More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0745 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_0745  TrkA domain-containing protein  100 
 
 		 231 aa  461  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0161  TrkA domain-containing protein  86.15 
 
 		 231 aa  402  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.825727 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1520  TrkA-N domain protein  59.55 
 
 		 218 aa  260  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1450  TrkA domain-containing protein  52.38 
 
 		 229 aa  243  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0807714  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3757  TrkA-N domain protein  53.18 
 
 		 217 aa  239  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000992935  normal  0.446525 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1485  TrkA domain-containing protein  51.95 
 
 		 229 aa  240  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0637531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1876  TrkA-N domain protein  50.67 
 
 		 220 aa  237  1e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.416785  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4528  TrkA-N domain-containing protein  50.66 
 
 		 222 aa  237  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.468661  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1712  TrkA-N domain protein  51.77 
 
 		 219 aa  235  5.0000000000000005e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.887824  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1399  TrkA domain-containing protein  53.12 
 
 		 233 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2904  TrkA domain-containing protein  50.66 
 
 		 223 aa  232  5e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6760  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  51.3 
 
 		 223 aa  228  6e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0522309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1641  TrkA-N domain protein  54.72 
 
 		 233 aa  226  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  0.0943946 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2256  TrkA-N domain protein  49.78 
 
 		 218 aa  226  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13318  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2286  TrkA-N domain-containing protein  50 
 
 		 219 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.241613 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2196  TrkA-N  48.03 
 
 		 222 aa  218  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2242  TrkA domain-containing protein  48.03 
 
 		 222 aa  218  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.081798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2185  TrkA domain-containing protein  48.03 
 
 		 222 aa  218  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314676  normal  0.0103731 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1561  TrkA-N domain protein  48.66 
 
 		 219 aa  217  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534326  normal  0.490374 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16160  K+ transport system, NAD-binding component  49.76 
 
 		 249 aa  215  5e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.534565  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3928  TrkA domain-containing protein  47.77 
 
 		 221 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0399436  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2472  TrkA domain-containing protein  48.66 
 
 		 221 aa  211  5.999999999999999e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5192  TrkA domain-containing protein  47.77 
 
 		 259 aa  207  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0506525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1918  TrkA-N domain protein  47.73 
 
 		 224 aa  206  2e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388192  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1941  TrkA-N domain protein  47.89 
 
 		 241 aa  203  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0298197 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1707  TrkA-N domain protein  46.58 
 
 		 224 aa  204  1e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102172  normal  0.0591298 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12707  trk system potassium uptake protein ceoC  48.58 
 
 		 220 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.44928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1322  TrkA-like  46.22 
 
 		 231 aa  198  5e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1640  TrkA domain-containing protein  40.26 
 
 		 253 aa  195  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0557692  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1406  TrkA-N domain protein  43.98 
 
 		 225 aa  192  4e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.699899  normal  0.545013 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1633  TrkA-N domain protein  40 
 
 		 299 aa  189  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1929  putative potassium uptake protein  42.06 
 
 		 229 aa  172  5e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.123463  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2875  TrkA-N domain protein  43.36 
 
 		 226 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220378  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13080  K+ transport system, NAD-binding component  39.37 
 
 		 227 aa  155  4e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0024035  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1924  TrkA-N domain protein  38.77 
 
 		 231 aa  154  8e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2407  TrkA domain-containing protein  33.49 
 
 		 220 aa  121  7e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3071  TrkA domain-containing protein  32.89 
 
 		 220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2082  TrkA-N domain protein  34.23 
 
 		 218 aa  109  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.124657  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  30.57 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2661  TrkA domain-containing protein  32.41 
 
 		 220 aa  102  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.202256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  32.3 
 
 		 218 aa  102  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  29.69 
 
 		 221 aa  100  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1348  hypothetical protein  33.04 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0533287  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  29.91 
 
 		 221 aa  99  5e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0638  TrkA-N  28.63 
 
 		 225 aa  94.4  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0542  TrkA-N domain protein  31.05 
 
 		 215 aa  94.7  1e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.840001  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  30.77 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3062  TrkA domain-containing protein  31.02 
 
 		 227 aa  92.4  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.793731  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  29.95 
 
