More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_01280 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_01280  K+ transport system, NAD-binding component  100 
 
 
225 aa  455  1e-127  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0251  TrkA-N domain protein  64.44 
 
 
225 aa  298  4e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00290  K+ transport system, NAD-binding component  60.09 
 
 
226 aa  262  4e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2082  TrkA-N domain protein  36.45 
 
 
218 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.124657  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0242  TrkA-N domain protein  32.61 
 
 
221 aa  124  9e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0254  TrkA-N domain protein  30.8 
 
 
221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.153232 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  31.8 
 
 
221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  35.37 
 
 
218 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  31.92 
 
 
221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  31.92 
 
 
221 aa  112  6e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3062  TrkA domain-containing protein  37.8 
 
 
227 aa  108  8.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.793731  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  33.78 
 
 
223 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2661  TrkA domain-containing protein  38.89 
 
 
220 aa  106  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.202256  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1348  hypothetical protein  34.21 
 
 
220 aa  105  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0533287  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1794  hypothetical protein  31.8 
 
 
222 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1924  TrkA-N domain protein  37.9 
 
 
231 aa  103  2e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2286  TrkA-N domain-containing protein  33.04 
 
 
219 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.241613 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0542  TrkA-N domain protein  34.41 
 
 
215 aa  100  3e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.840001  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2407  TrkA domain-containing protein  33.19 
 
 
220 aa  96.7  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163912  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1712  TrkA-N domain protein  31.72 
 
 
219 aa  96.7  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.887824  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2904  TrkA domain-containing protein  29.95 
 
 
223 aa  96.3  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1520  TrkA-N domain protein  32.98 
 
 
218 aa  95.9  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1728  TrkA domain-containing protein  30.94 
 
 
218 aa  94.4  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000194267  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1322  TrkA-like  32.74 
 
 
231 aa  93.6  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3757  TrkA-N domain protein  30.67 
 
 
217 aa  93.2  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000992935  normal  0.446525 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11630  TrkA-C domain protein  30.77 
 
 
207 aa  92.4  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1655  TrkA domain-containing protein  30.94 
 
 
218 aa  92  6e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000867889  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16160  K+ transport system, NAD-binding component  32.98 
 
 
249 aa  92  6e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.534565  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6760  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  30.88 
 
 
223 aa  92  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0522309 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3071  TrkA domain-containing protein  31.86 
 
 
220 aa  90.9  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0637  TrkA-N  27.01 
 
 
219 aa  90.9  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0432302 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0638  TrkA-N  30.67 
 
 
225 aa  90.9  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1561  TrkA-N domain protein  34.39 
 
 
219 aa  90.9  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534326  normal  0.490374 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5192  TrkA domain-containing protein  32.74 
 
 
259 aa  90.1  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0506525  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1876  TrkA-N domain protein  33.48 
 
 
220 aa  89.7  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.416785  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1640  TrkA domain-containing protein  34.76 
 
 
253 aa  90.1  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0557692  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  31.13 
 
 
221 aa  89.7  3e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1641  TrkA-N domain protein  32.63 
 
 
233 aa  89.4  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  0.0943946 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  30.73 
 
 
221 aa  89  6e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  35.67 
 
 
221 aa  88.6  7e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4528  TrkA-N domain-containing protein  32.45 
 
 
222 aa  88.6  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.468661  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1633  TrkA-N domain protein  34.22 
 
 
299 aa  88.6  8e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  29.65 
 
 
221 aa  88.2  9e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0243  TrkA-N domain protein  30.14 
 
 
206 aa  88.2  9e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2256  TrkA-N domain protein  31.05 
 
 
218 aa  87.4  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13318  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0807  TrkA-N domain protein  36.92 
 
 
137 aa  87.4  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1918  TrkA-N domain protein  30.67 
 
 
224 aa  85.9  5e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388192  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2406  TrkA domain-containing protein  30.53 
 
 
214 aa  85.9  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.716891  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1261  TrkA domain-containing protein  25.12 
 
 
219 aa  85.9  5e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1485  TrkA domain-containing protein  30.59 
 
 
229 aa  85.1  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0637531  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  33.19 
 
 
626 aa  85.1  9e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1941  TrkA-N domain protein  32.98 
 
 
241 aa  84.3  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0298197 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1450  TrkA domain-containing protein  30.41 
 
 
229 aa  84  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0807714  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  30 
 
 
630 aa  83.2  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0112  TrkA-N domain protein  30.97 
 
