  28.33 
 
 		 458 aa  65.9  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3971  potassium transporter peripheral membrane component  31.13 
 
 		 458 aa  65.9  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0755481  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1067  hypothetical protein  34.56 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521072 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1261  TrkA domain-containing protein  24.2 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0353  potassium transporter peripheral membrane component  31.79 
 
 		 458 aa  65.5  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3126  potassium transporter peripheral membrane component  27.23 
 
 		 458 aa  65.5  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3606  potassium transporter peripheral membrane component  37.25 
 
 		 458 aa  65.1  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.454415 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3776  potassium transporter peripheral membrane component  37.25 
 
 		 458 aa  65.1  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>