108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1920 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1920  TrkA domain-containing protein  100 
 
 		 224 aa  436  1e-121  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1261  TrkA domain-containing protein  27.06 
 
 		 219 aa  91.7  7e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11630  TrkA-C domain protein  26.73 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1655  TrkA domain-containing protein  27.98 
 
 		 218 aa  81.6  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000867889  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1686  TrkA domain-containing protein  26.73 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0415019  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1728  TrkA domain-containing protein  27.98 
 
 		 218 aa  81.3  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000194267  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0254  TrkA-N domain protein  26.36 
 
 		 221 aa  77  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.153232 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5192  TrkA domain-containing protein  22.32 
 
 		 259 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0506525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  24.88 
 
 		 221 aa  68.6  0.00000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  24.76 
 
 		 221 aa  68.6  0.00000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1322  TrkA-like  23.21 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2661  TrkA domain-containing protein  25.99 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.202256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  23.79 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3757  TrkA-N domain protein  23.11 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000992935  normal  0.446525 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0638  TrkA-N  24.88 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2407  TrkA domain-containing protein  22.54 
 
 		 220 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1712  TrkA-N domain protein  22.52 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.887824  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  22.48 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0242  TrkA-N domain protein  23.9 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1794  hypothetical protein  21.9 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2286  TrkA-N domain-containing protein  23.08 
 
 		 219 aa  62  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.241613 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1520  TrkA-N domain protein  21.4 
 
 		 218 aa  62  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3071  TrkA domain-containing protein  22.54 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0251  TrkA-N domain protein  28.44 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1489  hypothetical protein  27.17 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00984888  normal  0.0109156 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2196  TrkA-N  23.15 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2242  TrkA domain-containing protein  23.15 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.081798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2185  TrkA domain-containing protein  23.15 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314676  normal  0.0103731 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0542  TrkA-N domain protein  20.86 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.840001  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2904  TrkA domain-containing protein  21.95 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6760  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  23.22 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0522309 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3335  sodium/hydrogen exchanger  24.02 
 
 		 620 aa  58.5  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2256  TrkA-N domain protein  22.27 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13318  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1450  TrkA domain-containing protein  22.38 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0807714  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2907  potassium transporter peripheral membrane component  24.54 
 
 		 450 aa  57  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000237268  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1561  TrkA-N domain protein  20.91 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534326  normal  0.490374 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  22.27 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1876  TrkA-N domain protein  22.12 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.416785  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1485  TrkA domain-containing protein  22.38 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0637531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00290  K+ transport system, NAD-binding component  22.22 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3062  TrkA domain-containing protein  23.32 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.793731  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1399  TrkA domain-containing protein  21.33 
 
 		 233 aa  54.7  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1641  TrkA-N domain protein  23.12 
 
 		 233 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  0.0943946 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1918  TrkA-N domain protein  20.56 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388192  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0407  potassium/proton antiporter  36.25 
 
 		 486 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3126  potassium transporter peripheral membrane component  21.29 
 
 		 458 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1399  TrkA-N domain protein  25.32 
 
 		 455 aa  52.8  0.000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000200171  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1707  TrkA-N domain protein  19.83 
 
 		 224 aa  52.4  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102172  normal  0.0591298 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2472  TrkA domain-containing protein  21.56 
 
 		 221 aa  52  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12707  trk system potassium uptake protein ceoC  18.84 
 
 		 220 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.44928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1348  hypothetical protein  20.09 
 
 		 220 aa  51.6  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0533287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0038  potassium transporter peripheral membrane component  25.7 
 
 		 458 aa  51.6  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  26.58 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3928  TrkA domain-containing protein  21.36 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0399436  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1944  TrkA domain-containing protein  23.26 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.772638 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2082  TrkA-N domain protein  22.82 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.124657  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2911  potassium transporter peripheral membrane component  22.07 
 
 		 449 aa  49.7  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000908908  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  26.61 
 
 		 221 aa  49.7  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1035  potassium/proton antiporter  32.5 
 
 		 483 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  26.13 
 
 		 221 aa  49.7  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0266  potassium transporter peripheral membrane component  22.02 
 
 		 445 aa  49.7  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1681  potassium transporter peripheral membrane component  24.66 
 
 		 458 aa  49.3  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16160  K+ transport system, NAD-binding component  18.35 
 
 		 249 aa  48.9  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.534565  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1929  putative potassium uptake protein  21.78 
 
 		 229 aa  48.1  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.123463  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0505  TrkA domain-containing protein  24.29 
 
 		 229 aa  48.1  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  26.13 
 
 		 221 aa  47.8  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1406  TrkA-N domain protein  19.1 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.699899  normal  0.545013 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1310  potassium transporter peripheral membrane component  30.88 
 
 		 444 aa  47  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0769  TrkA-N domain protein  21.93 
 
 		 445 aa  47  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.601936 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3424  potassium transporter peripheral membrane component  35.48 
 
 		 448 aa  47  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0020  potassium transporter peripheral membrane component  23.08 
 
 		 457 aa  46.6  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1198  TrkA domain-containing protein  23.12 
 
 		 214 aa  46.6  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1216  TrkA-N domain protein  25.52 
 
 		 229 aa  47  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1469  TrkA-N domain protein  34.78 
 
 		 454 aa  46.6  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4528  TrkA-N domain-containing protein  19.23 
 
 		 222 aa  46.2  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.468661  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4396  potassium transporter peripheral membrane component  23.18 
 
 		 458 aa  46.2  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0641614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2083  TrkA-N domain protein  23.3 
 
 		 210 aa  46.2  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1209  potassium transporter peripheral membrane component  19.72 
 
 		 448 aa  45.8  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.356485  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1203  potassium/proton antiporter  36.92 
 
 		 486 aa  45.8  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.195277  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0087  potassium transporter peripheral membrane component  25.14 
 
 		 466 aa  45.8  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0908  potassium/proton antiporter  36.92 
 
 		 497 aa  45.8  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.709599  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  22.84 
 
 		 617 aa  45.8  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0734  TrkA-N domain protein  26.83 
 
 		 450 aa  45.8  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0243  TrkA-N domain protein  24.73 
 
 		 206 aa  45.4  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1941  TrkA-N domain protein  22.5 
 
 		 241 aa  45.4  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0298197 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  33.33 
 
 		 443 aa  45.1  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2757  potassium/proton antiporter  38.89 
 
 		 538 aa  45.1  0.0009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1273  TrkA-N  21.82 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0745  TrkA domain-containing protein  18.47 
 
 		 231 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0890  TrkA-C domain protein  25.69 
 
 		 446 aa  45.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000220881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1924  TrkA-N domain protein  20.69 
 
 		 231 aa  45.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2188  Chloride channel core  32.84 
 
 		 563 aa  44.7  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000751746  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2267  TrkA-N domain protein  21.63 
 
 		 459 aa  44.3  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.634076  hitchhiker  0.00765776 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1262  TrkA domain-containing protein  25.49 
 
 		 141 aa  44.3  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1062  TrkA-N domain-containing protein  22.4 
 
 		 445 aa  44.3  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.121384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3218  potassium transporter peripheral membrane component  32.81 
 
 		 454 aa  44.3  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.715113  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5829  sodium/hydrogen exchanger  35.59 
 
 		 593 aa  43.5  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.626917  normal  0.686522 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2711  YidE/YbjL duplication  35.94 
 
 		 549 aa  43.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.129476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  24.07 
 
 		 630 aa  42.7  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2479  TrkA-N domain protein  23.04 
 
 		 445 aa  43.1  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>