More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1184 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1184  TrkA-N domain protein  100 
 
 
218 aa  432  1e-120  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1539  TrkA-N domain protein  72.56 
 
 
222 aa  323  2e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.465203  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1173  TrkA-N domain protein  62.96 
 
 
221 aa  267  8e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2420  TrkA-N domain protein  63.72 
 
 
220 aa  267  1e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2258  TrkA-N domain protein  52.07 
 
 
236 aa  227  8e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1276  TrkA-N domain protein  52.53 
 
 
228 aa  224  8e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.283168  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1602  TrkA-N domain protein  53 
 
 
228 aa  209  2e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.316093  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0633  TrkA-N domain protein  47.93 
 
 
248 aa  205  4e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  32.57 
 
 
443 aa  88.6  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0161  TrkA domain-containing protein  30.13 
 
 
231 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.825727 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1640  TrkA domain-containing protein  33.03 
 
 
253 aa  78.6  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0557692  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0745  TrkA domain-containing protein  29.57 
 
 
231 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26958  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1450  TrkA domain-containing protein  29.6 
 
 
229 aa  75.1  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0807714  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1485  TrkA domain-containing protein  29.6 
 
 
229 aa  75.1  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0637531  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2849  potassium transporter peripheral membrane component  30.4 
 
 
457 aa  73.6  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.336578  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1520  TrkA-N domain protein  29.55 
 
 
218 aa  72.8  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1633  TrkA-N domain protein  33.16 
 
 
299 aa  72  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2196  TrkA-N  32.95 
 
 
222 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2242  TrkA domain-containing protein  32.95 
 
 
222 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.081798  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1918  TrkA-N domain protein  32.02 
 
 
224 aa  70.9  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388192  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2185  TrkA domain-containing protein  32.95 
 
 
222 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314676  normal  0.0103731 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4528  TrkA-N domain-containing protein  28.7 
 
 
222 aa  71.2  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.468661  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  26.79 
 
 
221 aa  69.7  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12243  putative potassium uptake protein  32.06 
 
 
449 aa  68.9  0.00000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  26.09 
 
 
221 aa  67.4  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  26.03 
 
 
218 aa  67.8  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1399  TrkA domain-containing protein  27.52 
 
 
233 aa  67.8  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3757  TrkA-N domain protein  29.86 
 
 
217 aa  68.2  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000992935  normal  0.446525 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2286  TrkA-N domain-containing protein  30.29 
 
 
219 aa  67.4  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.241613 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1794  hypothetical protein  25 
 
 
222 aa  67  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1876  TrkA-N domain protein  31.84 
 
 
220 aa  67.4  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.416785  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2256  TrkA-N domain protein  31.11 
 
 
218 aa  66.6  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13318  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1469  TrkA-N domain protein  29.49 
 
 
454 aa  66.2  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  25.65 
 
 
221 aa  65.9  0.0000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1754  hypothetical protein  28.8 
 
 
227 aa  65.9  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169137  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1641  TrkA domain-containing protein  30.63 
 
 
223 aa  65.9  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0270311  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1561  TrkA-N domain protein  29.36 
 
 
219 aa  65.5  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534326  normal  0.490374 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1489  hypothetical protein  31.97 
 
 
218 aa  65.1  0.0000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00984888  normal  0.0109156 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13070  K+ transport system, NAD-binding component  31.47 
 
 
233 aa  65.5  0.0000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00265603  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0914  potassium transporter peripheral membrane component  25.79 
 
 
450 aa  65.1  0.0000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2472  TrkA domain-containing protein  31.64 
 
 
221 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1941  TrkA-N domain protein  27.6 
 
 
241 aa  64.3  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0298197 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4027  TrkA family potassium uptake protein  27.15 
 
 
221 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.426006  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1041  TrkA domain-containing protein  31.14 
 
 
452 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3993  potassium uptake protein, TrkA family  27.15 
 
 
221 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3888  TrkA family potassium uptake protein  27.15 
 
 
221 aa  64.3  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3720  Trk family potassium uptake protein  27.15 
 
 
221 aa  64.3  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.430715  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3736  Trk family potassium uptake protein  27.15 
 
 
221 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4098  potassium uptake protein, TrkA family  27.15 
 
 
221 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00103413  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1159  potassium uptake protein, TrkA family  27.15 
 
 
221 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10257  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4191  TrkA family potassium uptake protein  27.15 
 
 
221 aa  64.3  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.841712  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16160  K+ transport system, NAD-binding component  27.67 
 
