More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1728 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1728  TrkA domain-containing protein  100 
 
 
218 aa  431  1e-120  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000194267  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1655  TrkA domain-containing protein  94.95 
 
 
218 aa  413  9.999999999999999e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000867889  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1261  TrkA domain-containing protein  45.32 
 
 
219 aa  205  5e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0254  TrkA-N domain protein  40.18 
 
 
221 aa  181  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.153232 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1686  TrkA domain-containing protein  39.35 
 
 
219 aa  165  5.9999999999999996e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0415019  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11630  TrkA-C domain protein  42.61 
 
 
207 aa  149  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0242  TrkA-N domain protein  38.21 
 
 
221 aa  144  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2082  TrkA-N domain protein  29.82 
 
 
218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.124657  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  31.94 
 
 
218 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1794  hypothetical protein  29.86 
 
 
222 aa  126  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  30.92 
 
 
221 aa  125  5e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0542  TrkA-N domain protein  32.84 
 
 
215 aa  125  6e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.840001  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  31.28 
 
 
221 aa  125  7e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  31.13 
 
 
221 aa  124  1e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1348  hypothetical protein  32.57 
 
 
220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0533287  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1924  TrkA-N domain protein  31.51 
 
 
231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  29.9 
 
 
223 aa  106  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1918  TrkA-N domain protein  30.77 
 
 
224 aa  105  5e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388192  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1520  TrkA-N domain protein  27.65 
 
 
218 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2661  TrkA domain-containing protein  30 
 
 
220 aa  103  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.202256  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16160  K+ transport system, NAD-binding component  28.1 
 
 
249 aa  99.4  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.534565  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2030  potassium transporter peripheral membrane component  28.37 
 
 
465 aa  99.4  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0693486  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0914  potassium transporter peripheral membrane component  30.41 
 
 
450 aa  99.8  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3335  sodium/hydrogen exchanger  29.3 
 
 
620 aa  99.8  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1876  TrkA-N domain protein  27.19 
 
 
220 aa  99.8  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.416785  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1640  TrkA domain-containing protein  30.81 
 
 
253 aa  99.4  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0557692  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3757  TrkA-N domain protein  28.57 
 
 
217 aa  99.4  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000992935  normal  0.446525 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2407  TrkA domain-containing protein  29.95 
 
 
220 aa  99.4  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163912  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2196  TrkA-N  29.36 
 
 
222 aa  98.6  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2242  TrkA domain-containing protein  29.36 
 
 
222 aa  98.6  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.081798  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2185  TrkA domain-containing protein  29.36 
 
 
222 aa  98.6  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314676  normal  0.0103731 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3126  potassium transporter peripheral membrane component  28.24 
 
 
458 aa  98.6  7e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2911  potassium transporter peripheral membrane component  31.46 
 
 
449 aa  98.6  7e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000908908  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1633  TrkA-N domain protein  30.81 
 
 
299 aa  98.2  9e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2256  TrkA-N domain protein  29.03 
 
 
218 aa  97.8  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13318  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3063  TrkA domain-containing protein  28.57 
 
 
214 aa  97.1  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1450  TrkA domain-containing protein  27.85 
 
 
229 aa  96.7  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0807714  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1485  TrkA domain-containing protein  27.85 
 
 
229 aa  95.9  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0637531  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3062  TrkA domain-containing protein  29.09 
 
 
227 aa  94.7  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.793731  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1681  potassium transporter peripheral membrane component  30.88 
 
 
458 aa  94.7  9e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2660  TrkA domain-containing protein  30.41 
 
 
214 aa  94.7  9e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0646767  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01280  K+ transport system, NAD-binding component  30.94 
 
 
225 aa  94.4  1e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1093  potassium transporter peripheral membrane component  29.17 
 
 
458 aa  94  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.915935  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  27.31 
 
 
221 aa  94.4  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3071  TrkA domain-containing protein  29.03 
 
 
220 aa  93.6  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  28.24 
 
 
221 aa  94  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1399  TrkA-N domain protein  30.09 
 
 
455 aa  92.4  5e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000200171  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  27.78 
 
 
221 aa  92.4  5e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2455  potassium transporter peripheral membrane component  29.44 
 
 
452 aa  92.4  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.341783  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  28.3 
 
 
221 aa  92  6e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2286  TrkA-N domain-containing protein  27.27 
 
 
219 aa  91.3  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.241613 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0638  TrkA-N  29.22 
 
