More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1323 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1323  TrkA-like  100 
 
 		 264 aa  525  1e-148  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5191  TrkA domain-containing protein  77.78 
 
 		 243 aa  340  1e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0357985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1642  TrkA-N domain protein  64.06 
 
 		 219 aa  275  6e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.623208  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2285  TrkA-N domain-containing protein  62.61 
 
 		 221 aa  275  7e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.311674 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6759  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  60.55 
 
 		 221 aa  268  8e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0519804 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1398  TrkA domain-containing protein  61.03 
 
 		 224 aa  263  2e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.870164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1713  TrkA-N domain protein  67.84 
 
 		 222 aa  260  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1562  TrkA-N domain protein  60.73 
 
 		 221 aa  259  4e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.308966  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16170  K+ transport system, NAD-binding component  55.76 
 
 		 221 aa  256  2e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.11506 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1917  TrkA-N domain protein  57.55 
 
 		 217 aa  255  5e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.678679  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1942  TrkA-N domain protein  60.85 
 
 		 216 aa  255  6e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0161521 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4527  TrkA-N domain-containing protein  58.37 
 
 		 221 aa  253  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.621759 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2473  TrkA domain-containing protein  60.77 
 
 		 223 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.214066  normal  0.684987 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1877  TrkA-N domain protein  57.99 
 
 		 222 aa  252  4.0000000000000004e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.608746  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1634  TrkA-N domain protein  58.9 
 
 		 224 aa  252  5.000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000521907 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2186  TrkA domain-containing protein  58.99 
 
 		 217 aa  251  6e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0106506 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2197  TrkA-N  58.53 
 
 		 217 aa  251  9.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2243  TrkA domain-containing protein  58.53 
 
 		 217 aa  251  9.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2903  TrkA domain-containing protein  56.42 
 
 		 220 aa  250  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3756  TrkA-N domain protein  60.7 
 
 		 236 aa  249  3e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000258956  normal  0.472401 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1708  TrkA-N domain protein  58.96 
 
 		 216 aa  248  5e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0311888  normal  0.0547174 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3927  TrkA domain-containing protein  60.49 
 
 		 234 aa  248  5e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0233751  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1405  TrkA-N domain protein  56.67 
 
 		 218 aa  244  9.999999999999999e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.364271  normal  0.729476 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1521  TrkA-N domain protein  57.34 
 
 		 220 aa  242  5e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.709024  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1641  TrkA domain-containing protein  55.25 
 
 		 223 aa  241  1e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0270311  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1451  TrkA domain-containing protein  60.89 
 
 		 221 aa  238  5.999999999999999e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0437642  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12706  trk system potassium uptake protein ceoB  58.5 
 
 		 227 aa  238  1e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1486  TrkA domain-containing protein  59.41 
 
 		 221 aa  236  2e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.370955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2257  TrkA-N domain protein  58 
 
 		 220 aa  233  3e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222998  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1928  putative potassium transporter  57.33 
 
 		 224 aa  224  2e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.292607  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2874  TrkA-N domain protein  55.67 
 
 		 242 aa  218  6e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.493191  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13070  K+ transport system, NAD-binding component  49 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00265603  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3072  TrkA domain-containing protein  44.39 
 
 		 214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1923  TrkA-N domain protein  51.92 
 
 		 220 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2406  TrkA domain-containing protein  42.99 
 
 		 214 aa  169  4e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.716891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2660  TrkA domain-containing protein  42.44 
 
 		 214 aa  159  5e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0646767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3063  TrkA domain-containing protein  41.46 
 
 		 214 aa  156  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0807  TrkA-N domain protein  47.37 
 
 		 137 aa  133  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0637  TrkA-N  32.86 
 
 		 219 aa  128  8.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0432302 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0243  TrkA-N domain protein  31.22 
 
 		 206 aa  126  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00280  K+ transport system, NAD-binding component  34.98 
 
 		 219 aa  125  7e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2083  TrkA-N domain protein  32.67 
 
 		 210 aa  122  4e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0027  potassium uptake protein, putative  45.38 
 
 		 134 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.248151  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0026  TrkA domain-containing protein  44.62 
 
 		 134 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_26  cation transport protein, Trk system  44.62 
 
 		 134 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0437885  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0250  TrkA-N domain protein  38.35 
 
