More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2660 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2660  TrkA domain-containing protein  100 
 
 		 214 aa  427  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0646767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3063  TrkA domain-containing protein  83.18 
 
 		 214 aa  369  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2406  TrkA domain-containing protein  47.42 
 
 		 214 aa  202  4e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.716891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0637  TrkA-N  43.81 
 
 		 219 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0432302 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3072  TrkA domain-containing protein  47.42 
 
 		 214 aa  199  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3756  TrkA-N domain protein  43.48 
 
 		 236 aa  168  6e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000258956  normal  0.472401 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12706  trk system potassium uptake protein ceoB  43.96 
 
 		 227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1323  TrkA-like  42.44 
 
 		 264 aa  159  4e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4527  TrkA-N domain-containing protein  42.79 
 
 		 221 aa  158  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.621759 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2257  TrkA-N domain protein  41.75 
 
 		 220 aa  154  7e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222998  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2285  TrkA-N domain-containing protein  40.85 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.311674 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1642  TrkA-N domain protein  41.4 
 
 		 219 aa  153  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.623208  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2903  TrkA domain-containing protein  40.8 
 
 		 220 aa  152  5e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2473  TrkA domain-containing protein  39.27 
 
 		 223 aa  151  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.214066  normal  0.684987 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6759  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  40.38 
 
 		 221 aa  151  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0519804 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1877  TrkA-N domain protein  40.55 
 
 		 222 aa  149  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.608746  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5191  TrkA domain-containing protein  42.86 
 
 		 243 aa  149  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0357985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1521  TrkA-N domain protein  39.61 
 
 		 220 aa  147  9e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.709024  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3927  TrkA domain-containing protein  38.65 
 
 		 234 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0233751  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16170  K+ transport system, NAD-binding component  36.15 
 
 		 221 aa  144  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.11506 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1398  TrkA domain-containing protein  39.91 
 
 		 224 aa  143  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.870164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1451  TrkA domain-containing protein  42.29 
 
 		 221 aa  143  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0437642  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1486  TrkA domain-containing protein  41.29 
 
 		 221 aa  143  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.370955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1562  TrkA-N domain protein  39.44 
 
 		 221 aa  142  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.308966  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2197  TrkA-N  39.11 
 
 		 217 aa  141  7e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2243  TrkA domain-containing protein  39.11 
 
 		 217 aa  141  7e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2186  TrkA domain-containing protein  39.11 
 
 		 217 aa  141  9e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0106506 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1928  putative potassium transporter  39.35 
 
 		 224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.292607  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1917  TrkA-N domain protein  38.94 
 
 		 217 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.678679  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1641  TrkA domain-containing protein  39 
 
 		 223 aa  139  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0270311  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1708  TrkA-N domain protein  39.69 
 
 		 216 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0311888  normal  0.0547174 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1405  TrkA-N domain protein  39.5 
 
 		 218 aa  138  7e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.364271  normal  0.729476 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1713  TrkA-N domain protein  38.79 
 
 		 222 aa  137  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1942  TrkA-N domain protein  40.21 
 
 		 216 aa  137  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0161521 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2874  TrkA-N domain protein  39.51 
 
 		 242 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.493191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1923  TrkA-N domain protein  42.99 
 
 		 220 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1634  TrkA-N domain protein  36.28 
 
 		 224 aa  134  8e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000521907 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0807  TrkA-N domain protein  51.26 
 
 		 137 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0243  TrkA-N domain protein  34.5 
 
 		 206 aa  128  6e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13070  K+ transport system, NAD-binding component  37.44 
 
 		 233 aa  125  5e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00265603  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01270  K+ transport system, NAD-binding component  38.65 
 
 		 219 aa  124  8.000000000000001e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00280  K+ transport system, NAD-binding component  36.76 
 
 		 219 aa  117  9.999999999999999e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1347  TrkA-N  46.83 
 
 		 134 aa  114  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0274494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  31.48 
 
 		 218 aa  112  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0250  TrkA-N domain protein  41.01 
 
 		 219 aa  112  5e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  28.57 
 
 		 221 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  28.11 
 
 		 221 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0253  TrkA-N domain protein  41.53 
 
 		 138 aa  108  6e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  27.65 
 
 		 221 aa  108  8.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2083  TrkA-N domain protein  37.9 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0027  potassium uptake protein, putative  42.86 
 
 		 134 aa  103  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.248151  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0026  TrkA domain-containing protein  42.02 
 
 		 134 aa  102  6e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_26  cation transport protein, Trk system  42.02 
 
