More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3756 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3756  TrkA-N domain protein  100 
 
 		 236 aa  472  1e-132  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000258956  normal  0.472401 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1521  TrkA-N domain protein  64.09 
 
 		 220 aa  287  9e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.709024  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2473  TrkA domain-containing protein  59.91 
 
 		 223 aa  262  3e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.214066  normal  0.684987 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2186  TrkA domain-containing protein  61.32 
 
 		 217 aa  259  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0106506 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3927  TrkA domain-containing protein  61.35 
 
 		 234 aa  260  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0233751  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2197  TrkA-N  60.85 
 
 		 217 aa  259  3e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2243  TrkA domain-containing protein  60.85 
 
 		 217 aa  259  3e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4527  TrkA-N domain-containing protein  55.45 
 
 		 221 aa  253  3e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.621759 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12706  trk system potassium uptake protein ceoB  59.11 
 
 		 227 aa  252  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1562  TrkA-N domain protein  60.7 
 
 		 221 aa  249  2e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.308966  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1323  TrkA-like  60.7 
 
 		 264 aa  249  2e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1877  TrkA-N domain protein  57.41 
 
 		 222 aa  249  2e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.608746  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1451  TrkA domain-containing protein  58.64 
 
 		 221 aa  249  3e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0437642  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6759  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  55.91 
 
 		 221 aa  248  4e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0519804 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1398  TrkA domain-containing protein  59.6 
 
 		 224 aa  247  1e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.870164  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2285  TrkA-N domain-containing protein  55.71 
 
 		 221 aa  245  4.9999999999999997e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.311674 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1486  TrkA domain-containing protein  56.36 
 
 		 221 aa  242  3e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.370955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1642  TrkA-N domain protein  56.68 
 
 		 219 aa  242  3.9999999999999997e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.623208  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1917  TrkA-N domain protein  53.27 
 
 		 217 aa  235  3e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.678679  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2257  TrkA-N domain protein  55.29 
 
 		 220 aa  236  3e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222998  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5191  TrkA domain-containing protein  60.98 
 
 		 243 aa  233  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0357985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1942  TrkA-N domain protein  54.67 
 
 		 216 aa  232  4.0000000000000004e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0161521 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16170  K+ transport system, NAD-binding component  54.23 
 
 		 221 aa  230  1e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.11506 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1708  TrkA-N domain protein  56.48 
 
 		 216 aa  229  3e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0311888  normal  0.0547174 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2903  TrkA domain-containing protein  55.72 
 
 		 220 aa  228  5e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1405  TrkA-N domain protein  52.94 
 
 		 218 aa  228  7e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.364271  normal  0.729476 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1634  TrkA-N domain protein  53.39 
 
 		 224 aa  227  1e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000521907 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1713  TrkA-N domain protein  55.3 
 
 		 222 aa  223  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1641  TrkA domain-containing protein  54.77 
 
 		 223 aa  223  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0270311  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2874  TrkA-N domain protein  54.15 
 
 		 242 aa  205  4e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.493191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1928  putative potassium transporter  52.97 
 
 		 224 aa  195  5.000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.292607  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13070  K+ transport system, NAD-binding component  50.75 
 
 		 233 aa  193  2e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00265603  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1923  TrkA-N domain protein  49.28 
 
 		 220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3072  TrkA domain-containing protein  42.86 
 
 		 214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2660  TrkA domain-containing protein  43.48 
 
 		 214 aa  168  7e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0646767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2406  TrkA domain-containing protein  41.87 
 
 		 214 aa  167  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.716891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3063  TrkA domain-containing protein  43.48 
 
 		 214 aa  163  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0807  TrkA-N domain protein  47.83 
 
 		 137 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0243  TrkA-N domain protein  31.47 
 
 		 206 aa  119  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0027  potassium uptake protein, putative  44.62 
 
 		 134 aa  109  3e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.248151  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00280  K+ transport system, NAD-binding component  31.55 
 
 		 219 aa  108  6e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0026  TrkA domain-containing protein  43.85 
 
 		 134 aa  108  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_26  cation transport protein, Trk system  43.85 
 
 		 134 aa  108  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0437885  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2083  TrkA-N domain protein  29.3 
 
 		 210 aa  106  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0637  TrkA-N  30.69 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0432302 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01270  K+ transport system, NAD-binding component  38.76 
 
 		 219 aa  99.4  4e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0250  TrkA-N domain protein  35.11 
 
 		 219 aa  99  5e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0253  TrkA-N domain protein  34.09 
 
