298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1917 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1917  TrkA-N domain protein  100 
 
 
217 aa  439  9.999999999999999e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.678679  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16170  K+ transport system, NAD-binding component  74.53 
 
 
221 aa  338  2.9999999999999998e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.11506 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1405  TrkA-N domain protein  72.64 
 
 
218 aa  327  7e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.364271  normal  0.729476 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1708  TrkA-N domain protein  71.7 
 
 
216 aa  318  3e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0311888  normal  0.0547174 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1942  TrkA-N domain protein  66.67 
 
 
216 aa  293  2e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0161521 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2285  TrkA-N domain-containing protein  60.19 
 
 
221 aa  281  7.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.311674 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1642  TrkA-N domain protein  62.26 
 
 
219 aa  272  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.623208  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6759  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  59.35 
 
 
221 aa  266  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0519804 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1641  TrkA domain-containing protein  60.09 
 
 
223 aa  262  3e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0270311  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1634  TrkA-N domain protein  59.53 
 
 
224 aa  259  2e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000521907 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1562  TrkA-N domain protein  59.43 
 
 
221 aa  256  2e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.308966  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1323  TrkA-like  57.55 
 
 
264 aa  255  4e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1713  TrkA-N domain protein  60.38 
 
 
222 aa  251  5.000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2903  TrkA domain-containing protein  56.54 
 
 
220 aa  247  8e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1398  TrkA domain-containing protein  58.97 
 
 
224 aa  242  3e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.870164  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1486  TrkA domain-containing protein  56.07 
 
 
221 aa  242  3e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.370955  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4527  TrkA-N domain-containing protein  55.76 
 
 
221 aa  239  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.621759 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1451  TrkA domain-containing protein  55.61 
 
 
221 aa  237  1e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0437642  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3756  TrkA-N domain protein  53.27 
 
 
236 aa  235  3e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000258956  normal  0.472401 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1521  TrkA-N domain protein  55.61 
 
 
220 aa  233  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.709024  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1877  TrkA-N domain protein  56.7 
 
 
222 aa  225  3e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.608746  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2257  TrkA-N domain protein  55.73 
 
 
220 aa  225  5.0000000000000005e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222998  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5191  TrkA domain-containing protein  58.57 
 
 
243 aa  224  8e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0357985  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2197  TrkA-N  56.19 
 
 
217 aa  220  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2243  TrkA domain-containing protein  56.19 
 
 
217 aa  220  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20721  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2186  TrkA domain-containing protein  56.19 
 
 
217 aa  219  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0106506 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2874  TrkA-N domain protein  56.78 
 
 
242 aa  219  3e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.493191  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12706  trk system potassium uptake protein ceoB  54.64 
 
 
227 aa  218  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1928  putative potassium transporter  55.19 
 
 
224 aa  218  7e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.292607  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3927  TrkA domain-containing protein  53.09 
 
 
234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0233751  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2473  TrkA domain-containing protein  53.09 
 
 
223 aa  211  7.999999999999999e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.214066  normal  0.684987 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13070  K+ transport system, NAD-binding component  49.28 
 
 
233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00265603  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3072  TrkA domain-containing protein  44.85 
 
 
214 aa  162  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2406  TrkA domain-containing protein  44.33 
 
 
214 aa  160  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.716891  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1923  TrkA-N domain protein  48.95 
 
 
220 aa  160  1e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2660  TrkA domain-containing protein  38.94 
 
 
214 aa  139  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0646767  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3063  TrkA domain-containing protein  39.69 
 
 
214 aa  136  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0807  TrkA-N domain protein  47.75 
 
 
137 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0026  TrkA domain-containing protein  45.6 
 
 
134 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_26  cation transport protein, Trk system  45.6 
 
 
134 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0437885  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0027  potassium uptake protein, putative  44.8 
 
 
134 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.248151  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0250  TrkA-N domain protein  42.52 
 
 
219 aa  115  5e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0243  TrkA-N domain protein  42.19 
 
 
206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00280  K+ transport system, NAD-binding component  29.9 
 
 
219 aa  111  8.000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2083  TrkA-N domain protein  30 
 
 
210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0637  TrkA-N  32.31 
 
 
219 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0432302 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1347  TrkA-N  41.6 
 
 
134 aa  107  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0274494  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01270  K+ transport system, NAD-binding component  37.6 
 
