More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1486 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1486  TrkA domain-containing protein  100 
 
 		 221 aa  443  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.370955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1451  TrkA domain-containing protein  94.57 
 
 		 221 aa  424  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0437642  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4527  TrkA-N domain-containing protein  68.04 
 
 		 221 aa  306  1.0000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.621759 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1562  TrkA-N domain protein  60.27 
 
 		 221 aa  261  4.999999999999999e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.308966  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2285  TrkA-N domain-containing protein  61.11 
 
 		 221 aa  258  4e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.311674 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1642  TrkA-N domain protein  63.86 
 
 		 219 aa  258  7e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.623208  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1398  TrkA domain-containing protein  57.8 
 
 		 224 aa  256  1e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.870164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2903  TrkA domain-containing protein  59.8 
 
 		 220 aa  254  8e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1942  TrkA-N domain protein  62.2 
 
 		 216 aa  253  1.0000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0161521 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12706  trk system potassium uptake protein ceoB  62.81 
 
 		 227 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1521  TrkA-N domain protein  58.18 
 
 		 220 aa  250  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.709024  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6759  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  59.01 
 
 		 221 aa  249  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0519804 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1877  TrkA-N domain protein  59.91 
 
 		 222 aa  248  5e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.608746  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1708  TrkA-N domain protein  58.29 
 
 		 216 aa  244  9.999999999999999e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0311888  normal  0.0547174 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2473  TrkA domain-containing protein  56.48 
 
 		 223 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.214066  normal  0.684987 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1917  TrkA-N domain protein  56.07 
 
 		 217 aa  242  3e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.678679  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3756  TrkA-N domain protein  56.36 
 
 		 236 aa  242  3e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000258956  normal  0.472401 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1713  TrkA-N domain protein  58.45 
 
 		 222 aa  241  7.999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16170  K+ transport system, NAD-binding component  56.37 
 
 		 221 aa  241  7.999999999999999e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.11506 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2186  TrkA domain-containing protein  57.35 
 
 		 217 aa  240  1e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0106506 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2197  TrkA-N  56.87 
 
 		 217 aa  239  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2243  TrkA domain-containing protein  56.87 
 
 		 217 aa  239  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1323  TrkA-like  59.41 
 
 		 264 aa  236  2e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3927  TrkA domain-containing protein  58.29 
 
 		 234 aa  235  3e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0233751  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1405  TrkA-N domain protein  58.16 
 
 		 218 aa  235  4e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.364271  normal  0.729476 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1641  TrkA domain-containing protein  57.35 
 
 		 223 aa  234  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0270311  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2257  TrkA-N domain protein  52.78 
 
 		 220 aa  233  2.0000000000000002e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222998  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1634  TrkA-N domain protein  55.14 
 
 		 224 aa  232  3e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000521907 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1928  putative potassium transporter  63.04 
 
 		 224 aa  214  8e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.292607  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2874  TrkA-N domain protein  56.59 
 
 		 242 aa  209  3e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.493191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5191  TrkA domain-containing protein  59.7 
 
 		 243 aa  207  7e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0357985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13070  K+ transport system, NAD-binding component  51.28 
 
 		 233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00265603  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1923  TrkA-N domain protein  49.75 
 
 		 220 aa  167  9e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3072  TrkA domain-containing protein  42.79 
 
 		 214 aa  161  8.000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2406  TrkA domain-containing protein  42.79 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.716891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3063  TrkA domain-containing protein  43.28 
 
 		 214 aa  154  7e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2660  TrkA domain-containing protein  41.29 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0646767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0807  TrkA-N domain protein  49.62 
 
 		 137 aa  135  5e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0243  TrkA-N domain protein  42.86 
 
 		 206 aa  133  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2083  TrkA-N domain protein  32.31 
 
 		 210 aa  122  4e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_26  cation transport protein, Trk system  45.59 
 
 		 134 aa  120  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0437885  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0637  TrkA-N  34.3 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0432302 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0026  TrkA domain-containing protein  45.38 
 
 		 134 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0027  potassium uptake protein, putative  44.85 
 
 		 134 aa  119  3e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.248151  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00280  K+ transport system, NAD-binding component  32.55 
 
 		 219 aa  119  3e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0250  TrkA-N domain protein  31.31 
 
 		 219 aa  114  7.999999999999999e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1347  TrkA-N  40.77 
 
 		 134 aa  106  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0274494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0253  TrkA-N domain protein  38.46 
 
