More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0026 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  100 
 
 		 221 aa  449  1e-125  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  93.67 
 
 		 221 aa  427  1e-119  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  93.67 
 
 		 221 aa  428  1e-119  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  46.33 
 
 		 218 aa  210  1e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  40.38 
 
 		 223 aa  172  3.9999999999999995e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1348  hypothetical protein  38.46 
 
 		 220 aa  161  7e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0533287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2082  TrkA-N domain protein  37.79 
 
 		 218 aa  157  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.124657  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0242  TrkA-N domain protein  36.2 
 
 		 221 aa  157  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00290  K+ transport system, NAD-binding component  36.28 
 
 		 226 aa  144  9e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0251  TrkA-N domain protein  34.98 
 
 		 225 aa  138  4.999999999999999e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0254  TrkA-N domain protein  32.68 
 
 		 221 aa  137  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.153232 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3062  TrkA domain-containing protein  35.16 
 
 		 227 aa  137  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.793731  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1794  hypothetical protein  31.05 
 
 		 222 aa  135  4e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1261  TrkA domain-containing protein  30.28 
 
 		 219 aa  135  5e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16160  K+ transport system, NAD-binding component  34.56 
 
 		 249 aa  135  5e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.534565  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3071  TrkA domain-containing protein  34.72 
 
 		 220 aa  129  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2407  TrkA domain-containing protein  34.26 
 
 		 220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2661  TrkA domain-containing protein  33.79 
 
 		 220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.202256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1918  TrkA-N domain protein  34.15 
 
 		 224 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388192  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1399  TrkA domain-containing protein  32.11 
 
 		 233 aa  128  5.0000000000000004e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0542  TrkA-N domain protein  32.35 
 
 		 215 aa  128  7.000000000000001e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.840001  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1941  TrkA-N domain protein  32.68 
 
 		 241 aa  128  7.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0298197 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1322  TrkA-like  33.66 
 
 		 231 aa  126  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1707  TrkA-N domain protein  32.2 
 
 		 224 aa  126  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102172  normal  0.0591298 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1712  TrkA-N domain protein  31.53 
 
 		 219 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.887824  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11630  TrkA-C domain protein  35.75 
 
 		 207 aa  125  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1924  TrkA-N domain protein  31.65 
 
 		 231 aa  125  6e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1561  TrkA-N domain protein  32.11 
 
 		 219 aa  124  8.000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534326  normal  0.490374 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1876  TrkA-N domain protein  29.86 
 
 		 220 aa  124  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.416785  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1728  TrkA domain-containing protein  31.13 
 
 		 218 aa  124  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000194267  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1633  TrkA-N domain protein  31.98 
 
 		 299 aa  122  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  31.96 
 
 		 221 aa  122  3e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1641  TrkA-N domain protein  33.5 
 
 		 233 aa  122  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  0.0943946 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  31.51 
 
 		 221 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2286  TrkA-N domain-containing protein  32.42 
 
 		 219 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.241613 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4528  TrkA-N domain-containing protein  31.51 
 
 		 222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.468661  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1520  TrkA-N domain protein  32.11 
 
 		 218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1655  TrkA domain-containing protein  29.03 
 
 		 218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000867889  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3757  TrkA-N domain protein  30.28 
 
 		 217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000992935  normal  0.446525 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1450  TrkA domain-containing protein  29.82 
 
 		 229 aa  119  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0807714  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  31.65 
 
 		 221 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1640  TrkA domain-containing protein  31.51 
 
 		 253 aa  118  6e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0557692  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5192  TrkA domain-containing protein  31.92 
 
 		 259 aa  118  7.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0506525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2904  TrkA domain-containing protein  32.59 
 
 		 223 aa  118  7.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6760  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  30.45 
 
 		 223 aa  116  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0522309 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  34.47 
 
 		 626 aa  116  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1485  TrkA domain-containing protein  29.36 
 
 		 229 aa  116  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0637531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2256  TrkA-N domain protein  30.28 
 
 		 218 aa  115  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13318  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3928  TrkA domain-containing protein  30.73 
 
