More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1640 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1640  TrkA domain-containing protein  100 
 
 		 253 aa  499  1e-140  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0557692  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1633  TrkA-N domain protein  94.52 
 
 		 299 aa  411  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1561  TrkA-N domain protein  60.65 
 
 		 219 aa  263  1e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534326  normal  0.490374 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1707  TrkA-N domain protein  60.29 
 
 		 224 aa  261  6.999999999999999e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102172  normal  0.0591298 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1941  TrkA-N domain protein  57.85 
 
 		 241 aa  261  1e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0298197 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6760  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  57.21 
 
 		 223 aa  257  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0522309 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16160  K+ transport system, NAD-binding component  58.82 
 
 		 249 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.534565  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1918  TrkA-N domain protein  59.8 
 
 		 224 aa  253  2.0000000000000002e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388192  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1712  TrkA-N domain protein  57.14 
 
 		 219 aa  249  4e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.887824  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2286  TrkA-N domain-containing protein  57.14 
 
 		 219 aa  246  2e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.241613 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1399  TrkA domain-containing protein  57.41 
 
 		 233 aa  246  3e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2904  TrkA domain-containing protein  56.42 
 
 		 223 aa  244  9.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1641  TrkA-N domain protein  57.28 
 
 		 233 aa  244  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  0.0943946 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1406  TrkA-N domain protein  57.35 
 
 		 225 aa  243  1.9999999999999999e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.699899  normal  0.545013 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4528  TrkA-N domain-containing protein  55.87 
 
 		 222 aa  238  5e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.468661  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2196  TrkA-N  54.5 
 
 		 222 aa  238  9e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2242  TrkA domain-containing protein  54.5 
 
 		 222 aa  238  9e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.081798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2185  TrkA domain-containing protein  54.5 
 
 		 222 aa  238  9e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314676  normal  0.0103731 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5192  TrkA domain-containing protein  57.87 
 
 		 259 aa  236  3e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0506525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3928  TrkA domain-containing protein  54.5 
 
 		 221 aa  235  4e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0399436  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3757  TrkA-N domain protein  54.17 
 
 		 217 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000992935  normal  0.446525 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2472  TrkA domain-containing protein  53.6 
 
 		 221 aa  232  3e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13080  K+ transport system, NAD-binding component  51.82 
 
 		 227 aa  232  5e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0024035  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2256  TrkA-N domain protein  54.46 
 
 		 218 aa  229  4e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13318  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1485  TrkA domain-containing protein  50.93 
 
 		 229 aa  228  9e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0637531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1450  TrkA domain-containing protein  50.93 
 
 		 229 aa  228  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0807714  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1322  TrkA-like  56.48 
 
 		 231 aa  226  4e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1520  TrkA-N domain protein  52.31 
 
 		 218 aa  220  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1876  TrkA-N domain protein  50.46 
 
 		 220 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.416785  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12707  trk system potassium uptake protein ceoC  53.21 
 
 		 220 aa  216  4e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.44928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0745  TrkA domain-containing protein  40.26 
 
 		 231 aa  195  5.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0161  TrkA domain-containing protein  40.69 
 
 		 231 aa  194  9e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.825727 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1929  putative potassium uptake protein  45.69 
 
 		 229 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.123463  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1924  TrkA-N domain protein  43.67 
 
 		 231 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2875  TrkA-N domain protein  60.16 
 
 		 226 aa  159  5e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2661  TrkA domain-containing protein  38.72 
 
 		 220 aa  144  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.202256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3062  TrkA domain-containing protein  38.63 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.793731  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2407  TrkA domain-containing protein  39.51 
 
 		 220 aa  142  6e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3071  TrkA domain-containing protein  39.02 
 
 		 220 aa  139  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0638  TrkA-N  35.32 
 
 		 225 aa  132  5e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  34.4 
 
 		 218 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  32.88 
 
 		 221 aa  123  3e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  32.88 
 
 		 221 aa  121  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  34.39 
 
 		 223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  31.51 
 
 		 221 aa  118  7e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0242  TrkA-N domain protein  32.43 
 
 		 221 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2082  TrkA-N domain protein  31.78 
 
 		 218 aa  116  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.124657  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1348  hypothetical protein  35.71 
 
 		 220 aa  114  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0533287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1794  hypothetical protein  29.41 
 
 		 222 aa  103  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0254  TrkA-N domain protein  29.27 
 
 		 221 aa  102  7e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.153232 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1728  TrkA domain-containing protein  30.81 
 
 		 218 aa  99.4  5e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000194267  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00290  K+ transport system, NAD-binding component  32.74 
 
