273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1942 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1942  TrkA-N domain protein  100 
 
 		 216 aa  427  1e-119  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0161521 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1708  TrkA-N domain protein  68.4 
 
 		 216 aa  298  6e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0311888  normal  0.0547174 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16170  K+ transport system, NAD-binding component  65.09 
 
 		 221 aa  296  2e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.11506 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1917  TrkA-N domain protein  66.67 
 
 		 217 aa  293  2e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.678679  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1562  TrkA-N domain protein  69.34 
 
 		 221 aa  285  2.9999999999999996e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.308966  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1405  TrkA-N domain protein  63.21 
 
 		 218 aa  284  8e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.364271  normal  0.729476 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2285  TrkA-N domain-containing protein  63.68 
 
 		 221 aa  274  8e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.311674 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6759  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  62.26 
 
 		 221 aa  272  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0519804 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1642  TrkA-N domain protein  62.74 
 
 		 219 aa  266  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.623208  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1634  TrkA-N domain protein  62.5 
 
 		 224 aa  258  3e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000521907 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1398  TrkA domain-containing protein  60.1 
 
 		 224 aa  258  4e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.870164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1323  TrkA-like  60.85 
 
 		 264 aa  255  4e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1641  TrkA domain-containing protein  59.72 
 
 		 223 aa  254  7e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0270311  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1486  TrkA domain-containing protein  62.2 
 
 		 221 aa  253  1.0000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.370955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1451  TrkA domain-containing protein  61.24 
 
 		 221 aa  250  1e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0437642  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1713  TrkA-N domain protein  62.74 
 
 		 222 aa  249  3e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2903  TrkA domain-containing protein  58.14 
 
 		 220 aa  248  5e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1521  TrkA-N domain protein  56.13 
 
 		 220 aa  234  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.709024  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3756  TrkA-N domain protein  54.67 
 
 		 236 aa  232  3e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000258956  normal  0.472401 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4527  TrkA-N domain-containing protein  55.92 
 
 		 221 aa  232  4.0000000000000004e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.621759 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1877  TrkA-N domain protein  57.49 
 
 		 222 aa  229  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.608746  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5191  TrkA domain-containing protein  59.43 
 
 		 243 aa  226  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0357985  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2874  TrkA-N domain protein  61.5 
 
 		 242 aa  225  5.0000000000000005e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.493191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2197  TrkA-N  54.25 
 
 		 217 aa  224  6e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2243  TrkA domain-containing protein  54.25 
 
 		 217 aa  224  6e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2186  TrkA domain-containing protein  54.25 
 
 		 217 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0106506 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2473  TrkA domain-containing protein  53.24 
 
 		 223 aa  223  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.214066  normal  0.684987 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2257  TrkA-N domain protein  51.89 
 
 		 220 aa  222  3e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222998  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3927  TrkA domain-containing protein  57.73 
 
 		 234 aa  222  3e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0233751  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12706  trk system potassium uptake protein ceoB  55.67 
 
 		 227 aa  216  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13070  K+ transport system, NAD-binding component  54.63 
 
 		 233 aa  209  2e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00265603  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1928  putative potassium transporter  56.1 
 
 		 224 aa  206  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.292607  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1923  TrkA-N domain protein  53.59 
 
 		 220 aa  177  1e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2406  TrkA domain-containing protein  42.79 
 
 		 214 aa  158  6e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.716891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3072  TrkA domain-containing protein  44.33 
 
 		 214 aa  156  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3063  TrkA domain-containing protein  40.21 
 
 		 214 aa  140  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2660  TrkA domain-containing protein  40.21 
 
 		 214 aa  137  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0646767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0807  TrkA-N domain protein  45.8 
 
 		 137 aa  121  7e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0243  TrkA-N domain protein  43.75 
 
 		 206 aa  112  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00280  K+ transport system, NAD-binding component  32.02 
 
 		 219 aa  111  9e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0250  TrkA-N domain protein  33.66 
 
 		 219 aa  106  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2083  TrkA-N domain protein  31.48 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0027  potassium uptake protein, putative  43.2 
 
 		 134 aa  102  4e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.248151  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0637  TrkA-N  31.9 
 
 		 219 aa  102  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0432302 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0026  TrkA domain-containing protein  42.4 
 
 		 134 aa  101  9e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_26  cation transport protein, Trk system  42.4 
 
 		 134 aa  100  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0437885  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01270  K+ transport system, NAD-binding component  33.33 
 
 		 219 aa  97.8  1e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1347  TrkA-N  40.8 
 
 		 134 aa  97.4  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0274494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2911  TrkA-N domain protein  39.06 
 