 
225 aa  91.3  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  29.36 
 
 
443 aa  90.9  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2907  potassium transporter peripheral membrane component  30.66 
 
 
450 aa  91.3  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000237268  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1310  potassium transporter peripheral membrane component  29.11 
 
 
444 aa  90.1  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1970  potassium transporter peripheral membrane component  27.91 
 
 
453 aa  90.5  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.616677  normal  0.0915611 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6760  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  27.65 
 
 
223 aa  90.5  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0522309 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1944  TrkA domain-containing protein  30.61 
 
 
222 aa  89.7  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.772638 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4396  potassium transporter peripheral membrane component  29.63 
 
 
458 aa  89.4  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0641614  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1712  TrkA-N domain protein  26.7 
 
 
219 aa  88.6  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.887824  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1941  TrkA-N domain protein  28.37 
 
 
241 aa  89  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0298197 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1406  TrkA-N domain protein  28.43 
 
 
225 aa  87.4  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.699899  normal  0.545013 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00290  K+ transport system, NAD-binding component  31.22 
 
 
226 aa  87.4  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3424  potassium transporter peripheral membrane component  28.37 
 
 
448 aa  87.4  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4528  TrkA-N domain-containing protein  26.58 
 
 
222 aa  87  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.468661  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3928  TrkA domain-containing protein  27.52 
 
 
221 aa  87  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0399436  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0251  TrkA-N domain protein  29.74 
 
 
225 aa  86.3  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1322  TrkA-like  30.45 
 
 
231 aa  86.3  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1877  potassium transporter peripheral membrane component  28.37 
 
 
445 aa  86.7  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.113601 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1469  TrkA-N domain protein  29.52 
 
 
454 aa  85.9  4e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12243  putative potassium uptake protein  28.7 
 
 
449 aa  85.9  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0266  potassium transporter peripheral membrane component  31.19 
 
 
445 aa  85.9  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1072  potassium transporter peripheral membrane component  26.39 
 
 
458 aa  85.5  6e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1114  potassium transporter peripheral membrane component  26.39 
 
 
458 aa  85.1  7e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0547  K+ transport systems NAD-binding subunit  26.7 
 
 
219 aa  85.1  7e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5192  TrkA domain-containing protein  30.59 
 
 
259 aa  84.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0506525  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4126  potassium transporter peripheral membrane component  25.81 
 
 
458 aa  84.3  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.215607  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2267  TrkA-N domain protein  25.82 
 
 
459 aa  84.3  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.634076  hitchhiker  0.00765776 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0745  TrkA domain-containing protein  24.14 
 
 
231 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26958  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2472  TrkA domain-containing protein  26.61 
 
 
221 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1707  TrkA-N domain protein  26.36 
 
 
224 aa  83.6  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102172  normal  0.0591298 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  29.91 
 
 
628 aa  83.6  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0312  potassium transporter peripheral membrane component  27.75 
 
 
449 aa  83.6  0.000000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0720169  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2904  TrkA domain-containing protein  25.81 
 
 
223 aa  84  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2209  potassium transporter peripheral membrane component  25.93 
 
 
458 aa  84  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1489  hypothetical protein  27.88 
 
 
218 aa  83.2  0.000000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00984888  normal  0.0109156 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3430  potassium transporter peripheral membrane component  27.91 
 
 
448 aa  82.8  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0375932  normal  0.146617 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  30.28 
 
 
626 aa  82.8  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00170  potassium transporter peripheral membrane component  28.02 
 
 
457 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1929  putative potassium uptake protein  28.44 
 
 
229 aa  82.4  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.123463  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5999  potassium transporter peripheral membrane component  28.83 
 
 
485 aa  82  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0135992 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  29.09 
 
 
630 aa  81.6  0.000000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0436  potassium transporter peripheral membrane component  27.4 
 
 
458 aa  81.6  0.000000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1920  TrkA domain-containing protein  27.98 
 
 
224 aa  81.3  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2079  TrkA-N domain protein  31.15 
 
 
225 aa  80.9  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3218  potassium transporter peripheral membrane component  26.94 
 
 
454 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.715113  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1399  TrkA domain-containing protein  25.69 
 
 
233 aa  80.9  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0353  potassium transporter peripheral membrane component  27.88 
 
 
458 aa  80.9  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1186  potassium transporter peripheral membrane component  25.71 
 
 
445 aa  80.1  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.596494  decreased coverage  0.00000028569 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2406  TrkA domain-containing protein  25.46 
 
 
214 aa  80.1  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.716891  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>