 		 134 aa  101  7e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0437885  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3335  sodium/hydrogen exchanger  30.14 
 
 		 620 aa  97.8  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3062  TrkA domain-containing protein  34.25 
 
 		 227 aa  95.1  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.793731  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1728  TrkA domain-containing protein  30.41 
 
 		 218 aa  94.7  9e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000194267  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2407  TrkA domain-containing protein  35.41 
 
 		 220 aa  93.2  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3757  TrkA-N domain protein  33.18 
 
 		 217 aa  93.2  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000992935  normal  0.446525 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1655  TrkA domain-containing protein  30.88 
 
 		 218 aa  92.8  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000867889  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2661  TrkA domain-containing protein  33.79 
 
 		 220 aa  92.8  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.202256  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0242  TrkA-N domain protein  28.44 
 
 		 221 aa  92.4  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00019  potassium transporter peripheral membrane component  32.37 
 
 		 459 aa  92  6e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3071  TrkA domain-containing protein  33.97 
 
 		 220 aa  90.5  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  29.8 
 
 		 223 aa  89.7  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  33.49 
 
 		 626 aa  89.7  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2911  TrkA-N domain protein  37.04 
 
 		 142 aa  86.7  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0359474  normal  0.209528 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1406  TrkA-N domain protein  29.82 
 
 		 225 aa  86.3  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.699899  normal  0.545013 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1348  hypothetical protein  29.55 
 
 		 220 aa  85.5  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0533287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2242  potassium transporter peripheral membrane component  33.02 
 
 		 458 aa  84.7  8e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0521644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4126  potassium transporter peripheral membrane component  30.4 
 
 		 458 aa  84.7  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.215607  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4396  potassium transporter peripheral membrane component  29.57 
 
 		 458 aa  84.3  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0641614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1729  TrkA domain-containing protein  35.94 
 
 		 143 aa  84.3  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000411585  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  33.5 
 
 		 628 aa  84.7  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1093  potassium transporter peripheral membrane component  31.58 
 
 		 458 aa  83.6  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.915935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1322  TrkA-like  30.87 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1656  TrkA domain-containing protein  34.88 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153236  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1929  putative potassium uptake protein  35.47 
 
 		 229 aa  82.4  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.123463  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3792  potassium transporter peripheral membrane component  30.51 
 
 		 458 aa  82.4  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2082  TrkA-N domain protein  21.96 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.124657  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1615  potassium transporter peripheral membrane component  31.6 
 
 		 458 aa  82  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1261  TrkA domain-containing protein  24.54 
 
 		 219 aa  81.6  0.000000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3971  potassium transporter peripheral membrane component  30.51 
 
 		 458 aa  82  0.000000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0755481  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1641  TrkA-N domain protein  31.63 
 
 		 233 aa  81.6  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  0.0943946 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0020  potassium transporter peripheral membrane component  30.43 
 
 		 459 aa  81.3  0.000000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.688304  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0436  potassium transporter peripheral membrane component  28.02 
 
 		 458 aa  80.1  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0544  potassium transporter peripheral membrane component  29.87 
 
 		 458 aa  80.1  0.00000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.027133  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1924  TrkA-N domain protein  28.51 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0254  TrkA-N domain protein  27.32 
 
 		 221 aa  79.7  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.153232 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1262  TrkA domain-containing protein  28.57 
 
 		 141 aa  79.7  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16160  K+ transport system, NAD-binding component  27.85 
 
 		 249 aa  80.1  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.534565  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1569  potassium transporter peripheral membrane component  29.07 
 
 		 458 aa  79.3  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0202479  normal  0.0449671 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0038  potassium transporter peripheral membrane component  30 
 
 		 458 aa  79.3  0.00000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  30.2 
 
 		 617 aa  79  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3126  potassium transporter peripheral membrane component  27.75 
 
 		 458 aa  79  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1399  TrkA domain-containing protein  29.52 
 
 		 233 aa  79  0.00000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0017  potassium transporter peripheral membrane component  28.5 
 
 		 458 aa  79  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0026  potassium transporter peripheral membrane component  39.39 
 
 		 469 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.570638  hitchhiker  0.00237688 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0024  potassium transporter peripheral membrane component  39.39 
 
 		 469 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.738729  normal  0.0894147 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0032  potassium transporter peripheral membrane component  39.39 
 
 		 469 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.21174  hitchhiker  0.00000689203 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00394  potassium transporter peripheral membrane component  30.77 
 
 		 458 aa  78.6  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>