 		 219 aa  114  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1347  TrkA-N  40.77 
 
 		 134 aa  107  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0274494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0253  TrkA-N domain protein  34.35 
 
 		 138 aa  105  9e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01270  K+ transport system, NAD-binding component  37.4 
 
 		 219 aa  103  4e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2911  TrkA-N domain protein  42.15 
 
 		 142 aa  98.6  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0359474  normal  0.209528 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1656  TrkA domain-containing protein  42.24 
 
 		 143 aa  95.9  6e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153236  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  26.77 
 
 		 218 aa  95.5  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1729  TrkA domain-containing protein  41.38 
 
 		 143 aa  95.1  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000411585  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1262  TrkA domain-containing protein  29.06 
 
 		 141 aa  87  3e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  27.19 
 
 		 221 aa  86.3  5e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  26.37 
 
 		 221 aa  85.9  7e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  27.19 
 
 		 221 aa  85.5  9e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  32 
 
 		 626 aa  85.1  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  32.04 
 
 		 628 aa  82.8  0.000000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  25.57 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  27.69 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  26.24 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0242  TrkA-N domain protein  24.41 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2082  TrkA-N domain protein  23.47 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.124657  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0251  TrkA-N domain protein  29.78 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  30.92 
 
 		 630 aa  79.3  0.00000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  27.18 
 
 		 221 aa  79.7  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1261  TrkA domain-containing protein  21.67 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00290  K+ transport system, NAD-binding component  30.77 
 
 		 226 aa  76.3  0.0000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1944  TrkA domain-containing protein  30.39 
 
 		 222 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.772638 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1685  TrkA domain-containing protein  28.81 
 
 		 153 aa  74.7  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.124287  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3183  potassium transporter peripheral membrane component  21.15 
 
 		 465 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00657284  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  31.78 
 
 		 443 aa  72.8  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  29.05 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1348  hypothetical protein  28.75 
 
 		 220 aa  72  0.000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0533287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0312  potassium transporter peripheral membrane component  23.92 
 
 		 449 aa  71.6  0.00000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0720169  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0266  potassium transporter peripheral membrane component  24.88 
 
 		 445 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1041  TrkA domain-containing protein  44 
 
 		 452 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3335  sodium/hydrogen exchanger  25.58 
 
 		 620 aa  69.3  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1489  hypothetical protein  23.94 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00984888  normal  0.0109156 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00019  potassium transporter peripheral membrane component  28.11 
 
 		 459 aa  68.9  0.00000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0638  TrkA-N  28.1 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04100  K+ transport system, NAD-binding component  33.33 
 
 		 152 aa  68.6  0.00000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.453544  normal  0.632996 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2849  potassium transporter peripheral membrane component  25 
 
 		 457 aa  68.6  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.336578  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1406  TrkA-N domain protein  26.73 
 
 		 225 aa  68.2  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.699899  normal  0.545013 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3062  TrkA domain-containing protein  31.4 
 
 		 227 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.793731  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4814  TrkA-N domain protein  26.05 
 
 		 226 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0112  TrkA-N domain protein  30.1 
 
 		 617 aa  67  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1794  hypothetical protein  22.62 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0081  potassium transporter peripheral membrane component  25.79 
 
 		 458 aa  66.2  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  30.77 
 
 		 617 aa  65.5  0.0000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0020  potassium transporter peripheral membrane component  27.44 
 
 		 459 aa  65.5  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.688304  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0201  potassium transporter peripheral membrane component  27.18 
 
 		 457 aa  64.7  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0211158  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01280  K+ transport system, NAD-binding component  27.81 
 
 		 225 aa  65.1  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0187  potassium transporter peripheral membrane component  29.77 
 
 		 465 aa  65.1  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4514  potassium transporter peripheral membrane component  25.79 
 
 		 458 aa  65.1  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00906883  hitchhiker  0.00000865676 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1590  potassium transporter peripheral membrane component  24.27 
 
 		 449 aa  64.3  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00906485  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0436  potassium transporter peripheral membrane component  25.81 
 
 		 458 aa  64.3  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4070  potassium transporter peripheral membrane component  27.98 
 
 		 471 aa  64.3  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000101925 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1728  TrkA domain-containing protein  24.76 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000194267  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>