 		 142 aa  88.2  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0359474  normal  0.209528 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0253  TrkA-N domain protein  36.28 
 
 		 138 aa  87.8  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  26.6 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0014  potassium transporter peripheral membrane component  31.8 
 
 		 458 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00830339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00019  potassium transporter peripheral membrane component  30.7 
 
 		 459 aa  80.5  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0016  potassium transporter peripheral membrane component  31.48 
 
 		 457 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00140  potassium transporter peripheral membrane component  30.56 
 
 		 457 aa  79  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35944  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  34.38 
 
 		 443 aa  78.6  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0180  Trk system potassium uptake protein TrkA  31.48 
 
 		 457 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  31.1 
 
 		 630 aa  77  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00394  potassium transporter peripheral membrane component  30.49 
 
 		 458 aa  77.4  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0020  potassium transporter peripheral membrane component  28.37 
 
 		 459 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.688304  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002054  Trk system potassium uptake protein TrkA  30.49 
 
 		 458 aa  77  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3792  potassium transporter peripheral membrane component  28.37 
 
 		 458 aa  76.6  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0052  potassium transporter peripheral membrane component  30.56 
 
 		 457 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3971  potassium transporter peripheral membrane component  28.37 
 
 		 458 aa  76.3  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0755481  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2476  potassium transporter peripheral membrane component  30.04 
 
 		 458 aa  76.3  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0017  potassium transporter peripheral membrane component  30.56 
 
 		 457 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.290257  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00170  potassium transporter peripheral membrane component  30.56 
 
 		 457 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1262  TrkA domain-containing protein  29.46 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0072  potassium transporter peripheral membrane component  29.15 
 
 		 458 aa  75.1  0.0000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0081  potassium transporter peripheral membrane component  30.09 
 
 		 457 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685696  normal  0.107342 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  31.6 
 
 		 626 aa  74.7  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3605  potassium transporter peripheral membrane component  29.3 
 
 		 458 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.267887  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0065  potassium transporter peripheral membrane component  30.09 
 
 		 457 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948816  unclonable  0.000000448887 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0084  potassium transporter peripheral membrane component  30.09 
 
 		 457 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.409393  hitchhiker  0.00000000549949 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3713  potassium transporter peripheral membrane component  29.3 
 
 		 458 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.461523 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0081  potassium transporter peripheral membrane component  30.09 
 
 		 457 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  hitchhiker  0.0000000000177319 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3776  potassium transporter peripheral membrane component  29.3 
 
 		 458 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3678  potassium transporter peripheral membrane component  29.3 
 
 		 458 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3606  potassium transporter peripheral membrane component  29.3 
 
 		 458 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.454415 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03140  potassium transporter peripheral membrane component  29.3 
 
 		 458 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.946548  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0424  TrkA-N domain protein  29.3 
 
 		 458 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4612  potassium transporter peripheral membrane component  29.3 
 
 		 458 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00524775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3483  potassium transporter peripheral membrane component  29.3 
 
 		 458 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0624843  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0436  potassium transporter peripheral membrane component  27.8 
 
 		 458 aa  73.9  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0424  potassium transporter peripheral membrane component  29.3 
 
 		 458 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000421391 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0353  potassium transporter peripheral membrane component  27.8 
 
 		 458 aa  73.9  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03091  hypothetical protein  29.3 
 
 		 458 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3772  potassium transporter peripheral membrane component  29.3 
 
 		 458 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.241443  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3585  potassium transporter peripheral membrane component  29.3 
 
 		 458 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.931761  normal  0.13042 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3674  potassium transporter peripheral membrane component  29.3 
 
 		 458 aa  73.6  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0612  potassium transporter peripheral membrane component  27.91 
 
 		 458 aa  73.2  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0369792  normal  0.0559785 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4514  potassium transporter peripheral membrane component  27.44 
 
 		 458 aa  73.2  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00906883  hitchhiker  0.00000865676 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1656  TrkA domain-containing protein  36.61 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153236  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0313  potassium transporter peripheral membrane component  27.91 
 
 		 458 aa  73.2  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.888467  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3721  potassium transporter peripheral membrane component  29.3 
 
 		 458 aa  73.2  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.455601  hitchhiker  0.00773793 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3885  potassium transporter peripheral membrane component  27.91 
 
 		 458 aa  73.2  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0054195  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0081  potassium transporter peripheral membrane component  27.91 
 
 		 458 aa  72.8  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1729  TrkA domain-containing protein  35.71 
 
 		 143 aa  72  0.000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000411585  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0201  potassium transporter peripheral membrane component  28.04 
 
 		 457 aa  72  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0211158  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  28.99 
 
 		 628 aa  71.6  0.000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>