 		 138 aa  105  7e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01270  K+ transport system, NAD-binding component  43.1 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1262  TrkA domain-containing protein  32.48 
 
 		 141 aa  99  5e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  28.64 
 
 		 223 aa  96.3  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1656  TrkA domain-containing protein  42.24 
 
 		 143 aa  95.5  5e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153236  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1729  TrkA domain-containing protein  41.38 
 
 		 143 aa  94.7  9e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000411585  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  28.5 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  29.13 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  28.64 
 
 		 221 aa  89.4  4e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3071  TrkA domain-containing protein  33.96 
 
 		 220 aa  88.6  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2407  TrkA domain-containing protein  33.49 
 
 		 220 aa  88.2  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  24.88 
 
 		 218 aa  86.3  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00290  K+ transport system, NAD-binding component  27.93 
 
 		 226 aa  84.3  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2082  TrkA-N domain protein  29.08 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.124657  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2911  TrkA-N domain protein  35.11 
 
 		 142 aa  83.2  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0359474  normal  0.209528 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0353  potassium transporter peripheral membrane component  28.25 
 
 		 458 aa  82.8  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  29.41 
 
 		 626 aa  83.2  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0242  TrkA-N domain protein  27.23 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0251  TrkA-N domain protein  33.33 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  31.37 
 
 		 630 aa  82.8  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  32.06 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3605  potassium transporter peripheral membrane component  28.7 
 
 		 458 aa  82  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.267887  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3776  potassium transporter peripheral membrane component  28.7 
 
 		 458 aa  82  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3678  potassium transporter peripheral membrane component  28.7 
 
 		 458 aa  82  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3606  potassium transporter peripheral membrane component  28.7 
 
 		 458 aa  82  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.454415 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3713  potassium transporter peripheral membrane component  28.7 
 
 		 458 aa  82  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.461523 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03140  potassium transporter peripheral membrane component  28.7 
 
 		 458 aa  82  0.000000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.946548  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0424  TrkA-N domain protein  28.7 
 
 		 458 aa  82  0.000000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3585  potassium transporter peripheral membrane component  28.7 
 
 		 458 aa  82  0.000000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.931761  normal  0.13042 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4514  potassium transporter peripheral membrane component  28.25 
 
 		 458 aa  82  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00906883  hitchhiker  0.00000865676 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3674  potassium transporter peripheral membrane component  28.7 
 
 		 458 aa  82  0.000000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3772  potassium transporter peripheral membrane component  28.7 
 
 		 458 aa  82  0.000000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.241443  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0424  potassium transporter peripheral membrane component  28.7 
 
 		 458 aa  82  0.000000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000421391 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03091  hypothetical protein  28.7 
 
 		 458 aa  82  0.000000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3483  potassium transporter peripheral membrane component  28.7 
 
 		 458 aa  82  0.000000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0624843  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4612  potassium transporter peripheral membrane component  28.7 
 
 		 458 aa  82  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00524775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3721  potassium transporter peripheral membrane component  28.7 
 
 		 458 aa  81.6  0.000000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.455601  hitchhiker  0.00773793 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  29.77 
 
 		 221 aa  81.6  0.000000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0436  potassium transporter peripheral membrane component  27.8 
 
 		 458 aa  81.3  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  31.3 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3062  TrkA domain-containing protein  29.86 
 
 		 227 aa  80.1  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.793731  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  29.49 
 
 		 628 aa  80.9  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  31.3 
 
 		 221 aa  79.7  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3885  potassium transporter peripheral membrane component  27.8 
 
 		 458 aa  79.3  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0054195  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0612  potassium transporter peripheral membrane component  27.8 
 
 		 458 aa  79.3  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0369792  normal  0.0559785 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3792  potassium transporter peripheral membrane component  26.91 
 
 		 458 aa  79.3  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0313  potassium transporter peripheral membrane component  27.8 
 
 		 458 aa  79.3  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.888467  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3971  potassium transporter peripheral membrane component  26.91 
 
 		 458 aa  79  0.00000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0755481  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0072  potassium transporter peripheral membrane component  28.7 
 
 		 458 aa  78.6  0.00000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0020  potassium transporter peripheral membrane component  26.91 
 
 		 459 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.688304  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00019  potassium transporter peripheral membrane component  27.8 
 
 		 459 aa  77  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2476  potassium transporter peripheral membrane component  26.91 
 
 		 458 aa  76.6  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1261  TrkA domain-containing protein  21.18 
 
 		 219 aa  75.9  0.0000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>