 		 221 aa  91.3  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  30.23 
 
 		 221 aa  90.1  3e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  30.23 
 
 		 221 aa  88.2  9e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  27.59 
 
 		 221 aa  88.2  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1794  hypothetical protein  28.26 
 
 		 222 aa  88.2  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1728  TrkA domain-containing protein  24.14 
 
 		 218 aa  84.3  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000194267  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2479  TrkA-N domain protein  31.51 
 
 		 445 aa  82  0.000000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0254  TrkA-N domain protein  24.12 
 
 		 221 aa  81.3  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.153232 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1655  TrkA domain-containing protein  24.14 
 
 		 218 aa  81.3  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000867889  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0242  TrkA-N domain protein  25.11 
 
 		 221 aa  77.4  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1184  TrkA-N domain protein  29.57 
 
 		 218 aa  75.5  0.0000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  30.8 
 
 		 626 aa  75.1  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1261  TrkA domain-containing protein  24.77 
 
 		 219 aa  74.7  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2911  potassium transporter peripheral membrane component  29.15 
 
 		 449 aa  74.3  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000908908  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0769  TrkA-N domain protein  26.55 
 
 		 445 aa  73.2  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.601936 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2406  TrkA domain-containing protein  29.91 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.716891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0052  potassium transporter peripheral membrane component  28.16 
 
 		 457 aa  71.6  0.000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0266  potassium transporter peripheral membrane component  27.68 
 
 		 445 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1686  TrkA domain-containing protein  22.73 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0415019  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01280  K+ transport system, NAD-binding component  30.46 
 
 		 225 aa  70.9  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3424  potassium transporter peripheral membrane component  27.63 
 
 		 448 aa  70.1  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11630  TrkA-C domain protein  27.22 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1363  sodium/hydrogen exchanger  28.1 
 
 		 610 aa  70.1  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00040523  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  28.51 
 
 		 443 aa  70.1  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3072  TrkA domain-containing protein  29.49 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2267  TrkA-N domain protein  29.3 
 
 		 459 aa  69.3  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.634076  hitchhiker  0.00765776 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12706  trk system potassium uptake protein ceoB  29.36 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00170  potassium transporter peripheral membrane component  27.2 
 
 		 457 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00290  K+ transport system, NAD-binding component  30.04 
 
 		 226 aa  68.6  0.00000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00140  potassium transporter peripheral membrane component  26.94 
 
 		 457 aa  67.8  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35944  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0201  potassium transporter peripheral membrane component  27.62 
 
 		 457 aa  68.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0211158  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2849  potassium transporter peripheral membrane component  27.07 
 
 		 457 aa  67.4  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.336578  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0017  potassium transporter peripheral membrane component  26.78 
 
 		 457 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.290257  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0014  potassium transporter peripheral membrane component  28.05 
 
 		 458 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00830339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2841  potassium transporter peripheral membrane component  27 
 
 		 458 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.340173  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0436  potassium transporter peripheral membrane component  28.05 
 
 		 458 aa  67.4  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1453  potassium transporter peripheral membrane component  27 
 
 		 458 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.687964  normal  0.06884 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2476  potassium transporter peripheral membrane component  28.86 
 
 		 458 aa  66.6  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1491  potassium transporter peripheral membrane component  27 
 
 		 458 aa  66.6  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.404255 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0088  potassium transporter peripheral membrane component  27.8 
 
 		 462 aa  66.6  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1445  potassium transporter peripheral membrane component  27.31 
 
 		 457 aa  66.2  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000607771 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  29.03 
 
 		 628 aa  65.9  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2907  potassium transporter peripheral membrane component  27.83 
 
 		 450 aa  65.9  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000237268  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00394  potassium transporter peripheral membrane component  28.46 
 
 		 458 aa  65.5  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  30.61 
 
 		 630 aa  65.1  0.0000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0251  TrkA-N domain protein  27.08 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0914  potassium transporter peripheral membrane component  25.21 
 
 		 450 aa  65.1  0.0000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1262  TrkA domain-containing protein  30.66 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0020  potassium transporter peripheral membrane component  29.17 
 
 		 457 aa  64.7  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1681  potassium transporter peripheral membrane component  28 
 
 		 458 aa  64.7  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1310  potassium transporter peripheral membrane component  24.34 
 
 		 444 aa  63.9  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0072  potassium transporter peripheral membrane component  27.24 
 
 		 458 aa  63.9  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>