 		 138 aa  99.4  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1347  TrkA-N  36.92 
 
 		 134 aa  92.8  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0274494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2911  TrkA-N domain protein  38.52 
 
 		 142 aa  89  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0359474  normal  0.209528 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1729  TrkA domain-containing protein  35.04 
 
 		 143 aa  84.3  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000411585  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1656  TrkA domain-containing protein  36.43 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153236  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00019  potassium transporter peripheral membrane component  30.95 
 
 		 459 aa  81.6  0.000000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  24.26 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1262  TrkA domain-containing protein  26.45 
 
 		 141 aa  79.7  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0016  potassium transporter peripheral membrane component  29.09 
 
 		 457 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  27.23 
 
 		 221 aa  78.6  0.00000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  26.73 
 
 		 221 aa  78.2  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  25.45 
 
 		 221 aa  77.4  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2082  TrkA-N domain protein  24.55 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.124657  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  30.39 
 
 		 626 aa  77  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0180  Trk system potassium uptake protein TrkA  28.71 
 
 		 457 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1322  TrkA-like  26.7 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  28.64 
 
 		 443 aa  74.3  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3792  potassium transporter peripheral membrane component  26.24 
 
 		 458 aa  72.4  0.000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0020  potassium transporter peripheral membrane component  28.85 
 
 		 459 aa  72  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.688304  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0014  potassium transporter peripheral membrane component  26.67 
 
 		 458 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00830339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4070  potassium transporter peripheral membrane component  31.6 
 
 		 471 aa  71.6  0.000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000101925 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2267  TrkA-N domain protein  27.88 
 
 		 459 aa  71.6  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.634076  hitchhiker  0.00765776 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00140  potassium transporter peripheral membrane component  25.84 
 
 		 457 aa  71.2  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35944  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3971  potassium transporter peripheral membrane component  26.24 
 
 		 458 aa  71.6  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0755481  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0014  TrkA domain-containing protein  26.96 
 
 		 457 aa  71.2  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0240987 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  28.57 
 
 		 628 aa  71.2  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0017  potassium transporter peripheral membrane component  28.1 
 
 		 458 aa  70.5  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  27.4 
 
 		 630 aa  70.5  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0436  potassium transporter peripheral membrane component  26.24 
 
 		 458 aa  70.5  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3885  potassium transporter peripheral membrane component  26.24 
 
 		 458 aa  70.1  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0054195  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0313  potassium transporter peripheral membrane component  26.24 
 
 		 458 aa  70.1  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.888467  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0353  potassium transporter peripheral membrane component  26.24 
 
 		 458 aa  69.7  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0612  potassium transporter peripheral membrane component  26.24 
 
 		 458 aa  70.1  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0369792  normal  0.0559785 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  27.23 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1641  TrkA-N domain protein  27.04 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  0.0943946 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0052  potassium transporter peripheral membrane component  26.32 
 
 		 457 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0242  TrkA-N domain protein  31.82 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0065  potassium transporter peripheral membrane component  25.35 
 
 		 457 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948816  unclonable  0.000000448887 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4514  potassium transporter peripheral membrane component  26.24 
 
 		 458 aa  68.6  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00906883  hitchhiker  0.00000865676 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0081  potassium transporter peripheral membrane component  25.35 
 
 		 457 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  hitchhiker  0.0000000000177319 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2911  potassium transporter peripheral membrane component  27.1 
 
 		 449 aa  68.2  0.00000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000908908  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0081  potassium transporter peripheral membrane component  25.35 
 
 		 457 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685696  normal  0.107342 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0084  potassium transporter peripheral membrane component  25.35 
 
 		 457 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.409393  hitchhiker  0.00000000549949 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0017  potassium transporter peripheral membrane component  25.84 
 
 		 457 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.290257  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00170  potassium transporter peripheral membrane component  25.84 
 
 		 457 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0072  potassium transporter peripheral membrane component  25.79 
 
 		 458 aa  67.4  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3713  potassium transporter peripheral membrane component  27.15 
 
 		 458 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.461523 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00290  K+ transport system, NAD-binding component  33.33 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3606  potassium transporter peripheral membrane component  27.15 
 
 		 458 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.454415 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3678  potassium transporter peripheral membrane component  27.15 
 
 		 458 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3776  potassium transporter peripheral membrane component  27.15 
 
 		 458 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0251  TrkA-N domain protein  29.27 
 
 		 225 aa  67  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3605  potassium transporter peripheral membrane component  27.15 
 
 		 458 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.267887  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>