 		 226 aa  97.8  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0312  potassium transporter peripheral membrane component  29.95 
 
 		 449 aa  96.3  4e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0720169  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1655  TrkA domain-containing protein  29.86 
 
 		 218 aa  94.7  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000867889  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1261  TrkA domain-containing protein  27.6 
 
 		 219 aa  94.7  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0017  potassium transporter peripheral membrane component  29.44 
 
 		 457 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.290257  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0201  potassium transporter peripheral membrane component  29.79 
 
 		 457 aa  91.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0211158  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0251  TrkA-N domain protein  32.14 
 
 		 225 aa  91.7  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00170  potassium transporter peripheral membrane component  29 
 
 		 457 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11630  TrkA-C domain protein  31.06 
 
 		 207 aa  90.9  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0542  TrkA-N domain protein  34.52 
 
 		 215 aa  90.9  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.840001  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01280  K+ transport system, NAD-binding component  34.76 
 
 		 225 aa  90.1  3e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0052  potassium transporter peripheral membrane component  28.57 
 
 		 457 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0769  TrkA-N domain protein  32.47 
 
 		 445 aa  89.4  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.601936 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  28.18 
 
 		 443 aa  89  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2622  potassium transporter peripheral membrane component  30.21 
 
 		 458 aa  88.2  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637696 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0065  potassium transporter peripheral membrane component  28.57 
 
 		 457 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948816  unclonable  0.000000448887 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0084  potassium transporter peripheral membrane component  28.57 
 
 		 457 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.409393  hitchhiker  0.00000000549949 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0081  potassium transporter peripheral membrane component  28.57 
 
 		 457 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  hitchhiker  0.0000000000177319 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4082  potassium transporter peripheral membrane component  27.66 
 
 		 467 aa  87.4  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0081  potassium transporter peripheral membrane component  28.57 
 
 		 457 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685696  normal  0.107342 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0014  potassium transporter peripheral membrane component  29.31 
 
 		 458 aa  87  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00830339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2872  potassium transporter peripheral membrane component  28.39 
 
 		 457 aa  87  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  26.91 
 
 		 221 aa  87  3e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00140  potassium transporter peripheral membrane component  28.57 
 
 		 457 aa  86.3  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35944  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0020  potassium transporter peripheral membrane component  31.09 
 
 		 457 aa  86.7  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  26.46 
 
 		 221 aa  85.9  5e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0072  potassium transporter peripheral membrane component  27.12 
 
 		 458 aa  85.9  6e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  27.15 
 
 		 221 aa  85.5  7e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3721  potassium transporter peripheral membrane component  27.12 
 
 		 458 aa  85.5  8e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.455601  hitchhiker  0.00773793 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2849  potassium transporter peripheral membrane component  25.32 
 
 		 457 aa  84  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.336578  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3424  potassium transporter peripheral membrane component  28.04 
 
 		 448 aa  83.6  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2479  TrkA-N domain protein  29.28 
 
 		 445 aa  83.2  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0028  potassium transporter peripheral membrane component  26.61 
 
 		 469 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.736909  normal  0.0141363 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0028  potassium transporter peripheral membrane component  26.61 
 
 		 469 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000283519 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0187  potassium transporter peripheral membrane component  26.87 
 
 		 465 aa  83.2  0.000000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1062  TrkA-N domain-containing protein  29.26 
 
 		 445 aa  83.2  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.121384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0021  potassium transporter peripheral membrane component  26.61 
 
 		 469 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0914  potassium transporter peripheral membrane component  28.71 
 
 		 450 aa  83.2  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  25.56 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0029  potassium transporter peripheral membrane component  26.61 
 
 		 469 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.313972  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0024  potassium transporter peripheral membrane component  26.61 
 
 		 469 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0029  potassium transporter peripheral membrane component  26.21 
 
 		 469 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0018  potassium transporter peripheral membrane component  28.09 
 
 		 477 aa  82.4  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.265003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2907  potassium transporter peripheral membrane component  29.33 
 
 		 450 aa  82  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000237268  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0026  potassium transporter peripheral membrane component  26.21 
 
 		 469 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.570638  hitchhiker  0.00237688 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0024  potassium transporter peripheral membrane component  26.21 
 
 		 469 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.738729  normal  0.0894147 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0032  potassium transporter peripheral membrane component  26.21 
 
 		 469 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.21174  hitchhiker  0.00000689203 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3585  potassium transporter peripheral membrane component  26.69 
 
 		 458 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.931761  normal  0.13042 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3483  potassium transporter peripheral membrane component  26.69 
 
 		 458 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0624843  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>