More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2188 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_2188  Chloride channel core  100 
 
 
563 aa  1115    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000751746  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0681  Chloride channel core  51.04 
 
 
538 aa  498  1e-139  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2944  Cl- channel, voltage-gated family protein  41.81 
 
 
526 aa  357  3.9999999999999996e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0120087  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1400  chloride channel protein  40.91 
 
 
523 aa  333  4e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.340394  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1662  voltage-gated chloride channel family protein  40.71 
 
 
523 aa  333  6e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0762  chloride channel core  40.83 
 
 
518 aa  320  6e-86  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000775923  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1830  chloride channel protein EriC  37.92 
 
 
512 aa  319  7e-86  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.116382  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  39.65 
 
 
519 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  39.69 
 
 
519 aa  304  2.0000000000000002e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2179  voltage-gated chloride channel  33.72 
 
 
528 aa  300  4e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A25  chloride channel protein EriC  33.93 
 
 
510 aa  298  2e-79  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0757  Chloride channel core  34.36 
 
 
528 aa  274  4.0000000000000004e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.937422  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1891  chloride channel protein EriC  33.33 
 
 
534 aa  266  5.999999999999999e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  8.85971e-16 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1588  Cl- channel, voltage gated  35.41 
 
 
539 aa  260  4e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000108225  normal  0.782392 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0391  chloride channel, core  33.74 
 
 
516 aa  253  6e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000201773  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1107  voltage-gated chloride channel family protein  32.99 
 
 
510 aa  251  2e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1147  chloride channel protein EriC  33.87 
 
 
487 aa  224  3e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.433892  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  31.74 
 
 
533 aa  223  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1346  chloride channel protein  30.8 
 
 
527 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0845  chloride channel protein EriC  33.94 
 
 
512 aa  221  3e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0386  chloride channel protein EriC  31.89 
 
 
457 aa  190  7e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000543407 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  30.02 
 
 
473 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  30.02 
 
 
473 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  30.02 
 
 
473 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  30.02 
 
 
473 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  29.66 
 
 
473 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2366  Cl- channel voltage-gated family protein  29.38 
 
 
416 aa  185  2.0000000000000003e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  30.77 
 
 
466 aa  184  4.0000000000000006e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  31.78 
 
 
471 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0449  Chloride channel core  36.01 
 
 
428 aa  184  5.0000000000000004e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0487186  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0459  chloride channel protein  32.66 
 
 
468 aa  180  5.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.511438  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0118  chloride transporter, ClC family  32.16 
 
 
455 aa  175  1.9999999999999998e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0189  chloride channel, core  32.57 
 
 
445 aa  172  1e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  29.16 
 
 
859 aa  172  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0782  chloride channel protein  28.64 
 
 
479 aa  172  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.12239 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1698  chloride channel protein  32.17 
 
 
427 aa  171  3e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2409  Chloride channel core  31.4 
 
 
435 aa  169  1e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3329  chloride channel protein  28.07 
 
 
478 aa  168  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3458  chloride channel protein  29.86 
 
 
478 aa  167  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.41349  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0993  chloride channel protein  29.86 
 
 
478 aa  167  4e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1697  chloride channel protein  31.7 
 
 
427 aa  166  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0552  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.04 
 
 
437 aa  166  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4719  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.25 
 
 
439 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000478  H(+)/Cl(-) exchange transporter ClcA  32.54 
 
 
467 aa  163  9e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.791443  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0866  chloride channel protein  31.45 
 
 
470 aa  160  9e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0280286  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4200  Cl- channel, voltage gated  33.7 
 
 
439 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.419413  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4266  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.7 
 
 
439 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal  0.948351 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4427  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.7 
 
 
439 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.292219 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  30.2 
 
 
863 aa  157  5.0000000000000005e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3026  chloride channel protein  32.94 
 
 
436 aa  155  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.139269  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2810  chloride channel protein  29.1 
 
 
472 aa  155  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1576  chloride channel protein  30.03 
 
 
463 aa  154  2.9999999999999998e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.803836 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0212  chloride channel protein  30.77 
 
 
456 aa  154  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2509  chloride channel protein  33.49 
 
 
455 aa  153  8.999999999999999e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  29.46 
 
 
569 aa  151  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3829  chloride channel core  27.13 
 
 
455 aa  150  8e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0318  Chloride channel core  32.07 
 
 
511 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000450379  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  33.43 
 
 
875 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4138  Chloride channel core  26.9 
 
 
455 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2176  chloride channel protein  30.74 
 
 
466 aa  149  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.462447  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0167  chloride channel protein  30.36 
 
 
473 aa  144  4e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0165  chloride channel protein  30.36 
 
 
473 aa  144  4e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0147  chloride channel protein  30.13 
 
 
473 aa  144  5e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0159  chloride channel protein  30.13 
 
 
473 aa  144  6e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5126  Chloride channel core  29.49 
 
 
455 aa  144  6e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.967493 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00154  chloride channel protein  30.13 
 
 
473 aa  143  7e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0502549  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3447  Chloride channel core  30.13 
 
 
473 aa  143  7e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06233  chloride channel protein  30.73 
 
 
468 aa  143  7e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0160  chloride channel protein  30.13 
 
 
473 aa  143  7e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00153  hypothetical protein  30.13 
 
 
473 aa  143  7e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0410723  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3504  chloride channel protein  30.13 
 
 
473 aa  143  7e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17992  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  30.94 
 
 
614 aa  143  8e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  33.22 
 
 
613 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  31.12 
 
 
862 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.96 
 
 
582 aa  138  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1638  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.17 
 
 
436 aa  134  3e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2009  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.89 
 
 
443 aa  133  6.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.41 
 
 
587 aa  129  2.0000000000000002e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.97 
 
 
598 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1979  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.97 
 
 
426 aa  127  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  28.85 
 
 
600 aa  127  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3436  Chloride channel core  28.66 
 
 
879 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2680  Chloride channel core  28.66 
 
 
879 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2460  chloride channel core  28.06 
 
 
459 aa  125  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11718  normal  0.460638 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2285  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.93 
 
 
426 aa  124  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397915  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.49 
 
 
589 aa  124  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4507  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.14 
 
 
594 aa  124  5e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1867  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.65 
 
 
414 aa  124  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.396231  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0773  Chloride channel core  30.77 
 
 
444 aa  123  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.80393  normal  0.191961 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3051  chloride channel core  33.42 
 
 
449 aa  121  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156315  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  28.16 
 
 
606 aa  121  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  27.71 
 
 
602 aa  121  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0832  chloride channel  27.27 
 
 
585 aa  121  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.1 
 
 
579 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.1 
 
 
579 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.1 
 
 
636 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.1 
 
 
579 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.24 
 
 
628 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0583  Chloride channel core  29.61 
 
 
462 aa  120  9e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.36 
 
 
593 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>