More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_00280 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_00280  K+ transport system, NAD-binding component  100 
 
 		 219 aa  442  1e-123  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0250  TrkA-N domain protein  64.22 
 
 		 219 aa  311  4.999999999999999e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01270  K+ transport system, NAD-binding component  56.62 
 
 		 219 aa  269  2.9999999999999997e-71  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0243  TrkA-N domain protein  46.43 
 
 		 206 aa  131  7.999999999999999e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1877  TrkA-N domain protein  31.96 
 
 		 222 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.608746  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2285  TrkA-N domain-containing protein  36.06 
 
 		 221 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.311674 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2903  TrkA domain-containing protein  32.21 
 
 		 220 aa  128  8.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4527  TrkA-N domain-containing protein  32.55 
 
 		 221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.621759 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1323  TrkA-like  34.98 
 
 		 264 aa  125  5e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1634  TrkA-N domain protein  30.18 
 
 		 224 aa  124  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000521907 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1641  TrkA domain-containing protein  30.63 
 
 		 223 aa  123  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0270311  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1451  TrkA domain-containing protein  33.49 
 
 		 221 aa  122  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0437642  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0807  TrkA-N domain protein  45.38 
 
 		 137 aa  122  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12706  trk system potassium uptake protein ceoB  33 
 
 		 227 aa  122  4e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3072  TrkA domain-containing protein  36.82 
 
 		 214 aa  120  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1486  TrkA domain-containing protein  32.55 
 
 		 221 aa  119  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.370955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1642  TrkA-N domain protein  34.33 
 
 		 219 aa  119  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.623208  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2257  TrkA-N domain protein  35.64 
 
 		 220 aa  118  4.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222998  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6759  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  33.17 
 
 		 221 aa  118  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0519804 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2660  TrkA domain-containing protein  36.76 
 
 		 214 aa  117  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0646767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1713  TrkA-N domain protein  33.49 
 
 		 222 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3927  TrkA domain-containing protein  33 
 
 		 234 aa  115  5e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0233751  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1928  putative potassium transporter  36.95 
 
 		 224 aa  115  6e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.292607  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2473  TrkA domain-containing protein  33 
 
 		 223 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.214066  normal  0.684987 
 
 
-
 
NC_002936  DET0027  potassium uptake protein, putative  43.41 
 
 		 134 aa  112  3e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.248151  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2406  TrkA domain-containing protein  42.4 
 
 		 214 aa  113  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.716891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0026  TrkA domain-containing protein  43.41 
 
 		 134 aa  112  6e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1923  TrkA-N domain protein  32.41 
 
 		 220 aa  112  6e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_26  cation transport protein, Trk system  43.41 
 
 		 134 aa  112  6e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0437885  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2083  TrkA-N domain protein  42.74 
 
 		 210 aa  112  6e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1405  TrkA-N domain protein  30.77 
 
 		 218 aa  112  6e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.364271  normal  0.729476 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1917  TrkA-N domain protein  29.9 
 
 		 217 aa  111  8.000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.678679  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0253  TrkA-N domain protein  40.15 
 
 		 138 aa  111  8.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1562  TrkA-N domain protein  34 
 
 		 221 aa  111  9e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.308966  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1521  TrkA-N domain protein  34.65 
 
 		 220 aa  111  9e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.709024  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1942  TrkA-N domain protein  32.02 
 
 		 216 aa  111  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0161521 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2197  TrkA-N  32.99 
 
 		 217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2243  TrkA domain-containing protein  32.99 
 
 		 217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1398  TrkA domain-containing protein  32.84 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.870164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2186  TrkA domain-containing protein  32.99 
 
 		 217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0106506 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13070  K+ transport system, NAD-binding component  32.18 
 
 		 233 aa  109  3e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00265603  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1708  TrkA-N domain protein  31.79 
 
 		 216 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0311888  normal  0.0547174 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3756  TrkA-N domain protein  31.55 
 
 		 236 aa  108  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000258956  normal  0.472401 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16170  K+ transport system, NAD-binding component  39.23 
 
 		 221 aa  108  6e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.11506 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3063  TrkA domain-containing protein  44.92 
 
 		 214 aa  106  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2874  TrkA-N domain protein  32.51 
 
 		 242 aa  105  7e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.493191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5191  TrkA domain-containing protein  33.67 
 
 		 243 aa  104  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0357985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1347  TrkA-N  41.53 
 
 		 134 aa  103  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0274494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0637  TrkA-N  32.2 
 