 
617 aa  83.2  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4514  potassium transporter peripheral membrane component  28.3 
 
 
458 aa  82.4  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00906883  hitchhiker  0.00000865676 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3072  TrkA domain-containing protein  31.02 
 
 
214 aa  81.3  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0026  TrkA domain-containing protein  31.54 
 
 
134 aa  80.5  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2285  TrkA-N domain-containing protein  30.56 
 
 
221 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.311674 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1707  TrkA-N domain protein  31.55 
 
 
224 aa  80.9  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102172  normal  0.0591298 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3063  TrkA domain-containing protein  32.06 
 
 
214 aa  80.5  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_26  cation transport protein, Trk system  31.54 
 
 
134 aa  80.5  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0437885  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0027  potassium uptake protein, putative  31.54 
 
 
134 aa  80.1  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.248151  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03140  potassium transporter peripheral membrane component  29.91 
 
 
458 aa  79.3  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.946548  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0424  TrkA-N domain protein  29.91 
 
 
458 aa  79.3  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0424  potassium transporter peripheral membrane component  29.91 
 
 
458 aa  79.3  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000421391 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03091  hypothetical protein  29.91 
 
 
458 aa  79.3  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3772  potassium transporter peripheral membrane component  29.91 
 
 
458 aa  79.3  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.241443  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3585  potassium transporter peripheral membrane component  29.91 
 
 
458 aa  79.3  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.931761  normal  0.13042 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3674  potassium transporter peripheral membrane component  29.91 
 
 
458 aa  79.3  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3483  potassium transporter peripheral membrane component  29.91 
 
 
458 aa  79.3  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0624843  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4612  potassium transporter peripheral membrane component  29.91 
 
 
458 aa  79.3  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00524775  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3678  potassium transporter peripheral membrane component  32.11 
 
 
458 aa  79  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3776  potassium transporter peripheral membrane component  32.11 
 
 
458 aa  79  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3606  potassium transporter peripheral membrane component  32.11 
 
 
458 aa  79  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.454415 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1399  TrkA domain-containing protein  30.04 
 
 
233 aa  79.3  0.00000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3713  potassium transporter peripheral membrane component  32.11 
 
 
458 aa  79  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.461523 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3605  potassium transporter peripheral membrane component  32.11 
 
 
458 aa  79  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.267887  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3928  TrkA domain-containing protein  29.26 
 
 
221 aa  78.6  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0399436  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1406  TrkA-N domain protein  31.65 
 
 
225 aa  78.6  0.00000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.699899  normal  0.545013 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1929  putative potassium uptake protein  32.75 
 
 
229 aa  77.8  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.123463  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  29.3 
 
 
628 aa  77.8  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3721  potassium transporter peripheral membrane component  28.97 
 
 
458 aa  77.8  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.455601  hitchhiker  0.00773793 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0436  potassium transporter peripheral membrane component  27.83 
 
 
458 aa  77.8  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2472  TrkA domain-containing protein  29.79 
 
 
221 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0313  potassium transporter peripheral membrane component  27.83 
 
 
458 aa  76.3  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.888467  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3885  potassium transporter peripheral membrane component  27.83 
 
 
458 aa  76.3  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0054195  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0612  potassium transporter peripheral membrane component  27.83 
 
 
458 aa  76.3  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0369792  normal  0.0559785 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2083  TrkA-N domain protein  27.01 
 
 
210 aa  76.6  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2267  TrkA-N domain protein  29.26 
 
 
459 aa  75.5  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.634076  hitchhiker  0.00765776 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2660  TrkA domain-containing protein  31.08 
 
 
214 aa  75.1  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0646767  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1398  TrkA domain-containing protein  29.09 
 
 
224 aa  75.1  0.0000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.870164  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  30.8 
 
 
443 aa  75.1  0.0000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0072  potassium transporter peripheral membrane component  30.86 
 
 
458 aa  74.3  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2196  TrkA-N  28.38 
 
 
222 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2242  TrkA domain-containing protein  28.38 
 
 
222 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.081798  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2185  TrkA domain-containing protein  28.38 
 
 
222 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314676  normal  0.0103731 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1686  TrkA domain-containing protein  26.72 
 
 
219 aa  73.9  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0415019  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2257  TrkA-N domain protein  35 
 
 
220 aa  74.3  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222998  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3792  potassium transporter peripheral membrane component  27.36 
 
 
458 aa  73.6  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>