 
249 aa  64.3  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.534565  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4081  potassium uptake protein, TrkA family  27.15 
 
 
221 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2285  TrkA-N domain-containing protein  30.17 
 
 
221 aa  64.3  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.311674 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3805  TrkA domain-containing protein  27.15 
 
 
221 aa  63.9  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0251033  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1929  putative potassium uptake protein  30.93 
 
 
229 aa  64.3  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.123463  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0014  potassium transporter peripheral membrane component  27.31 
 
 
458 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00830339  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6760  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  28.85 
 
 
223 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0522309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1641  TrkA-N domain protein  30.81 
 
 
233 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  0.0943946 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2904  TrkA domain-containing protein  27.48 
 
 
223 aa  63.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2911  potassium transporter peripheral membrane component  26.91 
 
 
449 aa  63.5  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000908908  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0065  potassium transporter peripheral membrane component  28.32 
 
 
457 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948816  unclonable  0.000000448887 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002054  Trk system potassium uptake protein TrkA  28.07 
 
 
458 aa  63.2  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2083  TrkA-N domain protein  33.04 
 
 
210 aa  63.2  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0081  potassium transporter peripheral membrane component  28.32 
 
 
457 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685696  normal  0.107342 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1707  TrkA-N domain protein  27.81 
 
 
224 aa  63.2  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102172  normal  0.0591298 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0081  potassium transporter peripheral membrane component  28.32 
 
 
457 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  hitchhiker  0.0000000000177319 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3928  TrkA domain-containing protein  29.68 
 
 
221 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0399436  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1728  TrkA domain-containing protein  26.58 
 
 
218 aa  62.8  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000194267  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3218  potassium transporter peripheral membrane component  25.66 
 
 
454 aa  62.8  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.715113  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0807  TrkA-N domain protein  36.84 
 
 
137 aa  62.8  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0084  potassium transporter peripheral membrane component  28.32 
 
 
457 aa  62  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.409393  hitchhiker  0.00000000549949 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1970  potassium transporter peripheral membrane component  28.02 
 
 
453 aa  62  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.616677  normal  0.0915611 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1634  TrkA-N domain protein  37.27 
 
 
224 aa  62  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000521907 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5192  TrkA domain-containing protein  28.64 
 
 
259 aa  62  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0506525  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0251  TrkA-N domain protein  28.19 
 
 
225 aa  62  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2907  potassium transporter peripheral membrane component  28.7 
 
 
450 aa  62  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000237268  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0038  potassium transporter peripheral membrane component  25.99 
 
 
458 aa  62  0.000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2079  TrkA-N domain protein  27.23 
 
 
225 aa  61.6  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2680  TrkA domain-containing protein  26.7 
 
 
221 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000338081  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0052  potassium transporter peripheral membrane component  26.99 
 
 
457 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1093  potassium transporter peripheral membrane component  25.68 
 
 
458 aa  60.8  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.915935  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2476  potassium transporter peripheral membrane component  26.87 
 
 
458 aa  61.2  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0028  potassium transporter peripheral membrane component  30.74 
 
 
469 aa  60.5  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4514  potassium transporter peripheral membrane component  28.07 
 
 
458 aa  60.5  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00906883  hitchhiker  0.00000865676 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0017  potassium transporter peripheral membrane component  28.19 
 
 
458 aa  59.7  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11690  TrkA-N domain protein  27.44 
 
 
215 aa  59.7  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00343321  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  26.11 
 
 
221 aa  59.7  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16170  K+ transport system, NAD-binding component  35.45 
 
 
221 aa  60.1  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.11506 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12706  trk system potassium uptake protein ceoB  30.49 
 
 
227 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1322  TrkA-like  28.22 
 
 
231 aa  59.3  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1655  TrkA domain-containing protein  26.36 
 
 
218 aa  59.3  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000867889  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3739  potassium transporter peripheral membrane component  29.2 
 
 
469 aa  59.3  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00764602 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1826  TrkA-N domain protein  25.35 
 
 
220 aa  58.9  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00394  potassium transporter peripheral membrane component  27.63 
 
 
458 aa  59.3  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3606  potassium transporter peripheral membrane component  26.75 
 
 
458 aa  58.9  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.454415 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3776  potassium transporter peripheral membrane component  26.75 
 
 
458 aa  58.9  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3713  potassium transporter peripheral membrane component  26.75 
 
 
458 aa  58.9  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.461523 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  37.5 
 
 
626 aa  58.9  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3071  TrkA domain-containing protein  30.33 
 
 
220 aa  58.9  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>