 		 219 aa  98.2  9e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0432302 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2661  TrkA domain-containing protein  32.75 
 
 		 220 aa  92.8  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.202256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  29.19 
 
 		 218 aa  87.8  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00290  K+ transport system, NAD-binding component  26.87 
 
 		 226 aa  80.5  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2079  TrkA-N domain protein  44.44 
 
 		 458 aa  77.8  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1262  TrkA domain-containing protein  29.01 
 
 		 141 aa  76.6  0.0000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1656  TrkA domain-containing protein  36.29 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153236  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0242  TrkA-N domain protein  24.43 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1685  TrkA domain-containing protein  32.37 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.124287  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1729  TrkA domain-containing protein  35.48 
 
 		 143 aa  74.7  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000411585  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0251  TrkA-N domain protein  25.79 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0084  potassium transporter peripheral membrane component  38.89 
 
 		 457 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.409393  hitchhiker  0.00000000549949 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3062  TrkA domain-containing protein  27.31 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.793731  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00140  potassium transporter peripheral membrane component  38.89 
 
 		 457 aa  72.8  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35944  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0065  potassium transporter peripheral membrane component  37.96 
 
 		 457 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948816  unclonable  0.000000448887 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0081  potassium transporter peripheral membrane component  37.96 
 
 		 457 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  hitchhiker  0.0000000000177319 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0014  potassium transporter peripheral membrane component  37.96 
 
 		 458 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00830339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0081  potassium transporter peripheral membrane component  37.96 
 
 		 457 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685696  normal  0.107342 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  27.36 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0017  potassium transporter peripheral membrane component  37.96 
 
 		 457 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.290257  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  29.72 
 
 		 626 aa  72  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00170  potassium transporter peripheral membrane component  37.96 
 
 		 457 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  27.36 
 
 		 221 aa  72  0.000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  29.35 
 
 		 617 aa  72  0.000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3020  potassium transporter peripheral membrane component  29.41 
 
 		 457 aa  71.6  0.000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0180  Trk system potassium uptake protein TrkA  37.96 
 
 		 457 aa  71.6  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0016  potassium transporter peripheral membrane component  37.96 
 
 		 457 aa  71.6  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0052  potassium transporter peripheral membrane component  37.96 
 
 		 457 aa  71.6  0.000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2849  potassium transporter peripheral membrane component  36.73 
 
 		 457 aa  71.2  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.336578  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  26.87 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3606  potassium transporter peripheral membrane component  38.78 
 
 		 458 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.454415 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3678  potassium transporter peripheral membrane component  38.78 
 
 		 458 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3713  potassium transporter peripheral membrane component  38.78 
 
 		 458 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.461523 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2267  TrkA-N domain protein  30.13 
 
 		 459 aa  70.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.634076  hitchhiker  0.00765776 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3776  potassium transporter peripheral membrane component  38.78 
 
 		 458 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3605  potassium transporter peripheral membrane component  38.78 
 
 		 458 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.267887  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03140  potassium transporter peripheral membrane component  38.78 
 
 		 458 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.946548  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0424  TrkA-N domain protein  38.78 
 
 		 458 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3674  potassium transporter peripheral membrane component  38.78 
 
 		 458 aa  70.1  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3885  potassium transporter peripheral membrane component  36.63 
 
 		 458 aa  70.1  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0054195  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  30.43 
 
 		 628 aa  70.1  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1400  TrkA-N domain-containing protein  26.91 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0201  potassium transporter peripheral membrane component  35.71 
 
 		 457 aa  69.7  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0211158  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3772  potassium transporter peripheral membrane component  38.78 
 
 		 458 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.241443  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0424  potassium transporter peripheral membrane component  38.78 
 
 		 458 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000421391 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3483  potassium transporter peripheral membrane component  38.78 
 
 		 458 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0624843  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03091  hypothetical protein  38.78 
 
 		 458 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3585  potassium transporter peripheral membrane component  38.78 
 
 		 458 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.931761  normal  0.13042 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4612  potassium transporter peripheral membrane component  38.78 
 
 		 458 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00524775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0612  potassium transporter peripheral membrane component  36.63 
 
 		 458 aa  70.1  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0369792  normal  0.0559785 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0313  potassium transporter peripheral membrane component  36.63 
 
 		 458 aa  70.1  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.888467  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0020  potassium transporter peripheral membrane component  36.73 
 
 		 459 aa  69.7  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.688304  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>