280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2197 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2197  TrkA-N  100 
 
 
217 aa  434  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2243  TrkA domain-containing protein  100 
 
 
217 aa  434  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20721  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2186  TrkA domain-containing protein  99.54 
 
 
217 aa  433  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0106506 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2473  TrkA domain-containing protein  88.37 
 
 
223 aa  393  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.214066  normal  0.684987 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3927  TrkA domain-containing protein  89.3 
 
 
234 aa  376  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0233751  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12706  trk system potassium uptake protein ceoB  78.6 
 
 
227 aa  338  2e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1521  TrkA-N domain protein  64.95 
 
 
220 aa  280  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.709024  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2257  TrkA-N domain protein  62.33 
 
 
220 aa  272  2.0000000000000002e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222998  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3756  TrkA-N domain protein  60.85 
 
 
236 aa  259  3e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000258956  normal  0.472401 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1323  TrkA-like  58.53 
 
 
264 aa  251  6e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1451  TrkA domain-containing protein  58.29 
 
 
221 aa  245  3e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0437642  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1398  TrkA domain-containing protein  56.87 
 
 
224 aa  243  9.999999999999999e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.870164  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1642  TrkA-N domain protein  59.62 
 
 
219 aa  241  6e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.623208  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2285  TrkA-N domain-containing protein  56.02 
 
 
221 aa  239  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.311674 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1877  TrkA-N domain protein  59.18 
 
 
222 aa  239  2e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.608746  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1486  TrkA domain-containing protein  56.87 
 
 
221 aa  239  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.370955  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4527  TrkA-N domain-containing protein  58.25 
 
 
221 aa  231  7.000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.621759 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1942  TrkA-N domain protein  54.25 
 
 
216 aa  224  6e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0161521 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6759  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  54.21 
 
 
221 aa  223  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0519804 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1405  TrkA-N domain protein  48.85 
 
 
218 aa  223  2e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.364271  normal  0.729476 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1562  TrkA-N domain protein  53.46 
 
 
221 aa  223  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.308966  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1917  TrkA-N domain protein  56.19 
 
 
217 aa  220  9.999999999999999e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.678679  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1634  TrkA-N domain protein  57.22 
 
 
224 aa  219  3.9999999999999997e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000521907 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1713  TrkA-N domain protein  62.24 
 
 
222 aa  218  5e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5191  TrkA domain-containing protein  56.74 
 
 
243 aa  215  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0357985  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2903  TrkA domain-containing protein  50.47 
 
 
220 aa  212  2.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1708  TrkA-N domain protein  51.85 
 
 
216 aa  211  9e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0311888  normal  0.0547174 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16170  K+ transport system, NAD-binding component  50.52 
 
 
221 aa  208  4e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.11506 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1641  TrkA domain-containing protein  50 
 
 
223 aa  207  7e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0270311  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2874  TrkA-N domain protein  52.5 
 
 
242 aa  192  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.493191  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1928  putative potassium transporter  52 
 
 
224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.292607  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13070  K+ transport system, NAD-binding component  48.97 
 
 
233 aa  176  2e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00265603  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3072  TrkA domain-containing protein  43.43 
 
 
214 aa  159  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2406  TrkA domain-containing protein  42.93 
 
 
214 aa  156  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.716891  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1923  TrkA-N domain protein  50 
 
 
220 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2660  TrkA domain-containing protein  39.11 
 
 
214 aa  141  7e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0646767  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3063  TrkA domain-containing protein  39.8 
 
 
214 aa  140  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0243  TrkA-N domain protein  32.82 
 
 
206 aa  118  7e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0807  TrkA-N domain protein  49.15 
 
 
137 aa  116  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2083  TrkA-N domain protein  30.77 
 
 
210 aa  112  5e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0637  TrkA-N  33.85 
 
 
219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0432302 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00280  K+ transport system, NAD-binding component  32.99 
 
 
219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0027  potassium uptake protein, putative  44.8 
 
 
134 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.248151  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_26  cation transport protein, Trk system  44 
 
 
134 aa  107  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0437885  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0026  TrkA domain-containing protein  44 
 
 
134 aa  107  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0250  TrkA-N domain protein  42.86 
 
 
219 aa  100  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1347  TrkA-N  40 
 
 
134 aa  97.1  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0274494  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01270  K+ transport system, NAD-binding component  34 
 
 
219 aa  94.4  1e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0253  TrkA-N domain protein  37.17 
 
 
138 aa  89  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1262  TrkA domain-containing protein  30.36 
 
 
141 aa  85.5  6e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2911  TrkA-N domain protein  34.92 
 
