More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1203 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1203  potassium/proton antiporter  100 
 
 
486 aa  946    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.195277  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0908  potassium/proton antiporter  58.95 
 
 
497 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.709599  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0407  potassium/proton antiporter  55.29 
 
 
486 aa  489  1e-137  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495315  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1035  potassium/proton antiporter  56.33 
 
 
483 aa  481  1e-134  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0222  potassium/proton antiporter  52.16 
 
 
499 aa  445  1.0000000000000001e-124  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3454  potassium/proton antiporter  48.52 
 
 
509 aa  419  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00729546  normal  0.358 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1841  Na(+)/H(+) exchanger  48.97 
 
 
485 aa  413  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.42634  hitchhiker  0.00748386 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1689  hypothetical protein  47.51 
 
 
445 aa  413  1e-114  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1466  sodium/hydrogen exchanger  48.28 
 
 
487 aa  408  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.576685  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0757  potassium/proton antiporter  45.57 
 
 
481 aa  382  1e-105  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00299818  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0768  potassium/proton antiporter  43.25 
 
 
478 aa  383  1e-105  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0154146  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2252  sodium/hydrogen exchanger  54.66 
 
 
414 aa  361  2e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.976938  normal  0.212899 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2920  potassium/proton antiporter  40.68 
 
 
477 aa  353  2.9999999999999997e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03170  cell volume regulation protein CvrA  44.38 
 
 
485 aa  353  4e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0381  potassium/proton antiporter  42.74 
 
 
506 aa  352  1e-95  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1590  potassium/proton antiporter  41.56 
 
 
498 aa  341  1e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.609323  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0640  sodium/hydrogen exchanger  56.12 
 
 
411 aa  338  9.999999999999999e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3272  sodium/hydrogen exchanger  49.88 
 
 
406 aa  333  5e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0500  sodium/hydrogen exchanger family protein  44.92 
 
 
578 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.76767 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002210  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  42.04 
 
 
581 aa  311  1e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.90325  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0762  potassium/proton antiporter  40.37 
 
 
576 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0611  sodium/hydrogen exchanger  39.44 
 
 
531 aa  308  2.0000000000000002e-82  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00744487  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0572  sodium/hydrogen exchanger  43.69 
 
 
575 aa  306  6e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0921  sodium/hydrogen exchanger  43.63 
 
 
574 aa  305  8.000000000000001e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0538395  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2361  potassium/proton antiporter  40.75 
 
 
577 aa  304  3.0000000000000004e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.325914  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2255  sodium/hydrogen exchanger  44.21 
 
 
573 aa  304  3.0000000000000004e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272655  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0502  potassium/proton antiporter  41.68 
 
 
580 aa  297  3e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0847  potassium/proton antiporter  41.74 
 
 
574 aa  297  3e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000112338  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3088  potassium/proton antiporter  41.74 
 
 
574 aa  296  4e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0092711  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0884  potassium/proton antiporter  41.74 
 
 
574 aa  296  4e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00781318  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5023  sodium/hydrogen exchanger family protein  41.68 
 
 
598 aa  296  5e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1867  potassium/proton antiporter  40.81 
 
 
573 aa  296  7e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0560  potassium/proton antiporter  41.77 
 
 
581 aa  295  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.761529  hitchhiker  0.0000000416087 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2276  potassium/proton antiporter  40.92 
 
 
581 aa  295  1e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0543146  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3747  potassium/proton antiporter  41.32 
 
 
574 aa  294  2e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0400  potassium/proton antiporter  42.53 
 
 
580 aa  294  3e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.763312 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0580  potassium/proton antiporter  39.29 
 
 
598 aa  293  3e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316248  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5066  potassium/proton antiporter  42.11 
 
 
580 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4939  potassium/proton antiporter  42.11 
 
 
580 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5116  potassium/proton antiporter  42.32 
 
 
580 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  39.58 
 
 
596 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01166  potassium/proton antiporter  41.1 
 
 
578 aa  291  2e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.106351  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2457  sodium/hydrogen exchanger  41.1 
 
 
578 aa  291  2e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000399384  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3425  potassium/proton antiporter  40.16 
 
 
576 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0240027  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3071  potassium/proton antiporter  41.74 
 
 
574 aa  291  2e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.57549  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0910  potassium/proton antiporter  40.16 
 
 
576 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.490198  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1294  potassium/proton antiporter  41.1 
 
 
578 aa  291  2e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000808232  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2434  potassium/proton antiporter  41.1 
 
 
578 aa  291  2e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.010009  normal  0.436306 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0583  sodium/hydrogen exchanger  42.12 
 
 
572 aa  291  2e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01176  hypothetical protein  41.1 
 
 
578 aa  291  2e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0803034  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0935  potassium/proton antiporter  40.16 
 