 		 221 aa  115  6e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0399436  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  31.19 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0638  TrkA-N  33.33 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1406  TrkA-N domain protein  29.27 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.699899  normal  0.545013 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01280  K+ transport system, NAD-binding component  31.92 
 
 		 225 aa  112  5e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2196  TrkA-N  30.28 
 
 		 222 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2242  TrkA domain-containing protein  30.28 
 
 		 222 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.081798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2185  TrkA domain-containing protein  30.28 
 
 		 222 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314676  normal  0.0103731 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2660  TrkA domain-containing protein  28.57 
 
 		 214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0646767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2472  TrkA domain-containing protein  29.36 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  31.78 
 
 		 628 aa  109  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  31.68 
 
 		 630 aa  107  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3063  TrkA domain-containing protein  28.57 
 
 		 214 aa  106  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1216  TrkA-N domain protein  27.48 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13080  K+ transport system, NAD-binding component  30.48 
 
 		 227 aa  105  5e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0024035  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1213  TrkA-N domain protein  27.03 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12707  trk system potassium uptake protein ceoC  30.69 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.44928  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2849  potassium transporter peripheral membrane component  26.67 
 
 		 457 aa  103  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.336578  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  27.75 
 
 		 443 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2079  TrkA-N domain protein  29.52 
 
 		 225 aa  101  9e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3072  TrkA domain-containing protein  29.15 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0161  TrkA domain-containing protein  29.2 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.825727 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2406  TrkA domain-containing protein  29.15 
 
 		 214 aa  99.8  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.716891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0745  TrkA domain-containing protein  29.91 
 
 		 231 aa  99  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1686  TrkA domain-containing protein  26.36 
 
 		 219 aa  98.6  6e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0415019  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0243  TrkA-N domain protein  31.15 
 
 		 206 aa  97.1  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1929  putative potassium uptake protein  30.53 
 
 		 229 aa  95.1  7e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.123463  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3126  potassium transporter peripheral membrane component  26.15 
 
 		 458 aa  94.7  9e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0266  potassium transporter peripheral membrane component  28.92 
 
 		 445 aa  93.6  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0014  potassium transporter peripheral membrane component  27.06 
 
 		 458 aa  94  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00830339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1041  TrkA domain-containing protein  32.65 
 
 		 452 aa  92.8  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12706  trk system potassium uptake protein ceoB  29.77 
 
 		 227 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0819  potassium transporter peripheral membrane component  28.11 
 
 		 437 aa  92  6e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4514  potassium transporter peripheral membrane component  25.7 
 
 		 458 aa  91.7  8e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00906883  hitchhiker  0.00000865676 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0112  TrkA-N domain protein  29.81 
 
 		 617 aa  91.3  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0201  potassium transporter peripheral membrane component  26.29 
 
 		 457 aa  91.3  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0211158  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1681  potassium transporter peripheral membrane component  27.98 
 
 		 458 aa  91.3  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0637  TrkA-N  29.5 
 
 		 219 aa  91.3  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0432302 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2911  potassium transporter peripheral membrane component  28.43 
 
 		 449 aa  90.5  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000908908  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1486  TrkA domain-containing protein  28.5 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.370955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2258  TrkA-N domain protein  29.09 
 
 		 236 aa  89.7  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2476  potassium transporter peripheral membrane component  25.55 
 
 		 458 aa  89.4  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0914  potassium transporter peripheral membrane component  26.79 
 
 		 450 aa  89.4  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4527  TrkA-N domain-containing protein  27.6 
 
 		 221 aa  89.4  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.621759 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  29.61 
 
 		 617 aa  89.4  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2083  TrkA-N domain protein  31.05 
 
 		 210 aa  89  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3020  potassium transporter peripheral membrane component  25.7 
 
 		 457 aa  89  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00394  potassium transporter peripheral membrane component  25.55 
 
 		 458 aa  89  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0065  potassium transporter peripheral membrane component  25.35 
 
 		 457 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948816  unclonable  0.000000448887 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0180  Trk system potassium uptake protein TrkA  25.35 
 
 		 457 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002054  Trk system potassium uptake protein TrkA  25.11 
 
 		 458 aa  87.8  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2479  TrkA-N domain protein  31.08 
 
 		 445 aa  87.4  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>