 
142 aa  84.3  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0359474  normal  0.209528 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1656  TrkA domain-containing protein  34.92 
 
 
143 aa  79.3  0.00000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153236  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  29.52 
 
 
626 aa  78.2  0.00000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  27.14 
 
 
221 aa  77  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1729  TrkA domain-containing protein  37.5 
 
 
143 aa  77  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000411585  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  29.17 
 
 
628 aa  77.4  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3792  potassium transporter peripheral membrane component  26.15 
 
 
458 aa  75.1  0.0000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04100  K+ transport system, NAD-binding component  35.71 
 
 
152 aa  74.7  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.453544  normal  0.632996 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  26.27 
 
 
221 aa  74.3  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3971  potassium transporter peripheral membrane component  26.15 
 
 
458 aa  74.7  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0755481  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  25.81 
 
 
221 aa  74.7  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0201  potassium transporter peripheral membrane component  25 
 
 
457 aa  72.8  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0211158  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00019  potassium transporter peripheral membrane component  27.06 
 
 
459 aa  72  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0313  potassium transporter peripheral membrane component  25.23 
 
 
458 aa  71.2  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.888467  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0612  potassium transporter peripheral membrane component  25.23 
 
 
458 aa  71.2  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0369792  normal  0.0559785 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3885  potassium transporter peripheral membrane component  25.23 
 
 
458 aa  71.2  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0054195  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0353  potassium transporter peripheral membrane component  25.69 
 
 
458 aa  70.5  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4514  potassium transporter peripheral membrane component  25.23 
 
 
458 aa  69.3  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00906883  hitchhiker  0.00000865676 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0436  potassium transporter peripheral membrane component  25.23 
 
 
458 aa  68.9  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2911  potassium transporter peripheral membrane component  28.43 
 
 
449 aa  68.9  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000908908  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2267  TrkA-N domain protein  29.46 
 
 
459 aa  68.2  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.634076  hitchhiker  0.00765776 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2407  TrkA domain-containing protein  31.34 
 
 
220 aa  67.8  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163912  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0017  potassium transporter peripheral membrane component  27.19 
 
 
458 aa  67.4  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5192  TrkA domain-containing protein  26.58 
 
 
259 aa  67.4  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0506525  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0180  Trk system potassium uptake protein TrkA  27.52 
 
 
457 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0040  potassium transporter peripheral membrane component  25.94 
 
 
467 aa  67.4  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0052  potassium transporter peripheral membrane component  26.48 
 
 
457 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0020  potassium transporter peripheral membrane component  26.57 
 
 
457 aa  66.2  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0020  potassium transporter peripheral membrane component  25.69 
 
 
459 aa  66.2  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.688304  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3071  TrkA domain-containing protein  31.34 
 
 
220 aa  66.6  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  27 
 
 
223 aa  65.9  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2082  TrkA-N domain protein  29.91 
 
 
218 aa  66.2  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.124657  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0016  potassium transporter peripheral membrane component  27.52 
 
 
457 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3335  sodium/hydrogen exchanger  24.88 
 
 
620 aa  65.5  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0040  potassium transporter peripheral membrane component  25.75 
 
 
469 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.165147 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2476  potassium transporter peripheral membrane component  24.31 
 
 
458 aa  65.1  0.0000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  24.75 
 
 
218 aa  65.5  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002054  Trk system potassium uptake protein TrkA  24.77 
 
 
458 aa  64.7  0.0000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00290  K+ transport system, NAD-binding component  33.91 
 
 
226 aa  64.7  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0251  TrkA-N domain protein  31.54 
 
 
225 aa  64.7  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3020  potassium transporter peripheral membrane component  25.93 
 
 
457 aa  64.3  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2622  potassium transporter peripheral membrane component  26.61 
 
 
458 aa  64.7  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.637696 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  34.82 
 
 
221 aa  64.7  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00394  potassium transporter peripheral membrane component  24.31 
 
 
458 aa  64.3  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0242  TrkA-N domain protein  22.69 
 
 
221 aa  63.5  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0018  potassium transporter peripheral membrane component  26.15 
 
 
477 aa  63.5  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.265003  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0026  potassium transporter peripheral membrane component  24.29 
 
 
469 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.570638  hitchhiker  0.00237688 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0024  potassium transporter peripheral membrane component  24.29 
 
 
469 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.738729  normal  0.0894147 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00140  potassium transporter peripheral membrane component  25.7 
 
 
457 aa  63.9  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35944  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  34.82 
 
 
221 aa  63.5  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>