More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1641 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1641  TrkA-N domain protein  100 
 
 		 233 aa  458  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  0.0943946 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1712  TrkA-N domain protein  76.96 
 
 		 219 aa  325  5e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.887824  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2286  TrkA-N domain-containing protein  76.04 
 
 		 219 aa  322  4e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.241613 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6760  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  76.04 
 
 		 223 aa  322  5e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0522309 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1399  TrkA domain-containing protein  69.1 
 
 		 233 aa  309  2.9999999999999997e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2904  TrkA domain-containing protein  66.37 
 
 		 223 aa  300  1e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1561  TrkA-N domain protein  66.67 
 
 		 219 aa  283  1.0000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534326  normal  0.490374 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5192  TrkA domain-containing protein  67.62 
 
 		 259 aa  281  4.0000000000000003e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0506525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1876  TrkA-N domain protein  63.47 
 
 		 220 aa  278  6e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.416785  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3757  TrkA-N domain protein  63.43 
 
 		 217 aa  274  8e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000992935  normal  0.446525 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1707  TrkA-N domain protein  62.39 
 
 		 224 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102172  normal  0.0591298 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4528  TrkA-N domain-containing protein  64.35 
 
 		 222 aa  272  3e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.468661  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1450  TrkA domain-containing protein  62.04 
 
 		 229 aa  271  5.000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0807714  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1520  TrkA-N domain protein  63.89 
 
 		 218 aa  271  8.000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1322  TrkA-like  63.47 
 
 		 231 aa  270  1e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2196  TrkA-N  62.96 
 
 		 222 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2242  TrkA domain-containing protein  62.96 
 
 		 222 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.081798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2185  TrkA domain-containing protein  62.96 
 
 		 222 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314676  normal  0.0103731 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1485  TrkA domain-containing protein  63.81 
 
 		 229 aa  268  5e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0637531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16160  K+ transport system, NAD-binding component  59.07 
 
 		 249 aa  265  4e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.534565  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1406  TrkA-N domain protein  60.39 
 
 		 225 aa  264  7e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.699899  normal  0.545013 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2472  TrkA domain-containing protein  62.04 
 
 		 221 aa  264  8e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1941  TrkA-N domain protein  63.55 
 
 		 241 aa  263  2e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0298197 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3928  TrkA domain-containing protein  61.11 
 
 		 221 aa  259  3e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0399436  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2256  TrkA-N domain protein  60.37 
 
 		 218 aa  258  4e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13318  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1918  TrkA-N domain protein  58.53 
 
 		 224 aa  258  5.0000000000000005e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388192  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1640  TrkA domain-containing protein  56.88 
 
 		 253 aa  252  3e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0557692  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1633  TrkA-N domain protein  55.96 
 
 		 299 aa  252  4.0000000000000004e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12707  trk system potassium uptake protein ceoC  57.77 
 
 		 220 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.44928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0745  TrkA domain-containing protein  52.89 
 
 		 231 aa  230  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0161  TrkA domain-containing protein  53.33 
 
 		 231 aa  226  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.825727 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1929  putative potassium uptake protein  53.12 
 
 		 229 aa  201  6e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.123463  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1924  TrkA-N domain protein  50 
 
 		 231 aa  191  6e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2875  TrkA-N domain protein  49.78 
 
 		 226 aa  182  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220378  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13080  K+ transport system, NAD-binding component  47.6 
 
 		 227 aa  181  8.000000000000001e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0024035  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3071  TrkA domain-containing protein  35.48 
 
 		 220 aa  138  6e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2661  TrkA domain-containing protein  36.24 
 
 		 220 aa  137  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.202256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2407  TrkA domain-containing protein  34.56 
 
 		 220 aa  135  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  33.79 
 
 		 218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3062  TrkA domain-containing protein  34.4 
 
 		 227 aa  133  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.793731  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  33.03 
 
 		 221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  31.96 
 
 		 221 aa  125  5e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0638  TrkA-N  32.88 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  31.51 
 
 		 221 aa  122  4e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  36.27 
 
 		 223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2082  TrkA-N domain protein  29.49 
 
 		 218 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.124657  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1348  hypothetical protein  32.41 
 
 		 220 aa  108  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0533287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  30.14 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  30.13 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  30.13 
 
 		 221 aa  102  3e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  29.68 
 
 		 221 aa  94  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0242  TrkA-N domain protein  24.55 
 
