More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1198 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1198  TrkA domain-containing protein  100 
 
 		 214 aa  413  9.999999999999999e-116  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  30.99 
 
 		 218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1348  hypothetical protein  32.73 
 
 		 220 aa  106  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0533287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  29.6 
 
 		 221 aa  97.4  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  30 
 
 		 221 aa  97.1  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  29.47 
 
 		 221 aa  97.1  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  28.84 
 
 		 221 aa  97.4  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2661  TrkA domain-containing protein  33.81 
 
 		 220 aa  96.3  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.202256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  28.84 
 
 		 221 aa  93.6  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  28.37 
 
 		 221 aa  94  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  28.37 
 
 		 221 aa  92  6e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0914  potassium transporter peripheral membrane component  33.33 
 
 		 450 aa  91.7  8e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1924  TrkA-N domain protein  33.63 
 
 		 231 aa  90.1  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2286  TrkA-N domain-containing protein  30.29 
 
 		 219 aa  90.5  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.241613 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1485  TrkA domain-containing protein  33.33 
 
 		 229 aa  88.6  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0637531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1450  TrkA domain-containing protein  33.33 
 
 		 229 aa  88.6  7e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0807714  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0242  TrkA-N domain protein  29.76 
 
 		 221 aa  87.8  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  30.91 
 
 		 630 aa  86.7  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2082  TrkA-N domain protein  29.5 
 
 		 218 aa  87  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.124657  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3062  TrkA domain-containing protein  34.31 
 
 		 227 aa  87  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.793731  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1261  TrkA domain-containing protein  27.49 
 
 		 219 aa  87  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4082  potassium transporter peripheral membrane component  27.57 
 
 		 467 aa  85.1  7e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1728  TrkA domain-containing protein  29.95 
 
 		 218 aa  84.7  9e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000194267  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5192  TrkA domain-containing protein  30.28 
 
 		 259 aa  84  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0506525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4528  TrkA-N domain-containing protein  31.82 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.468661  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1655  TrkA domain-containing protein  29.95 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000867889  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  32.7 
 
 		 443 aa  82  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1322  TrkA-like  32 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0254  TrkA-N domain protein  24.77 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.153232 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3757  TrkA-N domain protein  29.63 
 
 		 217 aa  80.1  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000992935  normal  0.446525 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3424  potassium transporter peripheral membrane component  32.74 
 
 		 448 aa  80.1  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  27.23 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16160  K+ transport system, NAD-binding component  29.58 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.534565  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2904  TrkA domain-containing protein  31.37 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1681  potassium transporter peripheral membrane component  29.67 
 
 		 458 aa  79  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1363  sodium/hydrogen exchanger  33.04 
 
 		 610 aa  79  0.00000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00040523  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1399  TrkA domain-containing protein  29.36 
 
 		 233 aa  78.2  0.00000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1712  TrkA-N domain protein  30.14 
 
 		 219 aa  77.8  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.887824  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1520  TrkA-N domain protein  29.91 
 
 		 218 aa  78.2  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1876  TrkA-N domain protein  33.94 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.416785  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0542  TrkA-N domain protein  26.87 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.840001  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1794  hypothetical protein  24.88 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2472  TrkA domain-containing protein  31.51 
 
 		 221 aa  75.1  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1216  TrkA-N domain protein  29.31 
 
 		 229 aa  74.3  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1454  TrkA-N domain protein  27.85 
 
 		 443 aa  74.3  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6760  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  28.85 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0522309 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0734  TrkA-N domain protein  32.11 
 
 		 450 aa  74.3  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1918  TrkA-N domain protein  32.21 
 
 		 224 aa  74.7  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388192  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2907  potassium transporter peripheral membrane component  31.84 
 
 		 450 aa  73.6  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000237268  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1877  potassium transporter peripheral membrane component  31.53 
 
 		 445 aa  73.6  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.113601 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3071  TrkA domain-containing protein  29.6 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00394  potassium transporter peripheral membrane component  28.02 
 