 
576 aa  291  3e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.108607  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0944  potassium/proton antiporter  40.16 
 
 
576 aa  290  3e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.542405 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1332  potassium/proton antiporter  40.76 
 
 
577 aa  290  5.0000000000000004e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000612144  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1939  potassium/proton antiporter  40.76 
 
 
577 aa  290  5.0000000000000004e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.058645  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1999  potassium/proton antiporter  40.76 
 
 
577 aa  290  5.0000000000000004e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.861236  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1517  potassium/proton antiporter  40.76 
 
 
577 aa  290  5.0000000000000004e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.044428  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3821  potassium/proton antiporter  40.82 
 
 
574 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000259426  hitchhiker  0.000169781 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1943  potassium/proton antiporter  40.76 
 
 
577 aa  290  5.0000000000000004e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00285963  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5758  potassium/proton antiporter  41.58 
 
 
580 aa  289  6e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1678  potassium/proton antiporter  40.89 
 
 
578 aa  289  7e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000113521  normal  0.874424 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1349  potassium/proton antiporter  40.89 
 
 
578 aa  289  7e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.401684  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1336  potassium/proton antiporter  40.89 
 
 
578 aa  289  7e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000106159  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1957  potassium/proton antiporter  40.89 
 
 
578 aa  289  7e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0260417  normal  0.308586 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0337  potassium/proton antiporter  39.5 
 
 
597 aa  288  1e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1549  potassium/proton antiporter  40.17 
 
 
575 aa  288  1e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1658  potassium/proton antiporter  40.17 
 
 
575 aa  288  1e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0846  transporter-associated region:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  40.25 
 
 
588 aa  286  4e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0446  potassium/proton antiporter  40.98 
 
 
580 aa  286  7e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0536009  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0729  potassium/proton antiporter  41.24 
 
 
572 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0915  sodium/hydrogen exchanger  43.7 
 
 
490 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.101671  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0919  sodium/hydrogen exchanger  43.7 
 
 
490 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0469679  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7379  potassium/proton antiporter  38.45 
 
 
597 aa  282  8.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0122  sodium/hydrogen exchanger  41.88 
 
 
570 aa  281  2e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0870  Sodium/hydrogen exchanger  43.91 
 
 
490 aa  281  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0432  potassium/proton antiporter  39.08 
 
 
597 aa  281  2e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5829  sodium/hydrogen exchanger  41.47 
 
 
593 aa  281  2e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.626917  normal  0.686522 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45090  potassium/proton antiporter  41.47 
 
 
582 aa  281  2e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00181989  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0056  potassium/proton antiporter  37.82 
 
 
597 aa  280  6e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0827  sodium/hydrogen exchanger  40.71 
 
 
605 aa  279  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0583075 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0500  sodium/hydrogen exchanger  38.87 
 
 
608 aa  273  5.000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0245914  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3728  sodium/hydrogen exchanger  38.72 
 
 
496 aa  272  8.000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3190  sodium/hydrogen exchanger  39.63 
 
 
498 aa  271  2e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1930  potassium/proton antiporter  41.32 
 
 
569 aa  269  7e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.401785  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0393  potassium/proton antiporter  37.82 
 
 
597 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0966  potassium/proton antiporter  38.66 
 
 
596 aa  265  1e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.230877  unclonable  0.0000431742 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3191  potassium/proton antiporter  40.04 
 
 
580 aa  265  2e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.943195  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0550  sodium/hydrogen exchanger  40.44 
 
 
541 aa  263  4.999999999999999e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0657  potassium/proton antiporter  42.71 
 
 
597 aa  263  4.999999999999999e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0833853 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66380  potassium/proton antiporter  41.03 
 
 
538 aa  263  6e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8651  potassium/proton antiporter  40.53 
 
 
501 aa  261  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0112  sodium/hydrogen exchanger  35.34 
 
 
527 aa  259  8e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1831  sodium/hydrogen exchanger  40.82 
 
 
598 aa  259  1e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000205605 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4559  potassium/proton antiporter  39.57 
 
 
592 aa  255  1.0000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.875877  normal  0.221715 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0927  sodium/hydrogen exchanger  45.43 
 
 
492 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.274458 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0298  potassium/proton antiporter  38.52 
 
 
505 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12158  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2757  potassium/proton antiporter  36.58 
 
 
538 aa  253  6e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0650  potassium/proton antiporter  40.39 
 
 
590 aa  249  7e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3634  potassium/proton antiporter  39.85 
 
 
626 aa  247  3e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2406  sodium/hydrogen exchanger  37.69 
 
 
491 aa  247  3e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.908088  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3438  potassium/proton antiporter  39.6 
 
 
616 aa  247  4e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>