 
219 aa  99.4  3e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0253  TrkA-N domain protein  36.28 
 
 
138 aa  94.4  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2911  TrkA-N domain protein  35.16 
 
 
142 aa  84.3  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0359474  normal  0.209528 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1656  TrkA domain-containing protein  41.07 
 
 
143 aa  82.4  0.000000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153236  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1729  TrkA domain-containing protein  40.18 
 
 
143 aa  81.6  0.000000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000411585  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  25.23 
 
 
221 aa  79  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1262  TrkA domain-containing protein  29.46 
 
 
141 aa  77.8  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  24.77 
 
 
221 aa  77.8  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  25.82 
 
 
218 aa  77  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1685  TrkA domain-containing protein  27.78 
 
 
153 aa  75.9  0.0000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.124287  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  24.3 
 
 
221 aa  74.3  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  22.9 
 
 
221 aa  72  0.000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  34.65 
 
 
626 aa  71.6  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00290  K+ transport system, NAD-binding component  28.24 
 
 
226 aa  69.3  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  33.07 
 
 
617 aa  67.8  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2082  TrkA-N domain protein  28.04 
 
 
218 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.124657  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00019  potassium transporter peripheral membrane component  33.33 
 
 
459 aa  66.2  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0242  TrkA-N domain protein  32.17 
 
 
221 aa  66.2  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3183  potassium transporter peripheral membrane component  24.04 
 
 
465 aa  66.6  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00657284  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0251  TrkA-N domain protein  25.94 
 
 
225 aa  65.9  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  32.81 
 
 
630 aa  65.1  0.0000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0638  TrkA-N  34.29 
 
 
225 aa  63.9  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  29.92 
 
 
628 aa  62.8  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  29.63 
 
 
221 aa  62.4  0.000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  29.63 
 
 
221 aa  62  0.000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  29.63 
 
 
221 aa  61.6  0.000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1348  hypothetical protein  25.33 
 
 
220 aa  61.6  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0533287  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2849  potassium transporter peripheral membrane component  24.2 
 
 
457 aa  61.2  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.336578  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0353  potassium transporter peripheral membrane component  25.95 
 
 
458 aa  60.5  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3678  potassium transporter peripheral membrane component  27.85 
 
 
458 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1681  potassium transporter peripheral membrane component  29.41 
 
 
458 aa  60.5  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3713  potassium transporter peripheral membrane component  27.85 
 
 
458 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.461523 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3606  potassium transporter peripheral membrane component  27.85 
 
 
458 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.454415 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3605  potassium transporter peripheral membrane component  27.85 
 
 
458 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.267887  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0081  potassium transporter peripheral membrane component  25.25 
 
 
458 aa  60.5  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3776  potassium transporter peripheral membrane component  27.85 
 
 
458 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03140  potassium transporter peripheral membrane component  27.85 
 
 
458 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.946548  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0424  TrkA-N domain protein  27.85 
 
 
458 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00140  potassium transporter peripheral membrane component  24.88 
 
 
457 aa  59.7  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35944  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3772  potassium transporter peripheral membrane component  27.85 
 
 
458 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.241443  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03091  hypothetical protein  27.85 
 
 
458 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0018  potassium transporter peripheral membrane component  26.29 
 
 
477 aa  59.7  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.265003  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0436  potassium transporter peripheral membrane component  24.26 
 
 
458 aa  60.1  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4612  potassium transporter peripheral membrane component  27.85 
 
 
458 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00524775  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3483  potassium transporter peripheral membrane component  27.85 
 
 
458 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0624843  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3585  potassium transporter peripheral membrane component  27.85 
 
 
458 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.931761  normal  0.13042 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3674  potassium transporter peripheral membrane component  27.85 
 
 
458 aa  59.7  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0424  potassium transporter peripheral membrane component  27.85 
 
 
458 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000421391 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0072  potassium transporter peripheral membrane component  28.07 
 
 
458 aa  59.3  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3261  potassium transporter peripheral membrane component  34.04 
 
 
484 aa  59.3  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.386779  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3912  potassium transporter peripheral membrane component  34.04 
 
 
484 aa  59.3  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  26.6 
 
 
223 aa  58.9  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1363  sodium/hydrogen exchanger  27.44 
 
 
610 aa  58.9  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00040523  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>