 		 458 aa  73.6  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3928  TrkA domain-containing protein  31.56 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0399436  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11630  TrkA-C domain protein  27.68 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2083  TrkA-N domain protein  29.03 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1093  potassium transporter peripheral membrane component  28.51 
 
 		 458 aa  73.2  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.915935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0819  potassium transporter peripheral membrane component  26.82 
 
 		 437 aa  73.2  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1970  potassium transporter peripheral membrane component  29.86 
 
 		 453 aa  73.2  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.616677  normal  0.0915611 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2911  potassium transporter peripheral membrane component  30.95 
 
 		 449 aa  73.2  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000908908  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0769  TrkA-N domain protein  39.82 
 
 		 445 aa  72.4  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.601936 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2085  TrkA-N domain protein  28.7 
 
 		 444 aa  72.4  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002054  Trk system potassium uptake protein TrkA  27.54 
 
 		 458 aa  72.4  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1213  TrkA-N domain protein  28.72 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0088  potassium transporter peripheral membrane component  28.1 
 
 		 462 aa  72.4  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2079  TrkA-N domain protein  30.16 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1615  potassium transporter peripheral membrane component  28.05 
 
 		 458 aa  72  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0266  potassium transporter peripheral membrane component  29.52 
 
 		 445 aa  72  0.000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  28.77 
 
 		 626 aa  72  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3430  potassium transporter peripheral membrane component  28.38 
 
 		 448 aa  71.6  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0375932  normal  0.146617 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0243  TrkA-N domain protein  25.85 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4396  potassium transporter peripheral membrane component  29.03 
 
 		 458 aa  71.6  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0641614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2455  potassium transporter peripheral membrane component  32.38 
 
 		 452 aa  71.6  0.000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.341783  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0544  potassium transporter peripheral membrane component  29.22 
 
 		 458 aa  71.6  0.000000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.027133  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0014  potassium transporter peripheral membrane component  27.54 
 
 		 458 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00830339  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1941  TrkA-N domain protein  28.37 
 
 		 241 aa  71.6  0.000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0298197 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2476  potassium transporter peripheral membrane component  27.05 
 
 		 458 aa  71.6  0.000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1310  potassium transporter peripheral membrane component  29.82 
 
 		 444 aa  71.6  0.000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2849  potassium transporter peripheral membrane component  25 
 
 		 457 aa  70.9  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.336578  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1400  TrkA-N domain-containing protein  30.38 
 
 		 227 aa  71.2  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2407  TrkA domain-containing protein  29.15 
 
 		 220 aa  71.2  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0890  TrkA-C domain protein  25.69 
 
 		 446 aa  70.9  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000220881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  27.4 
 
 		 628 aa  71.2  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1489  hypothetical protein  25.24 
 
 		 218 aa  71.2  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00984888  normal  0.0109156 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0699  TrkA-N domain protein  27.6 
 
 		 444 aa  70.1  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1265  hypothetical protein  28.22 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2209  potassium transporter peripheral membrane component  27.6 
 
 		 458 aa  70.5  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1406  TrkA-N domain protein  28.92 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.699899  normal  0.545013 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0905  TrkA-N domain protein  25.91 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0032  potassium transporter peripheral membrane component  25.69 
 
 		 469 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0670474 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2257  TrkA-N domain protein  29.95 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222998  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2256  TrkA-N domain protein  31.9 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13318  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1685  TrkA domain-containing protein  34.09 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.124287  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0638  TrkA-N  28.24 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0018  potassium transporter peripheral membrane component  27.27 
 
 		 477 aa  69.3  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.265003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1641  TrkA-N domain protein  28.08 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  0.0943946 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0072  potassium transporter peripheral membrane component  28.23 
 
 		 458 aa  69.3  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0251  TrkA-N domain protein  26.94 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1067  hypothetical protein  26.61 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521072 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1640  TrkA domain-containing protein  29.35 
 
 		 253 aa  68.9  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0557692  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0040  potassium transporter peripheral membrane component  24.77 
 
 		 469 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.165147 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>