 		 221 aa  94  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0542  TrkA-N domain protein  29 
 
 		 215 aa  92  8e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.840001  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1794  hypothetical protein  26.03 
 
 		 222 aa  91.3  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00290  K+ transport system, NAD-binding component  29.13 
 
 		 226 aa  90.5  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0187  potassium transporter peripheral membrane component  29.46 
 
 		 465 aa  90.1  3e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01280  K+ transport system, NAD-binding component  32.63 
 
 		 225 aa  89.4  4e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0254  TrkA-N domain protein  24.88 
 
 		 221 aa  89  6e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.153232 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11630  TrkA-C domain protein  29.61 
 
 		 207 aa  88.6  8e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2479  TrkA-N domain protein  31.08 
 
 		 445 aa  88.6  8e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1261  TrkA domain-containing protein  25.45 
 
 		 219 aa  88.2  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0251  TrkA-N domain protein  30.69 
 
 		 225 aa  87.4  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2267  TrkA-N domain protein  29.82 
 
 		 459 aa  87.4  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.634076  hitchhiker  0.00765776 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0914  potassium transporter peripheral membrane component  26.24 
 
 		 450 aa  86.7  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  32.42 
 
 		 443 aa  86.3  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2911  potassium transporter peripheral membrane component  31.34 
 
 		 449 aa  85.5  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000908908  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3063  TrkA domain-containing protein  30.77 
 
 		 214 aa  85.5  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0266  potassium transporter peripheral membrane component  30.05 
 
 		 445 aa  84.7  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2660  TrkA domain-containing protein  30.84 
 
 		 214 aa  84.3  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0646767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  30.74 
 
 		 626 aa  83.2  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2406  TrkA domain-containing protein  28.27 
 
 		 214 aa  82  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.716891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2907  potassium transporter peripheral membrane component  26.82 
 
 		 450 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000237268  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0769  TrkA-N domain protein  32.2 
 
 		 445 aa  80.5  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.601936 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3072  TrkA domain-containing protein  28.27 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4396  potassium transporter peripheral membrane component  28.83 
 
 		 458 aa  80.5  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0641614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1062  TrkA-N domain-containing protein  35.53 
 
 		 445 aa  79.7  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.121384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1728  TrkA domain-containing protein  25.11 
 
 		 218 aa  79  0.00000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000194267  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3126  potassium transporter peripheral membrane component  29.22 
 
 		 458 aa  78.2  0.00000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12706  trk system potassium uptake protein ceoB  29.67 
 
 		 227 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1400  TrkA-N domain-containing protein  31.16 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2622  potassium transporter peripheral membrane component  29.28 
 
 		 458 aa  77  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637696 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0201  potassium transporter peripheral membrane component  30.18 
 
 		 457 aa  76.6  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0211158  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0020  potassium transporter peripheral membrane component  29.81 
 
 		 457 aa  77  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1213  TrkA-N domain protein  31.63 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2258  TrkA-N domain protein  28.9 
 
 		 236 aa  75.9  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3739  potassium transporter peripheral membrane component  29.39 
 
 		 469 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00764602 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1655  TrkA domain-containing protein  25.11 
 
 		 218 aa  75.5  0.0000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000867889  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0035  potassium transporter peripheral membrane component  29.39 
 
 		 469 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.154438 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2872  potassium transporter peripheral membrane component  30.8 
 
 		 457 aa  75.1  0.0000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0040  potassium transporter peripheral membrane component  29.39 
 
 		 469 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.165147 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0905  TrkA-N domain protein  29.15 
 
 		 225 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1686  TrkA domain-containing protein  25.34 
 
 		 219 aa  74.7  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0415019  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0028  potassium transporter peripheral membrane component  25.45 
 
 		 469 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.736909  normal  0.0141363 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0029  potassium transporter peripheral membrane component  25.45 
 
 		 469 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0028  potassium transporter peripheral membrane component  25.45 
 
 		 469 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000283519 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0024  potassium transporter peripheral membrane component  25.45 
 
 		 469 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0028  potassium transporter peripheral membrane component  29.39 
 
 		 469 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0436  potassium transporter peripheral membrane component  28.07 
 
 		 458 aa  74.3  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0029  potassium transporter peripheral membrane component  25.45 
 
 		 469 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.313972  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0637  TrkA-N  25.94 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0432302 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>